MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw5 genomic sequence

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020267	AATC	2	8	397	404	50 %	25 %	0 %	25 %	449338617
2	NC_020267	TTGA	2	8	488	495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020267	AATC	2	8	956	963	50 %	25 %	0 %	25 %	449338618
4	NC_020267	GTAT	2	8	1379	1386	25 %	50 %	25 %	0 %	449338619
5	NC_020267	AAGG	2	8	1588	1595	50 %	0 %	50 %	0 %	449338619
6	NC_020267	ATTT	2	8	1837	1844	25 %	75 %	0 %	0 %	449338620
7	NC_020267	AATG	2	8	2471	2478	50 %	25 %	25 %	0 %	449338621
8	NC_020267	AAAT	2	8	2977	2984	75 %	25 %	0 %	0 %	449338621
9	NC_020267	TAAC	2	8	3001	3008	50 %	25 %	0 %	25 %	449338621
10	NC_020267	ATTA	2	8	3067	3074	50 %	50 %	0 %	0 %	449338622
11	NC_020267	CATT	2	8	3309	3316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020267	AATT	2	8	3506	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	449338623
13	NC_020267	CAAA	2	8	3927	3934	75 %	0 %	0 %	25 %	449338623
14	NC_020267	ATTT	2	8	4487	4494	25 %	75 %	0 %	0 %	449338623
15	NC_020267	AAAC	2	8	5167	5174	75 %	0 %	0 %	25 %	449338624
16	NC_020267	CAAT	2	8	5393	5400	50 %	25 %	0 %	25 %	449338624
17	NC_020267	TTAT	2	8	5726	5733	25 %	75 %	0 %	0 %	449338624
18	NC_020267	TAAA	2	8	6590	6597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020267	ATTA	2	8	6656	6663	50 %	50 %	0 %	0 %	449338626
20	NC_020267	GATC	2	8	7004	7011	25 %	25 %	25 %	25 %	449338626
21	NC_020267	AATT	2	8	7107	7114	50 %	50 %	0 %	0 %	449338626
22	NC_020267	AAAT	2	8	7211	7218	75 %	25 %	0 %	0 %	449338626
23	NC_020267	ACAA	2	8	7797	7804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020267	ACAT	2	8	8349	8356	50 %	25 %	0 %	25 %	449338627
25	NC_020267	AATA	2	8	9014	9021	75 %	25 %	0 %	0 %	449338628
26	NC_020267	TTGA	2	8	9078	9085	25 %	50 %	25 %	0 %	449338628
27	NC_020267	TTAT	2	8	9310	9317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020267	CAAA	2	8	9424	9431	75 %	0 %	0 %	25 %	449338629
29	NC_020267	AATA	2	8	9620	9627	75 %	25 %	0 %	0 %	449338629
30	NC_020267	TGCT	2	8	9674	9681	0 %	50 %	25 %	25 %	449338629
31	NC_020267	ATTG	2	8	9688	9695	25 %	50 %	25 %	0 %	449338629
32	NC_020267	AATT	2	8	9839	9846	50 %	50 %	0 %	0 %	449338629
33	NC_020267	TTGT	2	8	10189	10196	0 %	75 %	25 %	0 %	449338630
34	NC_020267	AATA	2	8	11178	11185	75 %	25 %	0 %	0 %	449338631
35	NC_020267	CATT	2	8	11619	11626	25 %	50 %	0 %	25 %	449338631
36	NC_020267	TCAA	2	8	11935	11942	50 %	25 %	0 %	25 %	449338631
37	NC_020267	ACAT	2	8	12574	12581	50 %	25 %	0 %	25 %	449338632
38	NC_020267	TAAA	2	8	14012	14019	75 %	25 %	0 %	0 %	449338633
39	NC_020267	TACT	2	8	14264	14271	25 %	50 %	0 %	25 %	449338633
40	NC_020267	TAAA	2	8	14558	14565	75 %	25 %	0 %	0 %	449338633
41	NC_020267	AAAT	2	8	14703	14710	75 %	25 %	0 %	0 %	449338633
42	NC_020267	AAAG	2	8	14941	14948	75 %	0 %	25 %	0 %	449338633
43	NC_020267	TAAG	2	8	15266	15273	50 %	25 %	25 %	0 %	449338635
44	NC_020267	ACAA	2	8	15494	15501	75 %	0 %	0 %	25 %	449338635
45	NC_020267	TAAT	2	8	15780	15787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020267	ACAT	2	8	16007	16014	50 %	25 %	0 %	25 %	449338636
47	NC_020267	TCTT	2	8	16251	16258	0 %	75 %	0 %	25 %	449338637

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.