MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_019680	GGC	2	6	2363926	2363931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427713430
41503	NC_019680	GC	3	6	2363930	2363935	0 %	0 %	50 %	50 %	427713430
41504	NC_019680	TTG	2	6	2363981	2363986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427713430
41505	NC_019680	CTT	2	6	2364014	2364019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427713430
41506	NC_019680	CTT	2	6	2364027	2364032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427713430
41507	NC_019680	GAA	2	6	2364184	2364189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427713430
41508	NC_019680	TAT	2	6	2364285	2364290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427713430
41509	NC_019680	CTAT	2	8	2364305	2364312	25 %	50 %	0 %	25 %	427713430
41510	NC_019680	GTG	2	6	2364346	2364351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427713430
41511	NC_019680	CGG	2	6	2364355	2364360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427713430
41512	NC_019680	GCC	2	6	2364373	2364378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427713430
41513	NC_019680	TTGT	2	8	2364433	2364440	0 %	75 %	25 %	0 %	427713430
41514	NC_019680	AAT	2	6	2364535	2364540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427713430
41515	NC_019680	GAG	2	6	2364612	2364617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427713431
41516	NC_019680	GAA	2	6	2364730	2364735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427713431
41517	NC_019680	CGG	2	6	2364780	2364785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427713431
41518	NC_019680	TAA	2	6	2364815	2364820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427713431
41519	NC_019680	G	6	6	2364822	2364827	0 %	0 %	100 %	0 %	427713431
41520	NC_019680	CGG	2	6	2364842	2364847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427713431
41521	NC_019680	G	6	6	2364887	2364892	0 %	0 %	100 %	0 %	427713431
41522	NC_019680	A	6	6	2364897	2364902	100 %	0 %	0 %	0 %	427713431
41523	NC_019680	T	6	6	2364925	2364930	0 %	100 %	0 %	0 %	427713431
41524	NC_019680	TGT	2	6	2365105	2365110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427713431
41525	NC_019680	GTGA	2	8	2365205	2365212	25 %	25 %	50 %	0 %	427713431
41526	NC_019680	CGG	3	9	2365270	2365278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427713431
41527	NC_019680	TGC	2	6	2365395	2365400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427713431
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41529	NC_019680	TTGA	2	8	2365693	2365700	25 %	50 %	25 %	0 %	427713432
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41531	NC_019680	TGC	2	6	2365797	2365802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427713432
41532	NC_019680	AATC	2	8	2365902	2365909	50 %	25 %	0 %	25 %	427713432
41533	NC_019680	AATC	2	8	2365911	2365918	50 %	25 %	0 %	25 %	427713432
41534	NC_019680	GGC	2	6	2365972	2365977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427713432
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41538	NC_019680	TTG	2	6	2366231	2366236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427713432
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41540	NC_019680	TCA	2	6	2366265	2366270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427713432
41541	NC_019680	CCCA	2	8	2366299	2366306	25 %	0 %	0 %	75 %	427713432
41542	NC_019680	GCT	2	6	2366354	2366359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427713432
41543	NC_019680	ATC	2	6	2366423	2366428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427713432
41544	NC_019680	CGG	2	6	2366451	2366456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427713432
41545	NC_019680	ATCA	2	8	2366464	2366471	50 %	25 %	0 %	25 %	427713432
41546	NC_019680	T	6	6	2366484	2366489	0 %	100 %	0 %	0 %	427713432
41547	NC_019680	TGT	2	6	2366496	2366501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427713432
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41549	NC_019680	GCC	2	6	2366652	2366657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427713432
41550	NC_019680	CAT	2	6	2366710	2366715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427713432
41551	NC_019680	TCGC	2	8	2366729	2366736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41552	NC_019680	TAAT	2	8	2366811	2366818	50 %	50 %	0 %	0 %	427713433
41553	NC_019680	CACC	2	8	2366924	2366931	25 %	0 %	0 %	75 %	427713433
41554	NC_019680	ATC	2	6	2366937	2366942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427713433
41555	NC_019680	CAT	2	6	2366964	2366969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427713433
41556	NC_019680	TTTC	2	8	2366972	2366979	0 %	75 %	0 %	25 %	427713433
41557	NC_019680	CAA	2	6	2366999	2367004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427713433
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41566	NC_019680	CCTGG	2	10	2367422	2367431	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41567	NC_019680	T	7	7	2367434	2367440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41568	NC_019680	GCCCAG	2	12	2367546	2367557	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427713434
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41584	NC_019680	CAA	2	6	2368913	2368918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427713435
41585	NC_019680	ACGCCA	2	12	2369029	2369040	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427713435
41586	NC_019680	AATA	2	8	2369049	2369056	75 %	25 %	0 %	0 %	427713435
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41589	NC_019680	GAC	2	6	2369147	2369152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427713435
41590	NC_019680	GTT	2	6	2369215	2369220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41591	NC_019680	GGT	2	6	2369336	2369341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427713436
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41594	NC_019680	G	6	6	2369538	2369543	0 %	0 %	100 %	0 %	427713436
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41602	NC_019680	GATG	2	8	2369869	2369876	25 %	25 %	50 %	0 %	427713436
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41605	NC_019680	TGG	3	9	2370036	2370044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427713436
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41607	NC_019680	T	6	6	2370080	2370085	0 %	100 %	0 %	0 %	427713436
41608	NC_019680	CAG	2	6	2370104	2370109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427713436
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41611	NC_019680	TG	3	6	2370183	2370188	0 %	50 %	50 %	0 %	427713436
41612	NC_019680	CCCAG	2	10	2370238	2370247	20 %	0 %	20 %	60 %	427713436
41613	NC_019680	A	6	6	2370333	2370338	100 %	0 %	0 %	0 %	427713436
41614	NC_019680	TGAAC	2	10	2370340	2370349	40 %	20 %	20 %	20 %	427713436
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41618	NC_019680	GAT	2	6	2370553	2370558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427713437
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41731	NC_019680	A	8	8	2376588	2376595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41732	NC_019680	GCAG	2	8	2376596	2376603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41733	NC_019680	AAC	2	6	2376670	2376675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41734	NC_019680	TCAA	2	8	2376741	2376748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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