MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019702	TAA	2	6	319251	319256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220438
5502	NC_019702	AT	3	6	319265	319270	50 %	50 %	0 %	0 %	428220438
5503	NC_019702	ATA	2	6	319325	319330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_019702	TAG	2	6	319376	319381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220439
5505	NC_019702	GAC	2	6	319412	319417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220439
5506	NC_019702	TCCC	2	8	319575	319582	0 %	25 %	0 %	75 %	428220439
5507	NC_019702	TGG	2	6	319614	319619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220439
5508	NC_019702	TAG	2	6	319634	319639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220439
5509	NC_019702	TAAA	2	8	319667	319674	75 %	25 %	0 %	0 %	428220439
5510	NC_019702	GGC	2	6	319677	319682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220439
5511	NC_019702	TGT	2	6	319726	319731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220439
5512	NC_019702	GCG	2	6	319821	319826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220439
5513	NC_019702	GTA	2	6	319828	319833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220439
5514	NC_019702	ATT	2	6	319839	319844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220439
5515	NC_019702	CAG	3	9	319919	319927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220439
5516	NC_019702	AAC	2	6	320013	320018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220439
5517	NC_019702	CTG	2	6	320228	320233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220439
5518	NC_019702	TGG	2	6	320265	320270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220439
5519	NC_019702	CT	3	6	320359	320364	0 %	50 %	0 %	50 %	428220439
5520	NC_019702	TA	3	6	320417	320422	50 %	50 %	0 %	0 %	428220439
5521	NC_019702	ATAAAT	2	12	320428	320439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220439
5522	NC_019702	TGG	2	6	320442	320447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_019702	TCT	2	6	320477	320482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_019702	TAG	2	6	320494	320499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220440
5525	NC_019702	CTT	2	6	320501	320506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220440
5526	NC_019702	GCT	2	6	320561	320566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220440
5527	NC_019702	T	7	7	320575	320581	0 %	100 %	0 %	0 %	428220440
5528	NC_019702	TTA	2	6	320656	320661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220440
5529	NC_019702	AAT	2	6	320850	320855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220440
5530	NC_019702	TAA	2	6	320915	320920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220440
5531	NC_019702	GAT	2	6	321067	321072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220441
5532	NC_019702	T	6	6	321121	321126	0 %	100 %	0 %	0 %	428220441
5533	NC_019702	TCG	2	6	321232	321237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220441
5534	NC_019702	CTA	2	6	321322	321327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220441
5535	NC_019702	CAGT	2	8	321366	321373	25 %	25 %	25 %	25 %	428220441
5536	NC_019702	AAT	2	6	321686	321691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220441
5537	NC_019702	AGT	2	6	321740	321745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220441
5538	NC_019702	CAC	2	6	321755	321760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220441
5539	NC_019702	GGC	2	6	321881	321886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220441
5540	NC_019702	TTA	2	6	322059	322064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220441
5541	NC_019702	GCT	2	6	322095	322100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220441
5542	NC_019702	GCA	2	6	322236	322241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220441
5543	NC_019702	TAT	2	6	322303	322308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_019702	ATGAGG	2	12	322339	322350	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_019702	ATTA	2	8	322381	322388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_019702	TAAA	2	8	322400	322407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_019702	ATAGA	2	10	322425	322434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_019702	TTAG	2	8	322466	322473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_019702	T	6	6	322485	322490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_019702	AAG	2	6	322497	322502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_019702	A	6	6	322511	322516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_019702	AATT	2	8	322523	322530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_019702	ATGA	2	8	322559	322566	50 %	25 %	25 %	0 %	428220442
5554	NC_019702	GAC	2	6	322756	322761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220442
5555	NC_019702	GCA	2	6	322820	322825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220442
5556	NC_019702	CAG	2	6	322830	322835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220442
5557	NC_019702	TAA	2	6	322875	322880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_019702	TCC	2	6	322923	322928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_019702	T	6	6	322940	322945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_019702	ATT	2	6	322972	322977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_019702	ATT	2	6	322983	322988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_019702	TTC	2	6	322997	323002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_019702	TCT	2	6	323047	323052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220443
5564	NC_019702	CTG	2	6	323076	323081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220443
5565	NC_019702	TTG	2	6	323090	323095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220443
5566	NC_019702	T	6	6	323161	323166	0 %	100 %	0 %	0 %	428220443
5567	NC_019702	TAA	2	6	323175	323180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220443
5568	NC_019702	T	7	7	323201	323207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_019702	T	9	9	323224	323232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_019702	ATTCC	2	10	323236	323245	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5571	NC_019702	AGG	2	6	323259	323264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_019702	C	8	8	323269	323276	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5573	NC_019702	T	7	7	323277	323283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_019702	TAG	2	6	323344	323349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220444
5575	NC_019702	CCA	3	9	323363	323371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220444
5576	NC_019702	GCC	2	6	323417	323422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220444
5577	NC_019702	CAC	3	9	323430	323438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220444
5578	NC_019702	ATA	2	6	323441	323446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220444
5579	NC_019702	TCAAAT	2	12	323516	323527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428220444
5580	NC_019702	AAT	2	6	323582	323587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220444
5581	NC_019702	TTGA	2	8	323588	323595	25 %	50 %	25 %	0 %	428220444
5582	NC_019702	TAA	3	9	323704	323712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220444
5583	NC_019702	CTC	2	6	323718	323723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220444
5584	NC_019702	TTTGCT	2	12	323729	323740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428220444
5585	NC_019702	ATC	2	6	323825	323830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220444
5586	NC_019702	CCA	3	9	323831	323839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220444
5587	NC_019702	ACC	2	6	323905	323910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220444
5588	NC_019702	ATCG	2	8	323941	323948	25 %	25 %	25 %	25 %	428220444
5589	NC_019702	TAA	2	6	323977	323982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220444
5590	NC_019702	GGAT	2	8	323995	324002	25 %	25 %	50 %	0 %	428220444
5591	NC_019702	CAT	2	6	324060	324065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220444
5592	NC_019702	ATTT	2	8	324093	324100	25 %	75 %	0 %	0 %	428220444
5593	NC_019702	TTC	3	9	324121	324129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220444
5594	NC_019702	CAT	2	6	324177	324182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220444
5595	NC_019702	ATC	2	6	324214	324219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220444
5596	NC_019702	TGT	2	6	324232	324237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220444
5597	NC_019702	TAA	2	6	324241	324246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220444
5598	NC_019702	ACTA	2	8	324316	324323	50 %	25 %	0 %	25 %	428220444
5599	NC_019702	TTGCC	2	10	324327	324336	0 %	40 %	20 %	40 %	428220444
5600	NC_019702	TCG	2	6	324389	324394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220444
5601	NC_019702	CT	3	6	324447	324452	0 %	50 %	0 %	50 %	428220444
5602	NC_019702	CTA	2	6	324456	324461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220444
5603	NC_019702	ATAAA	2	10	324500	324509	80 %	20 %	0 %	0 %	428220444
5604	NC_019702	AAC	2	6	324556	324561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_019702	CGAT	2	8	324637	324644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_019702	CTTA	2	8	324647	324654	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5607	NC_019702	CTA	2	6	324659	324664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_019702	TTAA	2	8	324676	324683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_019702	G	6	6	324712	324717	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_019702	ACC	2	6	324728	324733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_019702	AGA	2	6	324763	324768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_019702	ATTA	2	8	324769	324776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_019702	AGA	2	6	324790	324795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_019702	TTA	2	6	324864	324869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220445
5615	NC_019702	AGTA	2	8	324925	324932	50 %	25 %	25 %	0 %	428220445
5616	NC_019702	CAA	2	6	324940	324945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220445
5617	NC_019702	TTG	2	6	325007	325012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220445
5618	NC_019702	TAAA	2	8	325051	325058	75 %	25 %	0 %	0 %	428220445
5619	NC_019702	TCC	2	6	325125	325130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220445
5620	NC_019702	G	7	7	325209	325215	0 %	0 %	100 %	0 %	428220445
5621	NC_019702	TAG	2	6	325279	325284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220445
5622	NC_019702	AAT	2	6	325376	325381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220445
5623	NC_019702	GAATTT	2	12	325521	325532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428220445
5624	NC_019702	TGG	2	6	325561	325566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220445
5625	NC_019702	TTGT	2	8	325579	325586	0 %	75 %	25 %	0 %	428220445
5626	NC_019702	TGC	2	6	325658	325663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220445
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5628	NC_019702	TGC	2	6	325692	325697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220445
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5733	NC_019702	CTAGTT	2	12	331831	331842	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220451
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5739	NC_019702	TAA	2	6	332096	332101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220451
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5747	NC_019702	A	6	6	332622	332627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5748	NC_019702	A	7	7	332683	332689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5751	NC_019702	TTA	2	6	332831	332836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220452
5752	NC_019702	GTG	2	6	333023	333028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220452
5753	NC_019702	GTC	2	6	333062	333067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220452
5754	NC_019702	TAA	2	6	333204	333209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220452
5755	NC_019702	TTA	2	6	333322	333327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220452
5756	NC_019702	AGT	2	6	333352	333357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220452
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5764	NC_019702	ATC	2	6	333739	333744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220453
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5768	NC_019702	CTG	2	6	333876	333881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220453
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5772	NC_019702	GCAGTC	2	12	334085	334096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428220453
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5783	NC_019702	GCT	2	6	334514	334519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220453
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5808	NC_019702	TTA	2	6	335983	335988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5809	NC_019702	TAG	2	6	335989	335994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5864	NC_019702	AAC	2	6	338291	338296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5865	NC_019702	AGTTG	2	10	338320	338329	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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5869	NC_019702	ATG	2	6	338552	338557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5872	NC_019702	TAC	2	6	338921	338926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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