MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 3486

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019680	CG	3	6	2362	2367	0 %	0 %	50 %	50 %	427711181
2	NC_019680	GA	3	6	3663	3668	50 %	0 %	50 %	0 %	427711182
3	NC_019680	CG	3	6	4505	4510	0 %	0 %	50 %	50 %	427711183
4	NC_019680	AG	3	6	5805	5810	50 %	0 %	50 %	0 %	427711183
5	NC_019680	AC	3	6	7662	7667	50 %	0 %	0 %	50 %	427711186
6	NC_019680	AG	3	6	8689	8694	50 %	0 %	50 %	0 %	427711188
7	NC_019680	CA	3	6	9323	9328	50 %	0 %	0 %	50 %	427711189
8	NC_019680	TC	3	6	10443	10448	0 %	50 %	0 %	50 %	427711190
9	NC_019680	AC	3	6	11303	11308	50 %	0 %	0 %	50 %	427711191
10	NC_019680	GA	3	6	11453	11458	50 %	0 %	50 %	0 %	427711191
11	NC_019680	GT	3	6	13009	13014	0 %	50 %	50 %	0 %	427711191
12	NC_019680	AG	3	6	13822	13827	50 %	0 %	50 %	0 %	427711191
13	NC_019680	AT	3	6	14707	14712	50 %	50 %	0 %	0 %	427711193
14	NC_019680	TC	3	6	14722	14727	0 %	50 %	0 %	50 %	427711193
15	NC_019680	CT	3	6	14963	14968	0 %	50 %	0 %	50 %	427711194
16	NC_019680	GA	3	6	18876	18881	50 %	0 %	50 %	0 %	427711198
17	NC_019680	TC	3	6	19106	19111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_019680	GC	3	6	20026	20031	0 %	0 %	50 %	50 %	427711199
19	NC_019680	GA	3	6	20768	20773	50 %	0 %	50 %	0 %	427711199
20	NC_019680	AG	3	6	20801	20806	50 %	0 %	50 %	0 %	427711199
21	NC_019680	AC	3	6	20976	20981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_019680	GA	3	6	21565	21570	50 %	0 %	50 %	0 %	427711200
23	NC_019680	AG	3	6	21632	21637	50 %	0 %	50 %	0 %	427711200
24	NC_019680	CA	3	6	23653	23658	50 %	0 %	0 %	50 %	427711200
25	NC_019680	GA	5	10	24566	24575	50 %	0 %	50 %	0 %	427711201
26	NC_019680	TC	3	6	26903	26908	0 %	50 %	0 %	50 %	427711201
27	NC_019680	GA	3	6	26922	26927	50 %	0 %	50 %	0 %	427711201
28	NC_019680	GA	3	6	26979	26984	50 %	0 %	50 %	0 %	427711201
29	NC_019680	AG	3	6	27286	27291	50 %	0 %	50 %	0 %	427711201
30	NC_019680	GA	3	6	28190	28195	50 %	0 %	50 %	0 %	427711202
31	NC_019680	AG	3	6	28892	28897	50 %	0 %	50 %	0 %	427711202
32	NC_019680	CT	3	6	29967	29972	0 %	50 %	0 %	50 %	427711202
33	NC_019680	GA	4	8	31397	31404	50 %	0 %	50 %	0 %	427711202
34	NC_019680	GT	3	6	31889	31894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019680	TA	3	6	31920	31925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019680	GC	3	6	34131	34136	0 %	0 %	50 %	50 %	427711206
37	NC_019680	CT	3	6	35596	35601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_019680	TC	3	6	38075	38080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_019680	AC	4	8	40141	40148	50 %	0 %	0 %	50 %	427711212
40	NC_019680	TG	3	6	40638	40643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019680	TG	3	6	41821	41826	0 %	50 %	50 %	0 %	427711213
42	NC_019680	CT	3	6	44755	44760	0 %	50 %	0 %	50 %	427711217
43	NC_019680	TC	3	6	45903	45908	0 %	50 %	0 %	50 %	427711219
44	NC_019680	AT	3	6	52501	52506	50 %	50 %	0 %	0 %	427711226
45	NC_019680	GA	4	8	54456	54463	50 %	0 %	50 %	0 %	427711227
46	NC_019680	CT	3	6	56102	56107	0 %	50 %	0 %	50 %	427711229
47	NC_019680	TC	3	6	56182	56187	0 %	50 %	0 %	50 %	427711229
48	NC_019680	AT	3	6	56579	56584	50 %	50 %	0 %	0 %	427711230
49	NC_019680	GC	3	6	59454	59459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_019680	TG	3	6	60480	60485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019680	AC	3	6	60604	60609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_019680	TC	4	8	61019	61026	0 %	50 %	0 %	50 %	427711233
53	NC_019680	GC	3	6	61280	61285	0 %	0 %	50 %	50 %	427711233
54	NC_019680	AG	3	6	61288	61293	50 %	0 %	50 %	0 %	427711233
55	NC_019680	CT	3	6	61323	61328	0 %	50 %	0 %	50 %	427711233
56	NC_019680	AG	3	6	62999	63004	50 %	0 %	50 %	0 %	427711234
57	NC_019680	AG	3	6	63084	63089	50 %	0 %	50 %	0 %	427711234
58	NC_019680	GA	3	6	63658	63663	50 %	0 %	50 %	0 %	427711234
59	NC_019680	CT	3	6	63940	63945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_019680	TC	3	6	65446	65451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_019680	CT	3	6	65530	65535	0 %	50 %	0 %	50 %	427711236
62	NC_019680	AT	3	6	65793	65798	50 %	50 %	0 %	0 %	427711236
63	NC_019680	AT	3	6	68275	68280	50 %	50 %	0 %	0 %	427711238
64	NC_019680	CT	3	6	71276	71281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_019680	AG	3	6	71309	71314	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019680	AC	3	6	71610	71615	50 %	0 %	0 %	50 %	427711239
67	NC_019680	AG	3	6	72219	72224	50 %	0 %	50 %	0 %	427711240
68	NC_019680	AG	3	6	72748	72753	50 %	0 %	50 %	0 %	427711240
69	NC_019680	AG	3	6	74247	74252	50 %	0 %	50 %	0 %	427711240
70	NC_019680	GA	3	6	74851	74856	50 %	0 %	50 %	0 %	427711240
71	NC_019680	TC	3	6	76881	76886	0 %	50 %	0 %	50 %	427711240
72	NC_019680	GT	3	6	77352	77357	0 %	50 %	50 %	0 %	427711240
73	NC_019680	GT	3	6	77814	77819	0 %	50 %	50 %	0 %	427711240
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75	NC_019680	GA	4	8	78810	78817	50 %	0 %	50 %	0 %	427711240
76	NC_019680	GA	3	6	81233	81238	50 %	0 %	50 %	0 %	427711240
77	NC_019680	GC	3	6	81798	81803	0 %	0 %	50 %	50 %	427711240
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79	NC_019680	CA	3	6	85620	85625	50 %	0 %	0 %	50 %	427711242
80	NC_019680	TC	3	6	86236	86241	0 %	50 %	0 %	50 %	427711242
81	NC_019680	AG	3	6	86349	86354	50 %	0 %	50 %	0 %	427711242
82	NC_019680	CA	3	6	86800	86805	50 %	0 %	0 %	50 %	427711243
83	NC_019680	CT	3	6	87329	87334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_019680	TG	3	6	87553	87558	0 %	50 %	50 %	0 %	427711244
85	NC_019680	GC	3	6	89468	89473	0 %	0 %	50 %	50 %	427711246
86	NC_019680	CG	3	6	91952	91957	0 %	0 %	50 %	50 %	427711248
87	NC_019680	AT	3	6	93790	93795	50 %	50 %	0 %	0 %	427711251
88	NC_019680	GA	3	6	95604	95609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019680	CT	4	8	97496	97503	0 %	50 %	0 %	50 %	427711256
90	NC_019680	GC	3	6	98415	98420	0 %	0 %	50 %	50 %	427711257
91	NC_019680	GA	3	6	98811	98816	50 %	0 %	50 %	0 %	427711257
92	NC_019680	CA	3	6	99159	99164	50 %	0 %	0 %	50 %	427711257
93	NC_019680	AG	3	6	100314	100319	50 %	0 %	50 %	0 %	427711259
94	NC_019680	TG	3	6	103068	103073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019680	CT	3	6	106069	106074	0 %	50 %	0 %	50 %	427711264
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97	NC_019680	AT	3	6	109419	109424	50 %	50 %	0 %	0 %	427711267
98	NC_019680	GA	3	6	109541	109546	50 %	0 %	50 %	0 %	427711267
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102	NC_019680	GA	3	6	116667	116672	50 %	0 %	50 %	0 %	427711277
103	NC_019680	GA	3	6	119992	119997	50 %	0 %	50 %	0 %	427711281
104	NC_019680	GA	3	6	120781	120786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019680	CT	3	6	122789	122794	0 %	50 %	0 %	50 %	427711284
106	NC_019680	CT	3	6	123813	123818	0 %	50 %	0 %	50 %	427711286
107	NC_019680	GA	3	6	125976	125981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019680	AG	3	6	126511	126516	50 %	0 %	50 %	0 %	427711290
109	NC_019680	AG	3	6	126804	126809	50 %	0 %	50 %	0 %	427711290
110	NC_019680	GC	3	6	127404	127409	0 %	0 %	50 %	50 %	427711291
111	NC_019680	AT	3	6	128107	128112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019680	CT	6	12	129747	129758	0 %	50 %	0 %	50 %	427711293
113	NC_019680	CT	3	6	134544	134549	0 %	50 %	0 %	50 %	427711298
114	NC_019680	GA	3	6	135442	135447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019680	CA	3	6	136150	136155	50 %	0 %	0 %	50 %	427711300
116	NC_019680	GA	3	6	137186	137191	50 %	0 %	50 %	0 %	427711301
117	NC_019680	TG	3	6	138284	138289	0 %	50 %	50 %	0 %	427711303
118	NC_019680	TG	3	6	140020	140025	0 %	50 %	50 %	0 %	427711303
119	NC_019680	TG	3	6	140221	140226	0 %	50 %	50 %	0 %	427711303
120	NC_019680	GC	3	6	141281	141286	0 %	0 %	50 %	50 %	427711305
121	NC_019680	AT	3	6	146700	146705	50 %	50 %	0 %	0 %	427711307
122	NC_019680	TC	3	6	147527	147532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_019680	TC	3	6	147771	147776	0 %	50 %	0 %	50 %	427711308
124	NC_019680	GC	3	6	147949	147954	0 %	0 %	50 %	50 %	427711308
125	NC_019680	TC	3	6	148557	148562	0 %	50 %	0 %	50 %	427711309
126	NC_019680	TC	3	6	148647	148652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_019680	GC	3	6	149688	149693	0 %	0 %	50 %	50 %	427711311
128	NC_019680	GT	3	6	150738	150743	0 %	50 %	50 %	0 %	427711312
129	NC_019680	CT	3	6	150870	150875	0 %	50 %	0 %	50 %	427711313
130	NC_019680	CG	3	6	151080	151085	0 %	0 %	50 %	50 %	427711313
131	NC_019680	GA	3	6	151388	151393	50 %	0 %	50 %	0 %	427711313
132	NC_019680	CT	4	8	151572	151579	0 %	50 %	0 %	50 %	427711313
133	NC_019680	CG	3	6	151658	151663	0 %	0 %	50 %	50 %	427711313
134	NC_019680	TC	3	6	153384	153389	0 %	50 %	0 %	50 %	427711315
135	NC_019680	GT	3	6	153428	153433	0 %	50 %	50 %	0 %	427711315
136	NC_019680	CT	3	6	153636	153641	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_019680	CT	3	6	155160	155165	0 %	50 %	0 %	50 %	427711316
138	NC_019680	AT	3	6	156183	156188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019680	GA	3	6	156254	156259	50 %	0 %	50 %	0 %	427711318
140	NC_019680	GC	3	6	156382	156387	0 %	0 %	50 %	50 %	427711318
141	NC_019680	CT	3	6	156671	156676	0 %	50 %	0 %	50 %	427711319
142	NC_019680	CT	3	6	157520	157525	0 %	50 %	0 %	50 %	427711319
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