MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM_M

Total Repeats: 2290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020296	T	6	6	55	60	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020296	TTA	2	6	148	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020296	ATT	2	6	201	206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816544
4	NC_020296	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	451816544
5	NC_020296	CGG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816544
6	NC_020296	ATC	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020296	AGA	2	6	475	480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020296	T	7	7	489	495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020296	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020296	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	451816545
11	NC_020296	TAG	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816545
12	NC_020296	TTG	2	6	698	703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816545
13	NC_020296	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816545
14	NC_020296	CAT	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816545
15	NC_020296	CCGA	2	8	865	872	25 %	0 %	25 %	50 %	451816545
16	NC_020296	AG	3	6	952	957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020296	TTG	2	6	1089	1094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020296	TCT	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816546
19	NC_020296	CGC	2	6	1238	1243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816546
20	NC_020296	ATA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816546
21	NC_020296	ACA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816546
22	NC_020296	TTAA	2	8	1416	1423	50 %	50 %	0 %	0 %	451816546
23	NC_020296	TCA	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816546
24	NC_020296	CTA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816547
25	NC_020296	ATG	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816547
26	NC_020296	CGC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816547
27	NC_020296	ATA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816547
28	NC_020296	CAG	2	6	1843	1848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020296	TTAC	2	8	1913	1920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020296	AG	3	6	1948	1953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020296	ATT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020296	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020296	AAT	2	6	2030	2035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020296	AAG	2	6	2052	2057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020296	TAA	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020296	TAT	2	6	2112	2117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020296	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020296	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020296	ACAAA	2	10	2177	2186	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020296	AATCA	2	10	2222	2231	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020296	CT	3	6	2233	2238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020296	TCG	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020296	CTG	2	6	2278	2283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020296	TAT	2	6	2290	2295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020296	TC	3	6	2323	2328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_020296	CTC	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_020296	ATT	2	6	2419	2424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020296	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020296	TCTA	2	8	2489	2496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020296	CCT	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816548
51	NC_020296	GCC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
52	NC_020296	TGT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
53	NC_020296	CAGT	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
54	NC_020296	GGC	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
55	NC_020296	CGC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
56	NC_020296	AAC	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
57	NC_020296	GGA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816548
58	NC_020296	TAC	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
59	NC_020296	TAGAGC	2	12	3060	3071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816548
60	NC_020296	CAC	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816548
61	NC_020296	GAT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
62	NC_020296	CCTC	2	8	3230	3237	0 %	25 %	0 %	75 %	451816548
63	NC_020296	TTG	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
64	NC_020296	CTT	2	6	3291	3296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816548
65	NC_020296	T	6	6	3316	3321	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
66	NC_020296	TGCC	2	8	3360	3367	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
67	NC_020296	TAC	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
68	NC_020296	ACA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
69	NC_020296	AGA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
70	NC_020296	GTTT	2	8	3477	3484	0 %	75 %	25 %	0 %	451816548
71	NC_020296	GAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
72	NC_020296	CGG	2	6	3667	3672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
73	NC_020296	GGAG	2	8	3877	3884	25 %	0 %	75 %	0 %	451816548
74	NC_020296	ATG	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
75	NC_020296	TGG	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
76	NC_020296	AGG	2	6	4036	4041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816548
77	NC_020296	ACA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
78	NC_020296	GCC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
79	NC_020296	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
80	NC_020296	AG	3	6	4236	4241	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
81	NC_020296	TTA	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816548
82	NC_020296	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
83	NC_020296	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
84	NC_020296	ACG	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816548
85	NC_020296	AAT	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816548
86	NC_020296	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816548
87	NC_020296	GTT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
88	NC_020296	CAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
89	NC_020296	TGG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
90	NC_020296	AAC	2	6	4850	4855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
91	NC_020296	TCAG	2	8	4872	4879	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
92	NC_020296	GGA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816548
93	NC_020296	TTAAT	2	10	4914	4923	40 %	60 %	0 %	0 %	451816548
94	NC_020296	CTAA	2	8	4943	4950	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
95	NC_020296	T	6	6	4982	4987	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
96	NC_020296	CAAT	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
97	NC_020296	ACC	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816548
98	NC_020296	CTGG	2	8	5105	5112	0 %	25 %	50 %	25 %	451816548
99	NC_020296	TTA	2	6	5190	5195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816548
100	NC_020296	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
101	NC_020296	GAT	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
102	NC_020296	CTA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
103	NC_020296	TCCG	2	8	5321	5328	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
104	NC_020296	ATG	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
105	NC_020296	GGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
106	NC_020296	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
107	NC_020296	ATC	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
108	NC_020296	AGGA	2	8	5796	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
109	NC_020296	CGG	2	6	5826	5831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
110	NC_020296	CAA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
111	NC_020296	CCG	3	9	5934	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
112	NC_020296	AT	3	6	6099	6104	50 %	50 %	0 %	0 %	451816548
113	NC_020296	TAAC	2	8	6123	6130	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
114	NC_020296	GAT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
115	NC_020296	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
116	NC_020296	TGA	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
117	NC_020296	CAT	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
118	NC_020296	TGT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
119	NC_020296	CCG	2	6	6298	6303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816548
120	NC_020296	AGA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
121	NC_020296	A	6	6	6360	6365	100 %	0 %	0 %	0 %	451816548
122	NC_020296	ACA	2	6	6435	6440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
123	NC_020296	C	6	6	6461	6466	0 %	0 %	0 %	100 %	451816548
124	NC_020296	TC	3	6	6474	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	451816548
125	NC_020296	AACTTT	2	12	6494	6505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	451816548
126	NC_020296	AGA	2	6	6649	6654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
127	NC_020296	TGT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
128	NC_020296	CAC	2	6	6772	6777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816548
129	NC_020296	AAG	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
130	NC_020296	TGG	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
131	NC_020296	TGT	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816548
132	NC_020296	GA	3	6	7024	7029	50 %	0 %	50 %	0 %	451816548
133	NC_020296	GAA	2	6	7049	7054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
134	NC_020296	TAC	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816548
135	NC_020296	CCCAA	2	10	7129	7138	40 %	0 %	0 %	60 %	451816548
136	NC_020296	AAC	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816548
137	NC_020296	AAG	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
138	NC_020296	TGA	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
139	NC_020296	TCAG	2	8	7462	7469	25 %	25 %	25 %	25 %	451816548
140	NC_020296	TGG	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
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142	NC_020296	GCAGTA	2	12	7557	7568	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	451816548
143	NC_020296	AAG	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
144	NC_020296	GTG	2	6	7632	7637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
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150	NC_020296	TGA	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
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152	NC_020296	TGA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
153	NC_020296	CGGATG	2	12	7950	7961	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	451816548
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159	NC_020296	GGC	2	6	8095	8100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816548
160	NC_020296	TGA	2	6	8125	8130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816548
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162	NC_020296	TAA	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816548
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164	NC_020296	CAAT	2	8	8317	8324	50 %	25 %	0 %	25 %	451816548
165	NC_020296	GTCC	2	8	8357	8364	0 %	25 %	25 %	50 %	451816548
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168	NC_020296	TGG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
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254	NC_020296	AGCG	2	8	12685	12692	25 %	0 %	50 %	25 %	451816548
255	NC_020296	GAA	2	6	12764	12769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816548
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257	NC_020296	GTGGA	2	10	12789	12798	20 %	20 %	60 %	0 %	451816548
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261	NC_020296	G	6	6	12864	12869	0 %	0 %	100 %	0 %	451816548
262	NC_020296	CCA	2	6	12969	12974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816548
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264	NC_020296	TGG	2	6	13044	13049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
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268	NC_020296	T	6	6	13232	13237	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
269	NC_020296	T	6	6	13281	13286	0 %	100 %	0 %	0 %	451816548
270	NC_020296	TGG	2	6	13410	13415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
271	NC_020296	TGG	3	9	13437	13445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816548
272	NC_020296	CCGG	2	8	13555	13562	0 %	0 %	50 %	50 %	451816548
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282	NC_020296	GTCT	2	8	14170	14177	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_020296	T	6	6	14322	14327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_020296	ATC	2	6	15008	15013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816549
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303	NC_020296	CTTT	2	8	15558	15565	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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305	NC_020296	ATT	2	6	15623	15628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_020296	A	7	7	20613	20619	100 %	0 %	0 %	0 %	451816557
399	NC_020296	TTGTT	2	10	20625	20634	0 %	80 %	20 %	0 %	451816557
400	NC_020296	T	6	6	20647	20652	0 %	100 %	0 %	0 %	451816557
401	NC_020296	TAAT	2	8	20672	20679	50 %	50 %	0 %	0 %	451816557
402	NC_020296	CAT	2	6	20693	20698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816557
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404	NC_020296	TCG	2	6	20749	20754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816557
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484	NC_020296	ATT	2	6	24445	24450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816563
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498	NC_020296	GCG	2	6	25290	25295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816565
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500	NC_020296	AATT	2	8	25358	25365	50 %	50 %	0 %	0 %	451816565

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