MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Singulisphaera acidiphila DSM 18658 chromosome

Total Repeats: 202529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019892	ATG	3	9	139606	139614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_019892	CGTGA	2	10	139653	139662	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3003	NC_019892	TC	3	6	139782	139787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_019892	TTGC	2	8	139839	139846	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_019892	CGG	2	6	139891	139896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741136
3006	NC_019892	TCC	2	6	139931	139936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741136
3007	NC_019892	GAA	2	6	139981	139986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430741136
3008	NC_019892	GCC	2	6	140039	140044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741136
3009	NC_019892	ACGC	2	8	140097	140104	25 %	0 %	25 %	50 %	430741136
3010	NC_019892	ACG	2	6	140113	140118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741136
3011	NC_019892	CAG	2	6	140176	140181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741136
3012	NC_019892	CGGG	2	8	140184	140191	0 %	0 %	75 %	25 %	430741136
3013	NC_019892	TCC	2	6	140203	140208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741136
3014	NC_019892	AGCG	2	8	140258	140265	25 %	0 %	50 %	25 %	430741136
3015	NC_019892	AGGC	2	8	140310	140317	25 %	0 %	50 %	25 %	430741136
3016	NC_019892	TCGATT	2	12	140336	140347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430741136
3017	NC_019892	TGG	2	6	140358	140363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741136
3018	NC_019892	TGG	2	6	140421	140426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741136
3019	NC_019892	GCCG	2	8	140450	140457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_019892	TGCG	2	8	140496	140503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_019892	TCG	2	6	140512	140517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_019892	CCGG	2	8	140538	140545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_019892	AGC	2	6	140565	140570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_019892	GT	3	6	140630	140635	0 %	50 %	50 %	0 %	430741137
3025	NC_019892	CCA	2	6	140718	140723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741137
3026	NC_019892	TGT	2	6	140758	140763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430741137
3027	NC_019892	ACC	2	6	140782	140787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741137
3028	NC_019892	GAC	2	6	140793	140798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741137
3029	NC_019892	GTCGA	2	10	140823	140832	20 %	20 %	40 %	20 %	430741137
3030	NC_019892	GGGT	2	8	140835	140842	0 %	25 %	75 %	0 %	430741137
3031	NC_019892	GCC	2	6	140851	140856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741137
3032	NC_019892	AT	3	6	140902	140907	50 %	50 %	0 %	0 %	430741137
3033	NC_019892	ATA	2	6	140995	141000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_019892	GC	3	6	141004	141009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_019892	CATG	2	8	141064	141071	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3036	NC_019892	CGA	2	6	141091	141096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_019892	CA	3	6	141123	141128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_019892	CTTC	2	8	141136	141143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_019892	CG	3	6	141218	141223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_019892	TTG	2	6	141302	141307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_019892	AGG	2	6	141360	141365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_019892	TCC	2	6	141435	141440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_019892	GCGG	2	8	141467	141474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3044	NC_019892	CGCCC	2	10	141487	141496	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3045	NC_019892	GGC	2	6	141507	141512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_019892	CCCG	2	8	141617	141624	0 %	0 %	25 %	75 %	430741138
3047	NC_019892	GA	3	6	141768	141773	50 %	0 %	50 %	0 %	430741138
3048	NC_019892	GCC	2	6	141778	141783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741138
3049	NC_019892	CGC	2	6	141808	141813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741138
3050	NC_019892	ATC	2	6	141837	141842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741138
3051	NC_019892	CGG	2	6	141900	141905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741138
3052	NC_019892	GTC	2	6	141948	141953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741138
3053	NC_019892	CTT	2	6	142011	142016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741139
3054	NC_019892	GAG	2	6	142026	142031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741139
3055	NC_019892	TACC	2	8	142055	142062	25 %	25 %	0 %	50 %	430741139
3056	NC_019892	GAC	2	6	142134	142139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741139
3057	NC_019892	CCT	2	6	142148	142153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741139
3058	NC_019892	GC	3	6	142202	142207	0 %	0 %	50 %	50 %	430741139
3059	NC_019892	GCC	2	6	142259	142264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741139
3060	NC_019892	GTC	2	6	142302	142307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741139
3061	NC_019892	GGT	2	6	142348	142353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_019892	GA	3	6	142426	142431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_019892	TC	3	6	142493	142498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_019892	CGTCG	2	10	142506	142515	0 %	20 %	40 %	40 %	430741140
3065	NC_019892	GGC	2	6	142518	142523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741140
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3074	NC_019892	GC	3	6	143030	143035	0 %	0 %	50 %	50 %	430741140
3075	NC_019892	CCG	2	6	143065	143070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741140
3076	NC_019892	TGA	2	6	143168	143173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741140
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3078	NC_019892	GAGC	2	8	143250	143257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_019892	CGA	2	6	143262	143267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3082	NC_019892	CCA	2	6	143507	143512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741141
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3085	NC_019892	CTCGA	2	10	143618	143627	20 %	20 %	20 %	40 %	430741141
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3088	NC_019892	CGGGT	2	10	143811	143820	0 %	20 %	60 %	20 %	430741141
3089	NC_019892	TCT	2	6	144001	144006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741141
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3093	NC_019892	GCC	2	6	144101	144106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741141
3094	NC_019892	CGA	2	6	144166	144171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741141
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3097	NC_019892	CG	3	6	144246	144251	0 %	0 %	50 %	50 %	430741141
3098	NC_019892	GCC	2	6	144258	144263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741141
3099	NC_019892	TCG	2	6	144294	144299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
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3101	NC_019892	GGT	2	6	144362	144367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741141
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3103	NC_019892	GAC	2	6	144497	144502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3104	NC_019892	CGG	2	6	144528	144533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741141
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3106	NC_019892	GTC	2	6	144587	144592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
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3108	NC_019892	AGCC	2	8	144633	144640	25 %	0 %	25 %	50 %	430741141
3109	NC_019892	CCGG	2	8	144681	144688	0 %	0 %	50 %	50 %	430741141
3110	NC_019892	GCG	2	6	144774	144779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741141
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3112	NC_019892	CTT	2	6	144866	144871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741141
3113	NC_019892	CTC	2	6	144878	144883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741141
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3115	NC_019892	GCC	2	6	144942	144947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741141
3116	NC_019892	AGGCTC	2	12	144960	144971	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430741141
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3119	NC_019892	CGCC	2	8	145042	145049	0 %	0 %	25 %	75 %	430741141
3120	NC_019892	G	7	7	145127	145133	0 %	0 %	100 %	0 %	430741141
3121	NC_019892	AGG	2	6	145194	145199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741141
3122	NC_019892	GCG	2	6	145229	145234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741141
3123	NC_019892	GAT	2	6	145235	145240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430741141
3124	NC_019892	G	6	6	145267	145272	0 %	0 %	100 %	0 %	430741141
3125	NC_019892	CGGC	2	8	145278	145285	0 %	0 %	50 %	50 %	430741141
3126	NC_019892	G	6	6	145360	145365	0 %	0 %	100 %	0 %	430741141
3127	NC_019892	CGG	2	6	145388	145393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741141
3128	NC_019892	CTG	2	6	145481	145486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3129	NC_019892	CGT	2	6	145549	145554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3130	NC_019892	GCACCA	2	12	145597	145608	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	430741141
3131	NC_019892	CGGT	2	8	145629	145636	0 %	25 %	50 %	25 %	430741141
3132	NC_019892	GCGAA	2	10	145652	145661	40 %	0 %	40 %	20 %	430741141
3133	NC_019892	CGAG	2	8	145705	145712	25 %	0 %	50 %	25 %	430741141
3134	NC_019892	CAGG	2	8	145719	145726	25 %	0 %	50 %	25 %	430741141
3135	NC_019892	CGT	2	6	145729	145734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
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3137	NC_019892	GCC	2	6	145786	145791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741141
3138	NC_019892	CGA	2	6	145810	145815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3139	NC_019892	CAT	2	6	145856	145861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741141
3140	NC_019892	TCG	2	6	145873	145878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3141	NC_019892	GCC	3	9	145893	145901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741141
3142	NC_019892	TCC	2	6	145908	145913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741141
3143	NC_019892	AGG	2	6	145923	145928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741141
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3145	NC_019892	GGC	2	6	146020	146025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741141
3146	NC_019892	GAC	2	6	146039	146044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741141
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3148	NC_019892	CG	3	6	146124	146129	0 %	0 %	50 %	50 %	430741141
3149	NC_019892	CACG	2	8	146176	146183	25 %	0 %	25 %	50 %	430741141
3150	NC_019892	C	6	6	146205	146210	0 %	0 %	0 %	100 %	430741141
3151	NC_019892	GCT	2	6	146215	146220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
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3153	NC_019892	GGT	2	6	146340	146345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430741141
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3155	NC_019892	GCT	2	6	146408	146413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3156	NC_019892	GGGCCA	2	12	146421	146432	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430741141
3157	NC_019892	TCCAGG	2	12	146453	146464	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3158	NC_019892	CGG	3	9	146570	146578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741141
3159	NC_019892	CTC	2	6	146581	146586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430741141
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3162	NC_019892	TCA	2	6	146674	146679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741141
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3164	NC_019892	CGA	2	6	146828	146833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741141
3165	NC_019892	CG	3	6	146872	146877	0 %	0 %	50 %	50 %	430741141
3166	NC_019892	CAT	2	6	146924	146929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741141
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3169	NC_019892	CGGC	2	8	147146	147153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3170	NC_019892	TGA	2	6	147261	147266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3171	NC_019892	A	8	8	147292	147299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_019892	GAG	2	6	147301	147306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3173	NC_019892	CT	3	6	147323	147328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3174	NC_019892	TCAC	2	8	147351	147358	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3175	NC_019892	AAG	2	6	147366	147371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3177	NC_019892	CCA	2	6	147468	147473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3178	NC_019892	AGCG	2	8	147496	147503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3179	NC_019892	ACC	2	6	147508	147513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3180	NC_019892	A	7	7	147521	147527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3234	NC_019892	TCT	2	6	149503	149508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741142
3235	NC_019892	GAACC	2	10	149531	149540	40 %	0 %	20 %	40 %	430741142
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3240	NC_019892	GCCC	2	8	149695	149702	0 %	0 %	25 %	75 %	430741142
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3243	NC_019892	CGT	2	6	149818	149823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741142
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3247	NC_019892	GAG	2	6	149941	149946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430741142
3248	NC_019892	GCC	2	6	150030	150035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741142
3249	NC_019892	TCT	2	6	150088	150093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741142
3250	NC_019892	ATCG	2	8	150196	150203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3251	NC_019892	CGGC	2	8	150256	150263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3252	NC_019892	GAG	2	6	150276	150281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_019892	TCA	2	6	150324	150329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430741143
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3255	NC_019892	TTC	2	6	150357	150362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430741143
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3262	NC_019892	CCCCGA	2	12	150717	150728	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3263	NC_019892	CAC	2	6	150913	150918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741144
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3269	NC_019892	GCC	2	6	151103	151108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430741144
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3282	NC_019892	TCG	2	6	151757	151762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741144
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3284	NC_019892	GCT	2	6	151815	151820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741144
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3289	NC_019892	CT	3	6	152118	152123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3291	NC_019892	GA	3	6	152140	152145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3292	NC_019892	AAC	2	6	152226	152231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3293	NC_019892	AGCC	2	8	152289	152296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3294	NC_019892	CGG	2	6	152311	152316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3298	NC_019892	AAAC	2	8	152464	152471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3299	NC_019892	TC	3	6	152596	152601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3300	NC_019892	TCG	2	6	152633	152638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3301	NC_019892	CTT	2	6	152643	152648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3302	NC_019892	T	6	6	152733	152738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3303	NC_019892	CGT	2	6	152767	152772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3305	NC_019892	AGG	2	6	152825	152830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3306	NC_019892	CG	3	6	152863	152868	0 %	0 %	50 %	50 %	430741145
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3323	NC_019892	CGA	2	6	153310	153315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741145
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3351	NC_019892	GCGA	2	8	154411	154418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3352	NC_019892	CT	4	8	154431	154438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3353	NC_019892	CGG	2	6	154510	154515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430741146
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3363	NC_019892	ACC	2	6	154967	154972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430741146
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3367	NC_019892	TCG	2	6	155149	155154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741146
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3369	NC_019892	GAC	2	6	155217	155222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741146
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3496	NC_019892	G	6	6	161439	161444	0 %	0 %	100 %	0 %	430741151
3497	NC_019892	GTC	2	6	161462	161467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430741151
3498	NC_019892	CGA	2	6	161472	161477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430741151
3499	NC_019892	GGC	2	6	161512	161517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3500	NC_019892	GAT	2	6	161573	161578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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