MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	TGGCAT	2	12	2417	2428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	451816789
2	NC_020297	CGAAGG	2	12	4354	4365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451816792
3	NC_020297	GACATC	2	12	5359	5370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451816794
4	NC_020297	GTAATC	2	12	5636	5647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816794
5	NC_020297	GCCTTT	2	12	6142	6153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451816794
6	NC_020297	AAACCC	2	12	6575	6586	50 %	0 %	0 %	50 %	451816795
7	NC_020297	GCCAAG	2	12	8003	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816796
8	NC_020297	CCATTG	2	12	8905	8916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451816797
9	NC_020297	GAAATA	2	12	11915	11926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816800
10	NC_020297	TTTTAG	2	12	13598	13609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816801
11	NC_020297	AAATTT	2	12	15104	15115	50 %	50 %	0 %	0 %	451816802
12	NC_020297	TTTAAA	2	12	19555	19566	50 %	50 %	0 %	0 %	451816804
13	NC_020297	GATTTT	2	12	19946	19957	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816804
14	NC_020297	TGTTTT	2	12	22193	22204	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	451816808
15	NC_020297	AAGATG	2	12	24720	24731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816813
16	NC_020297	CAAAAA	2	12	26819	26830	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	451816817
17	NC_020297	AACGGC	2	12	28303	28314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816819
18	NC_020297	AACGGG	2	12	29965	29976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451816819
19	NC_020297	TCTTCA	2	12	33248	33259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	451816824
20	NC_020297	CATGCA	2	12	34900	34911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451816827
21	NC_020297	AGCCCA	2	12	38093	38104	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	451816830
22	NC_020297	CAAGTT	2	12	38400	38411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816830
23	NC_020297	GATGCC	2	12	41007	41018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	451816831
24	NC_020297	TTGGCT	2	12	41871	41882	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	451816831
25	NC_020297	TGGATT	2	12	43198	43209	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	451816833
26	NC_020297	TGATCT	2	12	47791	47802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451816837
27	NC_020297	ATTTTG	2	12	47867	47878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816838
28	NC_020297	ATTGCC	2	12	47965	47976	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451816838
29	NC_020297	GAAAAT	2	12	50970	50981	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816838
30	NC_020297	CAATCA	2	12	51734	51745	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	451816840
31	NC_020297	AAAGCC	2	12	52830	52841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	451816841
32	NC_020297	GGAATG	2	12	53217	53228	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	451816841
33	NC_020297	CGTTAT	2	12	55652	55663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451816846
34	NC_020297	CAACGG	2	12	55753	55764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816846
35	NC_020297	CGAAGG	2	12	59072	59083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451816851
36	NC_020297	GACATC	2	12	60077	60088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451816853
37	NC_020297	GTAATC	2	12	60354	60365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	451816853
38	NC_020297	GCCTTT	2	12	60860	60871	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	451816853
39	NC_020297	AAACCC	2	12	61293	61304	50 %	0 %	0 %	50 %	451816854
40	NC_020297	GCCAAG	2	12	62721	62732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816855
41	NC_020297	CCATTG	2	12	63623	63634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	451816856
42	NC_020297	GAAATA	2	12	66633	66644	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	451816859
43	NC_020297	TTTTAG	2	12	68316	68327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816860
44	NC_020297	AAATTT	2	12	69822	69833	50 %	50 %	0 %	0 %	451816861
45	NC_020297	TTTAAA	2	12	74273	74284	50 %	50 %	0 %	0 %	451816863
46	NC_020297	GATTTT	2	12	74664	74675	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	451816863
47	NC_020297	TGTTTT	2	12	76911	76922	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	451816867
48	NC_020297	AAGATG	2	12	79438	79449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816872
49	NC_020297	CAAAAA	2	12	81537	81548	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	451816876
50	NC_020297	TTGACT	2	12	83092	83103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	451816878
51	NC_020297	GGGCCA	2	12	84054	84065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	451816878
52	NC_020297	ATGCGG	2	12	89649	89660	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451816883
53	NC_020297	TACGAA	2	12	94443	94454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	451816889
54	NC_020297	TGAAGA	2	12	95954	95965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816890
55	NC_020297	GAAAAA	2	12	96137	96148	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	451816890
56	NC_020297	GGCAAA	2	12	96389	96400	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	451816890
57	NC_020297	CTGATA	2	12	98702	98713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020297	ATTTTA	2	12	98735	98746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020297	CAACGG	2	12	102189	102200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816895
60	NC_020297	TTATCG	2	12	105027	105038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.