MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 322

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019846	TC	3	6	1712	1717	0 %	50 %	0 %	50 %	433615117
2	NC_019846	GC	4	8	2843	2850	0 %	0 %	50 %	50 %	433615118
3	NC_019846	CG	3	6	3688	3693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_019846	CT	3	6	3708	3713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019846	CG	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019846	GC	3	6	4324	4329	0 %	0 %	50 %	50 %	433615119
7	NC_019846	GC	3	6	4550	4555	0 %	0 %	50 %	50 %	433615119
8	NC_019846	GC	3	6	4568	4573	0 %	0 %	50 %	50 %	433615119
9	NC_019846	GC	3	6	4862	4867	0 %	0 %	50 %	50 %	433615119
10	NC_019846	CG	3	6	5859	5864	0 %	0 %	50 %	50 %	433615122
11	NC_019846	CG	4	8	5917	5924	0 %	0 %	50 %	50 %	433615122
12	NC_019846	CG	3	6	7122	7127	0 %	0 %	50 %	50 %	433615123
13	NC_019846	TC	3	6	7647	7652	0 %	50 %	0 %	50 %	433615124
14	NC_019846	AG	4	8	7653	7660	50 %	0 %	50 %	0 %	433615124
15	NC_019846	CA	3	6	7983	7988	50 %	0 %	0 %	50 %	433615124
16	NC_019846	GC	3	6	8400	8405	0 %	0 %	50 %	50 %	433615125
17	NC_019846	CA	4	8	8826	8833	50 %	0 %	0 %	50 %	433615125
18	NC_019846	GC	3	6	9118	9123	0 %	0 %	50 %	50 %	433615125
19	NC_019846	CG	3	6	9907	9912	0 %	0 %	50 %	50 %	433615127
20	NC_019846	CG	4	8	10066	10073	0 %	0 %	50 %	50 %	433615127
21	NC_019846	GC	3	6	10634	10639	0 %	0 %	50 %	50 %	433615127
22	NC_019846	CA	3	6	10802	10807	50 %	0 %	0 %	50 %	433615128
23	NC_019846	CG	3	6	11890	11895	0 %	0 %	50 %	50 %	433615128
24	NC_019846	TC	3	6	12143	12148	0 %	50 %	0 %	50 %	433615128
25	NC_019846	TC	3	6	12675	12680	0 %	50 %	0 %	50 %	433615128
26	NC_019846	GT	3	6	13034	13039	0 %	50 %	50 %	0 %	433615129
27	NC_019846	CT	3	6	13536	13541	0 %	50 %	0 %	50 %	433615129
28	NC_019846	AG	3	6	13697	13702	50 %	0 %	50 %	0 %	433615129
29	NC_019846	AT	3	6	13942	13947	50 %	50 %	0 %	0 %	433615130
30	NC_019846	AC	3	6	14422	14427	50 %	0 %	0 %	50 %	433615130
31	NC_019846	CG	3	6	14663	14668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_019846	TC	3	6	14690	14695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_019846	CT	3	6	15226	15231	0 %	50 %	0 %	50 %	433615131
34	NC_019846	AG	3	6	15685	15690	50 %	0 %	50 %	0 %	433615131
35	NC_019846	CG	3	6	17060	17065	0 %	0 %	50 %	50 %	433615131
36	NC_019846	GC	3	6	17344	17349	0 %	0 %	50 %	50 %	433615131
37	NC_019846	CG	3	6	17633	17638	0 %	0 %	50 %	50 %	433615131
38	NC_019846	CG	3	6	18399	18404	0 %	0 %	50 %	50 %	433615131
39	NC_019846	AT	3	6	18594	18599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019846	GC	3	6	18665	18670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_019846	GC	3	6	18711	18716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019846	GC	3	6	18775	18780	0 %	0 %	50 %	50 %	433615132
43	NC_019846	GC	3	6	19153	19158	0 %	0 %	50 %	50 %	433615132
44	NC_019846	CG	3	6	19504	19509	0 %	0 %	50 %	50 %	433615132
45	NC_019846	GC	3	6	19558	19563	0 %	0 %	50 %	50 %	433615132
46	NC_019846	CG	5	10	19613	19622	0 %	0 %	50 %	50 %	433615132
47	NC_019846	GA	3	6	19751	19756	50 %	0 %	50 %	0 %	433615132
48	NC_019846	GC	3	6	20406	20411	0 %	0 %	50 %	50 %	433615132
49	NC_019846	GC	4	8	20868	20875	0 %	0 %	50 %	50 %	433615133
50	NC_019846	CG	3	6	21400	21405	0 %	0 %	50 %	50 %	433615133
51	NC_019846	GC	3	6	21648	21653	0 %	0 %	50 %	50 %	433615133
52	NC_019846	CG	3	6	21673	21678	0 %	0 %	50 %	50 %	433615133
53	NC_019846	GC	3	6	22049	22054	0 %	0 %	50 %	50 %	433615134
54	NC_019846	GC	3	6	22122	22127	0 %	0 %	50 %	50 %	433615134
55	NC_019846	CG	3	6	23008	23013	0 %	0 %	50 %	50 %	433615134
56	NC_019846	TG	3	6	23201	23206	0 %	50 %	50 %	0 %	433615134
57	NC_019846	CG	4	8	23219	23226	0 %	0 %	50 %	50 %	433615134
58	NC_019846	GC	3	6	24436	24441	0 %	0 %	50 %	50 %	433615134
59	NC_019846	AG	3	6	24784	24789	50 %	0 %	50 %	0 %	433615135
60	NC_019846	GC	3	6	24892	24897	0 %	0 %	50 %	50 %	433615135
61	NC_019846	GC	3	6	25473	25478	0 %	0 %	50 %	50 %	433615135
62	NC_019846	CG	3	6	25673	25678	0 %	0 %	50 %	50 %	433615135
63	NC_019846	AC	3	6	27084	27089	50 %	0 %	0 %	50 %	433615137
64	NC_019846	CG	3	6	27121	27126	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
65	NC_019846	CG	3	6	27442	27447	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
66	NC_019846	GC	4	8	27855	27862	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
67	NC_019846	GC	3	6	27952	27957	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
68	NC_019846	GC	3	6	28039	28044	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
69	NC_019846	GC	3	6	28067	28072	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
70	NC_019846	GC	4	8	28083	28090	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
71	NC_019846	CG	3	6	28566	28571	0 %	0 %	50 %	50 %	433615139
72	NC_019846	GC	3	6	28864	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	433615139
73	NC_019846	CG	3	6	29467	29472	0 %	0 %	50 %	50 %	433615140
74	NC_019846	AT	3	6	30196	30201	50 %	50 %	0 %	0 %	433615141
75	NC_019846	CG	3	6	31507	31512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019846	TG	3	6	32169	32174	0 %	50 %	50 %	0 %	433615143
77	NC_019846	TG	3	6	33079	33084	0 %	50 %	50 %	0 %	433615143
78	NC_019846	GC	4	8	35314	35321	0 %	0 %	50 %	50 %	433615144
79	NC_019846	CG	4	8	35743	35750	0 %	0 %	50 %	50 %	433615144
80	NC_019846	GC	3	6	38602	38607	0 %	0 %	50 %	50 %	433615147
81	NC_019846	TG	3	6	38758	38763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019846	GC	3	6	39149	39154	0 %	0 %	50 %	50 %	433615148
83	NC_019846	CG	3	6	39381	39386	0 %	0 %	50 %	50 %	433615148
84	NC_019846	CG	4	8	39550	39557	0 %	0 %	50 %	50 %	433615148
85	NC_019846	TC	3	6	40087	40092	0 %	50 %	0 %	50 %	433615149
86	NC_019846	CG	3	6	41015	41020	0 %	0 %	50 %	50 %	433615149
87	NC_019846	TC	3	6	41346	41351	0 %	50 %	0 %	50 %	433615150
88	NC_019846	GC	3	6	41361	41366	0 %	0 %	50 %	50 %	433615150
89	NC_019846	GT	3	6	41774	41779	0 %	50 %	50 %	0 %	433615150
90	NC_019846	GC	3	6	42321	42326	0 %	0 %	50 %	50 %	433615150
91	NC_019846	GC	3	6	43404	43409	0 %	0 %	50 %	50 %	433615151
92	NC_019846	TC	3	6	43520	43525	0 %	50 %	0 %	50 %	433615151
93	NC_019846	GC	3	6	43768	43773	0 %	0 %	50 %	50 %	433615152
94	NC_019846	GC	4	8	44093	44100	0 %	0 %	50 %	50 %	433615152
95	NC_019846	GC	3	6	45343	45348	0 %	0 %	50 %	50 %	433615153
96	NC_019846	GC	3	6	45522	45527	0 %	0 %	50 %	50 %	433615154
97	NC_019846	AT	4	8	46485	46492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019846	TC	3	6	48096	48101	0 %	50 %	0 %	50 %	433615156
99	NC_019846	GC	3	6	48332	48337	0 %	0 %	50 %	50 %	433615157
100	NC_019846	AC	3	6	48415	48420	50 %	0 %	0 %	50 %	433615157
101	NC_019846	AT	3	6	48891	48896	50 %	50 %	0 %	0 %	433615158
102	NC_019846	GC	3	6	49329	49334	0 %	0 %	50 %	50 %	433615158
103	NC_019846	CG	3	6	49771	49776	0 %	0 %	50 %	50 %	433615159
104	NC_019846	CT	3	6	50139	50144	0 %	50 %	0 %	50 %	433615159
105	NC_019846	GC	3	6	50148	50153	0 %	0 %	50 %	50 %	433615159
106	NC_019846	CG	3	6	50585	50590	0 %	0 %	50 %	50 %	433615160
107	NC_019846	GC	3	6	50676	50681	0 %	0 %	50 %	50 %	433615160
108	NC_019846	GC	3	6	50768	50773	0 %	0 %	50 %	50 %	433615160
109	NC_019846	CG	3	6	50915	50920	0 %	0 %	50 %	50 %	433615160
110	NC_019846	CG	3	6	51028	51033	0 %	0 %	50 %	50 %	433615160
111	NC_019846	GC	3	6	51211	51216	0 %	0 %	50 %	50 %	433615160
112	NC_019846	GC	3	6	51771	51776	0 %	0 %	50 %	50 %	433615161
113	NC_019846	CG	3	6	51895	51900	0 %	0 %	50 %	50 %	433615161
114	NC_019846	CG	3	6	52061	52066	0 %	0 %	50 %	50 %	433615161
115	NC_019846	GC	3	6	52422	52427	0 %	0 %	50 %	50 %	433615162
116	NC_019846	TC	3	6	53403	53408	0 %	50 %	0 %	50 %	433615163
117	NC_019846	GC	3	6	53431	53436	0 %	0 %	50 %	50 %	433615164
118	NC_019846	AG	3	6	53551	53556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019846	AG	3	6	53876	53881	50 %	0 %	50 %	0 %	433615165
120	NC_019846	GC	3	6	53905	53910	0 %	0 %	50 %	50 %	433615165
121	NC_019846	GC	3	6	56134	56139	0 %	0 %	50 %	50 %	433615165
122	NC_019846	TG	3	6	56179	56184	0 %	50 %	50 %	0 %	433615165
123	NC_019846	GC	3	6	56478	56483	0 %	0 %	50 %	50 %	433615165
124	NC_019846	TC	3	6	58328	58333	0 %	50 %	0 %	50 %	433615166
125	NC_019846	GC	3	6	58906	58911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019846	GC	4	8	59004	59011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019846	GC	3	6	59099	59104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019846	GA	3	6	59308	59313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019846	GC	3	6	59672	59677	0 %	0 %	50 %	50 %	433615167
130	NC_019846	GA	3	6	60562	60567	50 %	0 %	50 %	0 %	433615168
131	NC_019846	GC	3	6	61316	61321	0 %	0 %	50 %	50 %	433615169
132	NC_019846	GA	3	6	62004	62009	50 %	0 %	50 %	0 %	433615169
133	NC_019846	GC	3	6	62212	62217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019846	AG	3	6	62424	62429	50 %	0 %	50 %	0 %	433615170
135	NC_019846	CT	3	6	62500	62505	0 %	50 %	0 %	50 %	433615170
136	NC_019846	GC	3	6	62949	62954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019846	AT	3	6	63418	63423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019846	CG	3	6	65559	65564	0 %	0 %	50 %	50 %	433615173
139	NC_019846	CG	3	6	66463	66468	0 %	0 %	50 %	50 %	433615173
140	NC_019846	CT	3	6	68517	68522	0 %	50 %	0 %	50 %	433615175
141	NC_019846	GC	3	6	69219	69224	0 %	0 %	50 %	50 %	433615175
142	NC_019846	GC	3	6	70097	70102	0 %	0 %	50 %	50 %	433615175
143	NC_019846	CG	3	6	70827	70832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_019846	TG	3	6	71894	71899	0 %	50 %	50 %	0 %	433615178
145	NC_019846	CT	3	6	72395	72400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.