MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019680	GCC	2	6	197376	197381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711349
3502	NC_019680	CTT	2	6	197482	197487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711349
3503	NC_019680	TGG	2	6	197499	197504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711349
3504	NC_019680	TTA	2	6	197609	197614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_019680	ATG	2	6	197617	197622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_019680	GTA	2	6	197722	197727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3507	NC_019680	TGG	2	6	197747	197752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711350
3508	NC_019680	ATG	2	6	197822	197827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3509	NC_019680	GTT	2	6	197899	197904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711350
3510	NC_019680	TGA	2	6	197982	197987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3511	NC_019680	TAT	2	6	198007	198012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711350
3512	NC_019680	ATC	2	6	198079	198084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711350
3513	NC_019680	TATG	2	8	198105	198112	25 %	50 %	25 %	0 %	427711350
3514	NC_019680	GGT	2	6	198113	198118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711350
3515	NC_019680	AGTT	2	8	198185	198192	25 %	50 %	25 %	0 %	427711350
3516	NC_019680	AAG	2	6	198248	198253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711350
3517	NC_019680	TGGC	2	8	198340	198347	0 %	25 %	50 %	25 %	427711350
3518	NC_019680	CCTTT	2	10	198380	198389	0 %	60 %	0 %	40 %	427711350
3519	NC_019680	TGA	2	6	198431	198436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3520	NC_019680	TTTG	2	8	198610	198617	0 %	75 %	25 %	0 %	427711350
3521	NC_019680	TGA	2	6	198621	198626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711350
3522	NC_019680	ATT	2	6	198649	198654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711350
3523	NC_019680	CCT	2	6	198657	198662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711350
3524	NC_019680	TCC	2	6	198680	198685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711350
3525	NC_019680	TGG	2	6	198686	198691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711350
3526	NC_019680	CTC	2	6	198719	198724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711350
3527	NC_019680	G	8	8	198797	198804	0 %	0 %	100 %	0 %	427711350
3528	NC_019680	GGCCTG	2	12	198946	198957	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711350
3529	NC_019680	ACT	2	6	199010	199015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711350
3530	NC_019680	C	6	6	199124	199129	0 %	0 %	0 %	100 %	427711350
3531	NC_019680	GTTT	2	8	199137	199144	0 %	75 %	25 %	0 %	427711350
3532	NC_019680	CAAC	2	8	199164	199171	50 %	0 %	0 %	50 %	427711350
3533	NC_019680	T	7	7	199211	199217	0 %	100 %	0 %	0 %	427711350
3534	NC_019680	GAA	2	6	199252	199257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711350
3535	NC_019680	T	7	7	199402	199408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_019680	ACA	2	6	199501	199506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711351
3537	NC_019680	GTT	2	6	199521	199526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711351
3538	NC_019680	CGGC	2	8	199533	199540	0 %	0 %	50 %	50 %	427711351
3539	NC_019680	A	6	6	199546	199551	100 %	0 %	0 %	0 %	427711351
3540	NC_019680	CCA	2	6	199639	199644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711351
3541	NC_019680	TAT	2	6	199712	199717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711351
3542	NC_019680	GTT	2	6	199749	199754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711351
3543	NC_019680	TGAC	2	8	199810	199817	25 %	25 %	25 %	25 %	427711351
3544	NC_019680	AAC	2	6	199821	199826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711351
3545	NC_019680	GCC	2	6	199857	199862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711351
3546	NC_019680	GTT	2	6	199893	199898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711351
3547	NC_019680	TGAT	2	8	199908	199915	25 %	50 %	25 %	0 %	427711351
3548	NC_019680	CATA	2	8	199925	199932	50 %	25 %	0 %	25 %	427711351
3549	NC_019680	CCAACT	2	12	200023	200034	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	427711351
3550	NC_019680	TGA	2	6	200052	200057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711351
3551	NC_019680	TGA	2	6	200099	200104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711351
3552	NC_019680	CAT	2	6	200301	200306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_019680	TGA	2	6	200321	200326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_019680	ATGG	2	8	200385	200392	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_019680	TC	3	6	200421	200426	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3556	NC_019680	ATCT	2	8	200446	200453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3557	NC_019680	GC	3	6	200660	200665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_019680	A	6	6	200666	200671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_019680	CTGGG	2	10	200835	200844	0 %	20 %	60 %	20 %	427711352
3560	NC_019680	TGA	2	6	200909	200914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711352
3561	NC_019680	GGC	2	6	201049	201054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711352
3562	NC_019680	TGGG	2	8	201083	201090	0 %	25 %	75 %	0 %	427711352
3563	NC_019680	CTT	2	6	201252	201257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711352
3564	NC_019680	CCG	2	6	201360	201365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711352
3565	NC_019680	AGTC	2	8	201381	201388	25 %	25 %	25 %	25 %	427711352
3566	NC_019680	CTC	2	6	201444	201449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711352
3567	NC_019680	CTG	2	6	201456	201461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711352
3568	NC_019680	GAC	2	6	201466	201471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711352
3569	NC_019680	TGC	2	6	201472	201477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711352
3570	NC_019680	GCA	2	6	201595	201600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_019680	TAG	2	6	201608	201613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_019680	ATT	2	6	201648	201653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_019680	ATT	2	6	201734	201739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711353
3574	NC_019680	GAC	2	6	201773	201778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711353
3575	NC_019680	ATC	2	6	201879	201884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711353
3576	NC_019680	G	6	6	201980	201985	0 %	0 %	100 %	0 %	427711353
3577	NC_019680	GTC	2	6	202023	202028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711353
3578	NC_019680	CAAA	2	8	202102	202109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_019680	CCA	2	6	202173	202178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_019680	T	6	6	202215	202220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_019680	ATTC	2	8	202236	202243	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3582	NC_019680	GAC	2	6	202267	202272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3583	NC_019680	TGA	2	6	202371	202376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711354
3584	NC_019680	TGC	2	6	202423	202428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3585	NC_019680	TCC	2	6	202429	202434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711354
3586	NC_019680	AAC	2	6	202487	202492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711354
3587	NC_019680	ATC	2	6	202493	202498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3588	NC_019680	CTT	2	6	202515	202520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3589	NC_019680	GCT	2	6	202559	202564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3590	NC_019680	GGT	2	6	202589	202594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711354
3591	NC_019680	CTT	2	6	202618	202623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3592	NC_019680	TCT	2	6	202632	202637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3593	NC_019680	TCT	2	6	202734	202739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3594	NC_019680	TTCT	2	8	202762	202769	0 %	75 %	0 %	25 %	427711354
3595	NC_019680	CCA	2	6	202855	202860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711354
3596	NC_019680	TGG	2	6	202882	202887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711354
3597	NC_019680	ACTGAA	2	12	202946	202957	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427711354
3598	NC_019680	AAG	3	9	202986	202994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711354
3599	NC_019680	ACA	2	6	203001	203006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711354
3600	NC_019680	TGC	2	6	203011	203016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711354
3601	NC_019680	CAA	2	6	203059	203064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711354
3602	NC_019680	CTT	3	9	203080	203088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711354
3603	NC_019680	GCCTG	2	10	203093	203102	0 %	20 %	40 %	40 %	427711354
3604	NC_019680	CTTCAA	2	12	203161	203172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3605	NC_019680	TGT	2	6	203179	203184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711354
3606	NC_019680	TCA	2	6	203202	203207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3607	NC_019680	ATC	2	6	203222	203227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711354
3608	NC_019680	CT	4	8	203355	203362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_019680	CAT	2	6	203392	203397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_019680	G	6	6	203398	203403	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_019680	TCA	2	6	203421	203426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_019680	TTG	2	6	203504	203509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_019680	TTG	2	6	203526	203531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_019680	CAT	2	6	203548	203553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_019680	TCA	2	6	203571	203576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711355
3616	NC_019680	AAAT	2	8	203591	203598	75 %	25 %	0 %	0 %	427711355
3617	NC_019680	TAG	2	6	203630	203635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711355
3618	NC_019680	TCTGTA	2	12	203691	203702	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427711355
3619	NC_019680	CAA	2	6	203710	203715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711355
3620	NC_019680	TGAACA	2	12	203718	203729	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427711355
3621	NC_019680	TCA	2	6	203772	203777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711355
3622	NC_019680	CAATC	2	10	203783	203792	40 %	20 %	0 %	40 %	427711355
3623	NC_019680	TCT	3	9	203890	203898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711355
3624	NC_019680	GCA	2	6	203977	203982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711355
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3997	NC_019680	CGC	2	6	226183	226188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711375
3998	NC_019680	AGT	2	6	226200	226205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711375
3999	NC_019680	CT	3	6	226344	226349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4000	NC_019680	TTG	2	6	226462	226467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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