MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 8747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019680	GCAA	2	8	18	25	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019680	AATC	2	8	439	446	50 %	25 %	0 %	25 %	427711180
3	NC_019680	ACTT	2	8	2290	2297	25 %	50 %	0 %	25 %	427711181
4	NC_019680	AATC	2	8	2462	2469	50 %	25 %	0 %	25 %	427711181
5	NC_019680	GGTA	2	8	2510	2517	25 %	25 %	50 %	0 %	427711181
6	NC_019680	GTCG	2	8	3001	3008	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_019680	AGGG	2	8	3885	3892	25 %	0 %	75 %	0 %	427711182
8	NC_019680	TTTG	2	8	4108	4115	0 %	75 %	25 %	0 %	427711182
9	NC_019680	AACC	2	8	4422	4429	50 %	0 %	0 %	50 %	427711182
10	NC_019680	GCTT	2	8	4443	4450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_019680	AAAT	2	8	4602	4609	75 %	25 %	0 %	0 %	427711183
12	NC_019680	GTTT	2	8	5276	5283	0 %	75 %	25 %	0 %	427711183
13	NC_019680	TCAC	2	8	5926	5933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019680	ATTA	2	8	6506	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	427711185
15	NC_019680	CACC	2	8	6772	6779	25 %	0 %	0 %	75 %	427711185
16	NC_019680	TGGG	2	8	6869	6876	0 %	25 %	75 %	0 %	427711185
17	NC_019680	AAGT	2	8	6894	6901	50 %	25 %	25 %	0 %	427711185
18	NC_019680	TCTG	2	8	7425	7432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_019680	GCGG	2	8	7832	7839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019680	TGAT	2	8	8067	8074	25 %	50 %	25 %	0 %	427711187
21	NC_019680	TGTC	2	8	9083	9090	0 %	50 %	25 %	25 %	427711189
22	NC_019680	CGGT	2	8	9673	9680	0 %	25 %	50 %	25 %	427711189
23	NC_019680	ACTT	2	8	9787	9794	25 %	50 %	0 %	25 %	427711190
24	NC_019680	GTAG	2	8	10007	10014	25 %	25 %	50 %	0 %	427711190
25	NC_019680	CGGG	2	8	11193	11200	0 %	0 %	75 %	25 %	427711191
26	NC_019680	GGAA	2	8	11261	11268	50 %	0 %	50 %	0 %	427711191
27	NC_019680	CAAG	2	8	11562	11569	50 %	0 %	25 %	25 %	427711191
28	NC_019680	CAAG	2	8	12180	12187	50 %	0 %	25 %	25 %	427711191
29	NC_019680	TGAT	2	8	12260	12267	25 %	50 %	25 %	0 %	427711191
30	NC_019680	TGAA	2	8	12335	12342	50 %	25 %	25 %	0 %	427711191
31	NC_019680	TAAA	2	8	12440	12447	75 %	25 %	0 %	0 %	427711191
32	NC_019680	TTTG	2	8	12450	12457	0 %	75 %	25 %	0 %	427711191
33	NC_019680	ACTT	2	8	12538	12545	25 %	50 %	0 %	25 %	427711191
34	NC_019680	CTTA	2	8	13304	13311	25 %	50 %	0 %	25 %	427711191
35	NC_019680	ATTT	2	8	13499	13506	25 %	75 %	0 %	0 %	427711191
36	NC_019680	CAAA	2	8	13800	13807	75 %	0 %	0 %	25 %	427711191
37	NC_019680	GCCA	2	8	13813	13820	25 %	0 %	25 %	50 %	427711191
38	NC_019680	CCCA	2	8	14121	14128	25 %	0 %	0 %	75 %	427711191
39	NC_019680	CAAT	2	8	14540	14547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_019680	TGAT	2	8	15154	15161	25 %	50 %	25 %	0 %	427711194
41	NC_019680	CCGG	2	8	15296	15303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019680	GATA	2	8	15312	15319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019680	ACCC	2	8	15546	15553	25 %	0 %	0 %	75 %	427711195
44	NC_019680	GATA	2	8	16014	16021	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019680	ATCA	2	8	16836	16843	50 %	25 %	0 %	25 %	427711197
46	NC_019680	CCAA	2	8	17272	17279	50 %	0 %	0 %	50 %	427711198
47	NC_019680	AGCC	2	8	18468	18475	25 %	0 %	25 %	50 %	427711198
48	NC_019680	AATA	2	8	18500	18507	75 %	25 %	0 %	0 %	427711198
49	NC_019680	TCTG	2	8	19286	19293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_019680	GCCA	2	8	19759	19766	25 %	0 %	25 %	50 %	427711199
51	NC_019680	ACCC	2	8	19963	19970	25 %	0 %	0 %	75 %	427711199
52	NC_019680	TAAA	2	8	20162	20169	75 %	25 %	0 %	0 %	427711199
53	NC_019680	AGCC	2	8	20742	20749	25 %	0 %	25 %	50 %	427711199
54	NC_019680	TTAT	2	8	21238	21245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019680	AAGT	2	8	21468	21475	50 %	25 %	25 %	0 %	427711200
56	NC_019680	GTTC	2	8	21917	21924	0 %	50 %	25 %	25 %	427711200
57	NC_019680	TCAA	2	8	22750	22757	50 %	25 %	0 %	25 %	427711200
58	NC_019680	CATC	2	8	22919	22926	25 %	25 %	0 %	50 %	427711200
59	NC_019680	GCCC	2	8	22939	22946	0 %	0 %	25 %	75 %	427711200
60	NC_019680	TCAT	2	8	23674	23681	25 %	50 %	0 %	25 %	427711200
61	NC_019680	TTGA	2	8	24012	24019	25 %	50 %	25 %	0 %	427711200
62	NC_019680	CCAT	2	8	24318	24325	25 %	25 %	0 %	50 %	427711201
63	NC_019680	AACT	2	8	24578	24585	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
64	NC_019680	CTCA	2	8	24893	24900	25 %	25 %	0 %	50 %	427711201
65	NC_019680	AATC	2	8	25261	25268	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
66	NC_019680	GATA	2	8	25390	25397	50 %	25 %	25 %	0 %	427711201
67	NC_019680	GCTT	2	8	25488	25495	0 %	50 %	25 %	25 %	427711201
68	NC_019680	CCGG	2	8	26579	26586	0 %	0 %	50 %	50 %	427711201
69	NC_019680	ATCA	2	8	26702	26709	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
70	NC_019680	AGCC	2	8	26719	26726	25 %	0 %	25 %	50 %	427711201
71	NC_019680	CACG	2	8	26815	26822	25 %	0 %	25 %	50 %	427711201
72	NC_019680	ATCA	2	8	26996	27003	50 %	25 %	0 %	25 %	427711201
73	NC_019680	GCGA	2	8	28775	28782	25 %	0 %	50 %	25 %	427711202
74	NC_019680	CCAA	2	8	29424	29431	50 %	0 %	0 %	50 %	427711202
75	NC_019680	GCTG	2	8	29595	29602	0 %	25 %	50 %	25 %	427711202
76	NC_019680	TCAT	2	8	29739	29746	25 %	50 %	0 %	25 %	427711202
77	NC_019680	AGGG	2	8	29777	29784	25 %	0 %	75 %	0 %	427711202
78	NC_019680	TGGC	2	8	30547	30554	0 %	25 %	50 %	25 %	427711202
79	NC_019680	CAAA	2	8	31087	31094	75 %	0 %	0 %	25 %	427711202
80	NC_019680	AATT	2	8	31627	31634	50 %	50 %	0 %	0 %	427711202
81	NC_019680	GGCA	2	8	32417	32424	25 %	0 %	50 %	25 %	427711203
82	NC_019680	AATT	2	8	32587	32594	50 %	50 %	0 %	0 %	427711204
83	NC_019680	CTGT	2	8	33044	33051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_019680	CACC	2	8	33394	33401	25 %	0 %	0 %	75 %	427711205
85	NC_019680	TCCG	2	8	33723	33730	0 %	25 %	25 %	50 %	427711205
86	NC_019680	GAGG	2	8	34016	34023	25 %	0 %	75 %	0 %	427711205
87	NC_019680	GAAC	2	8	34147	34154	50 %	0 %	25 %	25 %	427711206
88	NC_019680	AGAA	2	8	34181	34188	75 %	0 %	25 %	0 %	427711206
89	NC_019680	ATTC	2	8	34416	34423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_019680	CTGC	2	8	34791	34798	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_019680	AGGC	2	8	34960	34967	25 %	0 %	50 %	25 %	427711208
92	NC_019680	TCAC	2	8	35687	35694	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019680	GGCC	2	8	36429	36436	0 %	0 %	50 %	50 %	427711210
94	NC_019680	ATTT	2	8	37150	37157	25 %	75 %	0 %	0 %	427711210
95	NC_019680	ATGA	2	8	38064	38071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019680	TGCG	2	8	38176	38183	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_019680	CCCA	2	8	38531	38538	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_019680	GTGG	2	8	38729	38736	0 %	25 %	75 %	0 %	427711211
99	NC_019680	CCGG	2	8	38764	38771	0 %	0 %	50 %	50 %	427711211
100	NC_019680	GTTT	2	8	38807	38814	0 %	75 %	25 %	0 %	427711211
101	NC_019680	CCGG	2	8	39131	39138	0 %	0 %	50 %	50 %	427711211
102	NC_019680	ATAC	2	8	39656	39663	50 %	25 %	0 %	25 %	427711212
103	NC_019680	TTGA	2	8	39780	39787	25 %	50 %	25 %	0 %	427711212
104	NC_019680	GCCC	2	8	39846	39853	0 %	0 %	25 %	75 %	427711212
105	NC_019680	ATCC	2	8	40238	40245	25 %	25 %	0 %	50 %	427711212
106	NC_019680	AACT	2	8	40499	40506	50 %	25 %	0 %	25 %	427711212
107	NC_019680	TGGC	2	8	40781	40788	0 %	25 %	50 %	25 %	427711213
108	NC_019680	ACTC	2	8	41083	41090	25 %	25 %	0 %	50 %	427711213
109	NC_019680	TTGA	2	8	41137	41144	25 %	50 %	25 %	0 %	427711213
110	NC_019680	GGCT	2	8	41784	41791	0 %	25 %	50 %	25 %	427711213
111	NC_019680	AATG	2	8	41815	41822	50 %	25 %	25 %	0 %	427711213
112	NC_019680	AGGA	2	8	42279	42286	50 %	0 %	50 %	0 %	427711214
113	NC_019680	CTAG	2	8	42671	42678	25 %	25 %	25 %	25 %	427711215
114	NC_019680	TTGG	2	8	42790	42797	0 %	50 %	50 %	0 %	427711215
115	NC_019680	TGCC	2	8	43099	43106	0 %	25 %	25 %	50 %	427711215
116	NC_019680	GAGG	2	8	43729	43736	25 %	0 %	75 %	0 %	427711216
117	NC_019680	TTTC	2	8	43782	43789	0 %	75 %	0 %	25 %	427711216
118	NC_019680	CAAC	2	8	43873	43880	50 %	0 %	0 %	50 %	427711216
119	NC_019680	TCAG	2	8	43958	43965	25 %	25 %	25 %	25 %	427711216
120	NC_019680	ATAA	2	8	44480	44487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019680	ATTT	2	8	44863	44870	25 %	75 %	0 %	0 %	427711217
122	NC_019680	CACC	2	8	44953	44960	25 %	0 %	0 %	75 %	427711217
123	NC_019680	CCGG	2	8	45239	45246	0 %	0 %	50 %	50 %	427711217
124	NC_019680	TGGT	2	8	45992	45999	0 %	50 %	50 %	0 %	427711219
125	NC_019680	GGCG	2	8	46135	46142	0 %	0 %	75 %	25 %	427711219
126	NC_019680	GGCT	2	8	46402	46409	0 %	25 %	50 %	25 %	427711219
127	NC_019680	ACAA	2	8	49051	49058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019680	AGCG	2	8	49314	49321	25 %	0 %	50 %	25 %	427711224
129	NC_019680	TTCC	2	8	49479	49486	0 %	50 %	0 %	50 %	427711224
130	NC_019680	CCAT	2	8	49733	49740	25 %	25 %	0 %	50 %	427711224
131	NC_019680	CAAA	2	8	49944	49951	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019680	AACA	2	8	50147	50154	75 %	0 %	0 %	25 %	427711225
133	NC_019680	CATA	2	8	51186	51193	50 %	25 %	0 %	25 %	427711225
134	NC_019680	ATCA	2	8	51424	51431	50 %	25 %	0 %	25 %	427711225
135	NC_019680	AGTC	2	8	51549	51556	25 %	25 %	25 %	25 %	427711225
136	NC_019680	GCCC	2	8	51748	51755	0 %	0 %	25 %	75 %	427711226
137	NC_019680	GGCG	2	8	51854	51861	0 %	0 %	75 %	25 %	427711226
138	NC_019680	CCCA	2	8	52038	52045	25 %	0 %	0 %	75 %	427711226
139	NC_019680	TCGC	2	8	53040	53047	0 %	25 %	25 %	50 %	427711226
140	NC_019680	AAAC	2	8	53280	53287	75 %	0 %	0 %	25 %	427711226
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