MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSG_M

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020288	CA	3	6	2895	2900	50 %	0 %	0 %	50 %	451816491
2	NC_020288	CA	3	6	3412	3417	50 %	0 %	0 %	50 %	451816492
3	NC_020288	GA	3	6	3519	3524	50 %	0 %	50 %	0 %	451816492
4	NC_020288	AG	3	6	3919	3924	50 %	0 %	50 %	0 %	451816494
5	NC_020288	AT	3	6	4371	4376	50 %	50 %	0 %	0 %	451816494
6	NC_020288	TC	3	6	4377	4382	0 %	50 %	0 %	50 %	451816494
7	NC_020288	CA	3	6	6928	6933	50 %	0 %	0 %	50 %	451816499
8	NC_020288	AG	3	6	7696	7701	50 %	0 %	50 %	0 %	451816499
9	NC_020288	GA	3	6	8720	8725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020288	AT	3	6	9112	9117	50 %	50 %	0 %	0 %	451816501
11	NC_020288	AG	4	8	9992	9999	50 %	0 %	50 %	0 %	451816504
12	NC_020288	AT	3	6	11549	11554	50 %	50 %	0 %	0 %	451816506
13	NC_020288	AG	3	6	11883	11888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020288	GA	3	6	12930	12935	50 %	0 %	50 %	0 %	451816507
15	NC_020288	CA	3	6	13270	13275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020288	AG	3	6	13280	13285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020288	GA	4	8	15544	15551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020288	CT	3	6	16662	16667	0 %	50 %	0 %	50 %	451816509
19	NC_020288	CT	3	6	17509	17514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020288	AT	3	6	17600	17605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020288	AC	3	6	17788	17793	50 %	0 %	0 %	50 %	451816510
22	NC_020288	CT	4	8	17938	17945	0 %	50 %	0 %	50 %	451816510
23	NC_020288	TC	3	6	18454	18459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020288	GA	3	6	19959	19964	50 %	0 %	50 %	0 %	451816513
25	NC_020288	TC	3	6	20390	20395	0 %	50 %	0 %	50 %	451816513
26	NC_020288	GT	3	6	20516	20521	0 %	50 %	50 %	0 %	451816513
27	NC_020288	AT	3	6	21657	21662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020288	AT	4	8	21666	21673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020288	AG	4	8	21975	21982	50 %	0 %	50 %	0 %	451816515
30	NC_020288	AG	3	6	22828	22833	50 %	0 %	50 %	0 %	451816516
31	NC_020288	CT	3	6	23665	23670	0 %	50 %	0 %	50 %	451816517
32	NC_020288	AT	3	6	24814	24819	50 %	50 %	0 %	0 %	451816519
33	NC_020288	AT	3	6	25515	25520	50 %	50 %	0 %	0 %	451816520
34	NC_020288	CT	3	6	25670	25675	0 %	50 %	0 %	50 %	451816520
35	NC_020288	GC	3	6	29880	29885	0 %	0 %	50 %	50 %	451816524
36	NC_020288	AC	3	6	30511	30516	50 %	0 %	0 %	50 %	451816525
37	NC_020288	GT	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	451816528
38	NC_020288	TA	3	6	39371	39376	50 %	50 %	0 %	0 %	451816533
39	NC_020288	TC	3	6	39462	39467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020288	TA	3	6	39486	39491	50 %	50 %	0 %	0 %	451816534
41	NC_020288	TA	3	6	39836	39841	50 %	50 %	0 %	0 %	451816534
42	NC_020288	CT	3	6	39892	39897	0 %	50 %	0 %	50 %	451816534
43	NC_020288	AC	3	6	39936	39941	50 %	0 %	0 %	50 %	451816534
44	NC_020288	AG	3	6	40818	40823	50 %	0 %	50 %	0 %	451816534
45	NC_020288	GA	3	6	41004	41009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020288	TA	3	6	41095	41100	50 %	50 %	0 %	0 %	451816535
47	NC_020288	TG	3	6	43387	43392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020288	GA	3	6	44205	44210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020288	GT	3	6	44258	44263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.