MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 1808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020246	AAGGG	2	10	1154	1163	40 %	0 %	60 %	0 %	449066048
2	NC_020246	AATAG	2	10	1561	1570	60 %	20 %	20 %	0 %	449066049
3	NC_020246	TAACT	2	10	3346	3355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020246	TATTT	2	10	7874	7883	20 %	80 %	0 %	0 %	449066058
5	NC_020246	CAAGC	2	10	8050	8059	40 %	0 %	20 %	40 %	449066058
6	NC_020246	ATAGA	2	10	8458	8467	60 %	20 %	20 %	0 %	449066059
7	NC_020246	CTAAA	2	10	8572	8581	60 %	20 %	0 %	20 %	449066059
8	NC_020246	TGCTT	2	10	9546	9555	0 %	60 %	20 %	20 %	449066061
9	NC_020246	TGAAT	2	10	11851	11860	40 %	40 %	20 %	0 %	449066064
10	NC_020246	CTTTT	2	10	13691	13700	0 %	80 %	0 %	20 %	449066067
11	NC_020246	ATTTG	2	10	14471	14480	20 %	60 %	20 %	0 %	449066068
12	NC_020246	GTTTT	2	10	16332	16341	0 %	80 %	20 %	0 %	449066070
13	NC_020246	CTTAC	2	10	16896	16905	20 %	40 %	0 %	40 %	449066071
14	NC_020246	TATCA	2	10	17066	17075	40 %	40 %	0 %	20 %	449066071
15	NC_020246	GGAAC	2	10	17290	17299	40 %	0 %	40 %	20 %	449066071
16	NC_020246	TTAAA	2	10	23335	23344	60 %	40 %	0 %	0 %	449066080
17	NC_020246	CAAAT	2	10	25619	25628	60 %	20 %	0 %	20 %	449066083
18	NC_020246	TAGAA	2	10	25671	25680	60 %	20 %	20 %	0 %	449066083
19	NC_020246	TATTG	2	10	29514	29523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020246	CATAA	2	10	29592	29601	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020246	ATTTT	2	10	29630	29639	20 %	80 %	0 %	0 %	449066089
22	NC_020246	ACAGT	2	10	29807	29816	40 %	20 %	20 %	20 %	449066089
23	NC_020246	TACTT	2	10	31287	31296	20 %	60 %	0 %	20 %	449066091
24	NC_020246	CTATT	2	10	31574	31583	20 %	60 %	0 %	20 %	449066091
25	NC_020246	TTCTT	2	10	31912	31921	0 %	80 %	0 %	20 %	449066091
26	NC_020246	AAAAG	2	10	32392	32401	80 %	0 %	20 %	0 %	449066092
27	NC_020246	GAATG	2	10	32634	32643	40 %	20 %	40 %	0 %	449066092
28	NC_020246	TTACT	2	10	34515	34524	20 %	60 %	0 %	20 %	449066094
29	NC_020246	TCTTT	2	10	34815	34824	0 %	80 %	0 %	20 %	449066095
30	NC_020246	ATCTA	2	10	34973	34982	40 %	40 %	0 %	20 %	449066095
31	NC_020246	TTTTC	2	10	35083	35092	0 %	80 %	0 %	20 %	449066095
32	NC_020246	TGTAT	2	10	35712	35721	20 %	60 %	20 %	0 %	449066095
33	NC_020246	TTCTT	2	10	35925	35934	0 %	80 %	0 %	20 %	449066096
34	NC_020246	CTCTT	2	10	36984	36993	0 %	60 %	0 %	40 %	449066096
35	NC_020246	CTTTC	2	10	38235	38244	0 %	60 %	0 %	40 %	449066096
36	NC_020246	AGATC	2	10	44900	44909	40 %	20 %	20 %	20 %	449066103
37	NC_020246	AGGTA	2	10	45370	45379	40 %	20 %	40 %	0 %	449066103
38	NC_020246	TCGTT	2	10	45538	45547	0 %	60 %	20 %	20 %	449066103
39	NC_020246	CTAAA	2	10	47328	47337	60 %	20 %	0 %	20 %	449066105
40	NC_020246	ACTTA	2	10	48342	48351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020246	AAATA	2	10	48596	48605	80 %	20 %	0 %	0 %	449066107
42	NC_020246	TTATG	2	10	48713	48722	20 %	60 %	20 %	0 %	449066108
43	NC_020246	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020246	CTATA	2	10	49743	49752	40 %	40 %	0 %	20 %	449066109
45	NC_020246	AAAAT	2	10	50278	50287	80 %	20 %	0 %	0 %	449066109
46	NC_020246	TGGAA	2	10	50613	50622	40 %	20 %	40 %	0 %	449066109
47	NC_020246	ACTGA	2	10	50638	50647	40 %	20 %	20 %	20 %	449066109
48	NC_020246	TAAGA	2	10	50935	50944	60 %	20 %	20 %	0 %	449066110
49	NC_020246	CCTTA	2	10	51521	51530	20 %	40 %	0 %	40 %	449066110
50	NC_020246	AGAGA	2	10	52022	52031	60 %	0 %	40 %	0 %	449066111
51	NC_020246	TCATT	2	10	52264	52273	20 %	60 %	0 %	20 %	449066111
52	NC_020246	TTTTA	2	10	52753	52762	20 %	80 %	0 %	0 %	449066112
53	NC_020246	GCAGT	2	10	53600	53609	20 %	20 %	40 %	20 %	449066113
54	NC_020246	AGAGA	2	10	56888	56897	60 %	0 %	40 %	0 %	449066116
55	NC_020246	ATATA	2	10	57007	57016	60 %	40 %	0 %	0 %	449066116
56	NC_020246	GGGAA	2	10	57307	57316	40 %	0 %	60 %	0 %	449066116
57	NC_020246	ATATT	2	10	57916	57925	40 %	60 %	0 %	0 %	449066116
58	NC_020246	TTTAG	2	10	59581	59590	20 %	60 %	20 %	0 %	449066118
59	NC_020246	TTGCA	2	10	59859	59868	20 %	40 %	20 %	20 %	449066118
60	NC_020246	GAAAG	2	10	66817	66826	60 %	0 %	40 %	0 %	449066130
61	NC_020246	TATAT	2	10	68109	68118	40 %	60 %	0 %	0 %	449066132
62	NC_020246	GGTAA	2	10	70893	70902	40 %	20 %	40 %	0 %	449066136
63	NC_020246	TTATA	2	10	70919	70928	40 %	60 %	0 %	0 %	449066136
64	NC_020246	GTATC	2	10	71074	71083	20 %	40 %	20 %	20 %	449066136
65	NC_020246	TTATT	2	10	71165	71174	20 %	80 %	0 %	0 %	449066136
66	NC_020246	ATATC	2	10	71387	71396	40 %	40 %	0 %	20 %	449066136
67	NC_020246	CCTAT	2	10	74793	74802	20 %	40 %	0 %	40 %	449066139
68	NC_020246	ATTAC	2	10	76105	76114	40 %	40 %	0 %	20 %	449066141
69	NC_020246	GGAAG	2	10	80855	80864	40 %	0 %	60 %	0 %	449066148
70	NC_020246	ATCCA	2	10	81881	81890	40 %	20 %	0 %	40 %	449066150
71	NC_020246	GAATA	2	10	81915	81924	60 %	20 %	20 %	0 %	449066150
72	NC_020246	GCCAT	2	10	82233	82242	20 %	20 %	20 %	40 %	449066150
73	NC_020246	TAACA	2	10	82731	82740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020246	ATGTT	2	10	83355	83364	20 %	60 %	20 %	0 %	449066153
75	NC_020246	ATTTA	2	10	88109	88118	40 %	60 %	0 %	0 %	449066160
76	NC_020246	TATTT	2	10	88880	88889	20 %	80 %	0 %	0 %	449066160
77	NC_020246	ATTTT	2	10	92817	92826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020246	ACAGA	2	10	93764	93773	60 %	0 %	20 %	20 %	449066165
79	NC_020246	TAAAC	2	10	95078	95087	60 %	20 %	0 %	20 %	449066166
80	NC_020246	CCACT	2	10	95214	95223	20 %	20 %	0 %	60 %	449066166
81	NC_020246	TCTGG	2	10	95958	95967	0 %	40 %	40 %	20 %	449066166
82	NC_020246	AGTGT	2	10	96243	96252	20 %	40 %	40 %	0 %	449066166
83	NC_020246	ATCTC	2	10	96696	96705	20 %	40 %	0 %	40 %	449066166
84	NC_020246	CTAGA	2	10	100603	100612	40 %	20 %	20 %	20 %	449066168
85	NC_020246	ATCCT	2	10	100696	100705	20 %	40 %	0 %	40 %	449066169
86	NC_020246	GATAC	2	10	100717	100726	40 %	20 %	20 %	20 %	449066169
87	NC_020246	TATTT	2	10	100782	100791	20 %	80 %	0 %	0 %	449066169
88	NC_020246	GATCA	2	10	102808	102817	40 %	20 %	20 %	20 %	449066171
89	NC_020246	TTTCT	2	10	103238	103247	0 %	80 %	0 %	20 %	449066172
90	NC_020246	ATTAC	2	10	103467	103476	40 %	40 %	0 %	20 %	449066172
91	NC_020246	AGGAA	2	10	103954	103963	60 %	0 %	40 %	0 %	449066173
92	NC_020246	ATTTG	2	10	105555	105564	20 %	60 %	20 %	0 %	449066175
93	NC_020246	AGGTA	2	10	106850	106859	40 %	20 %	40 %	0 %	449066176
94	NC_020246	TCCTA	2	10	111028	111037	20 %	40 %	0 %	40 %	449066180
95	NC_020246	TATTT	2	10	111956	111965	20 %	80 %	0 %	0 %	449066181
96	NC_020246	AATAA	2	10	112950	112959	80 %	20 %	0 %	0 %	449066182
97	NC_020246	TTTTG	2	10	112978	112987	0 %	80 %	20 %	0 %	449066182
98	NC_020246	ATTAT	2	10	114418	114427	40 %	60 %	0 %	0 %	449066184
99	NC_020246	TTTCT	2	10	114861	114870	0 %	80 %	0 %	20 %	449066185
100	NC_020246	CCTAA	2	10	115063	115072	40 %	20 %	0 %	40 %	449066185
101	NC_020246	TATTC	2	10	115892	115901	20 %	60 %	0 %	20 %	449066186
102	NC_020246	CCTTT	2	10	116518	116527	0 %	60 %	0 %	40 %	449066187
103	NC_020246	TAAAA	2	10	116928	116937	80 %	20 %	0 %	0 %	449066187
104	NC_020246	GAAAA	2	10	123502	123511	80 %	0 %	20 %	0 %	449066192
105	NC_020246	CTTAC	2	10	124347	124356	20 %	40 %	0 %	40 %	449066194
106	NC_020246	GTATA	2	10	124662	124671	40 %	40 %	20 %	0 %	449066194
107	NC_020246	ACTAT	2	10	124755	124764	40 %	40 %	0 %	20 %	449066194
108	NC_020246	GTGGA	2	10	124902	124911	20 %	20 %	60 %	0 %	449066194
109	NC_020246	TACAG	2	10	125968	125977	40 %	20 %	20 %	20 %	449066195
110	NC_020246	TTGTA	2	10	128094	128103	20 %	60 %	20 %	0 %	449066197
111	NC_020246	ATGGA	2	10	129525	129534	40 %	20 %	40 %	0 %	449066199
112	NC_020246	CCTTG	2	10	134381	134390	0 %	40 %	20 %	40 %	449066204
113	NC_020246	CATTT	2	10	134814	134823	20 %	60 %	0 %	20 %	449066204
114	NC_020246	AGGAA	2	10	135454	135463	60 %	0 %	40 %	0 %	449066205
115	NC_020246	CTTTT	2	10	139241	139250	0 %	80 %	0 %	20 %	449066210
116	NC_020246	TATCA	2	10	140154	140163	40 %	40 %	0 %	20 %	449066212
117	NC_020246	TCTTT	2	10	140873	140882	0 %	80 %	0 %	20 %	449066213
118	NC_020246	TTCAA	2	10	141007	141016	40 %	40 %	0 %	20 %	449066213
119	NC_020246	TTATC	2	10	141272	141281	20 %	60 %	0 %	20 %	449066213
120	NC_020246	GATCA	2	10	142482	142491	40 %	20 %	20 %	20 %	449066216
121	NC_020246	TAGGA	2	10	143063	143072	40 %	20 %	40 %	0 %	449066216
122	NC_020246	TAAGA	2	10	143344	143353	60 %	20 %	20 %	0 %	449066217
123	NC_020246	GTATA	2	10	143744	143753	40 %	40 %	20 %	0 %	449066217
124	NC_020246	TTTAT	2	10	145134	145143	20 %	80 %	0 %	0 %	449066219
125	NC_020246	ACTGG	2	10	147132	147141	20 %	20 %	40 %	20 %	449066221
126	NC_020246	TGGAC	2	10	147174	147183	20 %	20 %	40 %	20 %	449066221
127	NC_020246	TTTGG	2	10	150489	150498	0 %	60 %	40 %	0 %	449066224
128	NC_020246	AATTC	2	10	151825	151834	40 %	40 %	0 %	20 %	449066226
129	NC_020246	GGTAA	2	10	152393	152402	40 %	20 %	40 %	0 %	449066226
130	NC_020246	TTGAT	2	10	153014	153023	20 %	60 %	20 %	0 %	449066227
131	NC_020246	GAATT	2	10	153729	153738	40 %	40 %	20 %	0 %	449066228
132	NC_020246	GTAAA	2	10	154507	154516	60 %	20 %	20 %	0 %	449066229
133	NC_020246	ATATA	2	10	154717	154726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020246	TAATG	2	10	155034	155043	40 %	40 %	20 %	0 %	449066230
135	NC_020246	TTTTC	2	10	155272	155281	0 %	80 %	0 %	20 %	449066231
136	NC_020246	GCAAG	2	10	155832	155841	40 %	0 %	40 %	20 %	449066231
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265	NC_020246	TAAAT	2	10	325225	325234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_020246	TTCCA	2	10	326064	326073	20 %	40 %	0 %	40 %	449066417
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