MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Stanieria cyanosphaera PCC 7437 plasmid pSTA7437.01

Total Repeats: 402

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019765	CT	3	6	258	263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_019765	AG	3	6	528	533	50 %	0 %	50 %	0 %	434408265
3	NC_019765	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	434408265
4	NC_019765	CT	3	6	826	831	0 %	50 %	0 %	50 %	434408265
5	NC_019765	TG	3	6	940	945	0 %	50 %	50 %	0 %	434408265
6	NC_019765	GT	3	6	1016	1021	0 %	50 %	50 %	0 %	434408265
7	NC_019765	CT	3	6	1151	1156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019765	AG	3	6	1165	1170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019765	TC	3	6	1732	1737	0 %	50 %	0 %	50 %	434408266
10	NC_019765	TC	3	6	1763	1768	0 %	50 %	0 %	50 %	434408266
11	NC_019765	CT	3	6	3441	3446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019765	AT	3	6	3584	3589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019765	GA	3	6	4510	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	434408269
14	NC_019765	CT	3	6	8472	8477	0 %	50 %	0 %	50 %	434408271
15	NC_019765	CA	4	8	10052	10059	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019765	TA	3	6	12758	12763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019765	CT	3	6	13126	13131	0 %	50 %	0 %	50 %	434408275
18	NC_019765	CT	3	6	14944	14949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_019765	TA	3	6	15066	15071	50 %	50 %	0 %	0 %	434408277
20	NC_019765	CT	3	6	15276	15281	0 %	50 %	0 %	50 %	434408277
21	NC_019765	TC	3	6	15311	15316	0 %	50 %	0 %	50 %	434408277
22	NC_019765	AG	3	6	16290	16295	50 %	0 %	50 %	0 %	434408279
23	NC_019765	AT	3	6	16459	16464	50 %	50 %	0 %	0 %	434408279
24	NC_019765	AG	3	6	18701	18706	50 %	0 %	50 %	0 %	434408281
25	NC_019765	AT	3	6	19400	19405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019765	CT	3	6	22137	22142	0 %	50 %	0 %	50 %	434408284
27	NC_019765	GA	3	6	22894	22899	50 %	0 %	50 %	0 %	434408285
28	NC_019765	TA	3	6	23420	23425	50 %	50 %	0 %	0 %	434408285
29	NC_019765	TC	3	6	23833	23838	0 %	50 %	0 %	50 %	434408286
30	NC_019765	CT	3	6	24485	24490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_019765	AT	3	6	24636	24641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019765	TA	3	6	24651	24656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019765	GA	3	6	27882	27887	50 %	0 %	50 %	0 %	434408289
34	NC_019765	AG	3	6	31026	31031	50 %	0 %	50 %	0 %	434408290
35	NC_019765	TC	3	6	31105	31110	0 %	50 %	0 %	50 %	434408290
36	NC_019765	AG	3	6	31137	31142	50 %	0 %	50 %	0 %	434408290
37	NC_019765	AG	3	6	33591	33596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019765	AT	4	8	34245	34252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019765	AG	4	8	34470	34477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019765	AT	3	6	35215	35220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019765	AT	3	6	35420	35425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019765	AT	3	6	35675	35680	50 %	50 %	0 %	0 %	434408291
43	NC_019765	GA	3	6	36249	36254	50 %	0 %	50 %	0 %	434408292
44	NC_019765	GA	3	6	36563	36568	50 %	0 %	50 %	0 %	434408292
45	NC_019765	TA	3	6	36738	36743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019765	GA	3	6	39238	39243	50 %	0 %	50 %	0 %	434408296
47	NC_019765	TC	3	6	40026	40031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_019765	TA	3	6	40447	40452	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
49	NC_019765	TA	3	6	41503	41508	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
50	NC_019765	AT	3	6	41979	41984	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
51	NC_019765	AT	3	6	43507	43512	50 %	50 %	0 %	0 %	434408297
52	NC_019765	AT	3	6	43552	43557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019765	AT	3	6	43622	43627	50 %	50 %	0 %	0 %	434408298
54	NC_019765	AT	3	6	43660	43665	50 %	50 %	0 %	0 %	434408298
55	NC_019765	TA	3	6	45023	45028	50 %	50 %	0 %	0 %	434408299
56	NC_019765	AT	3	6	46199	46204	50 %	50 %	0 %	0 %	434408299
57	NC_019765	CA	3	6	46305	46310	50 %	0 %	0 %	50 %	434408300
58	NC_019765	AG	3	6	46356	46361	50 %	0 %	50 %	0 %	434408300
59	NC_019765	CG	5	10	46488	46497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019765	CG	3	6	46613	46618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019765	AT	3	6	47082	47087	50 %	50 %	0 %	0 %	434408301
62	NC_019765	TA	3	6	47114	47119	50 %	50 %	0 %	0 %	434408301
63	NC_019765	TC	3	6	49586	49591	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
64	NC_019765	TC	4	8	49821	49828	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
65	NC_019765	CT	3	6	51007	51012	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
66	NC_019765	TC	3	6	51209	51214	0 %	50 %	0 %	50 %	434408303
67	NC_019765	AT	3	6	52633	52638	50 %	50 %	0 %	0 %	434408305
68	NC_019765	TC	3	6	54141	54146	0 %	50 %	0 %	50 %	434408306
69	NC_019765	GA	3	6	54806	54811	50 %	0 %	50 %	0 %	434408307
70	NC_019765	CT	3	6	55805	55810	0 %	50 %	0 %	50 %	434408307
71	NC_019765	AG	3	6	55921	55926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019765	GA	3	6	57546	57551	50 %	0 %	50 %	0 %	434408309
73	NC_019765	AG	3	6	58648	58653	50 %	0 %	50 %	0 %	434408309
74	NC_019765	TA	3	6	61272	61277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019765	TA	3	6	61307	61312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019765	GA	3	6	64784	64789	50 %	0 %	50 %	0 %	434408313
77	NC_019765	AT	3	6	65080	65085	50 %	50 %	0 %	0 %	434408313
78	NC_019765	CT	3	6	65542	65547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_019765	TA	3	6	65589	65594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019765	CT	4	8	65676	65683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_019765	AT	4	8	66030	66037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019765	TA	3	6	66119	66124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019765	CT	3	6	67375	67380	0 %	50 %	0 %	50 %	434408316
84	NC_019765	TC	3	6	67782	67787	0 %	50 %	0 %	50 %	434408317
85	NC_019765	AT	3	6	70043	70048	50 %	50 %	0 %	0 %	434408318
86	NC_019765	CT	3	6	70186	70191	0 %	50 %	0 %	50 %	434408318
87	NC_019765	AG	3	6	71064	71069	50 %	0 %	50 %	0 %	434408319
88	NC_019765	AT	3	6	71912	71917	50 %	50 %	0 %	0 %	434408319
89	NC_019765	AG	4	8	72530	72537	50 %	0 %	50 %	0 %	434408320
90	NC_019765	TA	3	6	72629	72634	50 %	50 %	0 %	0 %	434408320
91	NC_019765	AG	3	6	72844	72849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019765	TA	3	6	72952	72957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019765	AT	3	6	75676	75681	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
94	NC_019765	TA	3	6	75978	75983	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
95	NC_019765	TA	3	6	76521	76526	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
96	NC_019765	AT	3	6	76569	76574	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
97	NC_019765	AT	3	6	76576	76581	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
98	NC_019765	AT	3	6	76614	76619	50 %	50 %	0 %	0 %	434408323
99	NC_019765	AT	3	6	77965	77970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019765	TC	3	6	79390	79395	0 %	50 %	0 %	50 %	434408326
101	NC_019765	GC	3	6	80280	80285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019765	TC	3	6	80702	80707	0 %	50 %	0 %	50 %	434408329
103	NC_019765	AG	3	6	81136	81141	50 %	0 %	50 %	0 %	434408329
104	NC_019765	CT	3	6	82010	82015	0 %	50 %	0 %	50 %	434408329
105	NC_019765	AG	3	6	82279	82284	50 %	0 %	50 %	0 %	434408330
106	NC_019765	AG	3	6	83717	83722	50 %	0 %	50 %	0 %	434408332
107	NC_019765	TC	3	6	83772	83777	0 %	50 %	0 %	50 %	434408332
108	NC_019765	TC	3	6	83902	83907	0 %	50 %	0 %	50 %	434408332
109	NC_019765	TC	3	6	84288	84293	0 %	50 %	0 %	50 %	434408332
110	NC_019765	TC	3	6	84486	84491	0 %	50 %	0 %	50 %	434408333
111	NC_019765	TA	3	6	85974	85979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019765	TC	3	6	90953	90958	0 %	50 %	0 %	50 %	434408338
113	NC_019765	AT	3	6	92039	92044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019765	GA	3	6	92927	92932	50 %	0 %	50 %	0 %	434408341
115	NC_019765	TC	3	6	93172	93177	0 %	50 %	0 %	50 %	434408341
116	NC_019765	TA	3	6	93723	93728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019765	TA	3	6	93731	93736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019765	TC	3	6	94501	94506	0 %	50 %	0 %	50 %	434408343
119	NC_019765	AG	3	6	94824	94829	50 %	0 %	50 %	0 %	434408343
120	NC_019765	TG	3	6	95118	95123	0 %	50 %	50 %	0 %	434408344
121	NC_019765	GA	3	6	95870	95875	50 %	0 %	50 %	0 %	434408345
122	NC_019765	AG	3	6	95895	95900	50 %	0 %	50 %	0 %	434408345
123	NC_019765	GC	3	6	97513	97518	0 %	0 %	50 %	50 %	434408346
124	NC_019765	CT	3	6	97704	97709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_019765	TA	3	6	98984	98989	50 %	50 %	0 %	0 %	434408348
126	NC_019765	TC	3	6	99645	99650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019765	AT	3	6	100345	100350	50 %	50 %	0 %	0 %	434408349
128	NC_019765	CA	3	6	106821	106826	50 %	0 %	0 %	50 %	434408355
129	NC_019765	AC	3	6	106958	106963	50 %	0 %	0 %	50 %	434408355
130	NC_019765	AT	3	6	107678	107683	50 %	50 %	0 %	0 %	434408355
131	NC_019765	AG	3	6	110379	110384	50 %	0 %	50 %	0 %	434408358
132	NC_019765	GT	3	6	112207	112212	0 %	50 %	50 %	0 %	434408361
133	NC_019765	AT	3	6	114162	114167	50 %	50 %	0 %	0 %	434408362
134	NC_019765	CT	3	6	114577	114582	0 %	50 %	0 %	50 %	434408363
135	NC_019765	GA	3	6	115065	115070	50 %	0 %	50 %	0 %	434408363
136	NC_019765	AT	3	6	115826	115831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019765	AT	3	6	115997	116002	50 %	50 %	0 %	0 %	434408364
138	NC_019765	AT	3	6	116637	116642	50 %	50 %	0 %	0 %	434408364
139	NC_019765	TA	4	8	118002	118009	50 %	50 %	0 %	0 %	434408365
140	NC_019765	TC	3	6	118342	118347	0 %	50 %	0 %	50 %	434408365
141	NC_019765	AT	3	6	118535	118540	50 %	50 %	0 %	0 %	434408365
142	NC_019765	AT	3	6	118790	118795	50 %	50 %	0 %	0 %	434408365
143	NC_019765	TA	5	10	118884	118893	50 %	50 %	0 %	0 %	434408365
144	NC_019765	TA	3	6	120044	120049	50 %	50 %	0 %	0 %	434408366
145	NC_019765	AT	3	6	120152	120157	50 %	50 %	0 %	0 %	434408366
146	NC_019765	GT	3	6	120561	120566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.