MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Staphylococcus warneri SG1 plasmid pSZ4

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020165	ATC	2	6	29	34	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020165	TAA	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020165	ACA	2	6	135	140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020165	ATG	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020165	GAT	2	6	277	282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020165	GAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020165	TCA	3	9	627	635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020165	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	445060930
9	NC_020165	TGA	2	6	844	849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060930
10	NC_020165	AAG	2	6	867	872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060930
11	NC_020165	ATC	2	6	877	882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	445060930
12	NC_020165	AAT	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060930
13	NC_020165	TTG	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060930
14	NC_020165	GGT	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	445060930
15	NC_020165	TAT	2	6	1178	1183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020165	ATT	2	6	1284	1289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020165	TCG	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020165	AAT	2	6	1326	1331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020165	TTA	2	6	1363	1368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020165	AGG	2	6	1407	1412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020165	AAG	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060931
22	NC_020165	GTT	2	6	1448	1453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060931
23	NC_020165	AAC	2	6	1576	1581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	445060931
24	NC_020165	ATA	2	6	1611	1616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060931
25	NC_020165	AGG	2	6	1811	1816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020165	TAA	3	9	1896	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020165	ATA	2	6	2015	2020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020165	TAA	2	6	2047	2052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020165	GTC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020165	GAC	2	6	2209	2214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020165	GAA	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
32	NC_020165	ACC	2	6	2345	2350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	445060932
33	NC_020165	TTG	2	6	2385	2390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	445060932
34	NC_020165	TAA	2	6	2398	2403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
35	NC_020165	TAA	2	6	2578	2583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
36	NC_020165	ATG	2	6	2592	2597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
37	NC_020165	GAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
38	NC_020165	GAA	2	6	2678	2683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
39	NC_020165	ATT	2	6	2694	2699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	445060932
40	NC_020165	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	445060932
41	NC_020165	TGA	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060932
42	NC_020165	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	445060932
43	NC_020165	AAT	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020165	GTT	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020165	GTA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060933
46	NC_020165	TAT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	445060933
47	NC_020165	ACC	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020165	ACG	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020165	GAA	2	6	3760	3765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020165	GTG	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020165	TGA	2	6	3780	3785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060934
52	NC_020165	CGA	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	445060934
53	NC_020165	TGA	2	6	4138	4143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	445060934
54	NC_020165	CAA	2	6	4151	4156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	445060934
55	NC_020165	AGA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020165	ATC	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.