MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019680	G	6	6	139898	139903	0 %	0 %	100 %	0 %	427711303
2502	NC_019680	G	7	7	139913	139919	0 %	0 %	100 %	0 %	427711303
2503	NC_019680	CAT	2	6	139927	139932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711303
2504	NC_019680	GCCGG	2	10	139955	139964	0 %	0 %	60 %	40 %	427711303
2505	NC_019680	GCC	2	6	139972	139977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711303
2506	NC_019680	TG	3	6	140020	140025	0 %	50 %	50 %	0 %	427711303
2507	NC_019680	GAT	2	6	140065	140070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711303
2508	NC_019680	CTC	2	6	140160	140165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711303
2509	NC_019680	TCCAT	2	10	140171	140180	20 %	40 %	0 %	40 %	427711303
2510	NC_019680	CGG	2	6	140201	140206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711303
2511	NC_019680	TG	3	6	140221	140226	0 %	50 %	50 %	0 %	427711303
2512	NC_019680	CGG	2	6	140237	140242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711303
2513	NC_019680	AGTC	2	8	140276	140283	25 %	25 %	25 %	25 %	427711303
2514	NC_019680	GCA	2	6	140325	140330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711303
2515	NC_019680	CAGGC	2	10	140359	140368	20 %	0 %	40 %	40 %	427711303
2516	NC_019680	AGC	2	6	140418	140423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_019680	GGGA	2	8	140433	140440	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_019680	AGT	2	6	140750	140755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711304
2519	NC_019680	AGCG	2	8	140801	140808	25 %	0 %	50 %	25 %	427711304
2520	NC_019680	GGT	2	6	140917	140922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711304
2521	NC_019680	TCAA	2	8	141003	141010	50 %	25 %	0 %	25 %	427711304
2522	NC_019680	GAT	2	6	141059	141064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711304
2523	NC_019680	C	6	6	141122	141127	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2524	NC_019680	ATTG	2	8	141143	141150	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_019680	GTT	2	6	141215	141220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_019680	GTG	2	6	141226	141231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711305
2527	NC_019680	GC	3	6	141281	141286	0 %	0 %	50 %	50 %	427711305
2528	NC_019680	TGGGCC	2	12	141315	141326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711305
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2531	NC_019680	GGTTG	2	10	141422	141431	0 %	40 %	60 %	0 %	427711305
2532	NC_019680	CTTGC	2	10	141476	141485	0 %	40 %	20 %	40 %	427711305
2533	NC_019680	T	7	7	141490	141496	0 %	100 %	0 %	0 %	427711305
2534	NC_019680	CCTGG	2	10	141530	141539	0 %	20 %	40 %	40 %	427711305
2535	NC_019680	TCAG	2	8	141645	141652	25 %	25 %	25 %	25 %	427711305
2536	NC_019680	CTG	2	6	141710	141715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711305
2537	NC_019680	CAC	2	6	141742	141747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711305
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2539	NC_019680	TGGG	2	8	141810	141817	0 %	25 %	75 %	0 %	427711305
2540	NC_019680	CGG	3	9	141875	141883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711305
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2543	NC_019680	TGT	3	9	142089	142097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711305
2544	NC_019680	AGCCGT	2	12	142114	142125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427711305
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2547	NC_019680	GGC	2	6	142324	142329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711305
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2549	NC_019680	AAGC	2	8	142405	142412	50 %	0 %	25 %	25 %	427711305
2550	NC_019680	TTA	2	6	142522	142527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_019680	TTA	2	6	142587	142592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_019680	GAT	2	6	142619	142624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_019680	AATA	2	8	142687	142694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_019680	AAC	2	6	142735	142740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2555	NC_019680	AGATTA	2	12	142745	142756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_019680	A	6	6	142769	142774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_019680	AAT	2	6	142812	142817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_019680	GATTTT	2	12	142904	142915	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_019680	GAT	2	6	142979	142984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711306
2560	NC_019680	TTG	2	6	143004	143009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711306
2561	NC_019680	ATC	2	6	143085	143090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711306
2562	NC_019680	ATG	2	6	143114	143119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711306
2563	NC_019680	TTA	2	6	143144	143149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711306
2564	NC_019680	GAT	2	6	143249	143254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711306
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2596	NC_019680	TCA	2	6	145248	145253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711307
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2598	NC_019680	TCAT	2	8	145376	145383	25 %	50 %	0 %	25 %	427711307
2599	NC_019680	TAA	2	6	145467	145472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711307
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2604	NC_019680	A	6	6	145607	145612	100 %	0 %	0 %	0 %	427711307
2605	NC_019680	TGAT	2	8	145631	145638	25 %	50 %	25 %	0 %	427711307
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2608	NC_019680	ATG	2	6	145790	145795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711307
2609	NC_019680	CCG	3	9	145881	145889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711307
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2612	NC_019680	TGA	2	6	145997	146002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711307
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2614	NC_019680	TCCC	2	8	146106	146113	0 %	25 %	0 %	75 %	427711307
2615	NC_019680	AATC	2	8	146143	146150	50 %	25 %	0 %	25 %	427711307
2616	NC_019680	A	6	6	146189	146194	100 %	0 %	0 %	0 %	427711307
2617	NC_019680	TTGATG	2	12	146195	146206	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	427711307
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2619	NC_019680	CGC	2	6	146284	146289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711307
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2622	NC_019680	A	8	8	146456	146463	100 %	0 %	0 %	0 %	427711307
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2624	NC_019680	GAT	2	6	146512	146517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711307
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2867	NC_019680	TCTA	3	12	159202	159213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2868	NC_019680	GGGC	2	8	159216	159223	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2869	NC_019680	AATA	2	8	159380	159387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2870	NC_019680	TGC	2	6	159587	159592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711322
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2999	NC_019680	TTC	2	6	167331	167336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711330
3000	NC_019680	TGA	2	6	167386	167391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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