MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 286

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020297	TGGT	2	8	65	72	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020297	AGGC	2	8	180	187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020297	AAAG	2	8	381	388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020297	GACG	2	8	1410	1417	25 %	0 %	50 %	25 %	451816789
5	NC_020297	CTTA	2	8	3339	3346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020297	AAAG	2	8	3421	3428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020297	TTTA	2	8	3456	3463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020297	CCGG	2	8	4430	4437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020297	GATG	2	8	4462	4469	25 %	25 %	50 %	0 %	451816793
10	NC_020297	TCGG	2	8	4495	4502	0 %	25 %	50 %	25 %	451816793
11	NC_020297	CAAT	2	8	5146	5153	50 %	25 %	0 %	25 %	451816793
12	NC_020297	TGGC	2	8	5166	5173	0 %	25 %	50 %	25 %	451816793
13	NC_020297	TACC	2	8	5216	5223	25 %	25 %	0 %	50 %	451816793
14	NC_020297	GGTT	2	8	5560	5567	0 %	50 %	50 %	0 %	451816794
15	NC_020297	GGGA	2	8	6482	6489	25 %	0 %	75 %	0 %	451816795
16	NC_020297	GTTG	2	8	6884	6891	0 %	50 %	50 %	0 %	451816795
17	NC_020297	CTTT	2	8	7488	7495	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020297	GCTC	2	8	9616	9623	0 %	25 %	25 %	50 %	451816798
19	NC_020297	CTTT	2	8	9700	9707	0 %	75 %	0 %	25 %	451816798
20	NC_020297	GATT	2	8	9770	9777	25 %	50 %	25 %	0 %	451816798
21	NC_020297	CATT	2	8	9974	9981	25 %	50 %	0 %	25 %	451816798
22	NC_020297	AAGC	2	8	10563	10570	50 %	0 %	25 %	25 %	451816799
23	NC_020297	TGAC	2	8	10687	10694	25 %	25 %	25 %	25 %	451816799
24	NC_020297	AGAA	2	8	10931	10938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020297	ATTT	2	8	11238	11245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020297	TAAA	2	8	11250	11257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020297	GGCA	2	8	11655	11662	25 %	0 %	50 %	25 %	451816800
28	NC_020297	AGAA	2	8	11781	11788	75 %	0 %	25 %	0 %	451816800
29	NC_020297	AGAA	2	8	12057	12064	75 %	0 %	25 %	0 %	451816800
30	NC_020297	GTAG	2	8	12905	12912	25 %	25 %	50 %	0 %	451816800
31	NC_020297	ATGA	2	8	12977	12984	50 %	25 %	25 %	0 %	451816800
32	NC_020297	GAAT	2	8	13117	13124	50 %	25 %	25 %	0 %	451816800
33	NC_020297	TATT	2	8	13901	13908	25 %	75 %	0 %	0 %	451816801
34	NC_020297	ATTA	2	8	14350	14357	50 %	50 %	0 %	0 %	451816801
35	NC_020297	ACAG	2	8	14379	14386	50 %	0 %	25 %	25 %	451816801
36	NC_020297	ATTG	2	8	15053	15060	25 %	50 %	25 %	0 %	451816802
37	NC_020297	AGAA	2	8	15154	15161	75 %	0 %	25 %	0 %	451816802
38	NC_020297	GATT	2	8	15494	15501	25 %	50 %	25 %	0 %	451816802
39	NC_020297	AGGA	2	8	15664	15671	50 %	0 %	50 %	0 %	451816802
40	NC_020297	TCAA	2	8	16207	16214	50 %	25 %	0 %	25 %	451816802
41	NC_020297	AATT	2	8	17289	17296	50 %	50 %	0 %	0 %	451816803
42	NC_020297	TAGA	2	8	17361	17368	50 %	25 %	25 %	0 %	451816803
43	NC_020297	GGAA	2	8	17383	17390	50 %	0 %	50 %	0 %	451816803
44	NC_020297	AAAG	2	8	17431	17438	75 %	0 %	25 %	0 %	451816803
45	NC_020297	TTAT	2	8	18477	18484	25 %	75 %	0 %	0 %	451816804
46	NC_020297	TCTT	2	8	18976	18983	0 %	75 %	0 %	25 %	451816804
47	NC_020297	TCAA	2	8	19118	19125	50 %	25 %	0 %	25 %	451816804
48	NC_020297	AGCG	2	8	19139	19146	25 %	0 %	50 %	25 %	451816804
49	NC_020297	ACAA	2	8	19778	19785	75 %	0 %	0 %	25 %	451816804
50	NC_020297	TTAT	2	8	20277	20284	25 %	75 %	0 %	0 %	451816804
51	NC_020297	AATC	2	8	21484	21491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020297	AATA	2	8	22031	22038	75 %	25 %	0 %	0 %	451816807
53	NC_020297	AAGA	2	8	22172	22179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020297	ATTA	2	8	22433	22440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020297	GAAA	2	8	22443	22450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020297	GAAA	2	8	22838	22845	75 %	0 %	25 %	0 %	451816809
57	NC_020297	ATCA	2	8	22970	22977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_020297	GGTG	2	8	23179	23186	0 %	25 %	75 %	0 %	451816810
59	NC_020297	GTCG	2	8	23532	23539	0 %	25 %	50 %	25 %	451816810
60	NC_020297	CCGG	2	8	23576	23583	0 %	0 %	50 %	50 %	451816810
61	NC_020297	CGGC	2	8	23604	23611	0 %	0 %	50 %	50 %	451816810
62	NC_020297	CTTG	2	8	23716	23723	0 %	50 %	25 %	25 %	451816810
63	NC_020297	TGGT	2	8	23782	23789	0 %	50 %	50 %	0 %	451816810
64	NC_020297	CAAT	2	8	23875	23882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020297	AGAT	2	8	24016	24023	50 %	25 %	25 %	0 %	451816811
66	NC_020297	TTAT	2	8	24176	24183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020297	GGAA	2	8	24370	24377	50 %	0 %	50 %	0 %	451816812
68	NC_020297	TGCC	2	8	24661	24668	0 %	25 %	25 %	50 %	451816813
69	NC_020297	TTTA	2	8	25574	25581	25 %	75 %	0 %	0 %	451816815
70	NC_020297	TGAA	2	8	25683	25690	50 %	25 %	25 %	0 %	451816815
71	NC_020297	AATC	2	8	26384	26391	50 %	25 %	0 %	25 %	451816816
72	NC_020297	AAAG	2	8	26440	26447	75 %	0 %	25 %	0 %	451816816
73	NC_020297	CAGG	2	8	26999	27006	25 %	0 %	50 %	25 %	451816817
74	NC_020297	ATTG	2	8	27024	27031	25 %	50 %	25 %	0 %	451816817
75	NC_020297	AAAC	2	8	27125	27132	75 %	0 %	0 %	25 %	451816817
76	NC_020297	ACAG	2	8	27173	27180	50 %	0 %	25 %	25 %	451816817
77	NC_020297	TAAA	2	8	27240	27247	75 %	25 %	0 %	0 %	451816817
78	NC_020297	CTTG	2	8	27829	27836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020297	AGAA	2	8	27891	27898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020297	AACC	2	8	28970	28977	50 %	0 %	0 %	50 %	451816819
81	NC_020297	ATCG	2	8	30240	30247	25 %	25 %	25 %	25 %	451816819
82	NC_020297	CCAT	2	8	30817	30824	25 %	25 %	0 %	50 %	451816819
83	NC_020297	ACAA	2	8	31452	31459	75 %	0 %	0 %	25 %	451816820
84	NC_020297	AGAA	2	8	31745	31752	75 %	0 %	25 %	0 %	451816821
85	NC_020297	GTTT	2	8	32853	32860	0 %	75 %	25 %	0 %	451816823
86	NC_020297	TCAC	2	8	32963	32970	25 %	25 %	0 %	50 %	451816824
87	NC_020297	CATC	2	8	33224	33231	25 %	25 %	0 %	50 %	451816824
88	NC_020297	CCCA	2	8	33360	33367	25 %	0 %	0 %	75 %	451816824
89	NC_020297	TTGA	2	8	33943	33950	25 %	50 %	25 %	0 %	451816825
90	NC_020297	GAAG	2	8	33987	33994	50 %	0 %	50 %	0 %	451816825
91	NC_020297	CAAT	2	8	34864	34871	50 %	25 %	0 %	25 %	451816827
92	NC_020297	GATG	2	8	35296	35303	25 %	25 %	50 %	0 %	451816827
93	NC_020297	GCTA	2	8	35524	35531	25 %	25 %	25 %	25 %	451816828
94	NC_020297	TTAA	2	8	35681	35688	50 %	50 %	0 %	0 %	451816828
95	NC_020297	AGCT	2	8	37927	37934	25 %	25 %	25 %	25 %	451816830
96	NC_020297	GCCC	2	8	38256	38263	0 %	0 %	25 %	75 %	451816830
97	NC_020297	TAAT	2	8	38386	38393	50 %	50 %	0 %	0 %	451816830
98	NC_020297	GTTT	2	8	38788	38795	0 %	75 %	25 %	0 %	451816830
99	NC_020297	GGTT	2	8	40323	40330	0 %	50 %	50 %	0 %	451816831
100	NC_020297	TATT	2	8	40608	40615	25 %	75 %	0 %	0 %	451816831
101	NC_020297	CACC	2	8	40760	40767	25 %	0 %	0 %	75 %	451816831
102	NC_020297	GGTT	2	8	40925	40932	0 %	50 %	50 %	0 %	451816831
103	NC_020297	GGAA	2	8	42136	42143	50 %	0 %	50 %	0 %	451816831
104	NC_020297	ATTT	2	8	42318	42325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020297	TCTT	2	8	43021	43028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020297	TATT	2	8	43328	43335	25 %	75 %	0 %	0 %	451816833
107	NC_020297	TATC	2	8	43502	43509	25 %	50 %	0 %	25 %	451816834
108	NC_020297	AAGG	2	8	43756	43763	50 %	0 %	50 %	0 %	451816835
109	NC_020297	CGAA	2	8	43949	43956	50 %	0 %	25 %	25 %	451816835
110	NC_020297	TGAT	2	8	44327	44334	25 %	50 %	25 %	0 %	451816835
111	NC_020297	TGGT	2	8	44531	44538	0 %	50 %	50 %	0 %	451816835
112	NC_020297	ATTA	2	8	44604	44611	50 %	50 %	0 %	0 %	451816835
113	NC_020297	TGCC	2	8	44717	44724	0 %	25 %	25 %	50 %	451816835
114	NC_020297	TGAT	2	8	44741	44748	25 %	50 %	25 %	0 %	451816835
115	NC_020297	CGAG	2	8	45111	45118	25 %	0 %	50 %	25 %	451816835
116	NC_020297	ATTT	2	8	45455	45462	25 %	75 %	0 %	0 %	451816835
117	NC_020297	ATCG	2	8	45502	45509	25 %	25 %	25 %	25 %	451816835
118	NC_020297	ATTT	2	8	45779	45786	25 %	75 %	0 %	0 %	451816835
119	NC_020297	GCGG	2	8	46227	46234	0 %	0 %	75 %	25 %	451816835
120	NC_020297	AATT	2	8	46310	46317	50 %	50 %	0 %	0 %	451816835
121	NC_020297	TGAG	2	8	47309	47316	25 %	25 %	50 %	0 %	451816836
122	NC_020297	TTAT	2	8	47538	47545	25 %	75 %	0 %	0 %	451816837
123	NC_020297	TGTT	2	8	48428	48435	0 %	75 %	25 %	0 %	451816838
124	NC_020297	TTCA	2	8	48439	48446	25 %	50 %	0 %	25 %	451816838
125	NC_020297	ATTC	2	8	48533	48540	25 %	50 %	0 %	25 %	451816838
126	NC_020297	GAAG	2	8	48852	48859	50 %	0 %	50 %	0 %	451816838
127	NC_020297	GAAA	2	8	48969	48976	75 %	0 %	25 %	0 %	451816838
128	NC_020297	AATC	2	8	49081	49088	50 %	25 %	0 %	25 %	451816838
129	NC_020297	GTTG	2	8	49611	49618	0 %	50 %	50 %	0 %	451816838
130	NC_020297	CGGG	2	8	49690	49697	0 %	0 %	75 %	25 %	451816838
131	NC_020297	GAAA	2	8	50010	50017	75 %	0 %	25 %	0 %	451816838
132	NC_020297	ACTT	2	8	50397	50404	25 %	50 %	0 %	25 %	451816838
133	NC_020297	TACA	2	8	50475	50482	50 %	25 %	0 %	25 %	451816838
134	NC_020297	AAAC	2	8	50823	50830	75 %	0 %	0 %	25 %	451816838
135	NC_020297	TGCT	2	8	51167	51174	0 %	50 %	25 %	25 %	451816839
136	NC_020297	AGTT	2	8	51248	51255	25 %	50 %	25 %	0 %	451816839
137	NC_020297	AACT	2	8	52160	52167	50 %	25 %	0 %	25 %	451816841
138	NC_020297	TCAG	2	8	52599	52606	25 %	25 %	25 %	25 %	451816841
139	NC_020297	TTCC	2	8	53318	53325	0 %	50 %	0 %	50 %	451816841
140	NC_020297	ATCA	2	8	53986	53993	50 %	25 %	0 %	25 %	451816843
141	NC_020297	ATAG	2	8	54102	54109	50 %	25 %	25 %	0 %	451816843
142	NC_020297	CTTC	2	8	54368	54375	0 %	50 %	0 %	50 %	451816844
143	NC_020297	AGGC	2	8	54665	54672	25 %	0 %	50 %	25 %	451816844
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282	NC_020297	AGAT	2	8	103083	103090	50 %	25 %	25 %	0 %	451816896
283	NC_020297	AAAT	2	8	103207	103214	75 %	25 %	0 %	0 %	451816896
284	NC_020297	TGCC	2	8	104301	104308	0 %	25 %	25 %	50 %	451816897
285	NC_020297	TTCA	2	8	104323	104330	25 %	50 %	0 %	25 %	451816897
286	NC_020297	CCTG	2	8	105553	105560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.