MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw4 genomic sequence

Total Repeats: 489

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020266	ATGT	2	8	53	60	25 %	50 %	25 %	0 %	449338591
2	NC_020266	TCA	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338591
3	NC_020266	TAA	2	6	139	144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338591
4	NC_020266	T	6	6	147	152	0 %	100 %	0 %	0 %	449338591
5	NC_020266	TTC	2	6	160	165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338591
6	NC_020266	ATG	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338591
7	NC_020266	AT	3	6	257	262	50 %	50 %	0 %	0 %	449338591
8	NC_020266	TAG	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338591
9	NC_020266	AGA	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020266	ATTAT	2	10	374	383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020266	CAT	2	6	551	556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338592
12	NC_020266	TTAA	2	8	625	632	50 %	50 %	0 %	0 %	449338592
13	NC_020266	TAT	2	6	647	652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338592
14	NC_020266	T	6	6	675	680	0 %	100 %	0 %	0 %	449338592
15	NC_020266	TTTA	2	8	714	721	25 %	75 %	0 %	0 %	449338592
16	NC_020266	AGC	2	6	735	740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338592
17	NC_020266	T	6	6	756	761	0 %	100 %	0 %	0 %	449338592
18	NC_020266	TAATT	2	10	778	787	40 %	60 %	0 %	0 %	449338592
19	NC_020266	GTT	2	6	839	844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338592
20	NC_020266	T	6	6	849	854	0 %	100 %	0 %	0 %	449338592
21	NC_020266	CCA	2	6	859	864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338592
22	NC_020266	TAT	2	6	893	898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338592
23	NC_020266	ATC	2	6	987	992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338592
24	NC_020266	T	7	7	1007	1013	0 %	100 %	0 %	0 %	449338592
25	NC_020266	TTA	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338592
26	NC_020266	T	8	8	1164	1171	0 %	100 %	0 %	0 %	449338592
27	NC_020266	GCAATT	2	12	1231	1242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	449338592
28	NC_020266	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020266	TAT	2	6	1339	1344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020266	AAT	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020266	AAG	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020266	TAA	2	6	1382	1387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
33	NC_020266	GTA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338593
34	NC_020266	T	6	6	1429	1434	0 %	100 %	0 %	0 %	449338593
35	NC_020266	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
36	NC_020266	TGCT	2	8	1496	1503	0 %	50 %	25 %	25 %	449338593
37	NC_020266	TAA	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
38	NC_020266	AAT	2	6	1558	1563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
39	NC_020266	CATAA	2	10	1603	1612	60 %	20 %	0 %	20 %	449338593
40	NC_020266	ACC	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338593
41	NC_020266	ATA	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
42	NC_020266	TTA	2	6	1709	1714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
43	NC_020266	TTA	2	6	1741	1746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
44	NC_020266	A	7	7	1793	1799	100 %	0 %	0 %	0 %	449338593
45	NC_020266	GATAC	2	10	1807	1816	40 %	20 %	20 %	20 %	449338593
46	NC_020266	A	8	8	1834	1841	100 %	0 %	0 %	0 %	449338593
47	NC_020266	AT	3	6	1899	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
48	NC_020266	AT	3	6	1956	1961	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
49	NC_020266	TCT	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338593
50	NC_020266	AAAG	2	8	2069	2076	75 %	0 %	25 %	0 %	449338593
51	NC_020266	TAA	2	6	2118	2123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
52	NC_020266	TAT	2	6	2160	2165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
53	NC_020266	T	6	6	2188	2193	0 %	100 %	0 %	0 %	449338593
54	NC_020266	AT	3	6	2201	2206	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
55	NC_020266	CATT	2	8	2212	2219	25 %	50 %	0 %	25 %	449338593
56	NC_020266	AGA	2	6	2245	2250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338593
57	NC_020266	TTAA	2	8	2251	2258	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
58	NC_020266	AAG	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338593
59	NC_020266	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	449338593
60	NC_020266	AATT	2	8	2291	2298	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
61	NC_020266	T	6	6	2322	2327	0 %	100 %	0 %	0 %	449338593
62	NC_020266	ATTATA	2	12	2375	2386	50 %	50 %	0 %	0 %	449338593
63	NC_020266	GAA	2	6	2472	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338593
64	NC_020266	AAAG	2	8	2503	2510	75 %	0 %	25 %	0 %	449338593
65	NC_020266	ATTT	2	8	2545	2552	25 %	75 %	0 %	0 %	449338593
66	NC_020266	CAT	2	6	2572	2577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338593
67	NC_020266	CTCAA	2	10	2735	2744	40 %	20 %	0 %	40 %	449338593
68	NC_020266	AATTA	2	10	2747	2756	60 %	40 %	0 %	0 %	449338593
69	NC_020266	TGGA	2	8	2791	2798	25 %	25 %	50 %	0 %	449338593
70	NC_020266	ATG	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338593
71	NC_020266	A	6	6	2875	2880	100 %	0 %	0 %	0 %	449338593
72	NC_020266	TCT	2	6	2896	2901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338593
73	NC_020266	ATT	2	6	2904	2909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
74	NC_020266	ACAGGT	2	12	2947	2958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449338593
75	NC_020266	TAA	2	6	2976	2981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338593
76	NC_020266	GGT	2	6	2984	2989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449338593
77	NC_020266	TAT	2	6	3022	3027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338593
78	NC_020266	A	6	6	3086	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	449338593
79	NC_020266	AATAT	2	10	3164	3173	60 %	40 %	0 %	0 %	449338594
80	NC_020266	A	6	6	3179	3184	100 %	0 %	0 %	0 %	449338594
81	NC_020266	AAG	2	6	3228	3233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
82	NC_020266	TA	3	6	3270	3275	50 %	50 %	0 %	0 %	449338594
83	NC_020266	A	6	6	3275	3280	100 %	0 %	0 %	0 %	449338594
84	NC_020266	ATTT	2	8	3311	3318	25 %	75 %	0 %	0 %	449338594
85	NC_020266	TCA	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338594
86	NC_020266	AGA	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
87	NC_020266	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338594
88	NC_020266	GAA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
89	NC_020266	GAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338594
90	NC_020266	ATA	2	6	3516	3521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020266	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020266	TAA	2	6	3563	3568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020266	TTA	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020266	TCTT	2	8	3627	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_020266	TA	3	6	3661	3666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020266	AT	3	6	3739	3744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020266	T	6	6	3744	3749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020266	TA	3	6	3775	3780	50 %	50 %	0 %	0 %	449338595
99	NC_020266	TGTT	2	8	3800	3807	0 %	75 %	25 %	0 %	449338595
100	NC_020266	TCT	2	6	3816	3821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338595
101	NC_020266	TGC	2	6	3914	3919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338595
102	NC_020266	T	6	6	3929	3934	0 %	100 %	0 %	0 %	449338595
103	NC_020266	TAA	2	6	3947	3952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338595
104	NC_020266	TCA	2	6	3979	3984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338595
105	NC_020266	AAT	2	6	4034	4039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338595
106	NC_020266	AATT	2	8	4082	4089	50 %	50 %	0 %	0 %	449338595
107	NC_020266	AAT	2	6	4150	4155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338595
108	NC_020266	ACC	2	6	4313	4318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020266	TACT	2	8	4339	4346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020266	TC	3	6	4380	4385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020266	TTAAG	2	10	4478	4487	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020266	AACG	2	8	4503	4510	50 %	0 %	25 %	25 %	449338596
113	NC_020266	GAG	2	6	4597	4602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338596
114	NC_020266	CAT	3	9	4731	4739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
115	NC_020266	T	7	7	4756	4762	0 %	100 %	0 %	0 %	449338596
116	NC_020266	TCA	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
117	NC_020266	CTT	2	6	4887	4892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338596
118	NC_020266	ATT	2	6	4900	4905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338596
119	NC_020266	ATCA	2	8	4906	4913	50 %	25 %	0 %	25 %	449338596
120	NC_020266	TTC	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338596
121	NC_020266	TAA	2	6	5002	5007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338596
122	NC_020266	ATTAAA	2	12	5012	5023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338596
123	NC_020266	TG	3	6	5054	5059	0 %	50 %	50 %	0 %	449338596
124	NC_020266	ATT	2	6	5074	5079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338596
125	NC_020266	CAA	2	6	5130	5135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338596
126	NC_020266	TCA	2	6	5139	5144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
127	NC_020266	T	6	6	5152	5157	0 %	100 %	0 %	0 %	449338596
128	NC_020266	TCC	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449338596
129	NC_020266	CAT	2	6	5284	5289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338596
130	NC_020266	AAT	2	6	5302	5307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338596
131	NC_020266	A	6	6	5332	5337	100 %	0 %	0 %	0 %	449338596
132	NC_020266	ATG	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338596
133	NC_020266	TGA	2	6	5405	5410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338596
134	NC_020266	TTCATG	2	12	5419	5430	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	449338596
135	NC_020266	CCT	2	6	5474	5479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020266	TA	3	6	5541	5546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020266	ATC	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_020266	TAT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020266	AT	3	6	5586	5591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020266	AT	3	6	5594	5599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020266	AT	3	6	5604	5609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020266	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_020266	AT	3	6	17883	17888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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