MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Javiana str. CFSAN001992 plasmid pCFSAN001992_1

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020306	TC	3	6	982	987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020306	CG	3	6	1374	1379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020306	GC	3	6	1537	1542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020306	TA	3	6	2105	2110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020306	CG	3	6	3440	3445	0 %	0 %	50 %	50 %	452119513
6	NC_020306	GC	3	6	3555	3560	0 %	0 %	50 %	50 %	452119513
7	NC_020306	TC	3	6	3850	3855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020306	GC	3	6	4431	4436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020306	CG	3	6	5567	5572	0 %	0 %	50 %	50 %	452119514
10	NC_020306	TC	3	6	6753	6758	0 %	50 %	0 %	50 %	452119517
11	NC_020306	CA	3	6	8289	8294	50 %	0 %	0 %	50 %	452119520
12	NC_020306	TG	3	6	8346	8351	0 %	50 %	50 %	0 %	452119520
13	NC_020306	TG	4	8	9161	9168	0 %	50 %	50 %	0 %	452119522
14	NC_020306	CA	3	6	9897	9902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020306	GC	3	6	11742	11747	0 %	0 %	50 %	50 %	452119525
16	NC_020306	AT	3	6	12222	12227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020306	TG	4	8	12440	12447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020306	AT	3	6	13362	13367	50 %	50 %	0 %	0 %	452119526
19	NC_020306	CA	3	6	13724	13729	50 %	0 %	0 %	50 %	452119527
20	NC_020306	TC	3	6	14543	14548	0 %	50 %	0 %	50 %	452119528
21	NC_020306	AG	3	6	14784	14789	50 %	0 %	50 %	0 %	452119528
22	NC_020306	GA	3	6	15091	15096	50 %	0 %	50 %	0 %	452119528
23	NC_020306	GT	3	6	16138	16143	0 %	50 %	50 %	0 %	452119528
24	NC_020306	AT	3	6	16470	16475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020306	AT	3	6	16735	16740	50 %	50 %	0 %	0 %	452119529
26	NC_020306	TA	3	6	17095	17100	50 %	50 %	0 %	0 %	452119529
27	NC_020306	AT	3	6	19102	19107	50 %	50 %	0 %	0 %	452119531
28	NC_020306	AT	3	6	19138	19143	50 %	50 %	0 %	0 %	452119531
29	NC_020306	AT	3	6	19490	19495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020306	TC	3	6	19949	19954	0 %	50 %	0 %	50 %	452119532
31	NC_020306	TA	3	6	20297	20302	50 %	50 %	0 %	0 %	452119532
32	NC_020306	TG	3	6	20577	20582	0 %	50 %	50 %	0 %	452119533
33	NC_020306	AG	3	6	20901	20906	50 %	0 %	50 %	0 %	452119533
34	NC_020306	GA	3	6	22192	22197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020306	AT	3	6	22739	22744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020306	TA	3	6	22847	22852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020306	GC	3	6	23080	23085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020306	CG	3	6	23188	23193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.