MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 2176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_020297	TCG	2	6	98696	98701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_020297	CTGATA	2	12	98702	98713	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2003	NC_020297	GGT	2	6	98715	98720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_020297	ATTTTA	2	12	98735	98746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_020297	ATT	2	6	98761	98766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_020297	CCAT	2	8	98822	98829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2007	NC_020297	ATCA	2	8	98887	98894	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2008	NC_020297	TGA	2	6	98901	98906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_020297	AAT	2	6	98936	98941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_020297	ATT	2	6	98952	98957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816892
2011	NC_020297	ATT	2	6	99043	99048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816892
2012	NC_020297	AAG	2	6	99070	99075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816892
2013	NC_020297	GGA	2	6	99105	99110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816892
2014	NC_020297	TAAT	2	8	99157	99164	50 %	50 %	0 %	0 %	451816892
2015	NC_020297	AGA	2	6	99170	99175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816892
2016	NC_020297	AATT	2	8	99202	99209	50 %	50 %	0 %	0 %	451816892
2017	NC_020297	A	6	6	99290	99295	100 %	0 %	0 %	0 %	451816892
2018	NC_020297	T	6	6	99296	99301	0 %	100 %	0 %	0 %	451816892
2019	NC_020297	ATG	2	6	99328	99333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816892
2020	NC_020297	A	7	7	99360	99366	100 %	0 %	0 %	0 %	451816892
2021	NC_020297	GAT	2	6	99372	99377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816892
2022	NC_020297	ACT	2	6	99380	99385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816892
2023	NC_020297	TAC	2	6	99414	99419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816892
2024	NC_020297	A	7	7	99477	99483	100 %	0 %	0 %	0 %	451816892
2025	NC_020297	AAT	2	6	99522	99527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2026	NC_020297	GAT	2	6	99534	99539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816893
2027	NC_020297	TATC	2	8	99568	99575	25 %	50 %	0 %	25 %	451816893
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2029	NC_020297	GAG	2	6	99698	99703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816893
2030	NC_020297	AT	3	6	99713	99718	50 %	50 %	0 %	0 %	451816893
2031	NC_020297	GCAA	2	8	99733	99740	50 %	0 %	25 %	25 %	451816893
2032	NC_020297	A	7	7	99739	99745	100 %	0 %	0 %	0 %	451816893
2033	NC_020297	ATA	2	6	99769	99774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816893
2034	NC_020297	A	6	6	99783	99788	100 %	0 %	0 %	0 %	451816893
2035	NC_020297	AGGA	2	8	99802	99809	50 %	0 %	50 %	0 %	451816893
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2041	NC_020297	AG	3	6	100179	100184	50 %	0 %	50 %	0 %	451816893
2042	NC_020297	TGA	2	6	100272	100277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816893
2043	NC_020297	A	6	6	100277	100282	100 %	0 %	0 %	0 %	451816893
2044	NC_020297	A	7	7	100297	100303	100 %	0 %	0 %	0 %	451816893
2045	NC_020297	AAG	2	6	100448	100453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816893
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2048	NC_020297	A	6	6	100505	100510	100 %	0 %	0 %	0 %	451816893
2049	NC_020297	TGA	2	6	100549	100554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816893
2050	NC_020297	TTTGC	2	10	100556	100565	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2051	NC_020297	ATT	2	6	100572	100577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_020297	GAT	2	6	100627	100632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816894
2053	NC_020297	AG	3	6	100644	100649	50 %	0 %	50 %	0 %	451816894
2054	NC_020297	ATA	2	6	100718	100723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816894
2055	NC_020297	A	6	6	100736	100741	100 %	0 %	0 %	0 %	451816894
2056	NC_020297	A	6	6	100784	100789	100 %	0 %	0 %	0 %	451816894
2057	NC_020297	CAG	2	6	100819	100824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816894
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2061	NC_020297	TTAA	2	8	100855	100862	50 %	50 %	0 %	0 %	451816894
2062	NC_020297	ATTA	2	8	100863	100870	50 %	50 %	0 %	0 %	451816894
2063	NC_020297	TAA	2	6	100881	100886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816894
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2065	NC_020297	TTA	2	6	100996	101001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816894
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2089	NC_020297	A	7	7	101629	101635	100 %	0 %	0 %	0 %	451816894
2090	NC_020297	TAA	2	6	101637	101642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816894
2091	NC_020297	GAT	3	9	101698	101706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816894
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2093	NC_020297	ATA	2	6	101738	101743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816894
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2096	NC_020297	CGAAT	2	10	101950	101959	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2097	NC_020297	GTC	2	6	101984	101989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2099	NC_020297	AT	3	6	102029	102034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2101	NC_020297	GTA	2	6	102139	102144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2104	NC_020297	AT	3	6	102236	102241	50 %	50 %	0 %	0 %	451816895
2105	NC_020297	TCA	2	6	102249	102254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816895
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2109	NC_020297	ACCG	2	8	102436	102443	25 %	0 %	25 %	50 %	451816895
2110	NC_020297	GGT	2	6	102457	102462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816895
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2113	NC_020297	ATC	2	6	102735	102740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_020297	TCAG	2	8	102766	102773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2115	NC_020297	TAAA	2	8	102798	102805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_020297	TTA	2	6	102818	102823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_020297	AT	3	6	102945	102950	50 %	50 %	0 %	0 %	451816896
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2122	NC_020297	AGC	2	6	103067	103072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816896
2123	NC_020297	AGAT	2	8	103083	103090	50 %	25 %	25 %	0 %	451816896
2124	NC_020297	AAAT	2	8	103207	103214	75 %	25 %	0 %	0 %	451816896
2125	NC_020297	ATT	2	6	103284	103289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816896
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2127	NC_020297	T	6	6	103305	103310	0 %	100 %	0 %	0 %	451816896
2128	NC_020297	CAT	2	6	103332	103337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816896
2129	NC_020297	TGT	2	6	103348	103353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816896
2130	NC_020297	AT	3	6	103369	103374	50 %	50 %	0 %	0 %	451816896
2131	NC_020297	GAT	2	6	103412	103417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816896
2132	NC_020297	TGA	2	6	103516	103521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816896
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2140	NC_020297	CAT	2	6	103893	103898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816897
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2149	NC_020297	TTCA	2	8	104323	104330	25 %	50 %	0 %	25 %	451816897
2150	NC_020297	ATT	2	6	104413	104418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_020297	ATT	2	6	104423	104428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2152	NC_020297	ATC	2	6	104598	104603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2153	NC_020297	AT	3	6	104736	104741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2154	NC_020297	TCG	2	6	104821	104826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2155	NC_020297	GACTG	2	10	104877	104886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2156	NC_020297	TC	3	6	104905	104910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2157	NC_020297	TAT	2	6	104927	104932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2158	NC_020297	ATA	2	6	104966	104971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2159	NC_020297	CTGCC	2	10	104994	105003	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2160	NC_020297	GGT	3	9	105008	105016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2161	NC_020297	TTATCG	2	12	105027	105038	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.