MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	C	6	6	994	999	0 %	0 %	0 %	100 %	451816789
2	NC_020297	C	6	6	1269	1274	0 %	0 %	0 %	100 %	451816789
3	NC_020297	C	8	8	1282	1289	0 %	0 %	0 %	100 %	451816789
4	NC_020297	A	6	6	1909	1914	100 %	0 %	0 %	0 %	451816789
5	NC_020297	T	6	6	2463	2468	0 %	100 %	0 %	0 %	451816789
6	NC_020297	A	7	7	3785	3791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020297	A	7	7	3827	3833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020297	A	7	7	3847	3853	100 %	0 %	0 %	0 %	451816791
9	NC_020297	A	6	6	4790	4795	100 %	0 %	0 %	0 %	451816793
10	NC_020297	C	7	7	4838	4844	0 %	0 %	0 %	100 %	451816793
11	NC_020297	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	451816793
12	NC_020297	G	6	6	5808	5813	0 %	0 %	100 %	0 %	451816794
13	NC_020297	C	6	6	6875	6880	0 %	0 %	0 %	100 %	451816795
14	NC_020297	C	6	6	7021	7026	0 %	0 %	0 %	100 %	451816795
15	NC_020297	C	7	7	7063	7069	0 %	0 %	0 %	100 %	451816795
16	NC_020297	T	6	6	7535	7540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020297	C	6	6	7892	7897	0 %	0 %	0 %	100 %	451816796
18	NC_020297	G	6	6	8271	8276	0 %	0 %	100 %	0 %	451816796
19	NC_020297	A	6	6	8848	8853	100 %	0 %	0 %	0 %	451816797
20	NC_020297	T	6	6	9991	9996	0 %	100 %	0 %	0 %	451816798
21	NC_020297	T	6	6	10267	10272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020297	T	7	7	11133	11139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020297	A	6	6	11169	11174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020297	T	6	6	11264	11269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020297	T	6	6	11304	11309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020297	A	7	7	11485	11491	100 %	0 %	0 %	0 %	451816800
27	NC_020297	A	7	7	11573	11579	100 %	0 %	0 %	0 %	451816800
28	NC_020297	A	6	6	11628	11633	100 %	0 %	0 %	0 %	451816800
29	NC_020297	A	8	8	11868	11875	100 %	0 %	0 %	0 %	451816800
30	NC_020297	A	7	7	12717	12723	100 %	0 %	0 %	0 %	451816800
31	NC_020297	T	6	6	13641	13646	0 %	100 %	0 %	0 %	451816801
32	NC_020297	A	7	7	13754	13760	100 %	0 %	0 %	0 %	451816801
33	NC_020297	T	6	6	14565	14570	0 %	100 %	0 %	0 %	451816801
34	NC_020297	T	6	6	14676	14681	0 %	100 %	0 %	0 %	451816801
35	NC_020297	A	6	6	14762	14767	100 %	0 %	0 %	0 %	451816801
36	NC_020297	A	8	8	15519	15526	100 %	0 %	0 %	0 %	451816802
37	NC_020297	T	6	6	15799	15804	0 %	100 %	0 %	0 %	451816802
38	NC_020297	T	7	7	15881	15887	0 %	100 %	0 %	0 %	451816802
39	NC_020297	T	6	6	15973	15978	0 %	100 %	0 %	0 %	451816802
40	NC_020297	T	6	6	16600	16605	0 %	100 %	0 %	0 %	451816803
41	NC_020297	A	6	6	17105	17110	100 %	0 %	0 %	0 %	451816803
42	NC_020297	T	6	6	17242	17247	0 %	100 %	0 %	0 %	451816803
43	NC_020297	A	6	6	17300	17305	100 %	0 %	0 %	0 %	451816803
44	NC_020297	A	6	6	17514	17519	100 %	0 %	0 %	0 %	451816803
45	NC_020297	T	6	6	18208	18213	0 %	100 %	0 %	0 %	451816804
46	NC_020297	A	8	8	18721	18728	100 %	0 %	0 %	0 %	451816804
47	NC_020297	A	6	6	18748	18753	100 %	0 %	0 %	0 %	451816804
48	NC_020297	A	6	6	19291	19296	100 %	0 %	0 %	0 %	451816804
49	NC_020297	A	6	6	19639	19644	100 %	0 %	0 %	0 %	451816804
50	NC_020297	T	6	6	19711	19716	0 %	100 %	0 %	0 %	451816804
51	NC_020297	T	6	6	19954	19959	0 %	100 %	0 %	0 %	451816804
52	NC_020297	T	6	6	20427	20432	0 %	100 %	0 %	0 %	451816804
53	NC_020297	T	6	6	21517	21522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020297	T	6	6	21530	21535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020297	A	6	6	21795	21800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020297	T	7	7	21873	21879	0 %	100 %	0 %	0 %	451816807
57	NC_020297	C	6	6	21893	21898	0 %	0 %	0 %	100 %	451816807
58	NC_020297	C	6	6	21945	21950	0 %	0 %	0 %	100 %	451816807
59	NC_020297	G	9	9	22071	22079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020297	T	6	6	22158	22163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020297	T	9	9	22238	22246	0 %	100 %	0 %	0 %	451816808
62	NC_020297	T	6	6	22278	22283	0 %	100 %	0 %	0 %	451816808
63	NC_020297	A	6	6	22303	22308	100 %	0 %	0 %	0 %	451816808
64	NC_020297	A	9	9	22344	22352	100 %	0 %	0 %	0 %	451816808
65	NC_020297	A	6	6	22373	22378	100 %	0 %	0 %	0 %	451816808
66	NC_020297	A	6	6	22415	22420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020297	A	6	6	22480	22485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020297	A	6	6	22493	22498	100 %	0 %	0 %	0 %	451816809
69	NC_020297	A	6	6	22512	22517	100 %	0 %	0 %	0 %	451816809
70	NC_020297	A	6	6	22636	22641	100 %	0 %	0 %	0 %	451816809
71	NC_020297	A	6	6	22787	22792	100 %	0 %	0 %	0 %	451816809
72	NC_020297	A	7	7	22883	22889	100 %	0 %	0 %	0 %	451816809
73	NC_020297	A	6	6	22950	22955	100 %	0 %	0 %	0 %	451816809
74	NC_020297	T	6	6	22962	22967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020297	C	6	6	22978	22983	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_020297	T	6	6	23068	23073	0 %	100 %	0 %	0 %	451816810
77	NC_020297	G	8	8	23147	23154	0 %	0 %	100 %	0 %	451816810
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79	NC_020297	G	6	6	23505	23510	0 %	0 %	100 %	0 %	451816810
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84	NC_020297	T	6	6	24629	24634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020297	T	6	6	25207	25212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020297	C	6	6	25494	25499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
87	NC_020297	C	6	6	26052	26057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_020297	A	8	8	26686	26693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_020297	A	7	7	26808	26814	100 %	0 %	0 %	0 %	451816817
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93	NC_020297	T	6	6	27490	27495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020297	A	6	6	27551	27556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020297	A	6	6	27650	27655	100 %	0 %	0 %	0 %	451816818
96	NC_020297	A	6	6	27666	27671	100 %	0 %	0 %	0 %	451816818
97	NC_020297	A	7	7	27689	27695	100 %	0 %	0 %	0 %	451816818
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100	NC_020297	G	7	7	29187	29193	0 %	0 %	100 %	0 %	451816819
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102	NC_020297	A	7	7	29818	29824	100 %	0 %	0 %	0 %	451816819
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109	NC_020297	A	6	6	33693	33698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020297	A	6	6	33834	33839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020297	G	6	6	37127	37132	0 %	0 %	100 %	0 %	451816829
112	NC_020297	G	6	6	37763	37768	0 %	0 %	100 %	0 %	451816830
113	NC_020297	A	6	6	38866	38871	100 %	0 %	0 %	0 %	451816830
114	NC_020297	G	6	6	38951	38956	0 %	0 %	100 %	0 %	451816830
115	NC_020297	C	6	6	39288	39293	0 %	0 %	0 %	100 %	451816831
116	NC_020297	G	7	7	39839	39845	0 %	0 %	100 %	0 %	451816831
117	NC_020297	T	6	6	40516	40521	0 %	100 %	0 %	0 %	451816831
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121	NC_020297	G	6	6	41909	41914	0 %	0 %	100 %	0 %	451816831
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126	NC_020297	A	6	6	46810	46815	100 %	0 %	0 %	0 %	451816835
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132	NC_020297	A	6	6	50540	50545	100 %	0 %	0 %	0 %	451816838
133	NC_020297	A	7	7	50553	50559	100 %	0 %	0 %	0 %	451816838
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136	NC_020297	A	7	7	51182	51188	100 %	0 %	0 %	0 %	451816839
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145	NC_020297	A	6	6	54346	54351	100 %	0 %	0 %	0 %	451816844
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.