MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_019680	T	6	6	167416	167421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_019680	TAT	2	6	167425	167430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_019680	CAA	2	6	167509	167514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711331
3004	NC_019680	TTG	2	6	167551	167556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711331
3005	NC_019680	C	6	6	167567	167572	0 %	0 %	0 %	100 %	427711331
3006	NC_019680	CGG	2	6	167630	167635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711331
3007	NC_019680	TCCTG	2	10	167640	167649	0 %	40 %	20 %	40 %	427711331
3008	NC_019680	TGT	2	6	167672	167677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711331
3009	NC_019680	CA	3	6	167681	167686	50 %	0 %	0 %	50 %	427711331
3010	NC_019680	GCA	2	6	167703	167708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711331
3011	NC_019680	CTT	2	6	167719	167724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711331
3012	NC_019680	CGGG	2	8	167798	167805	0 %	0 %	75 %	25 %	427711331
3013	NC_019680	AAT	2	6	167828	167833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711331
3014	NC_019680	CCGCTT	2	12	167854	167865	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	427711331
3015	NC_019680	G	6	6	167875	167880	0 %	0 %	100 %	0 %	427711331
3016	NC_019680	GACT	2	8	167902	167909	25 %	25 %	25 %	25 %	427711331
3017	NC_019680	ACGG	2	8	167948	167955	25 %	0 %	50 %	25 %	427711331
3018	NC_019680	GCT	2	6	168009	168014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711331
3019	NC_019680	GGC	2	6	168023	168028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711331
3020	NC_019680	ACC	2	6	168086	168091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711331
3021	NC_019680	GGA	2	6	168111	168116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711331
3022	NC_019680	TCA	2	6	168127	168132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711331
3023	NC_019680	ATC	2	6	168157	168162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_019680	GGCAT	2	10	168218	168227	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_019680	AC	3	6	168356	168361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_019680	CAATTA	2	12	168373	168384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3027	NC_019680	CTTT	2	8	168422	168429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_019680	GTC	2	6	168494	168499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711332
3029	NC_019680	TCC	2	6	168539	168544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711332
3030	NC_019680	ATG	2	6	168551	168556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711332
3031	NC_019680	GCC	2	6	168619	168624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711332
3032	NC_019680	GCC	2	6	168914	168919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711332
3033	NC_019680	GGA	2	6	168960	168965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711332
3034	NC_019680	GGA	2	6	169102	169107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711332
3035	NC_019680	GCC	2	6	169114	169119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711332
3036	NC_019680	ACA	2	6	169171	169176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711332
3037	NC_019680	TGA	2	6	169200	169205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711332
3038	NC_019680	GTGA	2	8	169267	169274	25 %	25 %	50 %	0 %	427711332
3039	NC_019680	TGA	2	6	169308	169313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711332
3040	NC_019680	ATTGAT	2	12	169366	169377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	427711332
3041	NC_019680	CGG	2	6	169379	169384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711332
3042	NC_019680	ACC	2	6	169476	169481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711332
3043	NC_019680	AAG	2	6	169580	169585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711332
3044	NC_019680	T	6	6	169621	169626	0 %	100 %	0 %	0 %	427711332
3045	NC_019680	ACC	2	6	169627	169632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711332
3046	NC_019680	GCG	2	6	169657	169662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711332
3047	NC_019680	CGC	2	6	169734	169739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711332
3048	NC_019680	GTG	2	6	169787	169792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711332
3049	NC_019680	ATT	2	6	169864	169869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711332
3050	NC_019680	AAC	2	6	169870	169875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711332
3051	NC_019680	TGG	2	6	170111	170116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711332
3052	NC_019680	GAT	2	6	170139	170144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711332
3053	NC_019680	AGC	2	6	170175	170180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711332
3054	NC_019680	TCA	2	6	170226	170231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711332
3055	NC_019680	GTA	2	6	170249	170254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711332
3056	NC_019680	TAA	3	9	170260	170268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711332
3057	NC_019680	TAA	2	6	170280	170285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_019680	T	6	6	170325	170330	0 %	100 %	0 %	0 %	427711333
3059	NC_019680	AAG	2	6	170434	170439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711333
3060	NC_019680	ACAA	2	8	170445	170452	75 %	0 %	0 %	25 %	427711333
3061	NC_019680	AT	3	6	170466	170471	50 %	50 %	0 %	0 %	427711333
3062	NC_019680	ATCCA	2	10	170524	170533	40 %	20 %	0 %	40 %	427711333
3063	NC_019680	CCAA	2	8	170546	170553	50 %	0 %	0 %	50 %	427711333
3064	NC_019680	GAT	2	6	170564	170569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711333
3065	NC_019680	AGC	2	6	170576	170581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711333
3066	NC_019680	C	8	8	170630	170637	0 %	0 %	0 %	100 %	427711333
3067	NC_019680	AAAT	2	8	170662	170669	75 %	25 %	0 %	0 %	427711333
3068	NC_019680	CAT	2	6	170687	170692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711333
3069	NC_019680	T	7	7	170728	170734	0 %	100 %	0 %	0 %	427711333
3070	NC_019680	ACT	2	6	170760	170765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711333
3071	NC_019680	CCA	2	6	170771	170776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711333
3072	NC_019680	TC	3	6	170877	170882	0 %	50 %	0 %	50 %	427711333
3073	NC_019680	GGC	2	6	170894	170899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711333
3074	NC_019680	ACC	2	6	170920	170925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711333
3075	NC_019680	GCA	2	6	171004	171009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711333
3076	NC_019680	CAG	2	6	171011	171016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711333
3077	NC_019680	AGA	2	6	171047	171052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711333
3078	NC_019680	ATA	2	6	171134	171139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711333
3079	NC_019680	GAA	2	6	171168	171173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711333
3080	NC_019680	AGG	2	6	171195	171200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711333
3081	NC_019680	A	7	7	171201	171207	100 %	0 %	0 %	0 %	427711333
3082	NC_019680	ATAAA	2	10	171232	171241	80 %	20 %	0 %	0 %	427711333
3083	NC_019680	ATT	2	6	171242	171247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711333
3084	NC_019680	AAT	2	6	171375	171380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_019680	GA	3	6	171414	171419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_019680	ATT	2	6	171440	171445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_019680	T	6	6	171444	171449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_019680	TC	3	6	171498	171503	0 %	50 %	0 %	50 %	427711334
3089	NC_019680	ACA	2	6	171627	171632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711334
3090	NC_019680	CAGGT	2	10	171661	171670	20 %	20 %	40 %	20 %	427711334
3091	NC_019680	TTTA	2	8	171734	171741	25 %	75 %	0 %	0 %	427711334
3092	NC_019680	AG	3	6	171750	171755	50 %	0 %	50 %	0 %	427711334
3093	NC_019680	T	6	6	171879	171884	0 %	100 %	0 %	0 %	427711334
3094	NC_019680	CAAA	2	8	171891	171898	75 %	0 %	0 %	25 %	427711334
3095	NC_019680	CAGTTT	2	12	171969	171980	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427711334
3096	NC_019680	AGA	2	6	172103	172108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711334
3097	NC_019680	TAA	2	6	172112	172117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711334
3098	NC_019680	AGCA	2	8	172120	172127	50 %	0 %	25 %	25 %	427711334
3099	NC_019680	TAC	2	6	172187	172192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_019680	GAT	2	6	172209	172214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_019680	GCTTG	2	10	172318	172327	0 %	40 %	40 %	20 %	427711335
3102	NC_019680	CAG	2	6	172343	172348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711335
3103	NC_019680	ATT	2	6	172420	172425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711335
3104	NC_019680	CCTGG	2	10	172428	172437	0 %	20 %	40 %	40 %	427711335
3105	NC_019680	T	8	8	172478	172485	0 %	100 %	0 %	0 %	427711335
3106	NC_019680	GCC	2	6	172544	172549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711335
3107	NC_019680	T	7	7	172564	172570	0 %	100 %	0 %	0 %	427711335
3108	NC_019680	CTG	2	6	172591	172596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711335
3109	NC_019680	GGC	2	6	172668	172673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711335
3110	NC_019680	ATT	2	6	172675	172680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711335
3111	NC_019680	GGC	2	6	172694	172699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711335
3112	NC_019680	A	7	7	172723	172729	100 %	0 %	0 %	0 %	427711335
3113	NC_019680	GTG	2	6	172846	172851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711335
3114	NC_019680	CTG	2	6	172913	172918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711335
3115	NC_019680	GCCTG	2	10	172919	172928	0 %	20 %	40 %	40 %	427711335
3116	NC_019680	TCA	2	6	172974	172979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_019680	ATG	2	6	173075	173080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711336
3118	NC_019680	T	6	6	173085	173090	0 %	100 %	0 %	0 %	427711336
3119	NC_019680	A	7	7	173168	173174	100 %	0 %	0 %	0 %	427711336
3120	NC_019680	AGT	2	6	173290	173295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711336
3121	NC_019680	ATT	2	6	173336	173341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711336
3122	NC_019680	ATG	2	6	173381	173386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711336
3123	NC_019680	AAC	2	6	173480	173485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711336
3124	NC_019680	GAT	2	6	173779	173784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711336
3125	NC_019680	TCAT	2	8	173791	173798	25 %	50 %	0 %	25 %	427711336
3126	NC_019680	ATC	2	6	173868	173873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711336
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3128	NC_019680	CAT	2	6	173955	173960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711336
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3145	NC_019680	CGG	2	6	174923	174928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711336
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3243	NC_019680	ACCG	2	8	181151	181158	25 %	0 %	25 %	50 %	427711340
3244	NC_019680	T	6	6	181169	181174	0 %	100 %	0 %	0 %	427711340
3245	NC_019680	AAG	2	6	181272	181277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711340
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3247	NC_019680	GCG	2	6	181435	181440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711340
3248	NC_019680	TAA	2	6	181528	181533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711340
3249	NC_019680	TAA	2	6	181618	181623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711340
3250	NC_019680	ATC	2	6	181644	181649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3251	NC_019680	TAA	2	6	181652	181657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_019680	A	6	6	181656	181661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_019680	ACT	2	6	181678	181683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3256	NC_019680	CAT	2	6	181804	181809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3356	NC_019680	CTAC	2	8	188409	188416	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3359	NC_019680	CCT	2	6	188629	188634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3360	NC_019680	A	6	6	188635	188640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_019680	GC	3	6	188649	188654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3371	NC_019680	ATA	2	6	189483	189488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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