MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4a

Total Repeats: 3665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019846	GC	3	6	25473	25478	0 %	0 %	50 %	50 %	433615135
502	NC_019846	GAC	2	6	25577	25582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615135
503	NC_019846	CAG	2	6	25626	25631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615135
504	NC_019846	CG	3	6	25673	25678	0 %	0 %	50 %	50 %	433615135
505	NC_019846	CGA	2	6	25863	25868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615135
506	NC_019846	CAG	2	6	25990	25995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615135
507	NC_019846	ACAG	2	8	26031	26038	50 %	0 %	25 %	25 %	433615135
508	NC_019846	TGA	2	6	26188	26193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_019846	GTG	2	6	26207	26212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_019846	CAC	2	6	26274	26279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615136
511	NC_019846	TAT	2	6	26282	26287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433615136
512	NC_019846	ATG	2	6	26333	26338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615136
513	NC_019846	GGCA	2	8	26360	26367	25 %	0 %	50 %	25 %	433615136
514	NC_019846	TCT	2	6	26506	26511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615137
515	NC_019846	TCAG	2	8	26540	26547	25 %	25 %	25 %	25 %	433615137
516	NC_019846	AGC	2	6	26564	26569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615137
517	NC_019846	CAT	2	6	26616	26621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615137
518	NC_019846	CTCGGC	2	12	26688	26699	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433615137
519	NC_019846	CGG	2	6	26701	26706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
520	NC_019846	CCCT	2	8	26735	26742	0 %	25 %	0 %	75 %	433615137
521	NC_019846	GTG	2	6	26877	26882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615137
522	NC_019846	GAT	2	6	27026	27031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
523	NC_019846	GAT	2	6	27060	27065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
524	NC_019846	AC	3	6	27084	27089	50 %	0 %	0 %	50 %	433615137
525	NC_019846	CG	3	6	27121	27126	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
526	NC_019846	GCA	2	6	27168	27173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615137
527	NC_019846	CGG	2	6	27176	27181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
528	NC_019846	TGA	2	6	27209	27214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
529	NC_019846	GCC	2	6	27221	27226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615137
530	NC_019846	AAT	2	6	27266	27271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433615137
531	NC_019846	GCG	2	6	27302	27307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
532	NC_019846	TCG	2	6	27314	27319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615137
533	NC_019846	CAG	2	6	27354	27359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615137
534	NC_019846	GATAC	2	10	27428	27437	40 %	20 %	20 %	20 %	433615137
535	NC_019846	CG	3	6	27442	27447	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
536	NC_019846	GGC	2	6	27596	27601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
537	NC_019846	GCC	2	6	27608	27613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615137
538	NC_019846	CTC	2	6	27678	27683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433615137
539	NC_019846	CATT	2	8	27713	27720	25 %	50 %	0 %	25 %	433615137
540	NC_019846	GCT	2	6	27759	27764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615137
541	NC_019846	CTT	2	6	27849	27854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615137
542	NC_019846	GC	4	8	27855	27862	0 %	0 %	50 %	50 %	433615137
543	NC_019846	GCAA	2	8	27880	27887	50 %	0 %	25 %	25 %	433615137
544	NC_019846	GCG	2	6	27924	27929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615137
545	NC_019846	TGA	2	6	27942	27947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615137
546	NC_019846	GC	3	6	27952	27957	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
547	NC_019846	ATC	3	9	27962	27970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615138
548	NC_019846	TCT	2	6	28002	28007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615138
549	NC_019846	AGC	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615138
550	NC_019846	GC	3	6	28039	28044	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
551	NC_019846	GC	3	6	28067	28072	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
552	NC_019846	GC	4	8	28083	28090	0 %	0 %	50 %	50 %	433615138
553	NC_019846	GGT	2	6	28103	28108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433615138
554	NC_019846	GGC	2	6	28136	28141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
555	NC_019846	GGC	2	6	28188	28193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
556	NC_019846	CGG	2	6	28195	28200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
557	NC_019846	TGC	3	9	28251	28259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615138
558	NC_019846	TGA	2	6	28296	28301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615138
559	NC_019846	GCC	2	6	28311	28316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615138
560	NC_019846	GCT	2	6	28327	28332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615138
561	NC_019846	TCG	2	6	28344	28349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615138
562	NC_019846	CGA	2	6	28360	28365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615138
563	NC_019846	CGGT	2	8	28455	28462	0 %	25 %	50 %	25 %	433615138
564	NC_019846	TGT	2	6	28483	28488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615138
565	NC_019846	GGC	2	6	28501	28506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615138
566	NC_019846	CG	3	6	28566	28571	0 %	0 %	50 %	50 %	433615139
567	NC_019846	CGG	2	6	28599	28604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615139
568	NC_019846	CTG	2	6	28605	28610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615139
569	NC_019846	TTC	2	6	28672	28677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615139
570	NC_019846	CGG	2	6	28690	28695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615139
571	NC_019846	GC	3	6	28864	28869	0 %	0 %	50 %	50 %	433615139
572	NC_019846	GCC	2	6	28882	28887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615139
573	NC_019846	CTT	2	6	28922	28927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615139
574	NC_019846	GCG	2	6	28933	28938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615139
575	NC_019846	GAG	2	6	28947	28952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615139
576	NC_019846	GAG	2	6	28956	28961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615139
577	NC_019846	GGA	2	6	28982	28987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615139
578	NC_019846	CAG	2	6	29019	29024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615140
579	NC_019846	GCT	2	6	29062	29067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615140
580	NC_019846	GCT	2	6	29365	29370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615140
581	NC_019846	GCG	2	6	29453	29458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615140
582	NC_019846	CG	3	6	29467	29472	0 %	0 %	50 %	50 %	433615140
583	NC_019846	CGC	2	6	29487	29492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615140
584	NC_019846	GCG	2	6	29613	29618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615141
585	NC_019846	GGC	2	6	29639	29644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615141
586	NC_019846	GCC	2	6	29750	29755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615141
587	NC_019846	CCA	2	6	29762	29767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615141
588	NC_019846	ACG	2	6	29820	29825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615141
589	NC_019846	TCG	2	6	29829	29834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615141
590	NC_019846	GCAGC	2	10	29884	29893	20 %	0 %	40 %	40 %	433615141
591	NC_019846	GCC	3	9	30072	30080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615141
592	NC_019846	CCG	2	6	30178	30183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615141
593	NC_019846	AT	3	6	30196	30201	50 %	50 %	0 %	0 %	433615141
594	NC_019846	AGG	2	6	30216	30221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433615141
595	NC_019846	GAT	2	6	30235	30240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615141
596	NC_019846	CGA	2	6	30244	30249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615141
597	NC_019846	TGC	2	6	30282	30287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615141
598	NC_019846	CGG	2	6	30354	30359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615141
599	NC_019846	GCA	2	6	30373	30378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615141
600	NC_019846	GCC	2	6	30550	30555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615142
601	NC_019846	GCT	2	6	30657	30662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615142
602	NC_019846	GCT	2	6	30672	30677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615142
603	NC_019846	AGC	2	6	30713	30718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615142
604	NC_019846	TGTCGG	2	12	30780	30791	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433615142
605	NC_019846	AGA	2	6	30824	30829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433615142
606	NC_019846	CTT	2	6	30845	30850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615142
607	NC_019846	TCG	2	6	30909	30914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615142
608	NC_019846	CGC	2	6	31044	31049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433615142
609	NC_019846	CAC	2	6	31157	31162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615142
610	NC_019846	CACC	2	8	31201	31208	25 %	0 %	0 %	75 %	433615142
611	NC_019846	GCT	2	6	31287	31292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_019846	GGC	2	6	31437	31442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_019846	AGG	2	6	31493	31498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_019846	CG	3	6	31507	31512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_019846	CGC	2	6	31554	31559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_019846	ACC	2	6	31579	31584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_019846	AAT	2	6	31597	31602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_019846	AGCAA	2	10	31637	31646	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
619	NC_019846	GAC	2	6	31728	31733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
620	NC_019846	GACC	2	8	31745	31752	25 %	0 %	25 %	50 %	433615143
621	NC_019846	CGT	2	6	31895	31900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
622	NC_019846	ACG	2	6	31930	31935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
623	NC_019846	TCG	2	6	32020	32025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
624	NC_019846	TGC	2	6	32048	32053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
625	NC_019846	ACC	2	6	32073	32078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615143
626	NC_019846	GTT	2	6	32087	32092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433615143
627	NC_019846	CGT	3	9	32144	32152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
628	NC_019846	GAC	2	6	32154	32159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
629	NC_019846	TG	3	6	32169	32174	0 %	50 %	50 %	0 %	433615143
630	NC_019846	CGG	2	6	32456	32461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615143
631	NC_019846	CCCA	2	8	32489	32496	25 %	0 %	0 %	75 %	433615143
632	NC_019846	TCA	2	6	32503	32508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615143
633	NC_019846	TTC	2	6	32514	32519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433615143
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635	NC_019846	GATA	2	8	32684	32691	50 %	25 %	25 %	0 %	433615143
636	NC_019846	TCG	2	6	32713	32718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
637	NC_019846	GTC	3	9	32739	32747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615143
638	NC_019846	TCCA	2	8	32753	32760	25 %	25 %	0 %	50 %	433615143
639	NC_019846	CGA	2	6	32900	32905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433615143
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661	NC_019846	ACC	2	6	33960	33965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433615143
662	NC_019846	GCG	2	6	33975	33980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433615143
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669	NC_019846	CGG	2	6	34294	34299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
670	NC_019846	G	6	6	34332	34337	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
671	NC_019846	TTG	2	6	34362	34367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
672	NC_019846	ATG	2	6	34370	34375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
673	NC_019846	CGC	2	6	34509	34514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
674	NC_019846	CTT	2	6	34530	34535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
675	NC_019846	ATC	2	6	34591	34596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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677	NC_019846	GAC	2	6	34696	34701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_019846	TTA	2	6	34708	34713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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743	NC_019846	TCG	2	6	38040	38045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
744	NC_019846	TCCG	2	8	38048	38055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
745	NC_019846	GTC	2	6	38078	38083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
746	NC_019846	CTT	2	6	38092	38097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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749	NC_019846	GCG	2	6	38176	38181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
750	NC_019846	TCGC	2	8	38187	38194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
751	NC_019846	CTT	2	6	38208	38213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_019846	CCT	2	6	38239	38244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
753	NC_019846	ATC	2	6	38329	38334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615146
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758	NC_019846	ATC	2	6	38661	38666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433615147
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983	NC_019846	CGAT	2	8	48400	48407	25 %	25 %	25 %	25 %	433615157
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998	NC_019846	GCT	2	6	49366	49371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433615158
999	NC_019846	CGAG	2	8	49383	49390	25 %	0 %	50 %	25 %	433615158
1000	NC_019846	ATG	2	6	49400	49405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433615158

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