MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 46505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020246	CTA	2	6	161276	161281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066237
3502	NC_020246	AAG	2	6	161368	161373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066237
3503	NC_020246	AAG	2	6	161393	161398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066237
3504	NC_020246	ATG	2	6	161455	161460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066237
3505	NC_020246	AGAGA	2	10	161484	161493	60 %	0 %	40 %	0 %	449066237
3506	NC_020246	GAA	2	6	161494	161499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066237
3507	NC_020246	TA	3	6	161524	161529	50 %	50 %	0 %	0 %	449066237
3508	NC_020246	AGA	2	6	161640	161645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066237
3509	NC_020246	G	6	6	161651	161656	0 %	0 %	100 %	0 %	449066237
3510	NC_020246	TTA	2	6	161700	161705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066237
3511	NC_020246	TAGGA	2	10	161753	161762	40 %	20 %	40 %	0 %	449066237
3512	NC_020246	CTG	2	6	161841	161846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066237
3513	NC_020246	AT	3	6	162024	162029	50 %	50 %	0 %	0 %	449066237
3514	NC_020246	GTGA	2	8	162054	162061	25 %	25 %	50 %	0 %	449066237
3515	NC_020246	TG	3	6	162134	162139	0 %	50 %	50 %	0 %	449066237
3516	NC_020246	AGA	2	6	162178	162183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066237
3517	NC_020246	ATT	3	9	162188	162196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066237
3518	NC_020246	GGT	2	6	162198	162203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066237
3519	NC_020246	GAA	2	6	162222	162227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066238
3520	NC_020246	A	6	6	162326	162331	100 %	0 %	0 %	0 %	449066238
3521	NC_020246	TGT	2	6	162373	162378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066238
3522	NC_020246	C	6	6	162393	162398	0 %	0 %	0 %	100 %	449066238
3523	NC_020246	TAGT	2	8	162414	162421	25 %	50 %	25 %	0 %	449066238
3524	NC_020246	ATC	2	6	162592	162597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066238
3525	NC_020246	TA	3	6	162609	162614	50 %	50 %	0 %	0 %	449066238
3526	NC_020246	GTT	2	6	162713	162718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066238
3527	NC_020246	AGT	2	6	162868	162873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066238
3528	NC_020246	TTC	2	6	162920	162925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_020246	TC	3	6	162924	162929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_020246	AT	4	8	162938	162945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020246	T	6	6	162949	162954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020246	AGG	2	6	162998	163003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066239
3533	NC_020246	CAGG	2	8	163073	163080	25 %	0 %	50 %	25 %	449066239
3534	NC_020246	CT	4	8	163095	163102	0 %	50 %	0 %	50 %	449066239
3535	NC_020246	CTA	2	6	163154	163159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066239
3536	NC_020246	AG	3	6	163162	163167	50 %	0 %	50 %	0 %	449066239
3537	NC_020246	AG	3	6	163212	163217	50 %	0 %	50 %	0 %	449066239
3538	NC_020246	CAC	2	6	163276	163281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066239
3539	NC_020246	CTA	2	6	163287	163292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066239
3540	NC_020246	TTCT	2	8	163324	163331	0 %	75 %	0 %	25 %	449066239
3541	NC_020246	AG	3	6	163339	163344	50 %	0 %	50 %	0 %	449066239
3542	NC_020246	GTT	2	6	163474	163479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066239
3543	NC_020246	GCTTC	2	10	163501	163510	0 %	40 %	20 %	40 %	449066239
3544	NC_020246	TA	3	6	163526	163531	50 %	50 %	0 %	0 %	449066239
3545	NC_020246	TA	3	6	163534	163539	50 %	50 %	0 %	0 %	449066239
3546	NC_020246	GA	3	6	163559	163564	50 %	0 %	50 %	0 %	449066239
3547	NC_020246	ATTA	2	8	163687	163694	50 %	50 %	0 %	0 %	449066239
3548	NC_020246	AG	3	6	163709	163714	50 %	0 %	50 %	0 %	449066239
3549	NC_020246	AG	3	6	163727	163732	50 %	0 %	50 %	0 %	449066240
3550	NC_020246	GCTTC	2	10	163752	163761	0 %	40 %	20 %	40 %	449066240
3551	NC_020246	ATT	2	6	163766	163771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066240
3552	NC_020246	ATT	2	6	163830	163835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066240
3553	NC_020246	GTT	2	6	163913	163918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066240
3554	NC_020246	GTAA	2	8	163919	163926	50 %	25 %	25 %	0 %	449066240
3555	NC_020246	AAAT	2	8	163953	163960	75 %	25 %	0 %	0 %	449066240
3556	NC_020246	ATA	2	6	163997	164002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066240
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3558	NC_020246	TAATA	2	10	164125	164134	60 %	40 %	0 %	0 %	449066240
3559	NC_020246	TTC	2	6	164222	164227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066240
3560	NC_020246	GTG	2	6	164260	164265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066240
3561	NC_020246	GAT	2	6	164267	164272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066240
3562	NC_020246	AAAG	2	8	164294	164301	75 %	0 %	25 %	0 %	449066240
3563	NC_020246	ACG	2	6	164346	164351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066240
3564	NC_020246	TAA	2	6	164385	164390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066240
3565	NC_020246	AGG	2	6	164408	164413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066240
3566	NC_020246	TCT	2	6	164460	164465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066240
3567	NC_020246	AAT	2	6	164557	164562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066240
3568	NC_020246	TTA	3	9	164704	164712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066241
3569	NC_020246	ACC	2	6	164769	164774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066241
3570	NC_020246	TTTAGT	2	12	164802	164813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	449066241
3571	NC_020246	CAA	2	6	164821	164826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066241
3572	NC_020246	CGC	2	6	164829	164834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449066241
3573	NC_020246	TAA	2	6	164841	164846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066241
3574	NC_020246	CCA	2	6	164938	164943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066241
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3576	NC_020246	TAA	2	6	164981	164986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066241
3577	NC_020246	TAG	2	6	164993	164998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066241
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3579	NC_020246	ATT	2	6	165059	165064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_020246	CT	3	6	165136	165141	0 %	50 %	0 %	50 %	449066242
3581	NC_020246	CCT	2	6	165149	165154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066242
3582	NC_020246	AT	3	6	165177	165182	50 %	50 %	0 %	0 %	449066242
3583	NC_020246	CT	3	6	165183	165188	0 %	50 %	0 %	50 %	449066242
3584	NC_020246	CTAT	2	8	165307	165314	25 %	50 %	0 %	25 %	449066242
3585	NC_020246	ATT	2	6	165325	165330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066242
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3588	NC_020246	T	6	6	165544	165549	0 %	100 %	0 %	0 %	449066242
3589	NC_020246	ACTC	2	8	165569	165576	25 %	25 %	0 %	50 %	449066242
3590	NC_020246	CAC	2	6	165587	165592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066243
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3592	NC_020246	AG	3	6	165963	165968	50 %	0 %	50 %	0 %	449066243
3593	NC_020246	AT	3	6	166045	166050	50 %	50 %	0 %	0 %	449066243
3594	NC_020246	TCC	2	6	166061	166066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066243
3595	NC_020246	T	6	6	166081	166086	0 %	100 %	0 %	0 %	449066243
3596	NC_020246	TATTTT	2	12	166147	166158	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	449066243
3597	NC_020246	AG	3	6	166172	166177	50 %	0 %	50 %	0 %	449066243
3598	NC_020246	CCT	2	6	166206	166211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066243
3599	NC_020246	TGAT	2	8	166215	166222	25 %	50 %	25 %	0 %	449066243
3600	NC_020246	AT	3	6	166236	166241	50 %	50 %	0 %	0 %	449066243
3601	NC_020246	TTC	2	6	166273	166278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_020246	ATA	2	6	166281	166286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_020246	TTG	2	6	166378	166383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066244
3604	NC_020246	CTT	2	6	166421	166426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066244
3605	NC_020246	TGTT	2	8	166452	166459	0 %	75 %	25 %	0 %	449066244
3606	NC_020246	CAC	2	6	166483	166488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066244
3607	NC_020246	ATT	2	6	166515	166520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066244
3608	NC_020246	TA	3	6	166550	166555	50 %	50 %	0 %	0 %	449066244
3609	NC_020246	GGA	2	6	166703	166708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066244
3610	NC_020246	CTC	2	6	166736	166741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066244
3611	NC_020246	CT	3	6	166768	166773	0 %	50 %	0 %	50 %	449066244
3612	NC_020246	TGAG	2	8	166790	166797	25 %	25 %	50 %	0 %	449066244
3613	NC_020246	ACT	2	6	166871	166876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066244
3614	NC_020246	ATT	2	6	166911	166916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066244
3615	NC_020246	ATG	2	6	166993	166998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066244
3616	NC_020246	CAG	2	6	167158	167163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066244
3617	NC_020246	ACA	2	6	167202	167207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066244
3618	NC_020246	ACC	2	6	167311	167316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066245
3619	NC_020246	T	7	7	167367	167373	0 %	100 %	0 %	0 %	449066245
3620	NC_020246	TCA	2	6	167393	167398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066245
3621	NC_020246	ACC	2	6	167458	167463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066245
3622	NC_020246	TCA	2	6	167489	167494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066245
3623	NC_020246	AT	3	6	167678	167683	50 %	50 %	0 %	0 %	449066245
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3625	NC_020246	ATTA	2	8	167755	167762	50 %	50 %	0 %	0 %	449066245
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3873	NC_020246	TTC	2	6	178618	178623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066255
3874	NC_020246	TTGA	2	8	178635	178642	25 %	50 %	25 %	0 %	449066255
3875	NC_020246	AGT	2	6	178656	178661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066255
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3881	NC_020246	TCAT	2	8	178908	178915	25 %	50 %	0 %	25 %	449066255
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3893	NC_020246	AT	3	6	179316	179321	50 %	50 %	0 %	0 %	449066256
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3902	NC_020246	AGTG	2	8	179751	179758	25 %	25 %	50 %	0 %	449066257
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3929	NC_020246	AT	3	6	181011	181016	50 %	50 %	0 %	0 %	449066258
3930	NC_020246	A	7	7	181083	181089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3952	NC_020246	TAA	2	6	182982	182987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3985	NC_020246	TAAA	2	8	184153	184160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3986	NC_020246	TAA	2	6	184199	184204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3987	NC_020246	TCC	2	6	184212	184217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3988	NC_020246	ATT	2	6	184285	184290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3989	NC_020246	GA	3	6	184303	184308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3990	NC_020246	GTT	2	6	184343	184348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_020246	TA	3	6	184386	184391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3992	NC_020246	ATA	2	6	184430	184435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3993	NC_020246	CTC	2	6	184467	184472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3994	NC_020246	TAC	2	6	184493	184498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_020246	CTT	2	6	184501	184506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3996	NC_020246	TA	3	6	184508	184513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3998	NC_020246	ATT	2	6	184629	184634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_020246	ATT	2	6	184659	184664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4000	NC_020246	ATC	2	6	184743	184748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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