MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw3 genomic sequence

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020265	TAT	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020265	AGA	2	6	327	332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020265	GTA	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020265	GAT	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020265	AAC	2	6	437	442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020265	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020265	AAT	2	6	693	698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020265	ATA	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020265	ATA	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020265	AGA	2	6	920	925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
11	NC_020265	ATT	2	6	993	998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338587
12	NC_020265	GAA	2	6	1066	1071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
13	NC_020265	ACG	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338587
14	NC_020265	GAA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
15	NC_020265	ATT	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338587
16	NC_020265	AGA	2	6	1395	1400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338587
17	NC_020265	ACC	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449338588
18	NC_020265	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338588
19	NC_020265	TAT	2	6	1630	1635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338588
20	NC_020265	ATT	2	6	1652	1657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338588
21	NC_020265	ATG	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338588
22	NC_020265	AAG	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338588
23	NC_020265	GAC	2	6	1806	1811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338588
24	NC_020265	AGC	2	6	1839	1844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449338588
25	NC_020265	ATG	2	6	2007	2012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338589
26	NC_020265	AGA	3	9	2231	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
27	NC_020265	TTG	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338589
28	NC_020265	AAG	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
29	NC_020265	AAG	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
30	NC_020265	AGA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
31	NC_020265	AGA	2	6	2618	2623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
32	NC_020265	CAT	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338589
33	NC_020265	AAG	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
34	NC_020265	AAG	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338589
35	NC_020265	TTA	2	6	2778	2783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338589
36	NC_020265	GAG	2	6	2841	2846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338589
37	NC_020265	AGG	2	6	2882	2887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449338589
38	NC_020265	ATG	2	6	2911	2916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338589
39	NC_020265	AGC	2	6	2939	2944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020265	TAA	2	6	3026	3031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020265	TAA	3	9	3128	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020265	GAA	2	6	3282	3287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020265	GAA	2	6	3319	3324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.