MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 3665

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019846	GCG	2	6	167866	167871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_019846	CG	3	6	167870	167875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_019846	CTGCGC	2	12	167888	167899	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_019846	TTTG	2	8	167912	167919	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_019846	GC	3	6	167936	167941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3506	NC_019846	TCCT	2	8	167981	167988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_019846	GCTC	2	8	168002	168009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_019846	CGGG	2	8	168059	168066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3509	NC_019846	C	6	6	168093	168098	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3510	NC_019846	GCT	2	6	168107	168112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_019846	CG	3	6	168114	168119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_019846	CAT	2	6	168194	168199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615293
3513	NC_019846	CAT	2	6	168206	168211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615293
3514	NC_019846	CCGAT	2	10	168238	168247	20 %	20 %	20 %	40 %	433615293
3515	NC_019846	GGC	2	6	168290	168295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615293
3516	NC_019846	GTT	2	6	168336	168341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615293
3517	NC_019846	AAG	2	6	168354	168359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615293
3518	NC_019846	TCG	3	9	168370	168378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3519	NC_019846	CGG	2	6	168380	168385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615293
3520	NC_019846	CCG	2	6	168386	168391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615293
3521	NC_019846	GGCG	2	8	168419	168426	0 %	0 %	75 %	25 %	433615293
3522	NC_019846	CG	3	6	168590	168595	0 %	0 %	50 %	50 %	433615293
3523	NC_019846	GGCT	2	8	168628	168635	0 %	25 %	50 %	25 %	433615293
3524	NC_019846	GCA	2	6	168662	168667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3525	NC_019846	CGA	2	6	168674	168679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3526	NC_019846	GAT	2	6	168720	168725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615293
3527	NC_019846	GCTT	2	8	168755	168762	0 %	50 %	25 %	25 %	433615293
3528	NC_019846	CGG	2	6	168845	168850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615293
3529	NC_019846	GCC	2	6	168972	168977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615293
3530	NC_019846	GAA	2	6	169083	169088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615293
3531	NC_019846	GGC	2	6	169094	169099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615293
3532	NC_019846	TTGA	2	8	169140	169147	25 %	50 %	25 %	0 %	433615293
3533	NC_019846	CGA	3	9	169160	169168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3534	NC_019846	GGC	2	6	169334	169339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615293
3535	NC_019846	GCG	2	6	169381	169386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615293
3536	NC_019846	GCT	2	6	169458	169463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3537	NC_019846	AAT	2	6	169482	169487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433615293
3538	NC_019846	TTG	2	6	169501	169506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615293
3539	NC_019846	CGT	2	6	169508	169513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3540	NC_019846	TGC	3	9	169522	169530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3541	NC_019846	CACG	2	8	169580	169587	25 %	0 %	25 %	50 %	433615293
3542	NC_019846	CGGCG	2	10	169751	169760	0 %	0 %	60 %	40 %	433615293
3543	NC_019846	GAA	2	6	169781	169786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615293
3544	NC_019846	GAA	2	6	169799	169804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615293
3545	NC_019846	GAC	2	6	169868	169873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615293
3546	NC_019846	AAG	2	6	169974	169979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615293
3547	NC_019846	GTT	2	6	170007	170012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615293
3548	NC_019846	CCG	2	6	170053	170058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615293
3549	NC_019846	TGAG	2	8	170120	170127	25 %	25 %	50 %	0 %	433615293
3550	NC_019846	TCC	2	6	170150	170155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3551	NC_019846	CGA	2	6	170186	170191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_019846	CCCCT	2	10	170247	170256	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3553	NC_019846	AC	3	6	170398	170403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_019846	GTT	2	6	170430	170435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_019846	CCAGA	2	10	170532	170541	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3556	NC_019846	ATAA	2	8	170591	170598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_019846	CCCT	2	8	170619	170626	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3558	NC_019846	TCA	2	6	170716	170721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615294
3559	NC_019846	CGC	2	6	170745	170750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615294
3560	NC_019846	CGG	2	6	170781	170786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615294
3561	NC_019846	TTCG	2	8	170908	170915	0 %	50 %	25 %	25 %	433615294
3562	NC_019846	CGGT	3	12	170975	170986	0 %	25 %	50 %	25 %	433615294
3563	NC_019846	ACGG	2	8	171092	171099	25 %	0 %	50 %	25 %	433615294
3564	NC_019846	AGA	2	6	171174	171179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615294
3565	NC_019846	GCC	2	6	171182	171187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615294
3566	NC_019846	GCG	2	6	171199	171204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615294
3567	NC_019846	GCC	2	6	171245	171250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615294
3568	NC_019846	TC	3	6	171256	171261	0 %	50 %	0 %	50 %	433615294
3569	NC_019846	GGA	2	6	171262	171267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615294
3570	NC_019846	CGG	2	6	171350	171355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615294
3571	NC_019846	GAT	2	6	171388	171393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615294
3572	NC_019846	TAG	2	6	171502	171507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615294
3573	NC_019846	AAC	2	6	171534	171539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615294
3574	NC_019846	GGCT	2	8	171553	171560	0 %	25 %	50 %	25 %	433615294
3575	NC_019846	GAA	2	6	171581	171586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615294
3576	NC_019846	GGC	2	6	171594	171599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615294
3577	NC_019846	TGG	2	6	171642	171647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615294
3578	NC_019846	CAC	2	6	171703	171708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615294
3579	NC_019846	GCGG	2	8	171724	171731	0 %	0 %	75 %	25 %	433615294
3580	NC_019846	AGC	2	6	171801	171806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615294
3581	NC_019846	GCC	2	6	171809	171814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615294
3582	NC_019846	GGA	2	6	171869	171874	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615294
3583	NC_019846	CGC	2	6	172002	172007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615295
3584	NC_019846	GCG	2	6	172111	172116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615295
3585	NC_019846	CAT	2	6	172233	172238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615295
3586	NC_019846	CGC	2	6	172255	172260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615295
3587	NC_019846	TGG	2	6	172262	172267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615295
3588	NC_019846	GGC	2	6	172408	172413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615295
3589	NC_019846	CCG	2	6	172455	172460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615295
3590	NC_019846	CGC	2	6	172560	172565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_019846	ATA	2	6	172595	172600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_019846	TGC	2	6	172602	172607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_019846	CTC	2	6	172671	172676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_019846	CCT	2	6	172793	172798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_019846	CCG	2	6	172834	172839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_019846	ATC	2	6	172852	172857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_019846	ACC	2	6	172861	172866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_019846	CCA	2	6	172954	172959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615296
3599	NC_019846	CG	3	6	173044	173049	0 %	0 %	50 %	50 %	433615296
3600	NC_019846	CGG	2	6	173066	173071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615296
3601	NC_019846	GAA	2	6	173078	173083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615296
3602	NC_019846	TAC	2	6	173106	173111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615296
3603	NC_019846	GAC	2	6	173169	173174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615296
3604	NC_019846	ATC	2	6	173190	173195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615296
3605	NC_019846	AGC	2	6	173237	173242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_019846	CCG	2	6	173352	173357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615297
3607	NC_019846	GCC	2	6	173398	173403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615297
3608	NC_019846	GC	4	8	173410	173417	0 %	0 %	50 %	50 %	433615297
3609	NC_019846	GAG	2	6	173458	173463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615297
3610	NC_019846	CG	3	6	173469	173474	0 %	0 %	50 %	50 %	433615297
3611	NC_019846	GCC	2	6	173526	173531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615297
3612	NC_019846	GCC	2	6	173570	173575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_019846	GGC	2	6	173587	173592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_019846	TTG	2	6	173596	173601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_019846	TGA	2	6	173616	173621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_019846	GAC	2	6	173659	173664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_019846	GA	3	6	173727	173732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_019846	CG	3	6	173737	173742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_019846	CCG	2	6	173744	173749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_019846	TCG	2	6	173882	173887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615298
3621	NC_019846	CGG	2	6	173903	173908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615298
3622	NC_019846	GGC	2	6	173919	173924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615298
3623	NC_019846	TCCT	2	8	173928	173935	0 %	50 %	0 %	50 %	433615298
3624	NC_019846	GGA	2	6	174017	174022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615298
3625	NC_019846	AG	3	6	174078	174083	50 %	0 %	50 %	0 %	433615298
3626	NC_019846	AGG	2	6	174100	174105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615298
3627	NC_019846	GCC	2	6	174124	174129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615298
3628	NC_019846	TCGA	2	8	174186	174193	25 %	25 %	25 %	25 %	433615298
3629	NC_019846	AAC	2	6	174201	174206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433615298
3630	NC_019846	TGA	2	6	174220	174225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615298
3631	NC_019846	CCGC	2	8	174333	174340	0 %	0 %	25 %	75 %	433615298
3632	NC_019846	GAG	2	6	174347	174352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615298
3633	NC_019846	ACG	2	6	174375	174380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615298
3634	NC_019846	GTC	2	6	174416	174421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3635	NC_019846	CG	3	6	174428	174433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3636	NC_019846	GAC	2	6	174455	174460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3637	NC_019846	AGC	2	6	174507	174512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3638	NC_019846	AGG	2	6	174519	174524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3639	NC_019846	CAG	2	6	174567	174572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3640	NC_019846	GGC	2	6	174611	174616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3641	NC_019846	ATG	2	6	174634	174639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3642	NC_019846	ACG	2	6	174640	174645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3643	NC_019846	AGG	2	6	174692	174697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3644	NC_019846	TCC	2	6	174784	174789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3645	NC_019846	T	6	6	174838	174843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3646	NC_019846	CAAC	2	8	174849	174856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3647	NC_019846	CAT	2	6	174912	174917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615299
3648	NC_019846	AGC	2	6	174920	174925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615299
3649	NC_019846	CCGCG	2	10	174988	174997	0 %	0 %	40 %	60 %	433615299
3650	NC_019846	CGG	2	6	175107	175112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615299
3651	NC_019846	GAC	2	6	175186	175191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615299
3652	NC_019846	GC	3	6	175194	175199	0 %	0 %	50 %	50 %	433615299
3653	NC_019846	CGGC	2	8	175270	175277	0 %	0 %	50 %	50 %	433615299
3654	NC_019846	GGA	2	6	175278	175283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615299
3655	NC_019846	CGG	2	6	175359	175364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615299
3656	NC_019846	GAC	2	6	175393	175398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615299
3657	NC_019846	TCG	2	6	175424	175429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615299
3658	NC_019846	GAG	2	6	175543	175548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615299
3659	NC_019846	ACCT	2	8	175624	175631	25 %	25 %	0 %	50 %	433615299
3660	NC_019846	GAA	2	6	175653	175658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615299
3661	NC_019846	GC	3	6	175665	175670	0 %	0 %	50 %	50 %	433615299
3662	NC_019846	ATC	2	6	175672	175677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615299
3663	NC_019846	CGG	2	6	175679	175684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615299
3664	NC_019846	TCC	2	6	175768	175773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3665	NC_019846	TAG	2	6	175942	175947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12345678Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.