MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7502 plasmid pSYN7502.01

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019691	TA	3	6	1745	1750	50 %	50 %	0 %	0 %	428223391
2	NC_019691	TC	3	6	4034	4039	0 %	50 %	0 %	50 %	428223393
3	NC_019691	AG	3	6	5033	5038	50 %	0 %	50 %	0 %	428223393
4	NC_019691	TA	3	6	5347	5352	50 %	50 %	0 %	0 %	428223393
5	NC_019691	TA	3	6	6380	6385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019691	GT	3	6	6432	6437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019691	GT	3	6	6543	6548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019691	CT	3	6	7238	7243	0 %	50 %	0 %	50 %	428223394
9	NC_019691	AT	3	6	8054	8059	50 %	50 %	0 %	0 %	428223394
10	NC_019691	GA	3	6	8356	8361	50 %	0 %	50 %	0 %	428223395
11	NC_019691	TC	4	8	13537	13544	0 %	50 %	0 %	50 %	428223398
12	NC_019691	CG	3	6	13556	13561	0 %	0 %	50 %	50 %	428223398
13	NC_019691	GA	3	6	14915	14920	50 %	0 %	50 %	0 %	428223400
14	NC_019691	GA	3	6	15108	15113	50 %	0 %	50 %	0 %	428223400
15	NC_019691	AC	4	8	15202	15209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_019691	TC	3	6	16570	16575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019691	TA	3	6	17386	17391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019691	TC	4	8	17650	17657	0 %	50 %	0 %	50 %	428223402
19	NC_019691	AT	3	6	18196	18201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019691	AG	3	6	18796	18801	50 %	0 %	50 %	0 %	428223403
21	NC_019691	CG	3	6	19521	19526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019691	CA	3	6	19664	19669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_019691	AT	3	6	20020	20025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019691	TC	3	6	20448	20453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_019691	TG	3	6	21326	21331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019691	GA	3	6	23078	23083	50 %	0 %	50 %	0 %	428223405
27	NC_019691	CT	3	6	23205	23210	0 %	50 %	0 %	50 %	428223405
28	NC_019691	AG	3	6	23971	23976	50 %	0 %	50 %	0 %	428223406
29	NC_019691	GA	3	6	25531	25536	50 %	0 %	50 %	0 %	428223409
30	NC_019691	TG	3	6	25537	25542	0 %	50 %	50 %	0 %	428223409
31	NC_019691	AG	3	6	25883	25888	50 %	0 %	50 %	0 %	428223409
32	NC_019691	GA	3	6	27001	27006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019691	TG	3	6	28552	28557	0 %	50 %	50 %	0 %	428223410
34	NC_019691	GT	3	6	29189	29194	0 %	50 %	50 %	0 %	428223410
35	NC_019691	AG	3	6	29703	29708	50 %	0 %	50 %	0 %	428223410
36	NC_019691	TC	3	6	31595	31600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_019691	AG	3	6	32945	32950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019691	TC	4	8	33667	33674	0 %	50 %	0 %	50 %	428223417
39	NC_019691	AG	3	6	33834	33839	50 %	0 %	50 %	0 %	428223417
40	NC_019691	AC	3	6	34954	34959	50 %	0 %	0 %	50 %	428223421
41	NC_019691	AT	3	6	37607	37612	50 %	50 %	0 %	0 %	428223422
42	NC_019691	TA	3	6	39369	39374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019691	GC	3	6	39590	39595	0 %	0 %	50 %	50 %	428223424
44	NC_019691	AT	3	6	39751	39756	50 %	50 %	0 %	0 %	428223424
45	NC_019691	AT	3	6	40216	40221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019691	AT	3	6	40380	40385	50 %	50 %	0 %	0 %	428223425
47	NC_019691	AT	4	8	40625	40632	50 %	50 %	0 %	0 %	428223425
48	NC_019691	CA	3	6	42468	42473	50 %	0 %	0 %	50 %	428223426
49	NC_019691	TG	3	6	43352	43357	0 %	50 %	50 %	0 %	428223427
50	NC_019691	AT	3	6	43910	43915	50 %	50 %	0 %	0 %	428223427
51	NC_019691	AT	3	6	44036	44041	50 %	50 %	0 %	0 %	428223427
52	NC_019691	AT	3	6	44921	44926	50 %	50 %	0 %	0 %	428223428
53	NC_019691	CT	3	6	46363	46368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_019691	TA	3	6	46595	46600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019691	CA	3	6	48997	49002	50 %	0 %	0 %	50 %	428223433
56	NC_019691	AT	3	6	52143	52148	50 %	50 %	0 %	0 %	428223437
57	NC_019691	GA	3	6	52508	52513	50 %	0 %	50 %	0 %	428223438
58	NC_019691	CA	3	6	53159	53164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_019691	GA	3	6	53588	53593	50 %	0 %	50 %	0 %	428223440
60	NC_019691	CT	3	6	54087	54092	0 %	50 %	0 %	50 %	428223440
61	NC_019691	AG	3	6	54635	54640	50 %	0 %	50 %	0 %	428223440
62	NC_019691	CT	3	6	56552	56557	0 %	50 %	0 %	50 %	428223442
63	NC_019691	TA	3	6	56700	56705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019691	AG	3	6	59475	59480	50 %	0 %	50 %	0 %	428223446
65	NC_019691	AT	3	6	62036	62041	50 %	50 %	0 %	0 %	428223446

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.