MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

< Previous12345678910111213...129130Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_019680	AT	3	6	109419	109424	50 %	50 %	0 %	0 %	427711267
2003	NC_019680	TGA	2	6	109430	109435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711267
2004	NC_019680	CTG	2	6	109495	109500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711267
2005	NC_019680	GA	3	6	109541	109546	50 %	0 %	50 %	0 %	427711267
2006	NC_019680	GAT	2	6	109613	109618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711267
2007	NC_019680	AATT	2	8	109699	109706	50 %	50 %	0 %	0 %	427711267
2008	NC_019680	AGC	2	6	109714	109719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711267
2009	NC_019680	TTTC	2	8	109720	109727	0 %	75 %	0 %	25 %	427711267
2010	NC_019680	TCT	2	6	109731	109736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711267
2011	NC_019680	AGTTT	2	10	109755	109764	20 %	60 %	20 %	0 %	427711267
2012	NC_019680	GTA	2	6	109772	109777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711267
2013	NC_019680	GAA	2	6	109801	109806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711268
2014	NC_019680	ATG	2	6	109821	109826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711268
2015	NC_019680	TCC	2	6	109881	109886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711268
2016	NC_019680	GTCT	2	8	109922	109929	0 %	50 %	25 %	25 %	427711268
2017	NC_019680	AAC	2	6	109954	109959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711268
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2021	NC_019680	ATT	2	6	110093	110098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711268
2022	NC_019680	GGTG	2	8	110110	110117	0 %	25 %	75 %	0 %	427711268
2023	NC_019680	GAA	2	6	110180	110185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711268
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2025	NC_019680	GGAA	2	8	110323	110330	50 %	0 %	50 %	0 %	427711268
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2029	NC_019680	ACT	2	6	110606	110611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711269
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2039	NC_019680	CTG	2	6	111084	111089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711269
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2042	NC_019680	T	6	6	111199	111204	0 %	100 %	0 %	0 %	427711269
2043	NC_019680	AAT	2	6	111208	111213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711269
2044	NC_019680	GCCAG	2	10	111218	111227	20 %	0 %	40 %	40 %	427711269
2045	NC_019680	CAA	2	6	111252	111257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711269
2046	NC_019680	TCT	2	6	111362	111367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_019680	TGA	2	6	111633	111638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711270
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2057	NC_019680	TGGC	2	8	112412	112419	0 %	25 %	50 %	25 %	427711270
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2092	NC_019680	C	6	6	114838	114843	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2093	NC_019680	T	6	6	114869	114874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2099	NC_019680	CT	4	8	115224	115231	0 %	50 %	0 %	50 %	427711275
2100	NC_019680	GTCA	2	8	115244	115251	25 %	25 %	25 %	25 %	427711275
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2103	NC_019680	TGAC	2	8	115437	115444	25 %	25 %	25 %	25 %	427711276
2104	NC_019680	CCAG	2	8	115471	115478	25 %	0 %	25 %	50 %	427711276
2105	NC_019680	ACC	2	6	115547	115552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711276
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2114	NC_019680	TGG	2	6	116115	116120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711276
2115	NC_019680	TATT	2	8	116163	116170	25 %	75 %	0 %	0 %	427711276
2116	NC_019680	T	6	6	116215	116220	0 %	100 %	0 %	0 %	427711276
2117	NC_019680	CGGGTG	2	12	116276	116287	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	427711276
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2119	NC_019680	GAT	2	6	116398	116403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711276
2120	NC_019680	GGGCG	2	10	116417	116426	0 %	0 %	80 %	20 %	427711276
2121	NC_019680	GA	3	6	116667	116672	50 %	0 %	50 %	0 %	427711277
2122	NC_019680	AGT	2	6	116781	116786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711277
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2124	NC_019680	TGA	2	6	116901	116906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711277
2125	NC_019680	GAC	2	6	116910	116915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711277
2126	NC_019680	CAG	2	6	116972	116977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711277
2127	NC_019680	TCT	3	9	117060	117068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711278
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2129	NC_019680	TTG	2	6	117362	117367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711279
2130	NC_019680	GTC	2	6	117402	117407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711279
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2133	NC_019680	GCA	2	6	117614	117619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711280
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2152	NC_019680	TCAAA	2	10	119225	119234	60 %	20 %	0 %	20 %	427711281
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2212	NC_019680	GAC	2	6	122951	122956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711285
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2231	NC_019680	C	6	6	124241	124246	0 %	0 %	0 %	100 %	427711286
2232	NC_019680	ACC	3	9	124290	124298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711286
2233	NC_019680	ACC	2	6	124388	124393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711286
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2240	NC_019680	ATTC	2	8	124761	124768	25 %	50 %	0 %	25 %	427711287
2241	NC_019680	TTGA	2	8	124774	124781	25 %	50 %	25 %	0 %	427711287
2242	NC_019680	G	6	6	124791	124796	0 %	0 %	100 %	0 %	427711287
2243	NC_019680	GGT	2	6	124849	124854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711287
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2369	NC_019680	ATAA	2	8	131829	131836	75 %	25 %	0 %	0 %	427711296
2370	NC_019680	CCAA	2	8	131926	131933	50 %	0 %	0 %	50 %	427711296
2371	NC_019680	GCCCG	2	10	132031	132040	0 %	0 %	40 %	60 %	427711296
2372	NC_019680	CCA	2	6	132226	132231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711296
2373	NC_019680	CTG	2	6	132276	132281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711296
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2375	NC_019680	ACTGG	2	10	132606	132615	20 %	20 %	40 %	20 %	427711296
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2377	NC_019680	CTGGGC	2	12	132764	132775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	427711296
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2382	NC_019680	T	6	6	133247	133252	0 %	100 %	0 %	0 %	427711297
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2399	NC_019680	CAT	2	6	134358	134363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2454	NC_019680	TAA	2	6	137428	137433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2466	NC_019680	TG	3	6	138284	138289	0 %	50 %	50 %	0 %	427711303
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2479	NC_019680	CATC	2	8	138924	138931	25 %	25 %	0 %	50 %	427711303
2480	NC_019680	TGA	2	6	138957	138962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711303
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2483	NC_019680	G	8	8	139186	139193	0 %	0 %	100 %	0 %	427711303
2484	NC_019680	TCA	2	6	139205	139210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711303
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2488	NC_019680	GCCCC	2	10	139327	139336	0 %	0 %	20 %	80 %	427711303
2489	NC_019680	GGAT	2	8	139466	139473	25 %	25 %	50 %	0 %	427711303
2490	NC_019680	GTC	2	6	139483	139488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711303
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2492	NC_019680	GCA	2	6	139616	139621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711303
2493	NC_019680	GTC	2	6	139678	139683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711303
2494	NC_019680	CGG	2	6	139705	139710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711303
2495	NC_019680	AGT	2	6	139731	139736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711303
2496	NC_019680	GGT	2	6	139737	139742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711303
2497	NC_019680	GGCC	2	8	139743	139750	0 %	0 %	50 %	50 %	427711303
2498	NC_019680	CGG	2	6	139767	139772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711303
2499	NC_019680	G	6	6	139824	139829	0 %	0 %	100 %	0 %	427711303
2500	NC_019680	GAT	2	6	139863	139868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711303

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