MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX_M

Total Repeats: 2176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020297	AGAT	2	8	24016	24023	50 %	25 %	25 %	0 %	451816811
502	NC_020297	GAC	2	6	24092	24097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816811
503	NC_020297	TTAT	2	8	24176	24183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020297	CCA	2	6	24233	24238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_020297	AAG	2	6	24273	24278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816812
506	NC_020297	CGC	2	6	24289	24294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816812
507	NC_020297	ATG	2	6	24305	24310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816812
508	NC_020297	GGA	2	6	24337	24342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816812
509	NC_020297	GGAA	2	8	24370	24377	50 %	0 %	50 %	0 %	451816812
510	NC_020297	AGA	2	6	24397	24402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816812
511	NC_020297	AGCAA	2	10	24483	24492	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
512	NC_020297	AAG	2	6	24500	24505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020297	ATT	2	6	24557	24562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020297	CCA	2	6	24605	24610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_020297	T	6	6	24629	24634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020297	TGCC	2	8	24661	24668	0 %	25 %	25 %	50 %	451816813
517	NC_020297	AAGATG	2	12	24720	24731	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	451816813
518	NC_020297	AAT	2	6	24733	24738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816813
519	NC_020297	GAA	2	6	24785	24790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816813
520	NC_020297	GAATT	2	10	24822	24831	40 %	40 %	20 %	0 %	451816813
521	NC_020297	TTA	2	6	24907	24912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816813
522	NC_020297	ATT	2	6	24945	24950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816813
523	NC_020297	TTA	2	6	25083	25088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816813
524	NC_020297	T	6	6	25207	25212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020297	CAC	2	6	25219	25224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816814
526	NC_020297	AAG	2	6	25232	25237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816814
527	NC_020297	AAAAC	2	10	25271	25280	80 %	0 %	0 %	20 %	451816814
528	NC_020297	CAT	2	6	25293	25298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816814
529	NC_020297	GAA	2	6	25396	25401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816814
530	NC_020297	ACG	2	6	25409	25414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816814
531	NC_020297	TAT	2	6	25420	25425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816814
532	NC_020297	ACC	2	6	25448	25453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816814
533	NC_020297	C	6	6	25494	25499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
534	NC_020297	CCA	2	6	25509	25514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_020297	TTTA	2	8	25574	25581	25 %	75 %	0 %	0 %	451816815
536	NC_020297	TC	3	6	25582	25587	0 %	50 %	0 %	50 %	451816815
537	NC_020297	TGAA	2	8	25683	25690	50 %	25 %	25 %	0 %	451816815
538	NC_020297	GAA	2	6	25718	25723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816815
539	NC_020297	AGA	2	6	25734	25739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020297	GGA	2	6	25818	25823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020297	TGA	2	6	25870	25875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020297	ACA	2	6	25923	25928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_020297	GAT	2	6	25996	26001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020297	GAA	2	6	26009	26014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020297	C	6	6	26052	26057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
546	NC_020297	CCA	2	6	26067	26072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_020297	ACC	2	6	26102	26107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816816
548	NC_020297	ACC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816816
549	NC_020297	CGA	2	6	26149	26154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816816
550	NC_020297	AATC	2	8	26384	26391	50 %	25 %	0 %	25 %	451816816
551	NC_020297	AAAG	2	8	26440	26447	75 %	0 %	25 %	0 %	451816816
552	NC_020297	GAA	2	6	26479	26484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816816
553	NC_020297	GAA	2	6	26627	26632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816816
554	NC_020297	TGA	2	6	26640	26645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816816
555	NC_020297	A	8	8	26686	26693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020297	C	6	6	26788	26793	0 %	0 %	0 %	100 %	451816817
557	NC_020297	A	7	7	26808	26814	100 %	0 %	0 %	0 %	451816817
558	NC_020297	CAAAAA	2	12	26819	26830	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	451816817
559	NC_020297	CGA	2	6	26882	26887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816817
560	NC_020297	G	6	6	26900	26905	0 %	0 %	100 %	0 %	451816817
561	NC_020297	ATC	2	6	26919	26924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816817
562	NC_020297	CAA	2	6	26931	26936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816817
563	NC_020297	CAGG	2	8	26999	27006	25 %	0 %	50 %	25 %	451816817
564	NC_020297	ATTG	2	8	27024	27031	25 %	50 %	25 %	0 %	451816817
565	NC_020297	AAAC	2	8	27125	27132	75 %	0 %	0 %	25 %	451816817
566	NC_020297	ACAG	2	8	27173	27180	50 %	0 %	25 %	25 %	451816817
567	NC_020297	GAA	2	6	27207	27212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816817
568	NC_020297	TAAA	2	8	27240	27247	75 %	25 %	0 %	0 %	451816817
569	NC_020297	T	6	6	27392	27397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020297	CT	3	6	27465	27470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_020297	T	6	6	27490	27495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020297	CTA	2	6	27523	27528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_020297	A	6	6	27551	27556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020297	TTC	2	6	27627	27632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816818
575	NC_020297	A	6	6	27650	27655	100 %	0 %	0 %	0 %	451816818
576	NC_020297	A	6	6	27666	27671	100 %	0 %	0 %	0 %	451816818
577	NC_020297	A	7	7	27689	27695	100 %	0 %	0 %	0 %	451816818
578	NC_020297	GGA	2	6	27722	27727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816818
579	NC_020297	AAC	2	6	27805	27810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_020297	CTTG	2	8	27829	27836	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_020297	GCG	2	6	27837	27842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_020297	AGAA	2	8	27891	27898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020297	AAG	2	6	27925	27930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020297	AGG	2	6	27943	27948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020297	C	6	6	28003	28008	0 %	0 %	0 %	100 %	451816819
586	NC_020297	GCC	2	6	28066	28071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816819
587	NC_020297	TGG	2	6	28127	28132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
588	NC_020297	A	6	6	28261	28266	100 %	0 %	0 %	0 %	451816819
589	NC_020297	AGG	2	6	28270	28275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816819
590	NC_020297	AACGGC	2	12	28303	28314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816819
591	NC_020297	TCG	2	6	28337	28342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
592	NC_020297	ATT	2	6	28431	28436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816819
593	NC_020297	AAC	2	6	28527	28532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816819
594	NC_020297	TGGGA	2	10	28536	28545	20 %	20 %	60 %	0 %	451816819
595	NC_020297	GGT	2	6	28553	28558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
596	NC_020297	AAG	2	6	28650	28655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816819
597	NC_020297	CGGAT	2	10	28743	28752	20 %	20 %	40 %	20 %	451816819
598	NC_020297	TG	3	6	28753	28758	0 %	50 %	50 %	0 %	451816819
599	NC_020297	CGC	3	9	28781	28789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816819
600	NC_020297	AACC	2	8	28970	28977	50 %	0 %	0 %	50 %	451816819
601	NC_020297	TGG	2	6	28992	28997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
602	NC_020297	G	7	7	29187	29193	0 %	0 %	100 %	0 %	451816819
603	NC_020297	A	7	7	29239	29245	100 %	0 %	0 %	0 %	451816819
604	NC_020297	CCA	2	6	29534	29539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
605	NC_020297	ACT	2	6	29584	29589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816819
606	NC_020297	ATT	2	6	29646	29651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816819
607	NC_020297	GTG	2	6	29700	29705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
608	NC_020297	CGG	2	6	29719	29724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816819
609	NC_020297	CCA	2	6	29734	29739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
610	NC_020297	TCG	2	6	29789	29794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
611	NC_020297	ATC	2	6	29807	29812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816819
612	NC_020297	A	7	7	29818	29824	100 %	0 %	0 %	0 %	451816819
613	NC_020297	ACT	2	6	29933	29938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816819
614	NC_020297	AACGGG	2	12	29965	29976	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	451816819
615	NC_020297	CCG	2	6	30083	30088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816819
616	NC_020297	CGA	2	6	30115	30120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816819
617	NC_020297	GGA	2	6	30128	30133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816819
618	NC_020297	CTG	2	6	30228	30233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
619	NC_020297	ATCG	2	8	30240	30247	25 %	25 %	25 %	25 %	451816819
620	NC_020297	CCA	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
621	NC_020297	GGGGT	2	10	30422	30431	0 %	20 %	80 %	0 %	451816819
622	NC_020297	ATT	2	6	30485	30490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816819
623	NC_020297	GTA	2	6	30580	30585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816819
624	NC_020297	ACC	2	6	30703	30708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
625	NC_020297	GTC	2	6	30742	30747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
626	NC_020297	CCAT	2	8	30817	30824	25 %	25 %	0 %	50 %	451816819
627	NC_020297	C	6	6	30886	30891	0 %	0 %	0 %	100 %	451816819
628	NC_020297	CAC	2	6	30953	30958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816819
629	NC_020297	GTC	2	6	30991	30996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816819
630	NC_020297	AACTG	2	10	31067	31076	40 %	20 %	20 %	20 %	451816819
631	NC_020297	GGA	2	6	31121	31126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816819
632	NC_020297	GCC	2	6	31130	31135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816819
633	NC_020297	GTG	2	6	31185	31190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816819
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