MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 9337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019702	GTAT	2	8	614	621	25 %	50 %	25 %	0 %	428220141
2	NC_019702	TTAG	2	8	1227	1234	25 %	50 %	25 %	0 %	428220141
3	NC_019702	TGGG	2	8	1489	1496	0 %	25 %	75 %	0 %	428220141
4	NC_019702	ATTT	2	8	1596	1603	25 %	75 %	0 %	0 %	428220141
5	NC_019702	CCAA	2	8	2006	2013	50 %	0 %	0 %	50 %	428220142
6	NC_019702	TAAC	2	8	2193	2200	50 %	25 %	0 %	25 %	428220142
7	NC_019702	GGGT	2	8	2419	2426	0 %	25 %	75 %	0 %	428220142
8	NC_019702	TTAG	2	8	2811	2818	25 %	50 %	25 %	0 %	428220142
9	NC_019702	TGCT	2	8	3440	3447	0 %	50 %	25 %	25 %	428220143
10	NC_019702	GGGA	2	8	3543	3550	25 %	0 %	75 %	0 %	428220143
11	NC_019702	AGTA	2	8	3645	3652	50 %	25 %	25 %	0 %	428220144
12	NC_019702	ATAG	2	8	4351	4358	50 %	25 %	25 %	0 %	428220144
13	NC_019702	ATTA	2	8	4662	4669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019702	TTCA	2	8	5231	5238	25 %	50 %	0 %	25 %	428220145
15	NC_019702	AGTA	2	8	6420	6427	50 %	25 %	25 %	0 %	428220147
16	NC_019702	CAAA	2	8	6528	6535	75 %	0 %	0 %	25 %	428220147
17	NC_019702	TAAT	2	8	7219	7226	50 %	50 %	0 %	0 %	428220147
18	NC_019702	TGCT	2	8	7355	7362	0 %	50 %	25 %	25 %	428220147
19	NC_019702	ATCA	2	8	7445	7452	50 %	25 %	0 %	25 %	428220147
20	NC_019702	AATT	2	8	7823	7830	50 %	50 %	0 %	0 %	428220147
21	NC_019702	ACAG	2	8	8514	8521	50 %	0 %	25 %	25 %	428220147
22	NC_019702	TTGA	2	8	8880	8887	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019702	TCTA	2	8	8902	8909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019702	AATT	2	8	10143	10150	50 %	50 %	0 %	0 %	428220149
25	NC_019702	AAAT	2	8	10550	10557	75 %	25 %	0 %	0 %	428220150
26	NC_019702	ATCA	2	8	10664	10671	50 %	25 %	0 %	25 %	428220150
27	NC_019702	TGCT	2	8	10744	10751	0 %	50 %	25 %	25 %	428220150
28	NC_019702	ACAT	2	8	11269	11276	50 %	25 %	0 %	25 %	428220150
29	NC_019702	TAAA	2	8	11654	11661	75 %	25 %	0 %	0 %	428220150
30	NC_019702	ATGA	2	8	11870	11877	50 %	25 %	25 %	0 %	428220150
31	NC_019702	AACT	2	8	12091	12098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_019702	TAAT	2	8	12450	12457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019702	TAAT	2	8	12461	12468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019702	CTCA	2	8	13678	13685	25 %	25 %	0 %	50 %	428220153
35	NC_019702	TCAT	2	8	13961	13968	25 %	50 %	0 %	25 %	428220153
36	NC_019702	TTCC	2	8	14088	14095	0 %	50 %	0 %	50 %	428220154
37	NC_019702	AATT	2	8	14211	14218	50 %	50 %	0 %	0 %	428220154
38	NC_019702	ACAG	2	8	14456	14463	50 %	0 %	25 %	25 %	428220154
39	NC_019702	TGGT	2	8	14501	14508	0 %	50 %	50 %	0 %	428220154
40	NC_019702	TCAC	2	8	15109	15116	25 %	25 %	0 %	50 %	428220154
41	NC_019702	CTAC	2	8	15241	15248	25 %	25 %	0 %	50 %	428220154
42	NC_019702	TCTT	2	8	15827	15834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019702	CTGG	2	8	15911	15918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019702	AAAT	2	8	15998	16005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019702	ATCG	2	8	16905	16912	25 %	25 %	25 %	25 %	428220156
46	NC_019702	AAGG	2	8	17778	17785	50 %	0 %	50 %	0 %	428220156
47	NC_019702	CATA	2	8	18113	18120	50 %	25 %	0 %	25 %	428220156
48	NC_019702	AAGG	2	8	18243	18250	50 %	0 %	50 %	0 %	428220156
49	NC_019702	TGGT	2	8	18351	18358	0 %	50 %	50 %	0 %	428220156
50	NC_019702	AAAT	2	8	18406	18413	75 %	25 %	0 %	0 %	428220156
51	NC_019702	GAAA	2	8	18515	18522	75 %	0 %	25 %	0 %	428220156
52	NC_019702	CTAT	2	8	19357	19364	25 %	50 %	0 %	25 %	428220157
53	NC_019702	TTCC	2	8	21248	21255	0 %	50 %	0 %	50 %	428220159
54	NC_019702	AATA	2	8	21363	21370	75 %	25 %	0 %	0 %	428220159
55	NC_019702	TTTA	2	8	21409	21416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019702	TAAA	2	8	21424	21431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019702	AAAG	2	8	21588	21595	75 %	0 %	25 %	0 %	428220160
58	NC_019702	ATAA	2	8	23162	23169	75 %	25 %	0 %	0 %	428220161
59	NC_019702	TTTA	2	8	24259	24266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019702	TGAA	2	8	24415	24422	50 %	25 %	25 %	0 %	428220163
61	NC_019702	CCGC	2	8	25850	25857	0 %	0 %	25 %	75 %	428220164
62	NC_019702	CTTA	2	8	27488	27495	25 %	50 %	0 %	25 %	428220165
63	NC_019702	ATCG	2	8	27785	27792	25 %	25 %	25 %	25 %	428220165
64	NC_019702	ACCA	2	8	27944	27951	50 %	0 %	0 %	50 %	428220165
65	NC_019702	ATCG	2	8	28079	28086	25 %	25 %	25 %	25 %	428220165
66	NC_019702	CAAG	2	8	29391	29398	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019702	TTAA	2	8	29464	29471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019702	TCTA	2	8	29564	29571	25 %	50 %	0 %	25 %	428220166
69	NC_019702	CTTA	2	8	30140	30147	25 %	50 %	0 %	25 %	428220166
70	NC_019702	CTGA	2	8	30864	30871	25 %	25 %	25 %	25 %	428220167
71	NC_019702	AATT	2	8	31135	31142	50 %	50 %	0 %	0 %	428220167
72	NC_019702	TAAT	2	8	31651	31658	50 %	50 %	0 %	0 %	428220167
73	NC_019702	CCAA	2	8	32074	32081	50 %	0 %	0 %	50 %	428220167
74	NC_019702	TTAA	2	8	32223	32230	50 %	50 %	0 %	0 %	428220167
75	NC_019702	TCAA	2	8	32473	32480	50 %	25 %	0 %	25 %	428220167
76	NC_019702	TATT	2	8	32742	32749	25 %	75 %	0 %	0 %	428220167
77	NC_019702	GCAA	2	8	32929	32936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019702	TAAA	2	8	33401	33408	75 %	25 %	0 %	0 %	428220168
79	NC_019702	AATG	2	8	33808	33815	50 %	25 %	25 %	0 %	428220168
80	NC_019702	ATTT	2	8	33872	33879	25 %	75 %	0 %	0 %	428220168
81	NC_019702	TAAC	2	8	34064	34071	50 %	25 %	0 %	25 %	428220168
82	NC_019702	CTGC	2	8	35340	35347	0 %	25 %	25 %	50 %	428220169
83	NC_019702	TAAT	2	8	36519	36526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019702	TTTA	2	8	36563	36570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019702	TTGA	2	8	36728	36735	25 %	50 %	25 %	0 %	428220171
86	NC_019702	TTCA	2	8	37290	37297	25 %	50 %	0 %	25 %	428220171
87	NC_019702	CGAT	2	8	37535	37542	25 %	25 %	25 %	25 %	428220171
88	NC_019702	TACT	2	8	37690	37697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_019702	ACCC	2	8	37849	37856	25 %	0 %	0 %	75 %	428220172
90	NC_019702	TATT	2	8	38037	38044	25 %	75 %	0 %	0 %	428220172
91	NC_019702	TACC	2	8	38093	38100	25 %	25 %	0 %	50 %	428220172
92	NC_019702	TCAG	2	8	38663	38670	25 %	25 %	25 %	25 %	428220173
93	NC_019702	TGAC	2	8	38792	38799	25 %	25 %	25 %	25 %	428220173
94	NC_019702	CTGG	2	8	39167	39174	0 %	25 %	50 %	25 %	428220174
95	NC_019702	AACT	2	8	39886	39893	50 %	25 %	0 %	25 %	428220176
96	NC_019702	ACCA	2	8	40335	40342	50 %	0 %	0 %	50 %	428220176
97	NC_019702	AGTG	2	8	40409	40416	25 %	25 %	50 %	0 %	428220176
98	NC_019702	CTTA	2	8	40423	40430	25 %	50 %	0 %	25 %	428220176
99	NC_019702	AGAT	2	8	40442	40449	50 %	25 %	25 %	0 %	428220176
100	NC_019702	TACC	2	8	41070	41077	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_019702	TTAC	2	8	41326	41333	25 %	50 %	0 %	25 %	428220178
102	NC_019702	AAGT	2	8	41886	41893	50 %	25 %	25 %	0 %	428220179
103	NC_019702	GTAG	2	8	42406	42413	25 %	25 %	50 %	0 %	428220179
104	NC_019702	CTTG	2	8	42569	42576	0 %	50 %	25 %	25 %	428220179
105	NC_019702	CTTG	2	8	42692	42699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_019702	ATTA	2	8	42817	42824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019702	TCCG	2	8	43497	43504	0 %	25 %	25 %	50 %	428220180
108	NC_019702	TCCC	2	8	43958	43965	0 %	25 %	0 %	75 %	428220180
109	NC_019702	TTAA	2	8	44221	44228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019702	CTAA	2	8	45305	45312	50 %	25 %	0 %	25 %	428220181
111	NC_019702	AATT	2	8	45810	45817	50 %	50 %	0 %	0 %	428220183
112	NC_019702	AAAT	2	8	46033	46040	75 %	25 %	0 %	0 %	428220183
113	NC_019702	ATTA	2	8	46541	46548	50 %	50 %	0 %	0 %	428220183
114	NC_019702	GCCA	2	8	46732	46739	25 %	0 %	25 %	50 %	428220184
115	NC_019702	AATC	2	8	47795	47802	50 %	25 %	0 %	25 %	428220185
116	NC_019702	TTTA	2	8	47939	47946	25 %	75 %	0 %	0 %	428220185
117	NC_019702	TATT	2	8	48512	48519	25 %	75 %	0 %	0 %	428220185
118	NC_019702	TGAA	2	8	49668	49675	50 %	25 %	25 %	0 %	428220185
119	NC_019702	AGGG	2	8	51102	51109	25 %	0 %	75 %	0 %	428220187
120	NC_019702	TTAG	2	8	52156	52163	25 %	50 %	25 %	0 %	428220188
121	NC_019702	GATT	2	8	52250	52257	25 %	50 %	25 %	0 %	428220188
122	NC_019702	AGTT	2	8	52307	52314	25 %	50 %	25 %	0 %	428220188
123	NC_019702	TTAA	2	8	52831	52838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019702	TAAA	2	8	52929	52936	75 %	25 %	0 %	0 %	428220190
125	NC_019702	TCGG	2	8	53804	53811	0 %	25 %	50 %	25 %	428220191
126	NC_019702	CCAT	2	8	54317	54324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019702	TGAT	2	8	54615	54622	25 %	50 %	25 %	0 %	428220192
128	NC_019702	CCTC	2	8	54818	54825	0 %	25 %	0 %	75 %	428220193
129	NC_019702	CTTG	2	8	54889	54896	0 %	50 %	25 %	25 %	428220193
130	NC_019702	ATGA	2	8	55078	55085	50 %	25 %	25 %	0 %	428220193
131	NC_019702	CGCC	2	8	55116	55123	0 %	0 %	25 %	75 %	428220193
132	NC_019702	TTTA	2	8	55193	55200	25 %	75 %	0 %	0 %	428220194
133	NC_019702	AACA	2	8	55907	55914	75 %	0 %	0 %	25 %	428220195
134	NC_019702	GCCA	2	8	56101	56108	25 %	0 %	25 %	50 %	428220195
135	NC_019702	CCTG	2	8	56564	56571	0 %	25 %	25 %	50 %	428220196
136	NC_019702	TCAG	2	8	57087	57094	25 %	25 %	25 %	25 %	428220196
137	NC_019702	CAAC	2	8	57464	57471	50 %	0 %	0 %	50 %	428220196
138	NC_019702	AATT	2	8	57497	57504	50 %	50 %	0 %	0 %	428220196
139	NC_019702	ACCA	2	8	57541	57548	50 %	0 %	0 %	50 %	428220197
140	NC_019702	GTCA	2	8	57814	57821	25 %	25 %	25 %	25 %	428220197
141	NC_019702	TTGA	2	8	58350	58357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019702	GGCT	2	8	58377	58384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_019702	TATT	2	8	58421	58428	25 %	75 %	0 %	0 %	428220198
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