MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 plasmid pSINAC01

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019893	TTCA	2	8	692	699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019893	CGAA	2	8	898	905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019893	AAAT	2	8	1081	1088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019893	GTCG	2	8	2287	2294	0 %	25 %	50 %	25 %	430740945
5	NC_019893	GCCA	2	8	3243	3250	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
6	NC_019893	CTTC	2	8	3474	3481	0 %	50 %	0 %	50 %	430740946
7	NC_019893	CCGA	2	8	3627	3634	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
8	NC_019893	GCTG	2	8	4020	4027	0 %	25 %	50 %	25 %	430740946
9	NC_019893	AATG	2	8	4051	4058	50 %	25 %	25 %	0 %	430740946
10	NC_019893	AGCC	2	8	4136	4143	25 %	0 %	25 %	50 %	430740946
11	NC_019893	CATG	2	8	4299	4306	25 %	25 %	25 %	25 %	430740946
12	NC_019893	GACG	2	8	4325	4332	25 %	0 %	50 %	25 %	430740947
13	NC_019893	GGAA	2	8	4464	4471	50 %	0 %	50 %	0 %	430740947
14	NC_019893	CAAG	2	8	4613	4620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019893	CAAA	2	8	4808	4815	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019893	TGAA	2	8	5164	5171	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019893	GGGT	2	8	5177	5184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019893	ACTT	2	8	5196	5203	25 %	50 %	0 %	25 %	430740948
19	NC_019893	CGGC	2	8	5713	5720	0 %	0 %	50 %	50 %	430740948
20	NC_019893	ACCC	2	8	6262	6269	25 %	0 %	0 %	75 %	430740948
21	NC_019893	AAGT	2	8	6618	6625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019893	TGGG	2	8	6631	6638	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019893	CCGA	2	8	6713	6720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_019893	CCGA	2	8	7010	7017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019893	GCCA	2	8	7171	7178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_019893	TCGA	2	8	7799	7806	25 %	25 %	25 %	25 %	430740949
27	NC_019893	TCGC	2	8	7874	7881	0 %	25 %	25 %	50 %	430740949
28	NC_019893	AATC	2	8	8139	8146	50 %	25 %	0 %	25 %	430740950
29	NC_019893	GCCT	2	8	8165	8172	0 %	25 %	25 %	50 %	430740950
30	NC_019893	CAAC	2	8	8280	8287	50 %	0 %	0 %	50 %	430740950
31	NC_019893	CCGA	2	8	8541	8548	25 %	0 %	25 %	50 %	430740950
32	NC_019893	GTCG	2	8	8688	8695	0 %	25 %	50 %	25 %	430740950
33	NC_019893	GCCG	2	8	9975	9982	0 %	0 %	50 %	50 %	430740951
34	NC_019893	GCCA	2	8	10147	10154	25 %	0 %	25 %	50 %	430740951
35	NC_019893	GAAA	2	8	10578	10585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019893	GGGA	2	8	11436	11443	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019893	CGTC	2	8	11923	11930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019893	ATCA	2	8	11938	11945	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_019893	AGGA	2	8	12601	12608	50 %	0 %	50 %	0 %	430740953
40	NC_019893	GCGG	2	8	13265	13272	0 %	0 %	75 %	25 %	430740954
41	NC_019893	ACGG	2	8	13769	13776	25 %	0 %	50 %	25 %	430740954
42	NC_019893	TGAA	2	8	14211	14218	50 %	25 %	25 %	0 %	430740954
43	NC_019893	GCCG	2	8	14349	14356	0 %	0 %	50 %	50 %	430740954
44	NC_019893	TGGA	2	8	14366	14373	25 %	25 %	50 %	0 %	430740954
45	NC_019893	CCGC	2	8	14392	14399	0 %	0 %	25 %	75 %	430740954
46	NC_019893	GATT	2	8	14508	14515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019893	CTGC	2	8	14867	14874	0 %	25 %	25 %	50 %	430740955
48	NC_019893	CAAC	2	8	15034	15041	50 %	0 %	0 %	50 %	430740955
49	NC_019893	CGGC	2	8	15322	15329	0 %	0 %	50 %	50 %	430740955
50	NC_019893	CGCC	2	8	15379	15386	0 %	0 %	25 %	75 %	430740955
51	NC_019893	CGGG	2	8	15391	15398	0 %	0 %	75 %	25 %	430740955
52	NC_019893	AAGG	2	8	15570	15577	50 %	0 %	50 %	0 %	430740955
53	NC_019893	GCGG	2	8	15729	15736	0 %	0 %	75 %	25 %	430740955
54	NC_019893	CGAG	2	8	16142	16149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_019893	AGCA	2	8	16353	16360	50 %	0 %	25 %	25 %	430740956
56	NC_019893	GGGC	2	8	16538	16545	0 %	0 %	75 %	25 %	430740956
57	NC_019893	TCGA	2	8	16755	16762	25 %	25 %	25 %	25 %	430740956
58	NC_019893	GATT	2	8	16967	16974	25 %	50 %	25 %	0 %	430740956
59	NC_019893	CAGG	2	8	17688	17695	25 %	0 %	50 %	25 %	430740957
60	NC_019893	GAAG	2	8	18014	18021	50 %	0 %	50 %	0 %	430740957
61	NC_019893	AGCA	2	8	18269	18276	50 %	0 %	25 %	25 %	430740957
62	NC_019893	CGAA	2	8	19317	19324	50 %	0 %	25 %	25 %	430740958
63	NC_019893	GCTT	2	8	19732	19739	0 %	50 %	25 %	25 %	430740958
64	NC_019893	TCGC	2	8	19814	19821	0 %	25 %	25 %	50 %	430740958
65	NC_019893	GGGA	2	8	19949	19956	25 %	0 %	75 %	0 %	430740958
66	NC_019893	CCGC	2	8	20219	20226	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_019893	CATT	2	8	20229	20236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_019893	GAGC	2	8	20985	20992	25 %	0 %	50 %	25 %	430740959
69	NC_019893	CGAC	2	8	22047	22054	25 %	0 %	25 %	50 %	430740960
70	NC_019893	GACC	2	8	22140	22147	25 %	0 %	25 %	50 %	430740960
71	NC_019893	AGAA	2	8	22377	22384	75 %	0 %	25 %	0 %	430740960
72	NC_019893	GGCG	2	8	22465	22472	0 %	0 %	75 %	25 %	430740960
73	NC_019893	GGTC	2	8	23384	23391	0 %	25 %	50 %	25 %	430740961
74	NC_019893	ATCG	2	8	23546	23553	25 %	25 %	25 %	25 %	430740961
75	NC_019893	GTCG	2	8	23922	23929	0 %	25 %	50 %	25 %	430740961
76	NC_019893	CCGA	2	8	23998	24005	25 %	0 %	25 %	50 %	430740961
77	NC_019893	GCCG	2	8	24478	24485	0 %	0 %	50 %	50 %	430740961
78	NC_019893	GACC	2	8	24907	24914	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
79	NC_019893	GGCA	2	8	24937	24944	25 %	0 %	50 %	25 %	430740962
80	NC_019893	GACC	2	8	25198	25205	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
81	NC_019893	GGGT	2	8	25367	25374	0 %	25 %	75 %	0 %	430740962
82	NC_019893	CAGC	2	8	25375	25382	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
83	NC_019893	TCTT	2	8	25652	25659	0 %	75 %	0 %	25 %	430740962
84	NC_019893	CCAG	2	8	25823	25830	25 %	0 %	25 %	50 %	430740962
85	NC_019893	GCTC	2	8	26027	26034	0 %	25 %	25 %	50 %	430740962
86	NC_019893	TGCC	2	8	26210	26217	0 %	25 %	25 %	50 %	430740962
87	NC_019893	GGCG	2	8	26884	26891	0 %	0 %	75 %	25 %	430740962
88	NC_019893	CCCG	2	8	27066	27073	0 %	0 %	25 %	75 %	430740963
89	NC_019893	TGCC	2	8	27240	27247	0 %	25 %	25 %	50 %	430740963
90	NC_019893	CGAT	2	8	27417	27424	25 %	25 %	25 %	25 %	430740963
91	NC_019893	CGGG	2	8	27786	27793	0 %	0 %	75 %	25 %	430740963
92	NC_019893	GTTT	2	8	28039	28046	0 %	75 %	25 %	0 %	430740963
93	NC_019893	CTGG	2	8	28267	28274	0 %	25 %	50 %	25 %	430740963
94	NC_019893	CCCA	2	8	28951	28958	25 %	0 %	0 %	75 %	430740964
95	NC_019893	CAGC	2	8	29169	29176	25 %	0 %	25 %	50 %	430740964
96	NC_019893	ACGC	2	8	29396	29403	25 %	0 %	25 %	50 %	430740964
97	NC_019893	CCGG	2	8	29466	29473	0 %	0 %	50 %	50 %	430740964
98	NC_019893	GCCG	2	8	29742	29749	0 %	0 %	50 %	50 %	430740964
99	NC_019893	TTGA	2	8	30345	30352	25 %	50 %	25 %	0 %	430740964
100	NC_019893	GAAC	2	8	30717	30724	50 %	0 %	25 %	25 %	430740964
101	NC_019893	TCCA	2	8	30839	30846	25 %	25 %	0 %	50 %	430740964
102	NC_019893	TCGA	2	8	30889	30896	25 %	25 %	25 %	25 %	430740964
103	NC_019893	GATC	2	8	31065	31072	25 %	25 %	25 %	25 %	430740964
104	NC_019893	CCCG	2	8	31707	31714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_019893	ATTA	2	8	31723	31730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019893	CGCC	2	8	31832	31839	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_019893	TGGA	2	8	31988	31995	25 %	25 %	50 %	0 %	430740965
108	NC_019893	GCCG	2	8	32315	32322	0 %	0 %	50 %	50 %	430740965
109	NC_019893	AGTC	2	8	32382	32389	25 %	25 %	25 %	25 %	430740965
110	NC_019893	TGGC	2	8	32846	32853	0 %	25 %	50 %	25 %	430740966
111	NC_019893	GTTG	2	8	32893	32900	0 %	50 %	50 %	0 %	430740966
112	NC_019893	GATT	2	8	33921	33928	25 %	50 %	25 %	0 %	430740966
113	NC_019893	GCCC	2	8	34012	34019	0 %	0 %	25 %	75 %	430740966
114	NC_019893	TCGA	2	8	34135	34142	25 %	25 %	25 %	25 %	430740966
115	NC_019893	CTTT	2	8	34267	34274	0 %	75 %	0 %	25 %	430740966
116	NC_019893	GATG	2	8	34582	34589	25 %	25 %	50 %	0 %	430740967
117	NC_019893	CTCG	2	8	34771	34778	0 %	25 %	25 %	50 %	430740967
118	NC_019893	GCTG	2	8	34800	34807	0 %	25 %	50 %	25 %	430740967
119	NC_019893	ACCT	2	8	34898	34905	25 %	25 %	0 %	50 %	430740967
120	NC_019893	CGAT	2	8	35250	35257	25 %	25 %	25 %	25 %	430740967
121	NC_019893	ACCG	2	8	36020	36027	25 %	0 %	25 %	50 %	430740967
122	NC_019893	CGTG	2	8	36040	36047	0 %	25 %	50 %	25 %	430740967
123	NC_019893	TCGT	2	8	36074	36081	0 %	50 %	25 %	25 %	430740967
124	NC_019893	TCGA	2	8	36839	36846	25 %	25 %	25 %	25 %	430740967
125	NC_019893	CTTG	2	8	36937	36944	0 %	50 %	25 %	25 %	430740967
126	NC_019893	CAGC	2	8	37077	37084	25 %	0 %	25 %	50 %	430740967
127	NC_019893	TTTA	2	8	37791	37798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019893	TCGG	2	8	38461	38468	0 %	25 %	50 %	25 %	430740968
129	NC_019893	GCTC	2	8	39004	39011	0 %	25 %	25 %	50 %	430740968
130	NC_019893	CAGC	2	8	39086	39093	25 %	0 %	25 %	50 %	430740968
131	NC_019893	GCTC	2	8	39743	39750	0 %	25 %	25 %	50 %	430740969
132	NC_019893	GGTG	2	8	39847	39854	0 %	25 %	75 %	0 %	430740969
133	NC_019893	GCCG	2	8	39999	40006	0 %	0 %	50 %	50 %	430740969
134	NC_019893	GCCG	2	8	40868	40875	0 %	0 %	50 %	50 %	430740970
135	NC_019893	CGGC	2	8	41879	41886	0 %	0 %	50 %	50 %	430740970
136	NC_019893	CCGC	2	8	42678	42685	0 %	0 %	25 %	75 %	430740972
137	NC_019893	TACA	2	8	43655	43662	50 %	25 %	0 %	25 %	430740973
138	NC_019893	CTCG	2	8	43778	43785	0 %	25 %	25 %	50 %	430740973
139	NC_019893	TTTC	2	8	44125	44132	0 %	75 %	0 %	25 %	430740973
140	NC_019893	GAGC	2	8	44428	44435	25 %	0 %	50 %	25 %	430740974
141	NC_019893	GTTG	2	8	44482	44489	0 %	50 %	50 %	0 %	430740974
142	NC_019893	GCGG	2	8	44504	44511	0 %	0 %	75 %	25 %	430740974
143	NC_019893	CCGG	2	8	44776	44783	0 %	0 %	50 %	50 %	430740974
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.