MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 1838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020247	AAGGG	2	10	1154	1163	40 %	0 %	60 %	0 %	449068324
2	NC_020247	AATAG	2	10	1561	1570	60 %	20 %	20 %	0 %	449068325
3	NC_020247	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020247	TATTT	2	10	7874	7883	20 %	80 %	0 %	0 %	449068334
5	NC_020247	CAAGC	2	10	8050	8059	40 %	0 %	20 %	40 %	449068334
6	NC_020247	ATAGA	2	10	8458	8467	60 %	20 %	20 %	0 %	449068335
7	NC_020247	CTAAA	2	10	8572	8581	60 %	20 %	0 %	20 %	449068335
8	NC_020247	TGCTT	2	10	9546	9555	0 %	60 %	20 %	20 %	449068337
9	NC_020247	TGAAT	2	10	11851	11860	40 %	40 %	20 %	0 %	449068340
10	NC_020247	CTTTT	2	10	13691	13700	0 %	80 %	0 %	20 %	449068343
11	NC_020247	ATTTG	2	10	14471	14480	20 %	60 %	20 %	0 %	449068344
12	NC_020247	GTTTT	2	10	16332	16341	0 %	80 %	20 %	0 %	449068346
13	NC_020247	CTTAC	2	10	16896	16905	20 %	40 %	0 %	40 %	449068347
14	NC_020247	TATCA	2	10	17066	17075	40 %	40 %	0 %	20 %	449068347
15	NC_020247	GGAAC	2	10	17290	17299	40 %	0 %	40 %	20 %	449068347
16	NC_020247	TTAAA	2	10	23335	23344	60 %	40 %	0 %	0 %	449068356
17	NC_020247	CAAAT	2	10	25619	25628	60 %	20 %	0 %	20 %	449068359
18	NC_020247	TAGAA	2	10	25671	25680	60 %	20 %	20 %	0 %	449068359
19	NC_020247	TATTG	2	10	29514	29523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020247	CATAA	2	10	29592	29601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020247	ATTTT	2	10	29630	29639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020247	ACAGT	2	10	29807	29816	40 %	20 %	20 %	20 %	449068365
23	NC_020247	TACTT	2	10	31287	31296	20 %	60 %	0 %	20 %	449068367
24	NC_020247	CTATT	2	10	31574	31583	20 %	60 %	0 %	20 %	449068367
25	NC_020247	TTCTT	2	10	31912	31921	0 %	80 %	0 %	20 %	449068367
26	NC_020247	AAAAG	2	10	32392	32401	80 %	0 %	20 %	0 %	449068368
27	NC_020247	GAATG	2	10	32634	32643	40 %	20 %	40 %	0 %	449068368
28	NC_020247	TTACT	2	10	34515	34524	20 %	60 %	0 %	20 %	449068370
29	NC_020247	TCTTT	2	10	34815	34824	0 %	80 %	0 %	20 %	449068371
30	NC_020247	ATCTA	2	10	34973	34982	40 %	40 %	0 %	20 %	449068371
31	NC_020247	TTTTC	2	10	35083	35092	0 %	80 %	0 %	20 %	449068371
32	NC_020247	TGTAT	2	10	35712	35721	20 %	60 %	20 %	0 %	449068371
33	NC_020247	TTCTT	2	10	35925	35934	0 %	80 %	0 %	20 %	449068372
34	NC_020247	CTCTT	2	10	36984	36993	0 %	60 %	0 %	40 %	449068372
35	NC_020247	CTTTC	2	10	38235	38244	0 %	60 %	0 %	40 %	449068372
36	NC_020247	AGATC	2	10	44900	44909	40 %	20 %	20 %	20 %	449068379
37	NC_020247	AGGTA	2	10	45370	45379	40 %	20 %	40 %	0 %	449068379
38	NC_020247	TCGTT	2	10	45538	45547	0 %	60 %	20 %	20 %	449068379
39	NC_020247	CTAAA	2	10	47328	47337	60 %	20 %	0 %	20 %	449068381
40	NC_020247	ACTTA	2	10	48342	48351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020247	AAATA	2	10	48596	48605	80 %	20 %	0 %	0 %	449068383
42	NC_020247	TTATG	2	10	48713	48722	20 %	60 %	20 %	0 %	449068384
43	NC_020247	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020247	CTATA	2	10	49743	49752	40 %	40 %	0 %	20 %	449068385
45	NC_020247	AAAAT	2	10	50278	50287	80 %	20 %	0 %	0 %	449068385
46	NC_020247	TGGAA	2	10	50613	50622	40 %	20 %	40 %	0 %	449068385
47	NC_020247	ACTGA	2	10	50638	50647	40 %	20 %	20 %	20 %	449068385
48	NC_020247	TAAGA	2	10	50935	50944	60 %	20 %	20 %	0 %	449068386
49	NC_020247	CCTTA	2	10	51521	51530	20 %	40 %	0 %	40 %	449068386
50	NC_020247	AGAGA	2	10	52022	52031	60 %	0 %	40 %	0 %	449068387
51	NC_020247	TCATT	2	10	52264	52273	20 %	60 %	0 %	20 %	449068387
52	NC_020247	TTTTA	2	10	52753	52762	20 %	80 %	0 %	0 %	449068388
53	NC_020247	GCAGT	2	10	53600	53609	20 %	20 %	40 %	20 %	449068389
54	NC_020247	AGAGA	2	10	56888	56897	60 %	0 %	40 %	0 %	449068392
55	NC_020247	ATATA	2	10	57007	57016	60 %	40 %	0 %	0 %	449068392
56	NC_020247	GGGAA	2	10	57307	57316	40 %	0 %	60 %	0 %	449068392
57	NC_020247	ATATT	2	10	57916	57925	40 %	60 %	0 %	0 %	449068392
58	NC_020247	TTTAG	2	10	59581	59590	20 %	60 %	20 %	0 %	449068394
59	NC_020247	TTGCA	2	10	59859	59868	20 %	40 %	20 %	20 %	449068394
60	NC_020247	GAAAG	2	10	66817	66826	60 %	0 %	40 %	0 %	449068406
61	NC_020247	TATAT	2	10	68109	68118	40 %	60 %	0 %	0 %	449068408
62	NC_020247	GGTAA	2	10	70893	70902	40 %	20 %	40 %	0 %	449068412
63	NC_020247	TTATA	2	10	70919	70928	40 %	60 %	0 %	0 %	449068412
64	NC_020247	GTATC	2	10	71074	71083	20 %	40 %	20 %	20 %	449068412
65	NC_020247	TTATT	2	10	71165	71174	20 %	80 %	0 %	0 %	449068412
66	NC_020247	ATATC	2	10	71387	71396	40 %	40 %	0 %	20 %	449068412
67	NC_020247	CCTAT	2	10	74793	74802	20 %	40 %	0 %	40 %	449068415
68	NC_020247	ATTAC	2	10	76105	76114	40 %	40 %	0 %	20 %	449068417
69	NC_020247	GGAAG	2	10	80855	80864	40 %	0 %	60 %	0 %	449068424
70	NC_020247	ATCCA	2	10	81881	81890	40 %	20 %	0 %	40 %	449068426
71	NC_020247	GAATA	2	10	81915	81924	60 %	20 %	20 %	0 %	449068426
72	NC_020247	GCCAT	2	10	82233	82242	20 %	20 %	20 %	40 %	449068426
73	NC_020247	TAACA	2	10	82731	82740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020247	ATGTT	2	10	83355	83364	20 %	60 %	20 %	0 %	449068429
75	NC_020247	ATTTA	2	10	88109	88118	40 %	60 %	0 %	0 %	449068436
76	NC_020247	TATTT	2	10	88880	88889	20 %	80 %	0 %	0 %	449068436
77	NC_020247	ATTTT	2	10	92817	92826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020247	ACAGA	2	10	93764	93773	60 %	0 %	20 %	20 %	449068441
79	NC_020247	TAAAC	2	10	95078	95087	60 %	20 %	0 %	20 %	449068442
80	NC_020247	CCACT	2	10	95214	95223	20 %	20 %	0 %	60 %	449068442
81	NC_020247	TCTGG	2	10	95958	95967	0 %	40 %	40 %	20 %	449068442
82	NC_020247	AGTGT	2	10	96243	96252	20 %	40 %	40 %	0 %	449068442
83	NC_020247	ATCTC	2	10	96696	96705	20 %	40 %	0 %	40 %	449068442
84	NC_020247	CTAGA	2	10	100603	100612	40 %	20 %	20 %	20 %	449068444
85	NC_020247	ATCCT	2	10	100696	100705	20 %	40 %	0 %	40 %	449068445
86	NC_020247	GATAC	2	10	100717	100726	40 %	20 %	20 %	20 %	449068445
87	NC_020247	TATTT	2	10	100782	100791	20 %	80 %	0 %	0 %	449068445
88	NC_020247	GATCA	2	10	102808	102817	40 %	20 %	20 %	20 %	449068447
89	NC_020247	TTTCT	2	10	103238	103247	0 %	80 %	0 %	20 %	449068448
90	NC_020247	ATTAC	2	10	103467	103476	40 %	40 %	0 %	20 %	449068448
91	NC_020247	AGGAA	2	10	103954	103963	60 %	0 %	40 %	0 %	449068449
92	NC_020247	ATTTG	2	10	105555	105564	20 %	60 %	20 %	0 %	449068451
93	NC_020247	AGGTA	2	10	106850	106859	40 %	20 %	40 %	0 %	449068452
94	NC_020247	TCCTA	2	10	111028	111037	20 %	40 %	0 %	40 %	449068456
95	NC_020247	TATTT	2	10	111956	111965	20 %	80 %	0 %	0 %	449068457
96	NC_020247	AATAA	2	10	112950	112959	80 %	20 %	0 %	0 %	449068458
97	NC_020247	TTTTG	2	10	112978	112987	0 %	80 %	20 %	0 %	449068458
98	NC_020247	ATTAT	2	10	114418	114427	40 %	60 %	0 %	0 %	449068460
99	NC_020247	TTTCT	2	10	114861	114870	0 %	80 %	0 %	20 %	449068461
100	NC_020247	CCTAA	2	10	115063	115072	40 %	20 %	0 %	40 %	449068461
101	NC_020247	TATTC	2	10	115892	115901	20 %	60 %	0 %	20 %	449068462
102	NC_020247	CCTTT	2	10	116518	116527	0 %	60 %	0 %	40 %	449068463
103	NC_020247	TAAAA	2	10	116928	116937	80 %	20 %	0 %	0 %	449068463
104	NC_020247	GAAAA	2	10	123502	123511	80 %	0 %	20 %	0 %	449068468
105	NC_020247	CTTAC	2	10	124347	124356	20 %	40 %	0 %	40 %	449068470
106	NC_020247	GTATA	2	10	124662	124671	40 %	40 %	20 %	0 %	449068470
107	NC_020247	ACTAT	2	10	124755	124764	40 %	40 %	0 %	20 %	449068470
108	NC_020247	GTGGA	2	10	124902	124911	20 %	20 %	60 %	0 %	449068470
109	NC_020247	TACAG	2	10	125968	125977	40 %	20 %	20 %	20 %	449068471
110	NC_020247	TTGTA	2	10	128094	128103	20 %	60 %	20 %	0 %	449068473
111	NC_020247	ATGGA	2	10	129525	129534	40 %	20 %	40 %	0 %	449068475
112	NC_020247	CCTTG	2	10	134381	134390	0 %	40 %	20 %	40 %	449068480
113	NC_020247	CATTT	2	10	134814	134823	20 %	60 %	0 %	20 %	449068480
114	NC_020247	AGGAA	2	10	135454	135463	60 %	0 %	40 %	0 %	449068481
115	NC_020247	CTTTT	2	10	139241	139250	0 %	80 %	0 %	20 %	449068486
116	NC_020247	TATCA	2	10	140154	140163	40 %	40 %	0 %	20 %	449068488
117	NC_020247	TCTTT	2	10	140873	140882	0 %	80 %	0 %	20 %	449068489
118	NC_020247	TTCAA	2	10	141007	141016	40 %	40 %	0 %	20 %	449068489
119	NC_020247	TTATC	2	10	141272	141281	20 %	60 %	0 %	20 %	449068489
120	NC_020247	GATCA	2	10	142482	142491	40 %	20 %	20 %	20 %	449068492
121	NC_020247	TAGGA	2	10	143063	143072	40 %	20 %	40 %	0 %	449068492
122	NC_020247	TAAGA	2	10	143344	143353	60 %	20 %	20 %	0 %	449068493
123	NC_020247	GTATA	2	10	143744	143753	40 %	40 %	20 %	0 %	449068493
124	NC_020247	TTTAT	2	10	145134	145143	20 %	80 %	0 %	0 %	449068495
125	NC_020247	ACTGG	2	10	147132	147141	20 %	20 %	40 %	20 %	449068497
126	NC_020247	TGGAC	2	10	147174	147183	20 %	20 %	40 %	20 %	449068497
127	NC_020247	TTTGG	2	10	150489	150498	0 %	60 %	40 %	0 %	449068500
128	NC_020247	AATTC	2	10	151825	151834	40 %	40 %	0 %	20 %	449068502
129	NC_020247	GGTAA	2	10	152393	152402	40 %	20 %	40 %	0 %	449068502
130	NC_020247	TTGAT	2	10	153014	153023	20 %	60 %	20 %	0 %	449068503
131	NC_020247	GAATT	2	10	153729	153738	40 %	40 %	20 %	0 %	449068504
132	NC_020247	GTAAA	2	10	154507	154516	60 %	20 %	20 %	0 %	449068505
133	NC_020247	ATATA	2	10	154717	154726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020247	TAATG	2	10	155034	155043	40 %	40 %	20 %	0 %	449068506
135	NC_020247	TTTTC	2	10	155272	155281	0 %	80 %	0 %	20 %	449068507
136	NC_020247	GCAAG	2	10	155832	155841	40 %	0 %	40 %	20 %	449068507
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264	NC_020247	AGGGA	2	10	324326	324335	40 %	0 %	60 %	0 %	449068691
265	NC_020247	TAAAT	2	10	325222	325231	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020247	TTCCA	2	10	326061	326070	20 %	40 %	0 %	40 %	449068693
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