MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 46505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020246	TTA	2	6	138043	138048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066207
3002	NC_020246	CTT	2	6	138130	138135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066207
3003	NC_020246	ATT	2	6	138166	138171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_020246	AAT	2	6	138187	138192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_020246	TAT	2	6	138215	138220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_020246	AAAGTA	2	12	138227	138238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_020246	GAT	2	6	138243	138248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_020246	AAT	2	6	138309	138314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066208
3009	NC_020246	ATT	2	6	138384	138389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066208
3010	NC_020246	TCC	2	6	138420	138425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066208
3011	NC_020246	GAAA	2	8	138484	138491	75 %	0 %	25 %	0 %	449066208
3012	NC_020246	T	6	6	138582	138587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_020246	CTT	2	6	138625	138630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_020246	TTA	2	6	138636	138641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_020246	TGG	2	6	138701	138706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_020246	CCG	2	6	138718	138723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_020246	ACC	2	6	138739	138744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_020246	TC	3	6	138846	138851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_020246	ATT	2	6	138855	138860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066209
3020	NC_020246	TCA	2	6	138917	138922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066209
3021	NC_020246	TTGT	2	8	138930	138937	0 %	75 %	25 %	0 %	449066209
3022	NC_020246	TCA	2	6	138956	138961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066209
3023	NC_020246	AAG	2	6	138969	138974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066209
3024	NC_020246	GTT	2	6	139067	139072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066209
3025	NC_020246	CTT	2	6	139080	139085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066209
3026	NC_020246	TA	3	6	139102	139107	50 %	50 %	0 %	0 %	449066209
3027	NC_020246	CAT	3	9	139156	139164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066209
3028	NC_020246	ATA	3	9	139207	139215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_020246	TTTA	2	8	139233	139240	25 %	75 %	0 %	0 %	449066210
3030	NC_020246	CTTTT	2	10	139241	139250	0 %	80 %	0 %	20 %	449066210
3031	NC_020246	CT	3	6	139342	139347	0 %	50 %	0 %	50 %	449066210
3032	NC_020246	CTT	2	6	139353	139358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066210
3033	NC_020246	ATT	2	6	139375	139380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066210
3034	NC_020246	T	6	6	139379	139384	0 %	100 %	0 %	0 %	449066210
3035	NC_020246	T	6	6	139458	139463	0 %	100 %	0 %	0 %	449066210
3036	NC_020246	T	7	7	139468	139474	0 %	100 %	0 %	0 %	449066211
3037	NC_020246	TAAT	2	8	139525	139532	50 %	50 %	0 %	0 %	449066211
3038	NC_020246	GCA	2	6	139611	139616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066211
3039	NC_020246	TAAG	2	8	139651	139658	50 %	25 %	25 %	0 %	449066211
3040	NC_020246	TG	3	6	139667	139672	0 %	50 %	50 %	0 %	449066211
3041	NC_020246	AAT	2	6	139699	139704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066211
3042	NC_020246	TTA	2	6	139717	139722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066211
3043	NC_020246	TTC	2	6	139738	139743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066212
3044	NC_020246	TTC	2	6	139800	139805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066212
3045	NC_020246	TC	3	6	139864	139869	0 %	50 %	0 %	50 %	449066212
3046	NC_020246	AAT	2	6	139893	139898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066212
3047	NC_020246	TGTA	2	8	139987	139994	25 %	50 %	25 %	0 %	449066212
3048	NC_020246	CTT	2	6	140097	140102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066212
3049	NC_020246	T	6	6	140121	140126	0 %	100 %	0 %	0 %	449066212
3050	NC_020246	TATCA	2	10	140154	140163	40 %	40 %	0 %	20 %	449066212
3051	NC_020246	CTC	2	6	140235	140240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066212
3052	NC_020246	TTC	2	6	140284	140289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066212
3053	NC_020246	CAC	2	6	140299	140304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066213
3054	NC_020246	AT	3	6	140309	140314	50 %	50 %	0 %	0 %	449066213
3055	NC_020246	ATC	2	6	140388	140393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066213
3056	NC_020246	AGG	2	6	140411	140416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066213
3057	NC_020246	CTAT	2	8	140428	140435	25 %	50 %	0 %	25 %	449066213
3058	NC_020246	TTA	2	6	140486	140491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066213
3059	NC_020246	TCC	2	6	140512	140517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066213
3060	NC_020246	TAT	2	6	140577	140582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066213
3061	NC_020246	ATT	2	6	140611	140616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066213
3062	NC_020246	GTC	2	6	140710	140715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066213
3063	NC_020246	ACT	2	6	140782	140787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066213
3064	NC_020246	AAT	2	6	140847	140852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066213
3065	NC_020246	TCTTT	2	10	140873	140882	0 %	80 %	0 %	20 %	449066213
3066	NC_020246	CGA	2	6	140916	140921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066213
3067	NC_020246	CTC	3	9	140982	140990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066213
3068	NC_020246	ACTT	2	8	140999	141006	25 %	50 %	0 %	25 %	449066213
3069	NC_020246	TTCAA	2	10	141007	141016	40 %	40 %	0 %	20 %	449066213
3070	NC_020246	GAG	2	6	141142	141147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066213
3071	NC_020246	AGA	2	6	141190	141195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066213
3072	NC_020246	CTT	2	6	141250	141255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066213
3073	NC_020246	TTATC	2	10	141272	141281	20 %	60 %	0 %	20 %	449066213
3074	NC_020246	GCT	2	6	141306	141311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066214
3075	NC_020246	CTT	2	6	141382	141387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066214
3076	NC_020246	TTCT	2	8	141404	141411	0 %	75 %	0 %	25 %	449066214
3077	NC_020246	TACA	2	8	141419	141426	50 %	25 %	0 %	25 %	449066214
3078	NC_020246	GCA	2	6	141456	141461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066214
3079	NC_020246	ATCT	2	8	141505	141512	25 %	50 %	0 %	25 %	449066214
3080	NC_020246	CAT	2	6	141527	141532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066214
3081	NC_020246	TTA	2	6	141544	141549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066214
3082	NC_020246	ATG	2	6	141551	141556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066214
3083	NC_020246	TTC	2	6	141603	141608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066214
3084	NC_020246	AGT	2	6	141674	141679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066214
3085	NC_020246	TCATAA	2	12	141693	141704	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	449066214
3086	NC_020246	TA	3	6	141761	141766	50 %	50 %	0 %	0 %	449066214
3087	NC_020246	TCT	2	6	141770	141775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066214
3088	NC_020246	ACT	2	6	141863	141868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066215
3089	NC_020246	TCT	2	6	141892	141897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066215
3090	NC_020246	TGT	2	6	141912	141917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066215
3091	NC_020246	CT	3	6	141996	142001	0 %	50 %	0 %	50 %	449066215
3092	NC_020246	TGAA	2	8	142007	142014	50 %	25 %	25 %	0 %	449066215
3093	NC_020246	ATTT	2	8	142016	142023	25 %	75 %	0 %	0 %	449066215
3094	NC_020246	ATT	2	6	142174	142179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066216
3095	NC_020246	ACA	2	6	142195	142200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066216
3096	NC_020246	TTG	2	6	142224	142229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066216
3097	NC_020246	ATA	2	6	142237	142242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066216
3098	NC_020246	GCAA	2	8	142246	142253	50 %	0 %	25 %	25 %	449066216
3099	NC_020246	ATA	2	6	142281	142286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066216
3100	NC_020246	CTA	2	6	142288	142293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066216
3101	NC_020246	GATCA	2	10	142482	142491	40 %	20 %	20 %	20 %	449066216
3102	NC_020246	TC	3	6	142581	142586	0 %	50 %	0 %	50 %	449066216
3103	NC_020246	TA	3	6	142653	142658	50 %	50 %	0 %	0 %	449066216
3104	NC_020246	GAA	2	6	142683	142688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066216
3105	NC_020246	TTC	2	6	142723	142728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066216
3106	NC_020246	GAC	2	6	142810	142815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066216
3107	NC_020246	AAGT	2	8	142836	142843	50 %	25 %	25 %	0 %	449066216
3108	NC_020246	AGA	2	6	142848	142853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066216
3109	NC_020246	TTA	2	6	142913	142918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066216
3110	NC_020246	GAT	2	6	143041	143046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066216
3111	NC_020246	TAGGA	2	10	143063	143072	40 %	20 %	40 %	0 %	449066216
3112	NC_020246	TAT	2	6	143073	143078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066216
3113	NC_020246	ACTA	2	8	143082	143089	50 %	25 %	0 %	25 %	449066216
3114	NC_020246	TCC	2	6	143101	143106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066216
3115	NC_020246	CTTC	2	8	143137	143144	0 %	50 %	0 %	50 %	449066217
3116	NC_020246	TC	3	6	143149	143154	0 %	50 %	0 %	50 %	449066217
3117	NC_020246	GGGA	2	8	143243	143250	25 %	0 %	75 %	0 %	449066217
3118	NC_020246	CTG	2	6	143281	143286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066217
3119	NC_020246	TAA	2	6	143303	143308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066217
3120	NC_020246	GTAA	2	8	143318	143325	50 %	25 %	25 %	0 %	449066217
3121	NC_020246	TAT	3	9	143330	143338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066217
3122	NC_020246	TAAGA	2	10	143344	143353	60 %	20 %	20 %	0 %	449066217
3123	NC_020246	AT	3	6	143386	143391	50 %	50 %	0 %	0 %	449066217
3124	NC_020246	TAA	2	6	143452	143457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066217
3125	NC_020246	TAAG	2	8	143471	143478	50 %	25 %	25 %	0 %	449066217
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3132	NC_020246	T	7	7	143735	143741	0 %	100 %	0 %	0 %	449066217
3133	NC_020246	GTATA	2	10	143744	143753	40 %	40 %	20 %	0 %	449066217
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3154	NC_020246	T	6	6	144662	144667	0 %	100 %	0 %	0 %	449066218
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3158	NC_020246	AGT	2	6	144941	144946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3169	NC_020246	TGA	2	6	145761	145766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066219
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3241	NC_020246	A	6	6	148812	148817	100 %	0 %	0 %	0 %	449066223
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3246	NC_020246	CAT	2	6	149144	149149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066223
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3249	NC_020246	TGT	2	6	149339	149344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066223
3250	NC_020246	GAG	2	6	149526	149531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066223
3251	NC_020246	AGGA	2	8	149545	149552	50 %	0 %	50 %	0 %	449066223
3252	NC_020246	TG	3	6	149567	149572	0 %	50 %	50 %	0 %	449066223
3253	NC_020246	TGA	2	6	149606	149611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066223
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3255	NC_020246	AAG	2	6	149902	149907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066224
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3257	NC_020246	GAG	2	6	150014	150019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066224
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3260	NC_020246	TA	3	6	150169	150174	50 %	50 %	0 %	0 %	449066224
3261	NC_020246	ATT	2	6	150178	150183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066224
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3265	NC_020246	TTG	2	6	150366	150371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066224
3266	NC_020246	A	6	6	150420	150425	100 %	0 %	0 %	0 %	449066224
3267	NC_020246	TTTGG	2	10	150489	150498	0 %	60 %	40 %	0 %	449066224
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3281	NC_020246	AGG	2	6	151382	151387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066225
3282	NC_020246	GGT	2	6	151395	151400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066225
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3359	NC_020246	ATATA	2	10	154717	154726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3372	NC_020246	GA	3	6	155252	155257	50 %	0 %	50 %	0 %	449066231
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3469	NC_020246	TGA	2	6	159428	159433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066235
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3480	NC_020246	AAT	2	6	160271	160276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066236
3481	NC_020246	AT	4	8	160301	160308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3482	NC_020246	AGT	2	6	160335	160340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066237
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3484	NC_020246	ATTG	2	8	160371	160378	25 %	50 %	25 %	0 %	449066237
3485	NC_020246	TGA	2	6	160391	160396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066237
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3489	NC_020246	TTG	2	6	160531	160536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066237
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3492	NC_020246	GGTT	2	8	160703	160710	0 %	50 %	50 %	0 %	449066237
3493	NC_020246	CTT	2	6	160719	160724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066237
3494	NC_020246	GAA	2	6	160745	160750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066237
3495	NC_020246	CTTCA	2	10	160792	160801	20 %	40 %	0 %	40 %	449066237
3496	NC_020246	GTA	2	6	160903	160908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066237
3497	NC_020246	AGA	2	6	161005	161010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066237
3498	NC_020246	TAT	2	6	161013	161018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066237
3499	NC_020246	GGT	2	6	161040	161045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066237
3500	NC_020246	AATG	2	8	161070	161077	50 %	25 %	25 %	0 %	449066237

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