MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019702	GAA	3	9	200675	200683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220339
3502	NC_019702	GCA	2	6	200710	200715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220339
3503	NC_019702	CAA	2	6	200794	200799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220339
3504	NC_019702	AT	3	6	200880	200885	50 %	50 %	0 %	0 %	428220339
3505	NC_019702	AAT	2	6	201017	201022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220339
3506	NC_019702	GTTA	2	8	201049	201056	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_019702	T	7	7	201126	201132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_019702	CAC	2	6	201215	201220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_019702	TGC	2	6	201311	201316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3510	NC_019702	TAA	2	6	201345	201350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220340
3511	NC_019702	GGAA	2	8	201510	201517	50 %	0 %	50 %	0 %	428220340
3512	NC_019702	ATGG	2	8	201586	201593	25 %	25 %	50 %	0 %	428220340
3513	NC_019702	GAAT	2	8	201653	201660	50 %	25 %	25 %	0 %	428220340
3514	NC_019702	TGA	2	6	201774	201779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
3515	NC_019702	G	6	6	201832	201837	0 %	0 %	100 %	0 %	428220340
3516	NC_019702	TCA	2	6	201859	201864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220340
3517	NC_019702	CGA	2	6	201902	201907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3518	NC_019702	A	7	7	201926	201932	100 %	0 %	0 %	0 %	428220340
3519	NC_019702	CTA	2	6	202058	202063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220340
3520	NC_019702	CAG	2	6	202097	202102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3521	NC_019702	GAT	2	6	202120	202125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
3522	NC_019702	AG	3	6	202142	202147	50 %	0 %	50 %	0 %	428220340
3523	NC_019702	TG	3	6	202157	202162	0 %	50 %	50 %	0 %	428220340
3524	NC_019702	GCGG	2	8	202207	202214	0 %	0 %	75 %	25 %	428220340
3525	NC_019702	TTA	2	6	202252	202257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220340
3526	NC_019702	AGA	2	6	202317	202322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220340
3527	NC_019702	AT	3	6	202366	202371	50 %	50 %	0 %	0 %	428220340
3528	NC_019702	A	6	6	202444	202449	100 %	0 %	0 %	0 %	428220340
3529	NC_019702	GAA	3	9	202486	202494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220340
3530	NC_019702	AGC	2	6	202500	202505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3531	NC_019702	G	6	6	202566	202571	0 %	0 %	100 %	0 %	428220340
3532	NC_019702	GCA	2	6	202603	202608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3533	NC_019702	ATT	2	6	202609	202614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220340
3534	NC_019702	GGGC	2	8	202616	202623	0 %	0 %	75 %	25 %	428220340
3535	NC_019702	GGT	2	6	202666	202671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220340
3536	NC_019702	TTTGG	2	10	202675	202684	0 %	60 %	40 %	0 %	428220340
3537	NC_019702	AAG	2	6	202739	202744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220340
3538	NC_019702	TAC	2	6	202778	202783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220340
3539	NC_019702	TGA	2	6	202797	202802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
3540	NC_019702	GCT	2	6	202810	202815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3541	NC_019702	CGT	2	6	202816	202821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220340
3542	NC_019702	ACC	2	6	202833	202838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220340
3543	NC_019702	AGT	2	6	202894	202899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220340
3544	NC_019702	C	6	6	203021	203026	0 %	0 %	0 %	100 %	428220341
3545	NC_019702	GTG	2	6	203154	203159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220341
3546	NC_019702	TTG	2	6	203202	203207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220341
3547	NC_019702	CAT	2	6	203369	203374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220341
3548	NC_019702	TAA	2	6	203410	203415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220341
3549	NC_019702	GCA	2	6	203485	203490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220341
3550	NC_019702	CGC	2	6	203566	203571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220341
3551	NC_019702	A	7	7	203604	203610	100 %	0 %	0 %	0 %	428220341
3552	NC_019702	TGA	2	6	203635	203640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220341
3553	NC_019702	AATT	2	8	203703	203710	50 %	50 %	0 %	0 %	428220341
3554	NC_019702	AG	3	6	203764	203769	50 %	0 %	50 %	0 %	428220341
3555	NC_019702	TTG	2	6	203771	203776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220341
3556	NC_019702	CTC	2	6	203846	203851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220341
3557	NC_019702	TGGG	2	8	203965	203972	0 %	25 %	75 %	0 %	428220341
3558	NC_019702	AGTTTA	2	12	204027	204038	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428220341
3559	NC_019702	GCA	2	6	204040	204045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220341
3560	NC_019702	AGT	2	6	204106	204111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220341
3561	NC_019702	AG	3	6	204129	204134	50 %	0 %	50 %	0 %	428220341
3562	NC_019702	TTC	2	6	204138	204143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220341
3563	NC_019702	TAA	2	6	204161	204166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_019702	ATTTA	2	10	204211	204220	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_019702	AGTG	2	8	204221	204228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_019702	TA	3	6	204259	204264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_019702	A	6	6	204271	204276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_019702	TATT	2	8	204297	204304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_019702	CTT	2	6	204341	204346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220342
3570	NC_019702	TGAT	2	8	204392	204399	25 %	50 %	25 %	0 %	428220342
3571	NC_019702	AGT	2	6	204453	204458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220342
3572	NC_019702	CTG	3	9	204515	204523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220342
3573	NC_019702	CTG	2	6	204527	204532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220342
3574	NC_019702	ATT	2	6	204621	204626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_019702	CTT	2	6	204642	204647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_019702	CAA	2	6	204716	204721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220343
3577	NC_019702	AGC	2	6	204759	204764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220343
3578	NC_019702	CAG	2	6	204779	204784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220343
3579	NC_019702	TA	3	6	204920	204925	50 %	50 %	0 %	0 %	428220343
3580	NC_019702	A	6	6	205105	205110	100 %	0 %	0 %	0 %	428220343
3581	NC_019702	CCG	2	6	205116	205121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220343
3582	NC_019702	AGTT	2	8	205131	205138	25 %	50 %	25 %	0 %	428220343
3583	NC_019702	GCC	2	6	205160	205165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220343
3584	NC_019702	CATC	2	8	205201	205208	25 %	25 %	0 %	50 %	428220343
3585	NC_019702	TAATT	2	10	205234	205243	40 %	60 %	0 %	0 %	428220343
3586	NC_019702	GTT	2	6	205373	205378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220343
3587	NC_019702	TAAT	2	8	205496	205503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_019702	TCC	2	6	205531	205536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220344
3589	NC_019702	CAG	2	6	205639	205644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220344
3590	NC_019702	ACC	2	6	205656	205661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220344
3591	NC_019702	TTA	2	6	205683	205688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220344
3592	NC_019702	TTC	2	6	205730	205735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220344
3593	NC_019702	A	6	6	205770	205775	100 %	0 %	0 %	0 %	428220344
3594	NC_019702	TGC	2	6	205856	205861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220344
3595	NC_019702	ATG	2	6	205885	205890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220344
3596	NC_019702	TAA	2	6	205916	205921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220344
3597	NC_019702	AGA	2	6	205940	205945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220344
3598	NC_019702	ATT	2	6	206015	206020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220344
3599	NC_019702	AGA	2	6	206033	206038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220344
3600	NC_019702	AACAG	2	10	206117	206126	60 %	0 %	20 %	20 %	428220344
3601	NC_019702	ACT	2	6	206136	206141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220344
3602	NC_019702	TTGGC	2	10	206146	206155	0 %	40 %	40 %	20 %	428220344
3603	NC_019702	ATTA	2	8	206174	206181	50 %	50 %	0 %	0 %	428220344
3604	NC_019702	ACCA	2	8	206208	206215	50 %	0 %	0 %	50 %	428220344
3605	NC_019702	CAGC	2	8	206224	206231	25 %	0 %	25 %	50 %	428220344
3606	NC_019702	ATT	2	6	206378	206383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220344
3607	NC_019702	ATTA	2	8	206420	206427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_019702	TTC	2	6	206494	206499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220345
3609	NC_019702	ATTCGG	2	12	206591	206602	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428220345
3610	NC_019702	TTA	2	6	206603	206608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220345
3611	NC_019702	TGG	2	6	206648	206653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220345
3612	NC_019702	ATT	2	6	206689	206694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220345
3613	NC_019702	ATT	2	6	206828	206833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220346
3614	NC_019702	CAT	2	6	206862	206867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220346
3615	NC_019702	CAG	2	6	206871	206876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220346
3616	NC_019702	TAA	2	6	206953	206958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220346
3617	NC_019702	ATCT	2	8	207027	207034	25 %	50 %	0 %	25 %	428220346
3618	NC_019702	TC	3	6	207068	207073	0 %	50 %	0 %	50 %	428220346
3619	NC_019702	CAT	2	6	207096	207101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220346
3620	NC_019702	A	6	6	207311	207316	100 %	0 %	0 %	0 %	428220346
3621	NC_019702	AACT	2	8	207340	207347	50 %	25 %	0 %	25 %	428220346
3622	NC_019702	T	6	6	207353	207358	0 %	100 %	0 %	0 %	428220346
3623	NC_019702	AAAT	2	8	207365	207372	75 %	25 %	0 %	0 %	428220346
3624	NC_019702	A	7	7	207431	207437	100 %	0 %	0 %	0 %	428220346
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3855	NC_019702	TCAT	2	8	220541	220548	25 %	50 %	0 %	25 %	428220355
3856	NC_019702	CGG	2	6	220571	220576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220355
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3861	NC_019702	GTG	2	6	220821	220826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220355
3862	NC_019702	CAT	2	6	220835	220840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220355
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3866	NC_019702	CTC	2	6	221068	221073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220355
3867	NC_019702	CTG	2	6	221109	221114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220355
3868	NC_019702	GT	4	8	221126	221133	0 %	50 %	50 %	0 %	428220355
3869	NC_019702	GTT	2	6	221195	221200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220355
3870	NC_019702	TTA	2	6	221225	221230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220355
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3873	NC_019702	GATC	2	8	221500	221507	25 %	25 %	25 %	25 %	428220356
3874	NC_019702	TGA	2	6	221525	221530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220356
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3998	NC_019702	AT	3	6	229058	229063	50 %	50 %	0 %	0 %	428220363
3999	NC_019702	TG	3	6	229089	229094	0 %	50 %	50 %	0 %	428220363
4000	NC_019702	CCA	2	6	229143	229148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220363

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