MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019680	TGT	2	6	226527	226532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_019680	ATAGGT	2	12	226654	226665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711376
4003	NC_019680	TGA	2	6	226697	226702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711376
4004	NC_019680	CTAA	2	8	226874	226881	50 %	25 %	0 %	25 %	427711376
4005	NC_019680	AAC	2	6	226921	226926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711376
4006	NC_019680	AAAT	2	8	226993	227000	75 %	25 %	0 %	0 %	427711376
4007	NC_019680	CAGC	3	12	227057	227068	25 %	0 %	25 %	50 %	427711376
4008	NC_019680	GGA	2	6	227097	227102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711376
4009	NC_019680	GC	4	8	227128	227135	0 %	0 %	50 %	50 %	427711376
4010	NC_019680	TTGA	2	8	227173	227180	25 %	50 %	25 %	0 %	427711376
4011	NC_019680	T	6	6	227262	227267	0 %	100 %	0 %	0 %	427711376
4012	NC_019680	GCA	2	6	227303	227308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711376
4013	NC_019680	TAA	2	6	227353	227358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711376
4014	NC_019680	TGT	2	6	227423	227428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711376
4015	NC_019680	GGC	2	6	227535	227540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711376
4016	NC_019680	CAGC	2	8	227703	227710	25 %	0 %	25 %	50 %	427711376
4017	NC_019680	ATG	2	6	227750	227755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711376
4018	NC_019680	TTG	2	6	227788	227793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711376
4019	NC_019680	GGA	2	6	227797	227802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711376
4020	NC_019680	GGCA	2	8	227886	227893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_019680	AGC	2	6	227966	227971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_019680	T	7	7	228024	228030	0 %	100 %	0 %	0 %	427711377
4023	NC_019680	GTTG	2	8	228125	228132	0 %	50 %	50 %	0 %	427711377
4024	NC_019680	ATT	2	6	228134	228139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711377
4025	NC_019680	TGT	2	6	228265	228270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_019680	CTG	2	6	228298	228303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711378
4027	NC_019680	CT	3	6	228419	228424	0 %	50 %	0 %	50 %	427711378
4028	NC_019680	TGAT	2	8	228490	228497	25 %	50 %	25 %	0 %	427711378
4029	NC_019680	CGC	2	6	228587	228592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711378
4030	NC_019680	TGC	2	6	228593	228598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711378
4031	NC_019680	CTGGC	2	10	228640	228649	0 %	20 %	40 %	40 %	427711378
4032	NC_019680	CTC	2	6	228729	228734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711378
4033	NC_019680	GATTG	2	10	228762	228771	20 %	40 %	40 %	0 %	427711378
4034	NC_019680	GGC	2	6	228782	228787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711378
4035	NC_019680	T	6	6	228825	228830	0 %	100 %	0 %	0 %	427711378
4036	NC_019680	CCA	2	6	228841	228846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711378
4037	NC_019680	G	6	6	228944	228949	0 %	0 %	100 %	0 %	427711378
4038	NC_019680	GGCC	2	8	228962	228969	0 %	0 %	50 %	50 %	427711378
4039	NC_019680	GTG	2	6	229007	229012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711378
4040	NC_019680	ATT	2	6	229077	229082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711378
4041	NC_019680	ACC	2	6	229110	229115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711378
4042	NC_019680	CGAA	2	8	229124	229131	50 %	0 %	25 %	25 %	427711378
4043	NC_019680	CAA	2	6	229200	229205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711378
4044	NC_019680	TGAT	2	8	229288	229295	25 %	50 %	25 %	0 %	427711378
4045	NC_019680	TGC	2	6	229406	229411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711378
4046	NC_019680	CCCCG	2	10	229545	229554	0 %	0 %	20 %	80 %	427711378
4047	NC_019680	CAA	2	6	229599	229604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711378
4048	NC_019680	ATGG	2	8	229605	229612	25 %	25 %	50 %	0 %	427711378
4049	NC_019680	T	6	6	229614	229619	0 %	100 %	0 %	0 %	427711378
4050	NC_019680	CCG	2	6	229819	229824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711379
4051	NC_019680	GAG	2	6	229861	229866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711379
4052	NC_019680	ATC	2	6	229952	229957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711379
4053	NC_019680	TCC	2	6	230021	230026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711379
4054	NC_019680	AGT	2	6	230051	230056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711379
4055	NC_019680	ACCCA	2	10	230105	230114	40 %	0 %	0 %	60 %	427711379
4056	NC_019680	CCCG	2	8	230181	230188	0 %	0 %	25 %	75 %	427711379
4057	NC_019680	AGG	2	6	230267	230272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711379
4058	NC_019680	CAGAT	2	10	230330	230339	40 %	20 %	20 %	20 %	427711379
4059	NC_019680	CAA	2	6	230371	230376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711379
4060	NC_019680	CAC	2	6	230380	230385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711379
4061	NC_019680	GCC	2	6	230402	230407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711379
4062	NC_019680	GGGCC	2	10	230431	230440	0 %	0 %	60 %	40 %	427711379
4063	NC_019680	CAT	2	6	230567	230572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711380
4064	NC_019680	CAG	2	6	230615	230620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711380
4065	NC_019680	CCA	2	6	230626	230631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711380
4066	NC_019680	GCA	2	6	230662	230667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711380
4067	NC_019680	T	6	6	230707	230712	0 %	100 %	0 %	0 %	427711380
4068	NC_019680	TAA	2	6	230763	230768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_019680	TTTAG	2	10	230782	230791	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_019680	AAC	2	6	230859	230864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711381
4071	NC_019680	ATG	2	6	230915	230920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711381
4072	NC_019680	CAG	2	6	231038	231043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711381
4073	NC_019680	GAT	2	6	231057	231062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711381
4074	NC_019680	TGC	2	6	231105	231110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711381
4075	NC_019680	TGG	2	6	231138	231143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711381
4076	NC_019680	ATC	2	6	231221	231226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711381
4077	NC_019680	CT	3	6	231365	231370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_019680	C	6	6	231372	231377	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4079	NC_019680	AGTA	2	8	231396	231403	50 %	25 %	25 %	0 %	427711382
4080	NC_019680	CCA	2	6	231421	231426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711382
4081	NC_019680	ACC	2	6	231482	231487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711382
4082	NC_019680	G	6	6	231491	231496	0 %	0 %	100 %	0 %	427711382
4083	NC_019680	TCGG	2	8	231528	231535	0 %	25 %	50 %	25 %	427711382
4084	NC_019680	CCAGGC	2	12	231634	231645	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711382
4085	NC_019680	T	7	7	231699	231705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_019680	CTT	2	6	231717	231722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_019680	GCT	2	6	231781	231786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_019680	CCT	3	9	231890	231898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711383
4089	NC_019680	CTT	2	6	231953	231958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711383
4090	NC_019680	CTG	2	6	231978	231983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711383
4091	NC_019680	AAC	2	6	231993	231998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711383
4092	NC_019680	GCT	2	6	232003	232008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711383
4093	NC_019680	TTCC	2	8	232133	232140	0 %	50 %	0 %	50 %	427711383
4094	NC_019680	ATG	2	6	232168	232173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711383
4095	NC_019680	ATC	2	6	232182	232187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711383
4096	NC_019680	TGA	2	6	232189	232194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711383
4097	NC_019680	C	6	6	232230	232235	0 %	0 %	0 %	100 %	427711383
4098	NC_019680	C	8	8	232274	232281	0 %	0 %	0 %	100 %	427711383
4099	NC_019680	A	6	6	232378	232383	100 %	0 %	0 %	0 %	427711383
4100	NC_019680	GGGC	2	8	232467	232474	0 %	0 %	75 %	25 %	427711383
4101	NC_019680	CCA	2	6	232499	232504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711383
4102	NC_019680	CCG	2	6	232598	232603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711383
4103	NC_019680	CCT	2	6	232622	232627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711383
4104	NC_019680	G	6	6	232646	232651	0 %	0 %	100 %	0 %	427711383
4105	NC_019680	TGA	2	6	232748	232753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711383
4106	NC_019680	CCA	2	6	232763	232768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711383
4107	NC_019680	GCC	2	6	232776	232781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711383
4108	NC_019680	GGA	2	6	232817	232822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_019680	AG	3	6	232848	232853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_019680	CAT	2	6	232889	232894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711384
4111	NC_019680	CAAC	2	8	232923	232930	50 %	0 %	0 %	50 %	427711384
4112	NC_019680	GCC	2	6	232933	232938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711384
4113	NC_019680	TTC	2	6	232959	232964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711384
4114	NC_019680	AGCA	2	8	233003	233010	50 %	0 %	25 %	25 %	427711384
4115	NC_019680	GTT	2	6	233042	233047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711384
4116	NC_019680	CA	3	6	233048	233053	50 %	0 %	0 %	50 %	427711384
4117	NC_019680	T	6	6	233122	233127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_019680	ATG	2	6	233239	233244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_019680	TGC	2	6	233330	233335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711385
4120	NC_019680	CTGG	2	8	233377	233384	0 %	25 %	50 %	25 %	427711385
4121	NC_019680	TGC	2	6	233396	233401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711385
4122	NC_019680	TAC	2	6	233402	233407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711385
4123	NC_019680	CGG	2	6	233578	233583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711385
4124	NC_019680	TGA	2	6	233590	233595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711385
4125	NC_019680	CGG	2	6	233656	233661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711385
4126	NC_019680	CCG	2	6	233723	233728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711385
4127	NC_019680	ACA	2	6	233746	233751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711385
4128	NC_019680	CT	3	6	233775	233780	0 %	50 %	0 %	50 %	427711385
4129	NC_019680	ATC	2	6	233831	233836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711385
4130	NC_019680	GGC	2	6	234065	234070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711385
4131	NC_019680	GCTG	2	8	234363	234370	0 %	25 %	50 %	25 %	427711385
4132	NC_019680	C	6	6	234450	234455	0 %	0 %	0 %	100 %	427711386
4133	NC_019680	GAT	2	6	234490	234495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711386
4134	NC_019680	TG	3	6	234496	234501	0 %	50 %	50 %	0 %	427711386
4135	NC_019680	GTG	3	9	234499	234507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711386
4136	NC_019680	GCG	2	6	234508	234513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711386
4137	NC_019680	GGCTG	2	10	234522	234531	0 %	20 %	60 %	20 %	427711386
4138	NC_019680	TTGGCG	2	12	234568	234579	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	427711386
4139	NC_019680	GGCG	2	8	234585	234592	0 %	0 %	75 %	25 %	427711386
4140	NC_019680	TAT	2	6	234611	234616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711386
4141	NC_019680	GCT	2	6	234778	234783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711386
4142	NC_019680	TGGGGC	2	12	234816	234827	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	427711386
4143	NC_019680	TGG	2	6	234932	234937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711386
4144	NC_019680	GAT	2	6	234938	234943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711386
4145	NC_019680	T	6	6	234959	234964	0 %	100 %	0 %	0 %	427711387
4146	NC_019680	CCT	2	6	234986	234991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711387
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4148	NC_019680	CTG	2	6	235047	235052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711387
4149	NC_019680	GGCC	2	8	235058	235065	0 %	0 %	50 %	50 %	427711387
4150	NC_019680	TGG	2	6	235066	235071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711387
4151	NC_019680	TCGA	2	8	235087	235094	25 %	25 %	25 %	25 %	427711387
4152	NC_019680	A	6	6	235141	235146	100 %	0 %	0 %	0 %	427711387
4153	NC_019680	ATT	2	6	235209	235214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711387
4154	NC_019680	ACA	2	6	235233	235238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711387
4155	NC_019680	GCTGG	2	10	235297	235306	0 %	20 %	60 %	20 %	427711387
4156	NC_019680	TGT	2	6	235321	235326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711387
4157	NC_019680	TTC	2	6	235410	235415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711387
4158	NC_019680	G	6	6	235477	235482	0 %	0 %	100 %	0 %	427711387
4159	NC_019680	TGA	2	6	235534	235539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711387
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4161	NC_019680	GATTGG	2	12	235601	235612	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	427711387
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4163	NC_019680	GTT	2	6	235749	235754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711387
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4170	NC_019680	ATTT	2	8	236118	236125	25 %	75 %	0 %	0 %	427711387
4171	NC_019680	CCAGC	2	10	236197	236206	20 %	0 %	20 %	60 %	427711387
4172	NC_019680	TCTA	2	8	236489	236496	25 %	50 %	0 %	25 %	427711387
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4176	NC_019680	TCC	2	6	236620	236625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711387
4177	NC_019680	AAT	2	6	236655	236660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711387
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4179	NC_019680	ATC	2	6	236867	236872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711388
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4185	NC_019680	ACC	2	6	237202	237207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711388
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4197	NC_019680	GCT	2	6	237992	237997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711388
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4200	NC_019680	ACGATT	2	12	238145	238156	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	427711388
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4202	NC_019680	GGCT	2	8	238231	238238	0 %	25 %	50 %	25 %	427711388
4203	NC_019680	ATA	2	6	238257	238262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711388
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4205	NC_019680	ATC	2	6	238341	238346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711388
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4208	NC_019680	AGC	2	6	238672	238677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711389
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4210	NC_019680	GCCA	2	8	238757	238764	25 %	0 %	25 %	50 %	427711389
4211	NC_019680	GTC	2	6	238809	238814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711389
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4215	NC_019680	CTT	2	6	239242	239247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711390
4216	NC_019680	TGA	2	6	239361	239366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4217	NC_019680	TCTG	2	8	239385	239392	0 %	50 %	25 %	25 %	427711391
4218	NC_019680	TGT	2	6	239414	239419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711391
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4220	NC_019680	CTG	2	6	239499	239504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711391
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4227	NC_019680	A	6	6	239729	239734	100 %	0 %	0 %	0 %	427711391
4228	NC_019680	ATC	2	6	239744	239749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711391
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4236	NC_019680	CAAC	2	8	240632	240639	50 %	0 %	0 %	50 %	427711391
4237	NC_019680	GCA	2	6	240659	240664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711391
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4244	NC_019680	CTA	2	6	241092	241097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711392
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4246	NC_019680	CTT	2	6	241120	241125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711392
4247	NC_019680	TGG	2	6	241198	241203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711392
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4251	NC_019680	CAT	2	6	241414	241419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4374	NC_019680	AGAC	2	8	247922	247929	50 %	0 %	25 %	25 %	427711398
4375	NC_019680	G	6	6	248039	248044	0 %	0 %	100 %	0 %	427711398
4376	NC_019680	G	6	6	248129	248134	0 %	0 %	100 %	0 %	427711398
4377	NC_019680	TC	3	6	248394	248399	0 %	50 %	0 %	50 %	427711398
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4382	NC_019680	GAGCC	2	10	248817	248826	20 %	0 %	40 %	40 %	427711398
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4491	NC_019680	CAT	2	6	256524	256529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4492	NC_019680	G	6	6	256530	256535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4493	NC_019680	GTT	2	6	256586	256591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711405
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4495	NC_019680	CTA	2	6	256604	256609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711405
4496	NC_019680	GCC	2	6	256699	256704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711405
4497	NC_019680	TGA	2	6	256762	256767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711405
4498	NC_019680	CCGG	2	8	256789	256796	0 %	0 %	50 %	50 %	427711405
4499	NC_019680	CAA	2	6	256908	256913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711406
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