MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA_M

Total Repeats: 1231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020287	AAT	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020287	ATC	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020287	TCA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020287	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816675
5	NC_020287	TTA	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816675
6	NC_020287	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816675
7	NC_020287	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816675
8	NC_020287	CTT	3	9	382	390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816675
9	NC_020287	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816675
10	NC_020287	TCA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816675
11	NC_020287	CCA	2	6	497	502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_020287	CTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020287	TCC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020287	CCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816676
15	NC_020287	ACT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816676
16	NC_020287	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816676
17	NC_020287	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
18	NC_020287	TGT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816676
19	NC_020287	TAT	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
20	NC_020287	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816676
21	NC_020287	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816676
22	NC_020287	TCT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816676
23	NC_020287	AAC	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020287	ATT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816677
25	NC_020287	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816677
26	NC_020287	CTC	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816677
27	NC_020287	TTG	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816677
28	NC_020287	CGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816677
29	NC_020287	TAA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816677
30	NC_020287	CCA	3	9	1987	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816678
31	NC_020287	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816678
32	NC_020287	CAA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020287	CAT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020287	TGG	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020287	AAT	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020287	AAT	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020287	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816679
38	NC_020287	TGA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816679
39	NC_020287	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816679
40	NC_020287	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816679
41	NC_020287	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816679
42	NC_020287	GAT	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816679
43	NC_020287	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816679
44	NC_020287	TAT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020287	CTA	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816680
46	NC_020287	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816680
47	NC_020287	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816680
48	NC_020287	AAG	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816680
49	NC_020287	TGT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816680
50	NC_020287	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816680
51	NC_020287	TTG	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816680
52	NC_020287	ATT	3	9	3370	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816681
53	NC_020287	CGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816681
54	NC_020287	ATC	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816681
55	NC_020287	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816681
56	NC_020287	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816681
57	NC_020287	TAG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816681
58	NC_020287	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020287	CCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020287	CCA	2	6	3800	3805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_020287	TTC	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020287	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020287	AAC	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020287	ATC	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020287	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020287	AAT	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020287	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020287	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
69	NC_020287	GAG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816682
70	NC_020287	GAG	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816682
71	NC_020287	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
72	NC_020287	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816682
73	NC_020287	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
74	NC_020287	AGA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816682
75	NC_020287	AAT	2	6	4820	4825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816682
76	NC_020287	TGA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
77	NC_020287	AAG	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816682
78	NC_020287	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816682
79	NC_020287	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816682
80	NC_020287	ATT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020287	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816683
82	NC_020287	CTC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451816683
83	NC_020287	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816683
84	NC_020287	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816683
85	NC_020287	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816683
86	NC_020287	CTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816683
87	NC_020287	CAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816683
88	NC_020287	TAT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020287	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816684
90	NC_020287	TAG	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
91	NC_020287	CAG	3	9	6700	6708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816684
92	NC_020287	ATC	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816684
93	NC_020287	ATT	2	6	6816	6821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816684
94	NC_020287	TGA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
95	NC_020287	GCG	2	6	7000	7005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	451816684
96	NC_020287	ATT	2	6	7297	7302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816684
97	NC_020287	AGT	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
98	NC_020287	GTC	2	6	7559	7564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816684
99	NC_020287	AGA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816684
100	NC_020287	CAC	2	6	7709	7714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816684
101	NC_020287	TGG	2	6	7900	7905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816684
102	NC_020287	TCT	2	6	7969	7974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816684
103	NC_020287	AGC	2	6	8079	8084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451816684
104	NC_020287	AGA	2	6	8106	8111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816684
105	NC_020287	GTT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816684
106	NC_020287	AAT	2	6	8323	8328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816684
107	NC_020287	ATG	2	6	8435	8440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816684
108	NC_020287	CCA	2	6	8492	8497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816684
109	NC_020287	ACA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
110	NC_020287	CTT	2	6	8540	8545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816685
111	NC_020287	GAA	2	6	8627	8632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816685
112	NC_020287	GGT	2	6	8657	8662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816685
113	NC_020287	AAC	2	6	8791	8796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
114	NC_020287	ATA	2	6	8925	8930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816685
115	NC_020287	ACA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
116	NC_020287	ATC	2	6	9126	9131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816685
117	NC_020287	CTA	2	6	9201	9206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816685
118	NC_020287	ACC	2	6	9264	9269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451816685
119	NC_020287	ACA	2	6	9281	9286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
120	NC_020287	CTG	2	6	9474	9479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451816685
121	NC_020287	TTA	2	6	9539	9544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816685
122	NC_020287	CAA	2	6	9595	9600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
123	NC_020287	GGA	2	6	9805	9810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816685
124	NC_020287	GAA	2	6	9953	9958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816685
125	NC_020287	AAC	2	6	10107	10112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
126	NC_020287	TAA	2	6	10195	10200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816685
127	NC_020287	AGG	2	6	10210	10215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451816685
128	NC_020287	CAA	2	6	10310	10315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
129	NC_020287	AGT	2	6	10360	10365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816685
130	NC_020287	CAA	3	9	10435	10443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816685
131	NC_020287	AGA	2	6	10528	10533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816685
132	NC_020287	TTG	2	6	10631	10636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816685
133	NC_020287	GCC	2	6	10823	10828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451816685
134	NC_020287	GTA	2	6	10830	10835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816685
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260	NC_020287	ATA	2	6	19221	19226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816694
261	NC_020287	ATA	2	6	19299	19304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816694
262	NC_020287	ATA	2	6	19377	19382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816694
263	NC_020287	ATA	2	6	19455	19460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816694
264	NC_020287	CTT	2	6	19528	19533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451816694
265	NC_020287	CAT	2	6	19765	19770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451816694
266	NC_020287	GGT	2	6	19869	19874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
267	NC_020287	ATC	2	6	19885	19890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_020287	AGA	2	6	20039	20044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816695
269	NC_020287	GAA	2	6	20082	20087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816695
270	NC_020287	GTT	2	6	20154	20159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	451816695
271	NC_020287	ACA	2	6	20165	20170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816695
272	NC_020287	GAA	2	6	20265	20270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816695
273	NC_020287	TGG	2	6	20351	20356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816695
274	NC_020287	TGG	2	6	20533	20538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816695
275	NC_020287	ATT	2	6	20637	20642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816695
276	NC_020287	GAT	2	6	20652	20657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816695
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280	NC_020287	AAT	2	6	20904	20909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816695
281	NC_020287	ATG	2	6	20986	20991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451816695
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292	NC_020287	ATT	2	6	22047	22052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451816696
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297	NC_020287	ACA	2	6	22470	22475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451816697
298	NC_020287	TCA	2	6	22506	22511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_020287	TGG	2	6	22577	22582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451816698
300	NC_020287	AAT	2	6	22610	22615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451816698
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372	NC_020287	CCA	2	6	29328	29333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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383	NC_020287	ATG	2	6	30226	30231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
384	NC_020287	AGA	2	6	30472	30477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451816708
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