MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 chromosome

Total Repeats: 138428

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019892	CGG	2	6	33	38	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019892	CGC	2	6	66	71	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_019892	GTG	2	6	209	214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741031
4	NC_019892	GCG	2	6	317	322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741031
5	NC_019892	TCC	2	6	385	390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_019892	TCG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019892	CTT	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019892	TGG	2	6	747	752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741032
9	NC_019892	GAC	2	6	860	865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741032
10	NC_019892	CTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741032
11	NC_019892	GGC	2	6	940	945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741032
12	NC_019892	CGA	2	6	991	996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741032
13	NC_019892	CAG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741032
14	NC_019892	GGC	2	6	1140	1145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741032
15	NC_019892	GCG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741032
16	NC_019892	TGA	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741032
17	NC_019892	TCC	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741032
18	NC_019892	ATC	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741032
19	NC_019892	GGC	2	6	1531	1536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741032
20	NC_019892	CGG	2	6	1550	1555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741032
21	NC_019892	CGA	2	6	1570	1575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741032
22	NC_019892	GTC	2	6	1604	1609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741032
23	NC_019892	CGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741032
24	NC_019892	TCA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741032
25	NC_019892	GCC	2	6	1847	1852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741032
26	NC_019892	ATG	2	6	1955	1960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741032
27	NC_019892	GCC	2	6	1991	1996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741032
28	NC_019892	GCC	2	6	2010	2015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741032
29	NC_019892	CGG	2	6	2020	2025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741032
30	NC_019892	CGA	2	6	2080	2085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741032
31	NC_019892	CGC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_019892	TCT	2	6	2293	2298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_019892	ATC	2	6	2328	2333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019892	TCC	2	6	2459	2464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741033
35	NC_019892	TCA	2	6	2803	2808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741033
36	NC_019892	TTA	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430741033
37	NC_019892	CGC	2	6	2912	2917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741033
38	NC_019892	CTT	2	6	2921	2926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741033
39	NC_019892	GTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741033
40	NC_019892	CGG	2	6	3096	3101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741033
41	NC_019892	CTC	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741033
42	NC_019892	CGG	2	6	3187	3192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741033
43	NC_019892	ACG	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741034
44	NC_019892	AGG	2	6	3411	3416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741034
45	NC_019892	TGG	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741034
46	NC_019892	CTC	2	6	3545	3550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741034
47	NC_019892	GGC	2	6	3606	3611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741034
48	NC_019892	GCC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741034
49	NC_019892	GAC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741034
50	NC_019892	CCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741034
51	NC_019892	CCA	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741034
52	NC_019892	TGC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741034
53	NC_019892	GCG	2	6	3939	3944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741034
54	NC_019892	CTC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741034
55	NC_019892	GCC	2	6	4061	4066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741034
56	NC_019892	CGC	2	6	4158	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741035
57	NC_019892	CGC	2	6	4254	4259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741035
58	NC_019892	TCC	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741035
59	NC_019892	ACT	2	6	4559	4564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741035
60	NC_019892	CCG	2	6	4574	4579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741035
61	NC_019892	TCG	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741035
62	NC_019892	TCG	2	6	4762	4767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741035
63	NC_019892	TTG	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741035
64	NC_019892	GAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741035
65	NC_019892	GTC	3	9	4909	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741035
66	NC_019892	TCC	2	6	5021	5026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741035
67	NC_019892	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741035
68	NC_019892	TCT	2	6	5166	5171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741035
69	NC_019892	GAT	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741035
70	NC_019892	TCT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741035
71	NC_019892	GCG	2	6	5356	5361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741035
72	NC_019892	CGA	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741035
73	NC_019892	CCG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741035
74	NC_019892	CGA	2	6	5592	5597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741035
75	NC_019892	CCG	2	6	5603	5608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741035
76	NC_019892	GCT	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741035
77	NC_019892	GAC	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741035
78	NC_019892	CAA	2	6	5757	5762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430741035
79	NC_019892	AAT	2	6	5859	5864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430741035
80	NC_019892	TTC	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741036
81	NC_019892	CGA	2	6	6157	6162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
82	NC_019892	CTT	2	6	6194	6199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741036
83	NC_019892	CGA	3	9	6253	6261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
84	NC_019892	CGA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
85	NC_019892	CAT	2	6	6365	6370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741036
86	NC_019892	TGG	2	6	6483	6488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741036
87	NC_019892	GGC	2	6	6535	6540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741036
88	NC_019892	GAT	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741036
89	NC_019892	CGG	2	6	6585	6590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741036
90	NC_019892	CGC	2	6	6606	6611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
91	NC_019892	CCG	2	6	6732	6737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
92	NC_019892	GCT	2	6	6784	6789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
93	NC_019892	CGG	2	6	6835	6840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741036
94	NC_019892	GCC	2	6	6972	6977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
95	NC_019892	TCG	2	6	7005	7010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
96	NC_019892	TCG	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
97	NC_019892	CGA	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
98	NC_019892	CTT	2	6	7052	7057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741036
99	NC_019892	CGT	2	6	7084	7089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
100	NC_019892	GTC	2	6	7121	7126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
101	NC_019892	GAT	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741036
102	NC_019892	CGA	2	6	7213	7218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
103	NC_019892	TCG	2	6	7338	7343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
104	NC_019892	GAC	2	6	7352	7357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
105	NC_019892	CCA	2	6	7461	7466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741036
106	NC_019892	CGA	2	6	7528	7533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
107	NC_019892	CGC	2	6	7579	7584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
108	NC_019892	AGG	2	6	7604	7609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741036
109	NC_019892	CCG	2	6	7632	7637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
110	NC_019892	CGC	2	6	7679	7684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
111	NC_019892	GCT	2	6	7696	7701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
112	NC_019892	TCC	3	9	7731	7739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741036
113	NC_019892	CGC	2	6	7808	7813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
114	NC_019892	ACG	2	6	7861	7866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741036
115	NC_019892	CGT	2	6	7870	7875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
116	NC_019892	CGT	2	6	7887	7892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741036
117	NC_019892	TTC	4	12	7893	7904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741036
118	NC_019892	GGC	2	6	7953	7958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741036
119	NC_019892	CGG	3	9	7972	7980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741036
120	NC_019892	CGC	2	6	8051	8056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741036
121	NC_019892	CTC	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741036
122	NC_019892	GAG	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741036
123	NC_019892	GAG	3	9	8187	8195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019892	GCC	2	6	8200	8205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019892	GGC	2	6	8228	8233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_019892	CTT	2	6	8315	8320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741037
127	NC_019892	GGC	2	6	8321	8326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741037
128	NC_019892	TCG	2	6	8442	8447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741037
129	NC_019892	GCC	2	6	8490	8495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741037
130	NC_019892	AGC	2	6	8608	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741037
131	NC_019892	GCG	2	6	8666	8671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741037
132	NC_019892	GCC	2	6	8697	8702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741037
133	NC_019892	ATC	2	6	8847	8852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741037
134	NC_019892	GCC	2	6	8853	8858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741037
135	NC_019892	CTG	2	6	8906	8911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741037
136	NC_019892	CAT	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741037
137	NC_019892	GAA	2	6	8990	8995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741037
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139	NC_019892	GGT	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741037
140	NC_019892	TCG	2	6	9282	9287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741037
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145	NC_019892	GGT	2	6	9389	9394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741037
146	NC_019892	CGT	2	6	9404	9409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741037
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153	NC_019892	CCG	2	6	9928	9933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741037
154	NC_019892	TCC	2	6	9951	9956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741037
155	NC_019892	TCC	2	6	10011	10016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741037
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157	NC_019892	CGA	2	6	10353	10358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019892	CTC	2	6	10396	10401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_019892	GCC	2	6	10466	10471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_019892	TGG	2	6	10582	10587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019892	CGA	2	6	10659	10664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741038
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163	NC_019892	TCG	2	6	10820	10825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741038
164	NC_019892	CGG	2	6	11019	11024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741038
165	NC_019892	TCC	2	6	11069	11074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741038
166	NC_019892	CTG	2	6	11122	11127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741038
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169	NC_019892	CGA	2	6	11238	11243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741038
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177	NC_019892	GAT	2	6	11684	11689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_019892	ACA	2	6	11706	11711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_019892	TTC	2	6	11735	11740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_019892	GTG	2	6	11754	11759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_019892	CCT	2	6	11876	11881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741039
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197	NC_019892	GTG	2	6	13021	13026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
198	NC_019892	GAC	2	6	13056	13061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741040
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200	NC_019892	GAC	2	6	13217	13222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741040
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205	NC_019892	CGC	2	6	13882	13887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741041
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211	NC_019892	ACG	2	6	14330	14335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741041
212	NC_019892	AGG	2	6	14378	14383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741041
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214	NC_019892	GAG	2	6	14588	14593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
215	NC_019892	GCA	2	6	14620	14625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
216	NC_019892	TCC	2	6	14795	14800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
217	NC_019892	AGA	2	6	14827	14832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
218	NC_019892	GAG	2	6	14868	14873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
219	NC_019892	CAA	2	6	14915	14920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430741042
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232	NC_019892	CAA	2	6	15953	15958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430741042
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234	NC_019892	CAA	2	6	16190	16195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_019892	TTC	2	6	16323	16328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
236	NC_019892	GAT	2	6	16353	16358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
237	NC_019892	GCG	2	6	16365	16370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
238	NC_019892	GGA	2	6	16419	16424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
239	NC_019892	AAG	2	6	16462	16467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
240	NC_019892	GAG	2	6	16573	16578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
241	NC_019892	GCC	2	6	16648	16653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
242	NC_019892	TCA	2	6	16698	16703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741043
243	NC_019892	TGG	2	6	16746	16751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741043
244	NC_019892	TCA	2	6	16785	16790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741043
245	NC_019892	CTT	2	6	16907	16912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_019892	CAT	2	6	16964	16969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741044
247	NC_019892	CCG	2	6	17092	17097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741044
248	NC_019892	TGG	2	6	17210	17215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741044
249	NC_019892	CGT	2	6	17298	17303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741044
250	NC_019892	CCA	2	6	17321	17326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741044
251	NC_019892	AGC	2	6	17476	17481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741044
252	NC_019892	TGT	2	6	17492	17497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741044
253	NC_019892	ATC	2	6	17530	17535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741044
254	NC_019892	TTA	2	6	17755	17760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430741044
255	NC_019892	GCC	2	6	17788	17793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741044
256	NC_019892	CCG	2	6	17882	17887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741044
257	NC_019892	CAC	2	6	18123	18128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741045
258	NC_019892	CGG	2	6	18131	18136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741045
259	NC_019892	GAT	2	6	18168	18173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741045
260	NC_019892	GAT	2	6	18221	18226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741045
261	NC_019892	TCG	2	6	18256	18261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741045
262	NC_019892	GAA	2	6	18276	18281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741045
263	NC_019892	CGA	2	6	18320	18325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741045
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383	NC_019892	TCG	2	6	26534	26539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741048
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387	NC_019892	CGA	2	6	26775	26780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741048
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