MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sulfolobus acidocaldarius N8

Total Repeats: 46505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020246	GGA	2	6	44392	44397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066103
1002	NC_020246	TCCAAA	2	12	44521	44532	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	449066103
1003	NC_020246	GA	3	6	44546	44551	50 %	0 %	50 %	0 %	449066103
1004	NC_020246	CCA	2	6	44630	44635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066103
1005	NC_020246	TCA	2	6	44688	44693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066103
1006	NC_020246	TGA	2	6	44740	44745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066103
1007	NC_020246	AAG	2	6	44783	44788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066103
1008	NC_020246	AGA	2	6	44809	44814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066103
1009	NC_020246	AG	3	6	44866	44871	50 %	0 %	50 %	0 %	449066103
1010	NC_020246	AGATC	2	10	44900	44909	40 %	20 %	20 %	20 %	449066103
1011	NC_020246	GTCA	2	8	44944	44951	25 %	25 %	25 %	25 %	449066103
1012	NC_020246	TGAA	2	8	45075	45082	50 %	25 %	25 %	0 %	449066103
1013	NC_020246	AT	3	6	45092	45097	50 %	50 %	0 %	0 %	449066103
1014	NC_020246	AAAG	2	8	45160	45167	75 %	0 %	25 %	0 %	449066103
1015	NC_020246	A	6	6	45189	45194	100 %	0 %	0 %	0 %	449066103
1016	NC_020246	GAG	2	6	45215	45220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066103
1017	NC_020246	AGA	3	9	45317	45325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066103
1018	NC_020246	GTTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	449066103
1019	NC_020246	AGGTA	2	10	45370	45379	40 %	20 %	40 %	0 %	449066103
1020	NC_020246	CT	3	6	45409	45414	0 %	50 %	0 %	50 %	449066103
1021	NC_020246	CT	3	6	45454	45459	0 %	50 %	0 %	50 %	449066103
1022	NC_020246	AAT	2	6	45497	45502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066103
1023	NC_020246	GAA	2	6	45514	45519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066103
1024	NC_020246	TCGTT	2	10	45538	45547	0 %	60 %	20 %	20 %	449066103
1025	NC_020246	AT	3	6	45576	45581	50 %	50 %	0 %	0 %	449066103
1026	NC_020246	A	6	6	45680	45685	100 %	0 %	0 %	0 %	449066103
1027	NC_020246	CT	3	6	45695	45700	0 %	50 %	0 %	50 %	449066103
1028	NC_020246	TA	3	6	45752	45757	50 %	50 %	0 %	0 %	449066103
1029	NC_020246	AAG	2	6	45775	45780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066103
1030	NC_020246	T	6	6	45862	45867	0 %	100 %	0 %	0 %	449066104
1031	NC_020246	AAG	2	6	45945	45950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066104
1032	NC_020246	GAA	2	6	45952	45957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066104
1033	NC_020246	ATG	2	6	45995	46000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066104
1034	NC_020246	TTC	2	6	46040	46045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066104
1035	NC_020246	CTC	2	6	46049	46054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066104
1036	NC_020246	ATT	2	6	46099	46104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066104
1037	NC_020246	TC	3	6	46195	46200	0 %	50 %	0 %	50 %	449066104
1038	NC_020246	AT	3	6	46298	46303	50 %	50 %	0 %	0 %	449066104
1039	NC_020246	AAG	2	6	46444	46449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066104
1040	NC_020246	CT	3	6	46457	46462	0 %	50 %	0 %	50 %	449066104
1041	NC_020246	TTA	2	6	46499	46504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066104
1042	NC_020246	T	6	6	46575	46580	0 %	100 %	0 %	0 %	449066104
1043	NC_020246	AAG	2	6	46604	46609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066104
1044	NC_020246	AAG	2	6	46687	46692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066105
1045	NC_020246	TTTA	2	8	46708	46715	25 %	75 %	0 %	0 %	449066105
1046	NC_020246	TAT	2	6	46759	46764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066105
1047	NC_020246	TAG	2	6	46783	46788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066105
1048	NC_020246	TCA	2	6	46865	46870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066105
1049	NC_020246	TCCA	2	8	46935	46942	25 %	25 %	0 %	50 %	449066105
1050	NC_020246	ATT	2	6	47051	47056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066105
1051	NC_020246	ATCC	2	8	47190	47197	25 %	25 %	0 %	50 %	449066105
1052	NC_020246	ACC	2	6	47233	47238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066105
1053	NC_020246	TCT	2	6	47291	47296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066105
1054	NC_020246	CTAAA	2	10	47328	47337	60 %	20 %	0 %	20 %	449066105
1055	NC_020246	CT	3	6	47599	47604	0 %	50 %	0 %	50 %	449066106
1056	NC_020246	TAT	2	6	47621	47626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066106
1057	NC_020246	T	6	6	47626	47631	0 %	100 %	0 %	0 %	449066106
1058	NC_020246	CTC	2	6	47719	47724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066106
1059	NC_020246	TACT	2	8	47812	47819	25 %	50 %	0 %	25 %	449066106
1060	NC_020246	AAC	2	6	47891	47896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066106
1061	NC_020246	CTA	2	6	47926	47931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066106
1062	NC_020246	CTA	2	6	47971	47976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066106
1063	NC_020246	T	6	6	48024	48029	0 %	100 %	0 %	0 %	449066106
1064	NC_020246	GCC	2	6	48038	48043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449066106
1065	NC_020246	ACC	2	6	48060	48065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449066106
1066	NC_020246	CTAG	2	8	48119	48126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_020246	TTA	2	6	48135	48140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020246	TTG	2	6	48143	48148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020246	ATT	2	6	48267	48272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_020246	TA	3	6	48303	48308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020246	AAT	2	6	48314	48319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_020246	ACTTA	2	10	48342	48351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_020246	TTTA	2	8	48363	48370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020246	AGAA	2	8	48435	48442	75 %	0 %	25 %	0 %	449066107
1075	NC_020246	AAG	2	6	48461	48466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066107
1076	NC_020246	GAC	2	6	48503	48508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066107
1077	NC_020246	ATT	2	6	48559	48564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066107
1078	NC_020246	AG	3	6	48587	48592	50 %	0 %	50 %	0 %	449066107
1079	NC_020246	AAATA	2	10	48596	48605	80 %	20 %	0 %	0 %	449066107
1080	NC_020246	TTA	2	6	48656	48661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_020246	TACT	2	8	48696	48703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1082	NC_020246	AT	3	6	48706	48711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_020246	TTATG	2	10	48713	48722	20 %	60 %	20 %	0 %	449066108
1084	NC_020246	GA	3	6	48747	48752	50 %	0 %	50 %	0 %	449066108
1085	NC_020246	A	6	6	48779	48784	100 %	0 %	0 %	0 %	449066108
1086	NC_020246	AAAT	2	8	48862	48869	75 %	25 %	0 %	0 %	449066108
1087	NC_020246	GTG	2	6	48964	48969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066108
1088	NC_020246	TAT	2	6	49031	49036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066108
1089	NC_020246	AT	3	6	49048	49053	50 %	50 %	0 %	0 %	449066108
1090	NC_020246	ATG	2	6	49055	49060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066108
1091	NC_020246	TGA	2	6	49079	49084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020246	AAACT	2	10	49143	49152	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_020246	AAT	2	6	49156	49161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020246	ACC	2	6	49187	49192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_020246	TC	3	6	49196	49201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_020246	ATC	2	6	49214	49219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_020246	CAA	2	6	49223	49228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_020246	ATC	2	6	49302	49307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_020246	TAGA	2	8	49329	49336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_020246	ATT	2	6	49393	49398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020246	ACG	2	6	49422	49427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449066109
1102	NC_020246	TGA	2	6	49440	49445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066109
1103	NC_020246	AATC	2	8	49461	49468	50 %	25 %	0 %	25 %	449066109
1104	NC_020246	CAT	2	6	49500	49505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066109
1105	NC_020246	AGA	2	6	49514	49519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066109
1106	NC_020246	GAG	2	6	49524	49529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066109
1107	NC_020246	AT	3	6	49559	49564	50 %	50 %	0 %	0 %	449066109
1108	NC_020246	CTG	2	6	49568	49573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066109
1109	NC_020246	TCGT	2	8	49609	49616	0 %	50 %	25 %	25 %	449066109
1110	NC_020246	AT	3	6	49619	49624	50 %	50 %	0 %	0 %	449066109
1111	NC_020246	TGA	2	6	49626	49631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066109
1112	NC_020246	TTC	2	6	49690	49695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449066109
1113	NC_020246	TAG	2	6	49700	49705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066109
1114	NC_020246	CTATA	2	10	49743	49752	40 %	40 %	0 %	20 %	449066109
1115	NC_020246	CCT	2	6	49813	49818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066109
1116	NC_020246	AGG	2	6	49924	49929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066109
1117	NC_020246	TGAA	2	8	50039	50046	50 %	25 %	25 %	0 %	449066109
1118	NC_020246	TTG	2	6	50093	50098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449066109
1119	NC_020246	GAA	2	6	50233	50238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449066109
1120	NC_020246	AAT	2	6	50266	50271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	449066109
1121	NC_020246	AAAAT	2	10	50278	50287	80 %	20 %	0 %	0 %	449066109
1122	NC_020246	GGA	2	6	50296	50301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449066109
1123	NC_020246	TGAT	2	8	50345	50352	25 %	50 %	25 %	0 %	449066109
1124	NC_020246	TGA	2	6	50394	50399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066109
1125	NC_020246	ATT	2	6	50478	50483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449066109
1126	NC_020246	AAC	2	6	50544	50549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449066109
1127	NC_020246	AAGC	2	8	50571	50578	50 %	0 %	25 %	25 %	449066109
1128	NC_020246	TGG	2	6	50585	50590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449066109
1129	NC_020246	TGGAA	2	10	50613	50622	40 %	20 %	40 %	0 %	449066109
1130	NC_020246	ACTGA	2	10	50638	50647	40 %	20 %	20 %	20 %	449066109
1131	NC_020246	CCT	2	6	50764	50769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	449066109
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1243	NC_020246	TAG	2	6	55670	55675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1250	NC_020246	TAG	2	6	55788	55793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449066116
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1498	NC_020246	TTCT	2	8	66914	66921	0 %	75 %	0 %	25 %	449066131
1499	NC_020246	GCT	2	6	67083	67088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449066131
1500	NC_020246	TAC	2	6	67095	67100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449066131

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