MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 chromosome

Total Repeats: 61129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019702	AAT	2	6	256942	256947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220384
4502	NC_019702	TAAT	2	8	256962	256969	50 %	50 %	0 %	0 %	428220384
4503	NC_019702	ATC	2	6	257032	257037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220384
4504	NC_019702	CAA	2	6	257046	257051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220384
4505	NC_019702	C	6	6	257055	257060	0 %	0 %	0 %	100 %	428220384
4506	NC_019702	GGAT	2	8	257074	257081	25 %	25 %	50 %	0 %	428220384
4507	NC_019702	TGA	2	6	257155	257160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_019702	TAC	2	6	257176	257181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220385
4509	NC_019702	CTG	2	6	257208	257213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220385
4510	NC_019702	TGT	2	6	257227	257232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220385
4511	NC_019702	CTT	2	6	257267	257272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220385
4512	NC_019702	TAC	2	6	257363	257368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220385
4513	NC_019702	ATTC	2	8	257417	257424	25 %	50 %	0 %	25 %	428220385
4514	NC_019702	ATT	2	6	257523	257528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220385
4515	NC_019702	TTAA	2	8	257646	257653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_019702	ATTT	2	8	257682	257689	25 %	75 %	0 %	0 %	428220386
4517	NC_019702	GCTT	2	8	257856	257863	0 %	50 %	25 %	25 %	428220386
4518	NC_019702	TTG	2	6	257864	257869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428220386
4519	NC_019702	ATC	2	6	257900	257905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220386
4520	NC_019702	TTC	2	6	257997	258002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220386
4521	NC_019702	TAG	2	6	258019	258024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_019702	A	6	6	258072	258077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_019702	TAC	2	6	258101	258106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_019702	CAC	2	6	258227	258232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220387
4525	NC_019702	CTG	2	6	258338	258343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220387
4526	NC_019702	ATT	2	6	258349	258354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220387
4527	NC_019702	TGAT	2	8	258506	258513	25 %	50 %	25 %	0 %	428220387
4528	NC_019702	TGC	2	6	258731	258736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220387
4529	NC_019702	ATT	3	9	258766	258774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220387
4530	NC_019702	ATT	2	6	258843	258848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220387
4531	NC_019702	CTAT	2	8	258853	258860	25 %	50 %	0 %	25 %	428220387
4532	NC_019702	T	6	6	258862	258867	0 %	100 %	0 %	0 %	428220387
4533	NC_019702	TGGG	2	8	258904	258911	0 %	25 %	75 %	0 %	428220387
4534	NC_019702	TTTA	2	8	258962	258969	25 %	75 %	0 %	0 %	428220387
4535	NC_019702	CAG	2	6	259178	259183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220387
4536	NC_019702	GGA	2	6	259323	259328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220388
4537	NC_019702	AAC	2	6	259340	259345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220388
4538	NC_019702	TGA	2	6	259347	259352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220388
4539	NC_019702	T	6	6	259386	259391	0 %	100 %	0 %	0 %	428220388
4540	NC_019702	A	8	8	259524	259531	100 %	0 %	0 %	0 %	428220388
4541	NC_019702	AAC	2	6	259544	259549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220388
4542	NC_019702	ATT	2	6	259628	259633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220388
4543	NC_019702	A	6	6	259637	259642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_019702	AT	3	6	259739	259744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_019702	GT	3	6	259827	259832	0 %	50 %	50 %	0 %	428220389
4546	NC_019702	TTC	2	6	259844	259849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220389
4547	NC_019702	AACTG	2	10	259896	259905	40 %	20 %	20 %	20 %	428220389
4548	NC_019702	GCG	2	6	259956	259961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220389
4549	NC_019702	AAT	2	6	259964	259969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220389
4550	NC_019702	GCG	2	6	259970	259975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428220389
4551	NC_019702	AGC	2	6	260009	260014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220389
4552	NC_019702	GAGGTA	2	12	260158	260169	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428220389
4553	NC_019702	TTA	2	6	260292	260297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220389
4554	NC_019702	TCA	2	6	260332	260337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220389
4555	NC_019702	AAC	2	6	260354	260359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220389
4556	NC_019702	TAG	2	6	260432	260437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220389
4557	NC_019702	AATTAC	2	12	260480	260491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428220389
4558	NC_019702	TCA	2	6	260517	260522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220389
4559	NC_019702	AAT	2	6	260528	260533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220389
4560	NC_019702	T	7	7	260634	260640	0 %	100 %	0 %	0 %	428220389
4561	NC_019702	AAC	2	6	260693	260698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220389
4562	NC_019702	ATG	2	6	260711	260716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220389
4563	NC_019702	A	6	6	260803	260808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_019702	TAT	2	6	260891	260896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_019702	ACT	2	6	260934	260939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_019702	GAAA	2	8	260940	260947	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_019702	ATT	2	6	261017	261022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_019702	AGA	2	6	261161	261166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220390
4569	NC_019702	CCT	2	6	261336	261341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428220390
4570	NC_019702	AGC	2	6	261368	261373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220390
4571	NC_019702	GCA	2	6	261381	261386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220390
4572	NC_019702	TAC	2	6	261428	261433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220390
4573	NC_019702	T	6	6	261474	261479	0 %	100 %	0 %	0 %	428220390
4574	NC_019702	AGATCA	2	12	261593	261604	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428220390
4575	NC_019702	ACC	2	6	261768	261773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220391
4576	NC_019702	TGG	2	6	261805	261810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220391
4577	NC_019702	ATTG	2	8	261841	261848	25 %	50 %	25 %	0 %	428220391
4578	NC_019702	TGG	2	6	261891	261896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428220391
4579	NC_019702	AGT	2	6	261962	261967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220391
4580	NC_019702	CAT	2	6	261975	261980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220391
4581	NC_019702	CAT	2	6	262024	262029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220391
4582	NC_019702	AT	3	6	262098	262103	50 %	50 %	0 %	0 %	428220391
4583	NC_019702	ACT	2	6	262108	262113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220391
4584	NC_019702	CTG	2	6	262216	262221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220391
4585	NC_019702	CTG	2	6	262360	262365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220391
4586	NC_019702	GA	3	6	262380	262385	50 %	0 %	50 %	0 %	428220391
4587	NC_019702	TTC	2	6	262393	262398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428220391
4588	NC_019702	ATA	2	6	262462	262467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220391
4589	NC_019702	GATT	2	8	262510	262517	25 %	50 %	25 %	0 %	428220391
4590	NC_019702	TTTA	2	8	262862	262869	25 %	75 %	0 %	0 %	428220392
4591	NC_019702	GCC	2	6	262963	262968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220392
4592	NC_019702	TC	3	6	263201	263206	0 %	50 %	0 %	50 %	428220392
4593	NC_019702	AAT	2	6	263241	263246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220392
4594	NC_019702	CAT	2	6	263251	263256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220392
4595	NC_019702	CCA	2	6	263374	263379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220392
4596	NC_019702	TCA	2	6	263394	263399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220392
4597	NC_019702	TAAATG	2	12	263431	263442	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428220392
4598	NC_019702	ATC	2	6	263519	263524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220392
4599	NC_019702	ACA	2	6	263526	263531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428220392
4600	NC_019702	AAT	2	6	263627	263632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220392
4601	NC_019702	CAT	2	6	263681	263686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220392
4602	NC_019702	GCA	2	6	263704	263709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428220392
4603	NC_019702	TTTCC	2	10	263772	263781	0 %	60 %	0 %	40 %	428220392
4604	NC_019702	CCCA	2	8	263891	263898	25 %	0 %	0 %	75 %	428220392
4605	NC_019702	GCC	2	6	264069	264074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220392
4606	NC_019702	CCA	2	6	264115	264120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428220392
4607	NC_019702	TTGA	2	8	264258	264265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_019702	A	6	6	264385	264390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_019702	A	6	6	264405	264410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_019702	CAAA	2	8	264460	264467	75 %	0 %	0 %	25 %	428220393
4611	NC_019702	TAA	2	6	264652	264657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220393
4612	NC_019702	CTA	2	6	264723	264728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428220393
4613	NC_019702	CT	3	6	264757	264762	0 %	50 %	0 %	50 %	428220393
4614	NC_019702	ATT	2	6	264932	264937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220393
4615	NC_019702	ATT	2	6	265019	265024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220393
4616	NC_019702	TAG	2	6	265080	265085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220393
4617	NC_019702	GTGG	2	8	265139	265146	0 %	25 %	75 %	0 %	428220393
4618	NC_019702	GCT	2	6	265148	265153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428220393
4619	NC_019702	TTA	2	6	265157	265162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220393
4620	NC_019702	GCTA	2	8	265219	265226	25 %	25 %	25 %	25 %	428220393
4621	NC_019702	AGT	2	6	265227	265232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220393
4622	NC_019702	CGT	2	6	265272	265277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_019702	T	6	6	265338	265343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_019702	AGA	2	6	265384	265389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428220394
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4873	NC_019702	TTTA	2	8	282448	282455	25 %	75 %	0 %	0 %	428220407
4874	NC_019702	T	6	6	282477	282482	0 %	100 %	0 %	0 %	428220407
4875	NC_019702	CCAT	2	8	282540	282547	25 %	25 %	0 %	50 %	428220407
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4879	NC_019702	A	6	6	282983	282988	100 %	0 %	0 %	0 %	428220408
4880	NC_019702	AAT	3	9	282995	283003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428220408
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4908	NC_019702	AT	3	6	284591	284596	50 %	50 %	0 %	0 %	428220409
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4911	NC_019702	TA	3	6	284791	284796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4939	NC_019702	CTAGTT	2	12	286945	286956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428220411
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4972	NC_019702	CT	4	8	288997	289004	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4973	NC_019702	ATT	2	6	289051	289056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4982	NC_019702	A	6	6	289448	289453	100 %	0 %	0 %	0 %	428220413
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4985	NC_019702	GATA	2	8	289556	289563	50 %	25 %	25 %	0 %	428220414
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4990	NC_019702	ATCC	2	8	289768	289775	25 %	25 %	0 %	50 %	428220414
4991	NC_019702	CGC	2	6	289784	289789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428220414
4992	NC_019702	ATT	2	6	289821	289826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220414
4993	NC_019702	ATT	2	6	289836	289841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428220414
4994	NC_019702	TGA	2	6	289892	289897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220414
4995	NC_019702	GA	3	6	289917	289922	50 %	0 %	50 %	0 %	428220414
4996	NC_019702	TA	3	6	289930	289935	50 %	50 %	0 %	0 %	428220414
4997	NC_019702	TAAC	2	8	289966	289973	50 %	25 %	0 %	25 %	428220414
4998	NC_019702	ATTGAG	2	12	290065	290076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428220415
4999	NC_019702	T	6	6	290083	290088	0 %	100 %	0 %	0 %	428220415
5000	NC_019702	GGA	2	6	290135	290140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428220415

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