MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019702	TTC	2	6	144751	144756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220278
2502	NC_019702	AGC	2	6	144757	144762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220278
2503	NC_019702	TCA	2	6	144929	144934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220278
2504	NC_019702	CGG	2	6	144985	144990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220278
2505	NC_019702	GAC	2	6	145074	145079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220278
2506	NC_019702	TGC	2	6	145099	145104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220278
2507	NC_019702	TCT	2	6	145151	145156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220278
2508	NC_019702	ATA	2	6	145313	145318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220278
2509	NC_019702	GAAA	2	8	145328	145335	75 %	0 %	25 %	0 %	428220278
2510	NC_019702	CTT	2	6	145392	145397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220278
2511	NC_019702	CAG	2	6	145509	145514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220278
2512	NC_019702	TCG	2	6	145536	145541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220278
2513	NC_019702	TCA	3	9	145559	145567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220278
2514	NC_019702	ACC	2	6	145618	145623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220279
2515	NC_019702	TTC	2	6	145627	145632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220279
2516	NC_019702	ATC	3	9	145665	145673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220279
2517	NC_019702	TCTCC	2	10	145769	145778	0 %	40 %	0 %	60 %	428220279
2518	NC_019702	TTC	2	6	145779	145784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220279
2519	NC_019702	TCT	3	9	145892	145900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220279
2520	NC_019702	GAA	2	6	145901	145906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220279
2521	NC_019702	CAA	2	6	145970	145975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220279
2522	NC_019702	AATA	2	8	146094	146101	75 %	25 %	0 %	0 %	428220279
2523	NC_019702	GTT	2	6	146129	146134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220279
2524	NC_019702	TTTC	2	8	146159	146166	0 %	75 %	0 %	25 %	428220279
2525	NC_019702	TTC	2	6	146199	146204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220279
2526	NC_019702	TTG	2	6	146240	146245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220279
2527	NC_019702	TTGC	2	8	146319	146326	0 %	50 %	25 %	25 %	428220279
2528	NC_019702	TGA	2	6	146344	146349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220279
2529	NC_019702	CAT	2	6	146390	146395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220279
2530	NC_019702	TCA	2	6	146399	146404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220279
2531	NC_019702	TTAGCT	2	12	146461	146472	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220279
2532	NC_019702	TTCA	2	8	146562	146569	25 %	50 %	0 %	25 %	428220279
2533	NC_019702	CAA	2	6	146711	146716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220279
2534	NC_019702	CTC	2	6	146718	146723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220279
2535	NC_019702	GAT	2	6	146784	146789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220279
2536	NC_019702	GA	3	6	146796	146801	50 %	0 %	50 %	0 %	428220279
2537	NC_019702	TCA	2	6	146821	146826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220279
2538	NC_019702	CAT	2	6	146906	146911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220279
2539	NC_019702	TCA	2	6	146968	146973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220279
2540	NC_019702	A	6	6	146984	146989	100 %	0 %	0 %	0 %	428220279
2541	NC_019702	A	6	6	147006	147011	100 %	0 %	0 %	0 %	428220279
2542	NC_019702	GCG	2	6	147201	147206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220279
2543	NC_019702	T	7	7	147215	147221	0 %	100 %	0 %	0 %	428220279
2544	NC_019702	GCC	2	6	147262	147267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220279
2545	NC_019702	TTGC	2	8	147298	147305	0 %	50 %	25 %	25 %	428220279
2546	NC_019702	T	6	6	147324	147329	0 %	100 %	0 %	0 %	428220279
2547	NC_019702	ATG	2	6	147337	147342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220279
2548	NC_019702	TAC	2	6	147410	147415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220279
2549	NC_019702	ACG	2	6	147477	147482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220279
2550	NC_019702	CTTT	2	8	147619	147626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2551	NC_019702	TAA	2	6	147661	147666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_019702	TAA	2	6	147680	147685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_019702	T	6	6	147690	147695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_019702	AT	3	6	147740	147745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_019702	TTC	2	6	147774	147779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220280
2556	NC_019702	AAT	2	6	147845	147850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220280
2557	NC_019702	TCT	2	6	147851	147856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220280
2558	NC_019702	TCT	2	6	147875	147880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220280
2559	NC_019702	TTGAAT	2	12	147913	147924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428220280
2560	NC_019702	CAG	2	6	147942	147947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220280
2561	NC_019702	CCG	2	6	147961	147966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220280
2562	NC_019702	AATT	2	8	147985	147992	50 %	50 %	0 %	0 %	428220280
2563	NC_019702	TGTAGC	2	12	148024	148035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428220280
2564	NC_019702	AAC	2	6	148038	148043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220280
2565	NC_019702	ATG	2	6	148175	148180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220280
2566	NC_019702	CCA	2	6	148217	148222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220280
2567	NC_019702	GAC	2	6	148227	148232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220280
2568	NC_019702	TGA	2	6	148292	148297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220280
2569	NC_019702	TCA	2	6	148524	148529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220281
2570	NC_019702	CCG	3	9	148576	148584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220281
2571	NC_019702	T	7	7	148668	148674	0 %	100 %	0 %	0 %	428220281
2572	NC_019702	TTGGT	2	10	148818	148827	0 %	60 %	40 %	0 %	428220281
2573	NC_019702	AGGT	2	8	149003	149010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_019702	ATT	2	6	149013	149018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220282
2575	NC_019702	ATT	2	6	149062	149067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220282
2576	NC_019702	GGC	2	6	149185	149190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220282
2577	NC_019702	TTG	2	6	149311	149316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220282
2578	NC_019702	AAT	2	6	149416	149421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220282
2579	NC_019702	GTA	2	6	149479	149484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220282
2580	NC_019702	TGC	2	6	149493	149498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220282
2581	NC_019702	CTAA	2	8	149518	149525	50 %	25 %	0 %	25 %	428220282
2582	NC_019702	GCG	2	6	149757	149762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220283
2583	NC_019702	GATG	2	8	149797	149804	25 %	25 %	50 %	0 %	428220283
2584	NC_019702	AG	3	6	149876	149881	50 %	0 %	50 %	0 %	428220283
2585	NC_019702	AATC	2	8	149901	149908	50 %	25 %	0 %	25 %	428220283
2586	NC_019702	TAGAG	2	10	149910	149919	40 %	20 %	40 %	0 %	428220283
2587	NC_019702	A	6	6	150122	150127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_019702	ACTTTC	2	12	150177	150188	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428220284
2589	NC_019702	GCT	2	6	150198	150203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220284
2590	NC_019702	GCT	2	6	150252	150257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220284
2591	NC_019702	AGT	2	6	150261	150266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220284
2592	NC_019702	CT	3	6	150285	150290	0 %	50 %	0 %	50 %	428220284
2593	NC_019702	GAA	2	6	150340	150345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220284
2594	NC_019702	TAA	2	6	150356	150361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220284
2595	NC_019702	T	6	6	150405	150410	0 %	100 %	0 %	0 %	428220284
2596	NC_019702	TAG	2	6	150473	150478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220284
2597	NC_019702	GGTGCA	2	12	150654	150665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428220284
2598	NC_019702	TGC	2	6	150677	150682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220284
2599	NC_019702	TAT	2	6	150769	150774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220284
2600	NC_019702	AAAGCT	2	12	150813	150824	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428220284
2601	NC_019702	CT	3	6	150858	150863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2602	NC_019702	TTTTTG	2	12	150881	150892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_019702	AAT	2	6	150937	150942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_019702	AGT	2	6	150971	150976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_019702	ATG	2	6	150994	150999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_019702	ATTT	2	8	151005	151012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_019702	TTA	2	6	151130	151135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_019702	ATTG	2	8	151180	151187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_019702	AG	4	8	151253	151260	50 %	0 %	50 %	0 %	428220285
2610	NC_019702	GTA	2	6	151276	151281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220285
2611	NC_019702	TTC	2	6	151438	151443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_019702	TA	4	8	151455	151462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_019702	TAT	2	6	151501	151506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_019702	TA	3	6	151516	151521	50 %	50 %	0 %	0 %	428220286
2615	NC_019702	GGT	2	6	151655	151660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220286
2616	NC_019702	TTG	2	6	151720	151725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220286
2617	NC_019702	CAA	2	6	151743	151748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220286
2618	NC_019702	T	6	6	151766	151771	0 %	100 %	0 %	0 %	428220286
2619	NC_019702	TGA	2	6	151807	151812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220286
2620	NC_019702	CAA	4	12	151848	151859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220286
2621	NC_019702	TGC	2	6	151882	151887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220286
2622	NC_019702	GGT	2	6	151956	151961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220287
2623	NC_019702	TG	3	6	151997	152002	0 %	50 %	50 %	0 %	428220287
2624	NC_019702	GAA	2	6	152100	152105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220287
2625	NC_019702	AGC	2	6	152183	152188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220287
2626	NC_019702	ATT	2	6	152202	152207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220287
2627	NC_019702	A	6	6	152249	152254	100 %	0 %	0 %	0 %	428220287
2628	NC_019702	A	6	6	152274	152279	100 %	0 %	0 %	0 %	428220288
2629	NC_019702	CAT	2	6	152291	152296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220288
2630	NC_019702	TGC	2	6	152300	152305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220288
2631	NC_019702	TACC	2	8	152335	152342	25 %	25 %	0 %	50 %	428220288
2632	NC_019702	TTA	2	6	152347	152352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220288
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2634	NC_019702	AAT	2	6	152454	152459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_019702	TAC	2	6	152463	152468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_019702	GTA	2	6	152474	152479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_019702	GTA	2	6	152486	152491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_019702	TGA	2	6	152523	152528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220289
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2640	NC_019702	ACA	2	6	152604	152609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220289
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2648	NC_019702	AACG	2	8	152850	152857	50 %	0 %	25 %	25 %	428220290
2649	NC_019702	ATT	2	6	153025	153030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220290
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2651	NC_019702	GTAA	2	8	153188	153195	50 %	25 %	25 %	0 %	428220291
2652	NC_019702	CGAAT	2	10	153236	153245	40 %	20 %	20 %	20 %	428220291
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2657	NC_019702	CCA	2	6	153428	153433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220291
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2661	NC_019702	CCATT	2	10	153566	153575	20 %	40 %	0 %	40 %	428220291
2662	NC_019702	GAC	2	6	153660	153665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220291
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2680	NC_019702	ATA	2	6	154987	154992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2681	NC_019702	A	6	6	155017	155022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2682	NC_019702	TCT	2	6	155157	155162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220292
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2707	NC_019702	GGAT	2	8	156464	156471	25 %	25 %	50 %	0 %	428220294
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2726	NC_019702	ATA	2	6	157806	157811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220294
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2730	NC_019702	GATA	2	8	157941	157948	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2731	NC_019702	AGA	2	6	157953	157958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2732	NC_019702	C	6	6	158030	158035	0 %	0 %	0 %	100 %	428220295
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2735	NC_019702	TCAA	2	8	158486	158493	50 %	25 %	0 %	25 %	428220295
2736	NC_019702	A	6	6	158504	158509	100 %	0 %	0 %	0 %	428220295
2737	NC_019702	AGA	2	6	158619	158624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220295
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2744	NC_019702	TACCC	2	10	159134	159143	20 %	20 %	0 %	60 %	428220296
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2992	NC_019702	AAG	3	9	173180	173188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220312
2993	NC_019702	ACA	2	6	173195	173200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220312
2994	NC_019702	TTG	2	6	173201	173206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220312
2995	NC_019702	CAA	2	6	173253	173258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220312
2996	NC_019702	CTT	2	6	173274	173279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220312
2997	NC_019702	AGT	2	6	173295	173300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220312
2998	NC_019702	AGT	2	6	173394	173399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220312
2999	NC_019702	GAAA	2	8	173455	173462	75 %	0 %	25 %	0 %	428220312
3000	NC_019702	GCT	2	6	173488	173493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220312

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