MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid clone pvSw2 genomic sequence

Total Repeats: 114

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020264	ATG	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
2	NC_020264	TCA	2	6	505	510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338575
3	NC_020264	TAA	2	6	523	528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338575
4	NC_020264	TTC	2	6	544	549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338575
5	NC_020264	ATG	2	6	603	608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
6	NC_020264	TAG	2	6	673	678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338575
7	NC_020264	AGA	2	6	737	742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020264	ACA	2	6	844	849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020264	ATT	2	6	868	873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020264	TTG	2	6	889	894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020264	TAT	3	9	919	927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020264	TTG	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020264	ATT	2	6	1058	1063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338576
14	NC_020264	TCT	3	9	1066	1074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338576
15	NC_020264	CAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338576
16	NC_020264	AGT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338576
17	NC_020264	ATA	2	6	1224	1229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020264	TAA	3	9	1370	1378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020264	TAA	2	6	1485	1490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020264	TGA	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338577
21	NC_020264	ATG	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338577
22	NC_020264	CCT	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020264	GAC	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020264	TAT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020264	TAT	2	6	1848	1853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020264	TTC	2	6	2152	2157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338578
27	NC_020264	CTA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
28	NC_020264	TAT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
29	NC_020264	TAA	2	6	2346	2351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338578
30	NC_020264	TTA	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
31	NC_020264	CGT	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449338578
32	NC_020264	TCT	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338578
33	NC_020264	ATT	2	6	2539	2544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338578
34	NC_020264	CAT	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
35	NC_020264	CTA	2	6	2723	2728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
36	NC_020264	TCA	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338578
37	NC_020264	TAT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020264	CAT	2	6	2930	2935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020264	CAT	2	6	2942	2947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020264	GCG	2	6	3016	3021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020264	ACT	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020264	ACT	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020264	ACT	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020264	ACT	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020264	ACT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020264	AGT	2	6	3252	3257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020264	ATT	2	6	3409	3414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020264	GTA	2	6	3463	3468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020264	TAA	2	6	3479	3484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020264	TAA	2	6	3642	3647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020264	ATT	3	9	3664	3672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020264	ATG	2	6	3740	3745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020264	TCA	2	6	3752	3757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020264	TAA	2	6	3798	3803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338579
55	NC_020264	TAT	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338579
56	NC_020264	TTA	2	6	4006	4011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020264	ACC	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_020264	CAA	2	6	4174	4179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020264	ATC	2	6	4253	4258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338580
60	NC_020264	TGT	2	6	4343	4348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449338580
61	NC_020264	ATA	2	6	4629	4634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338581
62	NC_020264	GAG	2	6	4842	4847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020264	CAA	2	6	4964	4969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020264	CAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020264	TAA	2	6	5252	5257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020264	CAA	2	6	5332	5337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020264	TAT	3	9	5341	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020264	CAA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020264	AAT	2	6	5547	5552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020264	AAT	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020264	ATT	2	6	5624	5629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020264	GAA	2	6	5656	5661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020264	GAA	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020264	TTA	2	6	5789	5794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020264	GAT	2	6	5870	5875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020264	TAA	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020264	TTA	2	6	6005	6010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020264	TAA	3	9	6054	6062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020264	ATT	2	6	6096	6101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020264	TCT	3	9	6102	6110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020264	AAT	2	6	6119	6124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020264	TTA	2	6	6141	6146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020264	TTC	2	6	6185	6190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020264	GAT	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020264	AGT	2	6	6296	6301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020264	ATC	2	6	6308	6313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020264	TTC	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449338582
88	NC_020264	ATC	2	6	6473	6478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338582
89	NC_020264	CTC	2	6	6572	6577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020264	TTA	2	6	6594	6599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020264	AGG	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020264	ATA	2	6	6743	6748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
93	NC_020264	ACA	2	6	6782	6787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338583
94	NC_020264	ATC	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338583
95	NC_020264	GAA	2	6	6944	6949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
96	NC_020264	TAA	2	6	6970	6975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
97	NC_020264	GAT	2	6	7073	7078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338583
98	NC_020264	GAA	2	6	7085	7090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
99	NC_020264	TAT	3	9	7114	7122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449338583
100	NC_020264	CAA	2	6	7149	7154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449338583
101	NC_020264	TAA	2	6	7192	7197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
102	NC_020264	TGA	2	6	7213	7218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449338583
103	NC_020264	TAA	2	6	7246	7251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
104	NC_020264	AAG	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
105	NC_020264	ATA	2	6	7335	7340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338583
106	NC_020264	ATC	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338583
107	NC_020264	AAG	2	6	7380	7385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338583
108	NC_020264	ATA	2	6	7643	7648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020264	TAA	2	6	7678	7683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338584
110	NC_020264	CAT	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338584
111	NC_020264	GAA	2	6	7859	7864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449338584
112	NC_020264	AAT	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449338584
113	NC_020264	TCA	2	6	7874	7879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449338584
114	NC_020264	ATA	2	6	7936	7941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.