MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 42019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019680	TGA	2	6	6	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019680	ATT	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019680	CTC	3	9	181	189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711180
4	NC_019680	GCC	2	6	191	196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711180
5	NC_019680	TGG	2	6	254	259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711180
6	NC_019680	ATG	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711180
7	NC_019680	TCC	3	9	408	416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711180
8	NC_019680	GGA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711180
9	NC_019680	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711180
10	NC_019680	AAG	2	6	848	853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711180
11	NC_019680	GGT	2	6	897	902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711180
12	NC_019680	ATT	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711180
13	NC_019680	CGG	2	6	1297	1302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711180
14	NC_019680	GAA	2	6	1381	1386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711180
15	NC_019680	GGC	2	6	1390	1395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711180
16	NC_019680	CCG	2	6	1514	1519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711180
17	NC_019680	CTA	4	12	1766	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019680	AAG	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019680	TAG	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019680	GTA	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019680	CTG	2	6	1966	1971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019680	TTG	2	6	2016	2021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019680	TCA	2	6	2482	2487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711181
24	NC_019680	ATC	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711181
25	NC_019680	GTG	2	6	2662	2667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711181
26	NC_019680	CAT	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711181
27	NC_019680	GGT	2	6	2793	2798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711181
28	NC_019680	CCG	2	6	2816	2821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711181
29	NC_019680	GAA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711181
30	NC_019680	TGA	2	6	3045	3050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019680	TCA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019680	TGG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019680	GAG	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019680	TAT	2	6	3286	3291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019680	ATT	2	6	3377	3382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711182
36	NC_019680	CCA	2	6	3450	3455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711182
37	NC_019680	GAA	2	6	3509	3514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711182
38	NC_019680	ATT	2	6	3515	3520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711182
39	NC_019680	GCG	3	9	3521	3529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711182
40	NC_019680	TGA	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711182
41	NC_019680	GCT	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711182
42	NC_019680	ATT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711182
43	NC_019680	TGG	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711182
44	NC_019680	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711182
45	NC_019680	GTG	2	6	4004	4009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711182
46	NC_019680	GCA	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711182
47	NC_019680	GCC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711182
48	NC_019680	GCC	2	6	4474	4479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711183
49	NC_019680	GGT	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711183
50	NC_019680	TCA	2	6	4733	4738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711183
51	NC_019680	ACT	2	6	4820	4825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711183
52	NC_019680	TAA	2	6	4894	4899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711183
53	NC_019680	CTG	2	6	4900	4905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711183
54	NC_019680	GAA	2	6	5007	5012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711183
55	NC_019680	TTC	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711183
56	NC_019680	TGG	2	6	5037	5042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711183
57	NC_019680	CAC	2	6	5059	5064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711183
58	NC_019680	GCT	2	6	5069	5074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711183
59	NC_019680	AGG	3	9	5120	5128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711183
60	NC_019680	TTC	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711183
61	NC_019680	GTT	2	6	5220	5225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711183
62	NC_019680	TGG	2	6	5253	5258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711183
63	NC_019680	GTT	2	6	5484	5489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711183
64	NC_019680	GGC	2	6	5524	5529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711183
65	NC_019680	ATA	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711183
66	NC_019680	CGG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711183
67	NC_019680	ATA	2	6	5876	5881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711183
68	NC_019680	CAC	2	6	5936	5941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_019680	CCA	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711184
70	NC_019680	ATC	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019680	ATG	2	6	6248	6253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019680	CTG	2	6	6314	6319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711185
73	NC_019680	CAA	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711185
74	NC_019680	GGC	2	6	6536	6541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711185
75	NC_019680	GGC	2	6	6623	6628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711185
76	NC_019680	TAA	2	6	6652	6657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711185
77	NC_019680	GCC	2	6	6699	6704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711185
78	NC_019680	TCT	2	6	6792	6797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711185
79	NC_019680	CTG	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711185
80	NC_019680	GAG	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711185
81	NC_019680	AGA	2	6	7092	7097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711185
82	NC_019680	TAA	2	6	7117	7122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711185
83	NC_019680	GAG	2	6	7171	7176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711185
84	NC_019680	ATC	3	9	7193	7201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711185
85	NC_019680	CAC	2	6	7464	7469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_019680	AGT	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711186
87	NC_019680	AGC	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711186
88	NC_019680	CCA	2	6	7656	7661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711186
89	NC_019680	GAA	2	6	7710	7715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711186
90	NC_019680	AAC	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019680	GAT	2	6	7881	7886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019680	GTA	2	6	8013	8018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711187
93	NC_019680	GAT	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711187
94	NC_019680	GCT	2	6	8120	8125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711187
95	NC_019680	TGA	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711187
96	NC_019680	ACG	2	6	8210	8215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711187
97	NC_019680	TCT	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019680	TTC	2	6	8471	8476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711188
99	NC_019680	TTC	2	6	8573	8578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711188
100	NC_019680	GGA	2	6	8725	8730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711188
101	NC_019680	GCT	2	6	8786	8791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711188
102	NC_019680	GAA	2	6	8836	8841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711189
103	NC_019680	GCT	2	6	8923	8928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711189
104	NC_019680	CAG	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711189
105	NC_019680	CCA	2	6	8980	8985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711189
106	NC_019680	CGG	2	6	9077	9082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711189
107	NC_019680	TGT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711189
108	NC_019680	GCA	2	6	9181	9186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711189
109	NC_019680	CAA	2	6	9263	9268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711189
110	NC_019680	CCA	2	6	9389	9394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711189
111	NC_019680	TTG	2	6	9416	9421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711189
112	NC_019680	GCC	2	6	9498	9503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711189
113	NC_019680	TAC	3	9	9510	9518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711189
114	NC_019680	ATT	2	6	9730	9735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019680	CTG	2	6	9764	9769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019680	GCT	2	6	9776	9781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711190
117	NC_019680	GAT	2	6	9796	9801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711190
118	NC_019680	CTG	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711190
119	NC_019680	CAT	2	6	9856	9861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711190
120	NC_019680	CAT	2	6	9886	9891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711190
121	NC_019680	CTC	2	6	9912	9917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711190
122	NC_019680	GGT	2	6	9991	9996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711190
123	NC_019680	TGC	2	6	10089	10094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711190
124	NC_019680	AGC	2	6	10198	10203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711190
125	NC_019680	CTT	2	6	10257	10262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711190
126	NC_019680	CCT	2	6	10296	10301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711190
127	NC_019680	CTA	2	6	10578	10583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019680	AGT	2	6	10639	10644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019680	AAT	2	6	10720	10725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019680	GAT	2	6	10829	10834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019680	TGC	2	6	10893	10898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711191
132	NC_019680	GAT	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711191
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259	NC_019680	TAA	2	6	22080	22085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711200
260	NC_019680	CGT	2	6	22093	22098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711200
261	NC_019680	GCT	2	6	22243	22248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711200
262	NC_019680	CGA	2	6	22355	22360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711200
263	NC_019680	TTA	2	6	22372	22377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711200
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382	NC_019680	CCA	2	6	31588	31593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711202
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500	NC_019680	TGA	2	6	41896	41901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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