MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019702	ATA	2	6	173564	173569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_019702	TGAAT	2	10	173581	173590	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019702	AT	3	6	173589	173594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_019702	GGGA	2	8	173601	173608	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_019702	CCTT	2	8	173616	173623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_019702	T	10	10	173622	173631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_019702	ATT	2	6	173647	173652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_019702	ACTC	2	8	173659	173666	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_019702	TA	3	6	173674	173679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_019702	AAT	2	6	173740	173745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220313
3011	NC_019702	AGAT	2	8	173772	173779	50 %	25 %	25 %	0 %	428220313
3012	NC_019702	GAA	2	6	173782	173787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220313
3013	NC_019702	TGG	2	6	173869	173874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220313
3014	NC_019702	CAAT	2	8	173894	173901	50 %	25 %	0 %	25 %	428220313
3015	NC_019702	TAGCT	2	10	173995	174004	20 %	40 %	20 %	20 %	428220313
3016	NC_019702	TACC	2	8	174046	174053	25 %	25 %	0 %	50 %	428220313
3017	NC_019702	AGAA	2	8	174630	174637	75 %	0 %	25 %	0 %	428220313
3018	NC_019702	TG	3	6	174643	174648	0 %	50 %	50 %	0 %	428220313
3019	NC_019702	TTC	2	6	174657	174662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220313
3020	NC_019702	GAA	2	6	174737	174742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220313
3021	NC_019702	CTA	2	6	174765	174770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220313
3022	NC_019702	AGA	2	6	174895	174900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220313
3023	NC_019702	A	6	6	174905	174910	100 %	0 %	0 %	0 %	428220313
3024	NC_019702	ATTA	2	8	174946	174953	50 %	50 %	0 %	0 %	428220313
3025	NC_019702	TG	3	6	174998	175003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_019702	AG	3	6	175024	175029	50 %	0 %	50 %	0 %	428220314
3027	NC_019702	GCTT	2	8	175081	175088	0 %	50 %	25 %	25 %	428220314
3028	NC_019702	CAC	2	6	175103	175108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220314
3029	NC_019702	CTT	2	6	175124	175129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220314
3030	NC_019702	CAT	2	6	175148	175153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220314
3031	NC_019702	A	6	6	175237	175242	100 %	0 %	0 %	0 %	428220314
3032	NC_019702	GAT	2	6	175250	175255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220314
3033	NC_019702	GGAT	2	8	175300	175307	25 %	25 %	50 %	0 %	428220314
3034	NC_019702	TGC	2	6	175323	175328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220314
3035	NC_019702	TCA	2	6	175495	175500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220314
3036	NC_019702	GCT	3	9	175564	175572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220314
3037	NC_019702	T	7	7	175631	175637	0 %	100 %	0 %	0 %	428220314
3038	NC_019702	TCA	2	6	175675	175680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220314
3039	NC_019702	T	6	6	175991	175996	0 %	100 %	0 %	0 %	428220314
3040	NC_019702	GTT	2	6	176103	176108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220314
3041	NC_019702	CAT	2	6	176159	176164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220314
3042	NC_019702	AGT	2	6	176169	176174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220314
3043	NC_019702	GGC	2	6	176217	176222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220314
3044	NC_019702	GGC	2	6	176325	176330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220314
3045	NC_019702	TAC	2	6	176355	176360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220314
3046	NC_019702	T	6	6	176396	176401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_019702	GCTT	2	8	176402	176409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3048	NC_019702	T	7	7	176408	176414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_019702	ATCG	2	8	176519	176526	25 %	25 %	25 %	25 %	428220315
3050	NC_019702	AGC	2	6	176543	176548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220315
3051	NC_019702	ATT	2	6	176738	176743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220315
3052	NC_019702	T	6	6	176801	176806	0 %	100 %	0 %	0 %	428220315
3053	NC_019702	CTT	2	6	176839	176844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220315
3054	NC_019702	AAT	2	6	176855	176860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220315
3055	NC_019702	GGAT	2	8	176894	176901	25 %	25 %	50 %	0 %	428220315
3056	NC_019702	ATC	2	6	176951	176956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220315
3057	NC_019702	CGC	2	6	177212	177217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220315
3058	NC_019702	AC	3	6	177274	177279	50 %	0 %	0 %	50 %	428220315
3059	NC_019702	ACT	2	6	177402	177407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220315
3060	NC_019702	ATT	2	6	177509	177514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220315
3061	NC_019702	ACT	2	6	177561	177566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220315
3062	NC_019702	T	6	6	177622	177627	0 %	100 %	0 %	0 %	428220316
3063	NC_019702	A	6	6	177642	177647	100 %	0 %	0 %	0 %	428220316
3064	NC_019702	GAT	2	6	177770	177775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220316
3065	NC_019702	GAC	2	6	177823	177828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220316
3066	NC_019702	T	6	6	177850	177855	0 %	100 %	0 %	0 %	428220316
3067	NC_019702	TTA	2	6	177943	177948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220316
3068	NC_019702	AAT	2	6	177974	177979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220316
3069	NC_019702	A	6	6	177992	177997	100 %	0 %	0 %	0 %	428220316
3070	NC_019702	CTA	2	6	178054	178059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220316
3071	NC_019702	AATA	2	8	178139	178146	75 %	25 %	0 %	0 %	428220316
3072	NC_019702	CCCTT	2	10	178160	178169	0 %	40 %	0 %	60 %	428220316
3073	NC_019702	CA	3	6	178178	178183	50 %	0 %	0 %	50 %	428220316
3074	NC_019702	TTG	2	6	178211	178216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220316
3075	NC_019702	GCC	2	6	178323	178328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220316
3076	NC_019702	AATT	2	8	178379	178386	50 %	50 %	0 %	0 %	428220316
3077	NC_019702	ACT	2	6	178409	178414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220316
3078	NC_019702	CCCT	2	8	178524	178531	0 %	25 %	0 %	75 %	428220316
3079	NC_019702	A	6	6	178542	178547	100 %	0 %	0 %	0 %	428220316
3080	NC_019702	GTA	2	6	178597	178602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220317
3081	NC_019702	ATC	2	6	178659	178664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220317
3082	NC_019702	ATTT	2	8	178767	178774	25 %	75 %	0 %	0 %	428220317
3083	NC_019702	TAG	2	6	178796	178801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220317
3084	NC_019702	A	6	6	178936	178941	100 %	0 %	0 %	0 %	428220317
3085	NC_019702	TAA	3	9	178981	178989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_019702	T	6	6	179017	179022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_019702	TTA	2	6	179031	179036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_019702	ATA	3	9	179037	179045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_019702	A	6	6	179056	179061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_019702	GCT	2	6	179282	179287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220318
3091	NC_019702	TTA	2	6	179353	179358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220318
3092	NC_019702	AAACT	2	10	179364	179373	60 %	20 %	0 %	20 %	428220318
3093	NC_019702	AT	3	6	179406	179411	50 %	50 %	0 %	0 %	428220318
3094	NC_019702	ATT	2	6	179461	179466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220318
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3096	NC_019702	TACC	2	8	179566	179573	25 %	25 %	0 %	50 %	428220318
3097	NC_019702	GAA	2	6	179606	179611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220318
3098	NC_019702	ATT	2	6	179687	179692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220318
3099	NC_019702	ATT	2	6	179708	179713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220318
3100	NC_019702	AAT	2	6	179723	179728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220318
3101	NC_019702	GTCA	2	8	179776	179783	25 %	25 %	25 %	25 %	428220318
3102	NC_019702	TTA	2	6	179846	179851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220318
3103	NC_019702	AAT	2	6	179879	179884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220318
3104	NC_019702	AAC	2	6	179910	179915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220318
3105	NC_019702	GAAATT	2	12	179918	179929	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428220318
3106	NC_019702	CAG	2	6	180155	180160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220318
3107	NC_019702	GTT	2	6	180176	180181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220318
3108	NC_019702	AT	3	6	180189	180194	50 %	50 %	0 %	0 %	428220318
3109	NC_019702	AGT	2	6	180214	180219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220318
3110	NC_019702	GGC	2	6	180242	180247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220318
3111	NC_019702	TTTGA	2	10	180341	180350	20 %	60 %	20 %	0 %	428220318
3112	NC_019702	AATT	2	8	180438	180445	50 %	50 %	0 %	0 %	428220318
3113	NC_019702	TTA	2	6	180524	180529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220318
3114	NC_019702	ACC	2	6	180566	180571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220318
3115	NC_019702	TGA	2	6	180637	180642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220318
3116	NC_019702	CTG	2	6	180668	180673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220318
3117	NC_019702	CGCC	2	8	180709	180716	0 %	0 %	25 %	75 %	428220318
3118	NC_019702	ACA	2	6	180820	180825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220318
3119	NC_019702	CTG	2	6	180905	180910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220318
3120	NC_019702	CTG	2	6	180957	180962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220318
3121	NC_019702	A	6	6	180977	180982	100 %	0 %	0 %	0 %	428220318
3122	NC_019702	ATCA	2	8	181020	181027	50 %	25 %	0 %	25 %	428220318
3123	NC_019702	ACCT	2	8	181080	181087	25 %	25 %	0 %	50 %	428220318
3124	NC_019702	AT	3	6	181129	181134	50 %	50 %	0 %	0 %	428220318
3125	NC_019702	TAT	2	6	181188	181193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220318
3126	NC_019702	TAA	2	6	181299	181304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_019702	CTT	2	6	181375	181380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_019702	CA	3	6	181390	181395	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_019702	CAC	2	6	181435	181440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220319
3130	NC_019702	CCA	2	6	181572	181577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220319
3131	NC_019702	TGGCAC	2	12	181609	181620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428220319
3132	NC_019702	ACA	2	6	181665	181670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220319
3133	NC_019702	ATC	2	6	181678	181683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220319
3134	NC_019702	ATTA	2	8	181747	181754	50 %	50 %	0 %	0 %	428220319
3135	NC_019702	TCTG	2	8	181805	181812	0 %	50 %	25 %	25 %	428220319
3136	NC_019702	ATT	2	6	181849	181854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220319
3137	NC_019702	TGA	2	6	181885	181890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220319
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3139	NC_019702	A	6	6	181946	181951	100 %	0 %	0 %	0 %	428220319
3140	NC_019702	AC	3	6	181987	181992	50 %	0 %	0 %	50 %	428220319
3141	NC_019702	GCATCA	2	12	182076	182087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428220320
3142	NC_019702	TCA	2	6	182330	182335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220320
3143	NC_019702	GA	3	6	182338	182343	50 %	0 %	50 %	0 %	428220320
3144	NC_019702	T	6	6	182344	182349	0 %	100 %	0 %	0 %	428220320
3145	NC_019702	ATC	2	6	182357	182362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220320
3146	NC_019702	A	6	6	182408	182413	100 %	0 %	0 %	0 %	428220320
3147	NC_019702	GCA	2	6	182640	182645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220320
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3149	NC_019702	ATT	2	6	182819	182824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220320
3150	NC_019702	GGC	2	6	183111	183116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220320
3151	NC_019702	GATCGC	2	12	183175	183186	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428220320
3152	NC_019702	ACT	2	6	183400	183405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220320
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3154	NC_019702	ATC	2	6	183473	183478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220320
3155	NC_019702	AAT	2	6	183496	183501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220320
3156	NC_019702	TGC	2	6	183525	183530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220320
3157	NC_019702	TGG	2	6	183550	183555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220320
3158	NC_019702	TAAT	2	8	183728	183735	50 %	50 %	0 %	0 %	428220320
3159	NC_019702	GAA	2	6	183770	183775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220320
3160	NC_019702	TCA	2	6	183885	183890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220320
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3164	NC_019702	TAC	2	6	184230	184235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220320
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3172	NC_019702	AAAG	2	8	184622	184629	75 %	0 %	25 %	0 %	428220321
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3175	NC_019702	TAA	2	6	184767	184772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220321
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3184	NC_019702	GCG	2	6	185116	185121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220322
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3194	NC_019702	AAGC	2	8	185581	185588	50 %	0 %	25 %	25 %	428220323
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3215	NC_019702	TAAC	2	8	186536	186543	50 %	25 %	0 %	25 %	428220323
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3218	NC_019702	TA	3	6	186683	186688	50 %	50 %	0 %	0 %	428220323
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3227	NC_019702	CTA	2	6	187251	187256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220323
3228	NC_019702	CTG	2	6	187397	187402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220323
3229	NC_019702	TA	3	6	187472	187477	50 %	50 %	0 %	0 %	428220323
3230	NC_019702	AGCC	2	8	187488	187495	25 %	0 %	25 %	50 %	428220323
3231	NC_019702	ATC	2	6	187512	187517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220323
3232	NC_019702	TCA	2	6	187528	187533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220324
3233	NC_019702	CCGA	2	8	187650	187657	25 %	0 %	25 %	50 %	428220324
3234	NC_019702	TGG	2	6	187668	187673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220324
3235	NC_019702	TAA	2	6	187698	187703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220324
3236	NC_019702	AAT	2	6	187716	187721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220324
3237	NC_019702	TGC	2	6	187798	187803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220324
3238	NC_019702	AATTA	2	10	187905	187914	60 %	40 %	0 %	0 %	428220324
3239	NC_019702	GCAACT	2	12	187915	187926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428220324
3240	NC_019702	TCC	2	6	187938	187943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220324
3241	NC_019702	TAAG	2	8	187974	187981	50 %	25 %	25 %	0 %	428220324
3242	NC_019702	AGC	2	6	188036	188041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220324
3243	NC_019702	AGG	2	6	188049	188054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220324
3244	NC_019702	ACTTC	2	10	188068	188077	20 %	40 %	0 %	40 %	428220324
3245	NC_019702	AATT	2	8	188126	188133	50 %	50 %	0 %	0 %	428220324
3246	NC_019702	AAT	2	6	188166	188171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220324
3247	NC_019702	ATTA	2	8	188181	188188	50 %	50 %	0 %	0 %	428220324
3248	NC_019702	GTACT	2	10	188252	188261	20 %	40 %	20 %	20 %	428220324
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3385	NC_019702	TAG	2	6	195084	195089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3494	NC_019702	GTA	2	6	200186	200191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220339
3495	NC_019702	A	6	6	200274	200279	100 %	0 %	0 %	0 %	428220339
3496	NC_019702	AAAG	2	8	200425	200432	75 %	0 %	25 %	0 %	428220339
3497	NC_019702	ATT	2	6	200540	200545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220339
3498	NC_019702	GAA	2	6	200588	200593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220339
3499	NC_019702	GGT	2	6	200642	200647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220339
3500	NC_019702	AGA	2	6	200656	200661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220339

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