MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992

Total Repeats: 98006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020307	GC	3	6	206118	206123	0 %	0 %	50 %	50 %	452119740
4502	NC_020307	T	9	9	206149	206157	0 %	100 %	0 %	0 %	452119740
4503	NC_020307	ATT	2	6	206162	206167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_020307	GTT	2	6	206209	206214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_020307	CTG	2	6	206223	206228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_020307	ATT	2	6	206229	206234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_020307	AAC	2	6	206316	206321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_020307	ATA	2	6	206353	206358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_020307	TAA	2	6	206387	206392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_020307	AGG	2	6	206394	206399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_020307	GTC	2	6	206414	206419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119741
4512	NC_020307	T	6	6	206424	206429	0 %	100 %	0 %	0 %	452119741
4513	NC_020307	GCT	2	6	206447	206452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119741
4514	NC_020307	CTGC	2	8	206453	206460	0 %	25 %	25 %	50 %	452119741
4515	NC_020307	GC	3	6	206459	206464	0 %	0 %	50 %	50 %	452119741
4516	NC_020307	GC	3	6	206491	206496	0 %	0 %	50 %	50 %	452119741
4517	NC_020307	GCA	2	6	206631	206636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119741
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4519	NC_020307	AATG	2	8	206790	206797	50 %	25 %	25 %	0 %	452119741
4520	NC_020307	GCA	2	6	206808	206813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119741
4521	NC_020307	TGA	2	6	206954	206959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119741
4522	NC_020307	GCG	2	6	206963	206968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119741
4523	NC_020307	CTG	2	6	207175	207180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119741
4524	NC_020307	TGAT	2	8	207197	207204	25 %	50 %	25 %	0 %	452119741
4525	NC_020307	TTG	2	6	207227	207232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452119741
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4529	NC_020307	GC	3	6	207359	207364	0 %	0 %	50 %	50 %	452119741
4530	NC_020307	CG	3	6	207391	207396	0 %	0 %	50 %	50 %	452119741
4531	NC_020307	GCG	2	6	207423	207428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119741
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4534	NC_020307	AT	3	6	207618	207623	50 %	50 %	0 %	0 %	452119741
4535	NC_020307	CGC	2	6	207624	207629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119741
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4539	NC_020307	TGG	2	6	207776	207781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452119741
4540	NC_020307	CTG	2	6	207829	207834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119741
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4543	NC_020307	GCTTC	2	10	208194	208203	0 %	40 %	20 %	40 %	452119741
4544	NC_020307	GGA	2	6	208245	208250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452119741
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4546	NC_020307	A	6	6	208297	208302	100 %	0 %	0 %	0 %	452119741
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4549	NC_020307	GAGAT	2	10	208448	208457	40 %	20 %	40 %	0 %	452119741
4550	NC_020307	CTGG	2	8	208458	208465	0 %	25 %	50 %	25 %	452119741
4551	NC_020307	TCCG	2	8	208514	208521	0 %	25 %	25 %	50 %	452119741
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4555	NC_020307	GAGG	2	8	208679	208686	25 %	0 %	75 %	0 %	452119741
4556	NC_020307	TGC	2	6	208723	208728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119742
4557	NC_020307	ATG	2	6	208729	208734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119742
4558	NC_020307	TGA	2	6	208943	208948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119742
4559	NC_020307	ATT	2	6	208993	208998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119742
4560	NC_020307	GGC	2	6	209087	209092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119742
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4562	NC_020307	GGTC	2	8	209177	209184	0 %	25 %	50 %	25 %	452119742
4563	NC_020307	CAG	2	6	209202	209207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119742
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4575	NC_020307	TTA	2	6	209495	209500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452119743
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4583	NC_020307	ATC	2	6	209988	209993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452119743
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4587	NC_020307	TGTT	2	8	210101	210108	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4596	NC_020307	CGGG	2	8	210588	210595	0 %	0 %	75 %	25 %	452119744
4597	NC_020307	GAT	2	6	210613	210618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452119744
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4603	NC_020307	AC	3	6	210865	210870	50 %	0 %	0 %	50 %	452119744
4604	NC_020307	CGG	2	6	210900	210905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119744
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4607	NC_020307	A	6	6	211037	211042	100 %	0 %	0 %	0 %	452119744
4608	NC_020307	AGCG	2	8	211049	211056	25 %	0 %	50 %	25 %	452119744
4609	NC_020307	AAAGA	2	10	211073	211082	80 %	0 %	20 %	0 %	452119744
4610	NC_020307	CGC	2	6	211189	211194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452119744
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4617	NC_020307	AC	3	6	211549	211554	50 %	0 %	0 %	50 %	452119745
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4869	NC_020307	GCA	2	6	222637	222642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119758
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4871	NC_020307	CGT	2	6	222688	222693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119758
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4988	NC_020307	ACG	2	6	228362	228367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119766
4989	NC_020307	CGA	2	6	228422	228427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119766
4990	NC_020307	GCACG	2	10	228448	228457	20 %	0 %	40 %	40 %	452119766
4991	NC_020307	ACGGC	2	10	228466	228475	20 %	0 %	40 %	40 %	452119766
4992	NC_020307	GC	3	6	228551	228556	0 %	0 %	50 %	50 %	452119766
4993	NC_020307	CCGGAG	2	12	228609	228620	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	452119766
4994	NC_020307	AAG	2	6	228663	228668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452119766
4995	NC_020307	CTT	2	6	228781	228786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452119766
4996	NC_020307	GAC	2	6	228814	228819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452119766
4997	NC_020307	CGG	2	6	228919	228924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119766
4998	NC_020307	CGG	2	6	228928	228933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119766
4999	NC_020307	CTG	2	6	228974	228979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452119766
5000	NC_020307	GCG	2	6	228989	228994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452119766

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