MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius Ron12/I

Total Repeats: 47456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020247	ATT	2	6	59	64	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020247	AG	3	6	200	205	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
3	NC_020247	AG	3	6	215	220	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
4	NC_020247	ACCGGA	2	12	287	298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449068324
5	NC_020247	AGG	2	6	336	341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068324
6	NC_020247	AAG	2	6	344	349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068324
7	NC_020247	AGGT	2	8	399	406	25 %	25 %	50 %	0 %	449068324
8	NC_020247	GAG	2	6	455	460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068324
9	NC_020247	AGAA	2	8	496	503	75 %	0 %	25 %	0 %	449068324
10	NC_020247	TAG	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068324
11	NC_020247	AT	3	6	536	541	50 %	50 %	0 %	0 %	449068324
12	NC_020247	ACT	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068324
13	NC_020247	GTAA	2	8	635	642	50 %	25 %	25 %	0 %	449068324
14	NC_020247	ATG	2	6	717	722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068324
15	NC_020247	ATTA	2	8	766	773	50 %	50 %	0 %	0 %	449068324
16	NC_020247	AT	3	6	802	807	50 %	50 %	0 %	0 %	449068324
17	NC_020247	TGC	2	6	808	813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068324
18	NC_020247	GCT	2	6	869	874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068324
19	NC_020247	GGAA	2	8	889	896	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
20	NC_020247	ATA	2	6	926	931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068324
21	NC_020247	AG	3	6	943	948	50 %	0 %	50 %	0 %	449068324
22	NC_020247	AGCT	2	8	987	994	25 %	25 %	25 %	25 %	449068324
23	NC_020247	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068324
24	NC_020247	TAA	2	6	1131	1136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068324
25	NC_020247	ATA	2	6	1145	1150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068324
26	NC_020247	AAGGG	2	10	1154	1163	40 %	0 %	60 %	0 %	449068324
27	NC_020247	GGA	2	6	1166	1171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068324
28	NC_020247	AGA	2	6	1320	1325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068325
29	NC_020247	GAG	3	9	1326	1334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449068325
30	NC_020247	TAT	3	9	1426	1434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068325
31	NC_020247	AGTA	2	8	1465	1472	50 %	25 %	25 %	0 %	449068325
32	NC_020247	AGA	2	6	1551	1556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068325
33	NC_020247	AATAG	2	10	1561	1570	60 %	20 %	20 %	0 %	449068325
34	NC_020247	TAG	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068325
35	NC_020247	TA	3	6	1633	1638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020247	ATT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068326
37	NC_020247	AAT	2	6	1766	1771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
38	NC_020247	AT	3	6	1799	1804	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
39	NC_020247	TAG	2	6	1828	1833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068326
40	NC_020247	AGT	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068326
41	NC_020247	ATA	3	9	1914	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
42	NC_020247	AT	3	6	1973	1978	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
43	NC_020247	TTAC	2	8	2025	2032	25 %	50 %	0 %	25 %	449068326
44	NC_020247	TGC	2	6	2102	2107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068326
45	NC_020247	TAA	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
46	NC_020247	TGC	2	6	2159	2164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449068326
47	NC_020247	ATT	2	6	2259	2264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068326
48	NC_020247	AT	3	6	2309	2314	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
49	NC_020247	TAA	2	6	2371	2376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068326
50	NC_020247	TTA	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068326
51	NC_020247	AT	3	6	2463	2468	50 %	50 %	0 %	0 %	449068326
52	NC_020247	TGA	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068326
53	NC_020247	AAAG	2	8	2559	2566	75 %	0 %	25 %	0 %	449068327
54	NC_020247	T	6	6	2570	2575	0 %	100 %	0 %	0 %	449068327
55	NC_020247	TTTA	2	8	2625	2632	25 %	75 %	0 %	0 %	449068327
56	NC_020247	CTTCCT	2	12	2708	2719	0 %	50 %	0 %	50 %	449068327
57	NC_020247	TTA	2	6	2771	2776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068327
58	NC_020247	CAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449068327
59	NC_020247	CTCTTG	2	12	2831	2842	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	449068327
60	NC_020247	TTA	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068327
61	NC_020247	A	6	6	2878	2883	100 %	0 %	0 %	0 %	449068327
62	NC_020247	TTA	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068327
63	NC_020247	ATA	2	6	2946	2951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068327
64	NC_020247	A	6	6	2972	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	449068327
65	NC_020247	TCT	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020247	T	6	6	3138	3143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020247	AAAC	2	8	3166	3173	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020247	TTA	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020247	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020247	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020247	ACTTCA	2	12	3374	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020247	TCT	2	6	3388	3393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020247	TTA	2	6	3470	3475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020247	TAG	2	6	3565	3570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068328
75	NC_020247	TATG	2	8	3634	3641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020247	TTG	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020247	ATAA	2	8	3690	3697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020247	TTG	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020247	A	6	6	3719	3724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020247	TAA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020247	AT	3	6	3789	3794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020247	A	6	6	3795	3800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020247	AAT	2	6	3923	3928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068329
84	NC_020247	CT	3	6	3982	3987	0 %	50 %	0 %	50 %	449068329
85	NC_020247	TCC	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068329
86	NC_020247	T	7	7	4131	4137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020247	ATGG	2	8	4143	4150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020247	AAC	2	6	4168	4173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020247	TTA	2	6	4200	4205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020247	TAA	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020247	AGA	2	6	4244	4249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020247	CATA	2	8	4284	4291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020247	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068330
94	NC_020247	AG	3	6	4345	4350	50 %	0 %	50 %	0 %	449068330
95	NC_020247	GAA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068330
96	NC_020247	AT	3	6	4426	4431	50 %	50 %	0 %	0 %	449068330
97	NC_020247	CTAA	2	8	4442	4449	50 %	25 %	0 %	25 %	449068330
98	NC_020247	A	6	6	4448	4453	100 %	0 %	0 %	0 %	449068330
99	NC_020247	ACT	2	6	4504	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068331
100	NC_020247	TCT	2	6	4562	4567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
101	NC_020247	AAT	2	6	4571	4576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068331
102	NC_020247	TCC	2	6	4640	4645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068331
103	NC_020247	CTAC	2	8	4649	4656	25 %	25 %	0 %	50 %	449068331
104	NC_020247	AGTG	2	8	4691	4698	25 %	25 %	50 %	0 %	449068331
105	NC_020247	TCT	2	6	4753	4758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
106	NC_020247	TCT	2	6	4921	4926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
107	NC_020247	TTC	2	6	4927	4932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
108	NC_020247	CTT	2	6	5028	5033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068331
109	NC_020247	CTA	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068331
110	NC_020247	TA	3	6	5103	5108	50 %	50 %	0 %	0 %	449068331
111	NC_020247	GTA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068331
112	NC_020247	GA	3	6	5348	5353	50 %	0 %	50 %	0 %	449068332
113	NC_020247	CTC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068332
114	NC_020247	GAGG	2	8	5524	5531	25 %	0 %	75 %	0 %	449068332
115	NC_020247	CTT	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068332
116	NC_020247	TA	3	6	5591	5596	50 %	50 %	0 %	0 %	449068332
117	NC_020247	AGT	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068332
118	NC_020247	CTT	2	6	5734	5739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068332
119	NC_020247	AAT	2	6	5757	5762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068332
120	NC_020247	TCT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068332
121	NC_020247	TGA	2	6	5898	5903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068332
122	NC_020247	CAT	2	6	6099	6104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068332
123	NC_020247	CTAA	2	8	6304	6311	50 %	25 %	0 %	25 %	449068333
124	NC_020247	ATT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068333
125	NC_020247	TGG	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068333
126	NC_020247	ATG	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068333
127	NC_020247	ATA	2	6	6472	6477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
128	NC_020247	T	7	7	6494	6500	0 %	100 %	0 %	0 %	449068333
129	NC_020247	TTG	2	6	6518	6523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449068333
130	NC_020247	TCC	2	6	6596	6601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068333
131	NC_020247	GAT	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068333
132	NC_020247	AAT	2	6	6636	6641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
133	NC_020247	AAT	2	6	6650	6655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
134	NC_020247	CTA	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068333
135	NC_020247	GAA	2	6	6714	6719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449068333
136	NC_020247	TTA	2	6	6803	6808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068333
137	NC_020247	ATG	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449068333
138	NC_020247	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449068333
139	NC_020247	AAGC	2	8	6956	6963	50 %	0 %	25 %	25 %	449068333
140	NC_020247	GGCTAA	2	12	6987	6998	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	449068333
141	NC_020247	TCC	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449068333
142	NC_020247	TTC	2	6	7018	7023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068333
143	NC_020247	GGT	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449068333
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153	NC_020247	AT	3	6	7536	7541	50 %	50 %	0 %	0 %	449068333
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158	NC_020247	GAA	2	6	7660	7665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020247	AGA	2	6	7666	7671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_020247	TA	3	6	7728	7733	50 %	50 %	0 %	0 %	449068334
162	NC_020247	CAT	2	6	7816	7821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449068334
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164	NC_020247	TATTT	2	10	7874	7883	20 %	80 %	0 %	0 %	449068334
165	NC_020247	TCAA	2	8	7932	7939	50 %	25 %	0 %	25 %	449068334
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173	NC_020247	TTC	2	6	8151	8156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449068334
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175	NC_020247	TA	3	6	8263	8268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020247	TTA	2	6	8316	8321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_020247	TAC	2	6	8341	8346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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264	NC_020247	ATT	2	6	12546	12551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068341
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273	NC_020247	CT	3	6	13207	13212	0 %	50 %	0 %	50 %	449068342
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394	NC_020247	TTA	2	6	18447	18452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449068348
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