MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019702	AATT	2	8	114971	114978	50 %	50 %	0 %	0 %	428220248
2002	NC_019702	TAAA	2	8	115034	115041	75 %	25 %	0 %	0 %	428220248
2003	NC_019702	TG	3	6	115071	115076	0 %	50 %	50 %	0 %	428220248
2004	NC_019702	TAA	2	6	115098	115103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220248
2005	NC_019702	ATA	2	6	115122	115127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220248
2006	NC_019702	AGGC	2	8	115144	115151	25 %	0 %	50 %	25 %	428220248
2007	NC_019702	T	6	6	115183	115188	0 %	100 %	0 %	0 %	428220248
2008	NC_019702	TAA	2	6	115218	115223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220248
2009	NC_019702	AAC	2	6	115238	115243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220248
2010	NC_019702	TTGA	2	8	115267	115274	25 %	50 %	25 %	0 %	428220248
2011	NC_019702	GTA	2	6	115456	115461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220248
2012	NC_019702	CGT	2	6	115476	115481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220248
2013	NC_019702	ACC	2	6	115500	115505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220248
2014	NC_019702	ATC	2	6	115521	115526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220248
2015	NC_019702	AAC	2	6	115527	115532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220248
2016	NC_019702	GGC	2	6	115578	115583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220248
2017	NC_019702	CCA	2	6	115700	115705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220248
2018	NC_019702	GTT	2	6	115736	115741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_019702	ATGA	2	8	115755	115762	50 %	25 %	25 %	0 %	428220249
2020	NC_019702	ACA	2	6	115805	115810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220249
2021	NC_019702	ATC	2	6	115865	115870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220249
2022	NC_019702	CACT	2	8	115953	115960	25 %	25 %	0 %	50 %	428220249
2023	NC_019702	TTA	2	6	116050	116055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220249
2024	NC_019702	AACC	2	8	116106	116113	50 %	0 %	0 %	50 %	428220249
2025	NC_019702	GGA	2	6	116127	116132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220249
2026	NC_019702	CCA	2	6	116143	116148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220249
2027	NC_019702	AGC	2	6	116165	116170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220249
2028	NC_019702	CTACAC	2	12	116191	116202	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428220249
2029	NC_019702	AAT	2	6	116241	116246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220249
2030	NC_019702	GATTA	2	10	116369	116378	40 %	40 %	20 %	0 %	428220249
2031	NC_019702	TCT	2	6	116409	116414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220249
2032	NC_019702	CAA	2	6	116442	116447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220249
2033	NC_019702	GAG	2	6	116453	116458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220249
2034	NC_019702	ACT	2	6	116469	116474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220249
2035	NC_019702	A	6	6	116501	116506	100 %	0 %	0 %	0 %	428220249
2036	NC_019702	ATT	2	6	116511	116516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220249
2037	NC_019702	TTG	2	6	116616	116621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220249
2038	NC_019702	CCCAT	2	10	116662	116671	20 %	20 %	0 %	60 %	428220249
2039	NC_019702	GCT	2	6	116727	116732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220249
2040	NC_019702	CTG	2	6	116807	116812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220250
2041	NC_019702	ACA	2	6	116917	116922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220250
2042	NC_019702	AATT	2	8	116980	116987	50 %	50 %	0 %	0 %	428220250
2043	NC_019702	GCT	2	6	117187	117192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220251
2044	NC_019702	ACC	2	6	117195	117200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220251
2045	NC_019702	TGC	2	6	117201	117206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220251
2046	NC_019702	ATA	2	6	117207	117212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220251
2047	NC_019702	TCA	3	9	117300	117308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220251
2048	NC_019702	TAA	2	6	117511	117516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220251
2049	NC_019702	TCA	3	9	117525	117533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220251
2050	NC_019702	TAA	2	6	117651	117656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2051	NC_019702	AC	3	6	117722	117727	50 %	0 %	0 %	50 %	428220252
2052	NC_019702	CAT	2	6	117854	117859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220252
2053	NC_019702	CCG	2	6	117905	117910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220252
2054	NC_019702	GGT	2	6	117967	117972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220252
2055	NC_019702	CCA	2	6	118055	118060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220252
2056	NC_019702	AAATC	2	10	118103	118112	60 %	20 %	0 %	20 %	428220252
2057	NC_019702	A	6	6	118186	118191	100 %	0 %	0 %	0 %	428220252
2058	NC_019702	GCT	2	6	118210	118215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220252
2059	NC_019702	AACTT	2	10	118306	118315	40 %	40 %	0 %	20 %	428220252
2060	NC_019702	TGT	2	6	118336	118341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220252
2061	NC_019702	TAA	2	6	118458	118463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220252
2062	NC_019702	TAAAA	2	10	118574	118583	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_019702	ATT	2	6	118646	118651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220253
2064	NC_019702	TTTC	2	8	118665	118672	0 %	75 %	0 %	25 %	428220253
2065	NC_019702	CTTC	2	8	118707	118714	0 %	50 %	0 %	50 %	428220253
2066	NC_019702	AAG	2	6	118779	118784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220253
2067	NC_019702	TATT	2	8	118803	118810	25 %	75 %	0 %	0 %	428220253
2068	NC_019702	ACC	2	6	118855	118860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220253
2069	NC_019702	GCC	2	6	118938	118943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220254
2070	NC_019702	AAT	2	6	118956	118961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220254
2071	NC_019702	CAT	2	6	118976	118981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220254
2072	NC_019702	AAG	2	6	119005	119010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220254
2073	NC_019702	TCA	2	6	119065	119070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220254
2074	NC_019702	TAC	2	6	119132	119137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220254
2075	NC_019702	ATT	2	6	119160	119165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220254
2076	NC_019702	TTGA	2	8	119246	119253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2077	NC_019702	ACT	2	6	119259	119264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220255
2078	NC_019702	GAT	2	6	119460	119465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220255
2079	NC_019702	TTA	2	6	119510	119515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220255
2080	NC_019702	CTA	2	6	119586	119591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220255
2081	NC_019702	AATTA	2	10	119737	119746	60 %	40 %	0 %	0 %	428220255
2082	NC_019702	T	6	6	119878	119883	0 %	100 %	0 %	0 %	428220255
2083	NC_019702	CCCA	2	8	119910	119917	25 %	0 %	0 %	75 %	428220255
2084	NC_019702	ATC	2	6	119944	119949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220255
2085	NC_019702	TGAG	2	8	119962	119969	25 %	25 %	50 %	0 %	428220255
2086	NC_019702	TAA	2	6	119981	119986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220255
2087	NC_019702	TCCA	2	8	120056	120063	25 %	25 %	0 %	50 %	428220255
2088	NC_019702	CCAA	2	8	120090	120097	50 %	0 %	0 %	50 %	428220255
2089	NC_019702	CAG	2	6	120192	120197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220255
2090	NC_019702	TTG	2	6	120212	120217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_019702	TTG	2	6	120223	120228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2092	NC_019702	AAT	2	6	120244	120249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_019702	AGC	2	6	120511	120516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220256
2094	NC_019702	A	7	7	120585	120591	100 %	0 %	0 %	0 %	428220256
2095	NC_019702	TTA	2	6	120599	120604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220256
2096	NC_019702	TTAGG	2	10	120660	120669	20 %	40 %	40 %	0 %	428220256
2097	NC_019702	TAT	2	6	120755	120760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_019702	ACT	2	6	120813	120818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_019702	TAT	2	6	120857	120862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2100	NC_019702	ATT	2	6	120887	120892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2101	NC_019702	GATA	2	8	120943	120950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2102	NC_019702	ACT	2	6	121010	121015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_019702	GCT	2	6	121087	121092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_019702	ATA	2	6	121155	121160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_019702	A	6	6	121164	121169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_019702	T	6	6	121622	121627	0 %	100 %	0 %	0 %	428220257
2107	NC_019702	CCTTG	2	10	121654	121663	0 %	40 %	20 %	40 %	428220257
2108	NC_019702	TTA	2	6	121704	121709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220257
2109	NC_019702	GCA	2	6	121751	121756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220257
2110	NC_019702	TGA	2	6	121839	121844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220257
2111	NC_019702	TGCT	2	8	121856	121863	0 %	50 %	25 %	25 %	428220257
2112	NC_019702	TGA	2	6	121891	121896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220257
2113	NC_019702	AAT	2	6	121919	121924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220257
2114	NC_019702	TTAT	2	8	121972	121979	25 %	75 %	0 %	0 %	428220257
2115	NC_019702	TAAT	2	8	122043	122050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_019702	AT	3	6	122075	122080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2117	NC_019702	TGAC	2	8	122121	122128	25 %	25 %	25 %	25 %	428220258
2118	NC_019702	A	6	6	122141	122146	100 %	0 %	0 %	0 %	428220258
2119	NC_019702	AGA	2	6	122158	122163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220258
2120	NC_019702	GC	3	6	122189	122194	0 %	0 %	50 %	50 %	428220258
2121	NC_019702	ATG	2	6	122256	122261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220258
2122	NC_019702	AGG	2	6	122292	122297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220258
2123	NC_019702	A	7	7	122334	122340	100 %	0 %	0 %	0 %	428220258
2124	NC_019702	ATT	2	6	122464	122469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220258
2125	NC_019702	CCTG	2	8	122485	122492	0 %	25 %	25 %	50 %	428220258
2126	NC_019702	ATTT	2	8	122534	122541	25 %	75 %	0 %	0 %	428220258
2127	NC_019702	TGG	2	6	122589	122594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220258
2128	NC_019702	ATT	2	6	122639	122644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220258
2129	NC_019702	TA	3	6	122730	122735	50 %	50 %	0 %	0 %	428220259
2130	NC_019702	TAGA	2	8	122804	122811	50 %	25 %	25 %	0 %	428220259
2131	NC_019702	AT	3	6	122845	122850	50 %	50 %	0 %	0 %	428220259
2132	NC_019702	CTT	2	6	122853	122858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220259
2133	NC_019702	GAC	2	6	123033	123038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220259
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2137	NC_019702	ACTCAT	2	12	123232	123243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220260
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2139	NC_019702	TTTCAG	2	12	123352	123363	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220260
2140	NC_019702	TAA	3	9	123473	123481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220261
2141	NC_019702	GT	3	6	123518	123523	0 %	50 %	50 %	0 %	428220261
2142	NC_019702	ATA	2	6	123531	123536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220261
2143	NC_019702	CAA	2	6	123570	123575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2144	NC_019702	TGAA	2	8	123598	123605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2145	NC_019702	T	6	6	123651	123656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2146	NC_019702	CA	3	6	123700	123705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2147	NC_019702	TGA	2	6	123807	123812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220262
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2150	NC_019702	TCC	2	6	123926	123931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220262
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2153	NC_019702	T	8	8	124212	124219	0 %	100 %	0 %	0 %	428220262
2154	NC_019702	ATA	2	6	124231	124236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220262
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2160	NC_019702	ATC	2	6	124531	124536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2167	NC_019702	GCAA	2	8	124995	125002	50 %	0 %	25 %	25 %	428220263
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2194	NC_019702	TGA	2	6	126730	126735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220265
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2210	NC_019702	TGGCTT	2	12	127641	127652	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2234	NC_019702	GTA	2	6	129345	129350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220266
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2237	NC_019702	ACTA	2	8	129512	129519	50 %	25 %	0 %	25 %	428220266
2238	NC_019702	CGCC	2	8	129590	129597	0 %	0 %	25 %	75 %	428220266
2239	NC_019702	T	7	7	129670	129676	0 %	100 %	0 %	0 %	428220266
2240	NC_019702	ATA	2	6	129679	129684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220266
2241	NC_019702	CTA	2	6	129703	129708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220266
2242	NC_019702	AACT	2	8	129743	129750	50 %	25 %	0 %	25 %	428220266
2243	NC_019702	CGTC	2	8	129892	129899	0 %	25 %	25 %	50 %	428220266
2244	NC_019702	T	7	7	129952	129958	0 %	100 %	0 %	0 %	428220266
2245	NC_019702	TA	3	6	129974	129979	50 %	50 %	0 %	0 %	428220266
2246	NC_019702	A	6	6	130119	130124	100 %	0 %	0 %	0 %	428220266
2247	NC_019702	AG	3	6	130192	130197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2248	NC_019702	CCT	2	6	130286	130291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2249	NC_019702	TTTG	2	8	130322	130329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2250	NC_019702	TTGGT	2	10	130335	130344	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2251	NC_019702	CTG	2	6	130446	130451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_019702	ATT	2	6	130495	130500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2253	NC_019702	ACC	2	6	130550	130555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2254	NC_019702	TAA	2	6	130579	130584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2261	NC_019702	TGG	2	6	131310	131315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220267
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2371	NC_019702	TGT	2	6	138347	138352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220273
2372	NC_019702	AAACT	2	10	138402	138411	60 %	20 %	0 %	20 %	428220273
2373	NC_019702	CTG	2	6	138420	138425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220273
2374	NC_019702	GTA	2	6	138432	138437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220273
2375	NC_019702	GCA	2	6	138459	138464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220273
2376	NC_019702	GAC	2	6	138477	138482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220273
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2378	NC_019702	TTC	2	6	138607	138612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220273
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2380	NC_019702	TA	3	6	138765	138770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2381	NC_019702	GTT	2	6	138797	138802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2382	NC_019702	CCT	2	6	138875	138880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2383	NC_019702	GA	3	6	138997	139002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2384	NC_019702	TTGA	2	8	139084	139091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2385	NC_019702	CTT	2	6	139101	139106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2386	NC_019702	TAAA	2	8	139125	139132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2387	NC_019702	ATC	2	6	139141	139146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2389	NC_019702	ATC	2	6	139181	139186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2391	NC_019702	GA	3	6	139310	139315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2392	NC_019702	ATC	2	6	139369	139374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2393	NC_019702	AAT	2	6	139494	139499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2394	NC_019702	TATTTT	2	12	139542	139553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2396	NC_019702	TAAT	2	8	139585	139592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2397	NC_019702	TTC	2	6	139614	139619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2402	NC_019702	TAAAGA	2	12	139802	139813	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2424	NC_019702	TAA	2	6	140672	140677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2426	NC_019702	AG	3	6	140718	140723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2429	NC_019702	ACT	2	6	140827	140832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2431	NC_019702	ACCT	2	8	140944	140951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2432	NC_019702	CATT	2	8	141010	141017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2433	NC_019702	ACA	2	6	141033	141038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2434	NC_019702	TAC	2	6	141175	141180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2438	NC_019702	AAATA	2	10	141394	141403	80 %	20 %	0 %	0 %	428220276
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2472	NC_019702	GAA	3	9	143249	143257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220276
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2474	NC_019702	ATA	2	6	143288	143293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2476	NC_019702	TAA	2	6	143385	143390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2479	NC_019702	TCT	2	6	143508	143513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2486	NC_019702	ACTA	2	8	143970	143977	50 %	25 %	0 %	25 %	428220277
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2493	NC_019702	ATTTC	2	10	144263	144272	20 %	60 %	0 %	20 %	428220278
2494	NC_019702	AAGC	2	8	144306	144313	50 %	0 %	25 %	25 %	428220278
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2498	NC_019702	TAC	2	6	144621	144626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220278
2499	NC_019702	CTT	2	6	144690	144695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220278
2500	NC_019702	GTA	2	6	144719	144724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220278

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