MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019680	GAGGC	2	10	82580	82589	20 %	0 %	60 %	20 %	427711240
1502	NC_019680	TTG	2	6	82646	82651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711240
1503	NC_019680	CGC	2	6	82684	82689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711240
1504	NC_019680	GAA	2	6	82691	82696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711240
1505	NC_019680	TGT	2	6	82707	82712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711240
1506	NC_019680	CTCCAA	2	12	82730	82741	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	427711240
1507	NC_019680	GTT	3	9	82816	82824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711240
1508	NC_019680	G	6	6	82987	82992	0 %	0 %	100 %	0 %	427711240
1509	NC_019680	C	8	8	83060	83067	0 %	0 %	0 %	100 %	427711240
1510	NC_019680	GGA	2	6	83092	83097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711240
1511	NC_019680	CGC	2	6	83131	83136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711240
1512	NC_019680	AAC	2	6	83164	83169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711240
1513	NC_019680	GGGGA	2	10	83194	83203	20 %	0 %	80 %	0 %	427711240
1514	NC_019680	GTAAAG	2	12	83207	83218	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	427711240
1515	NC_019680	TGCC	2	8	83247	83254	0 %	25 %	25 %	50 %	427711240
1516	NC_019680	CCA	2	6	83429	83434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711240
1517	NC_019680	GAA	2	6	83447	83452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711240
1518	NC_019680	T	6	6	83488	83493	0 %	100 %	0 %	0 %	427711240
1519	NC_019680	GCTTT	2	10	83520	83529	0 %	60 %	20 %	20 %	427711240
1520	NC_019680	GCCAA	2	10	83549	83558	40 %	0 %	20 %	40 %	427711240
1521	NC_019680	CCA	2	6	83625	83630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711240
1522	NC_019680	ACA	2	6	83651	83656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711240
1523	NC_019680	ATGA	2	8	83681	83688	50 %	25 %	25 %	0 %	427711240
1524	NC_019680	ATT	2	6	83707	83712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711240
1525	NC_019680	CAT	2	6	83757	83762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711240
1526	NC_019680	AGAT	2	8	83899	83906	50 %	25 %	25 %	0 %	427711240
1527	NC_019680	GCA	2	6	83945	83950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711240
1528	NC_019680	CATC	2	8	84027	84034	25 %	25 %	0 %	50 %	427711240
1529	NC_019680	GGA	2	6	84045	84050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711240
1530	NC_019680	TGC	2	6	84052	84057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711240
1531	NC_019680	CAT	2	6	84081	84086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711240
1532	NC_019680	CAC	2	6	84142	84147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711240
1533	NC_019680	CTT	2	6	84177	84182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711240
1534	NC_019680	CAC	2	6	84270	84275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711240
1535	NC_019680	AGG	2	6	84408	84413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711240
1536	NC_019680	A	6	6	84447	84452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_019680	TGT	2	6	84481	84486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_019680	G	6	6	84500	84505	0 %	0 %	100 %	0 %	427711241
1539	NC_019680	TC	3	6	84665	84670	0 %	50 %	0 %	50 %	427711241
1540	NC_019680	CTT	2	6	84671	84676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711241
1541	NC_019680	GTC	2	6	84677	84682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711241
1542	NC_019680	TTG	2	6	84696	84701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711241
1543	NC_019680	AACT	2	8	84750	84757	50 %	25 %	0 %	25 %	427711241
1544	NC_019680	AGT	2	6	84796	84801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711241
1545	NC_019680	ACCC	2	8	84830	84837	25 %	0 %	0 %	75 %	427711241
1546	NC_019680	ATAG	2	8	84839	84846	50 %	25 %	25 %	0 %	427711241
1547	NC_019680	GTT	2	6	85039	85044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711241
1548	NC_019680	A	7	7	85047	85053	100 %	0 %	0 %	0 %	427711241
1549	NC_019680	CAG	2	6	85064	85069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711241
1550	NC_019680	GGT	2	6	85074	85079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711241
1551	NC_019680	CGG	2	6	85114	85119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711241
1552	NC_019680	GTA	2	6	85140	85145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711241
1553	NC_019680	ACT	2	6	85216	85221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711241
1554	NC_019680	AGA	2	6	85386	85391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_019680	GAGTT	2	10	85408	85417	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_019680	CAT	2	6	85550	85555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711242
1557	NC_019680	AAT	2	6	85593	85598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711242
1558	NC_019680	CCA	2	6	85616	85621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711242
1559	NC_019680	CA	3	6	85620	85625	50 %	0 %	0 %	50 %	427711242
1560	NC_019680	CAA	2	6	85715	85720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711242
1561	NC_019680	ATCC	2	8	85790	85797	25 %	25 %	0 %	50 %	427711242
1562	NC_019680	AAC	2	6	85828	85833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711242
1563	NC_019680	ACC	2	6	85850	85855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711242
1564	NC_019680	CAA	2	6	85886	85891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711242
1565	NC_019680	ATCA	2	8	85908	85915	50 %	25 %	0 %	25 %	427711242
1566	NC_019680	GCC	2	6	85940	85945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711242
1567	NC_019680	CAT	2	6	85949	85954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711242
1568	NC_019680	TCT	2	6	86032	86037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711242
1569	NC_019680	TTG	2	6	86099	86104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711242
1570	NC_019680	CAT	2	6	86162	86167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711242
1571	NC_019680	TC	3	6	86236	86241	0 %	50 %	0 %	50 %	427711242
1572	NC_019680	ATAG	2	8	86289	86296	50 %	25 %	25 %	0 %	427711242
1573	NC_019680	GTTC	2	8	86335	86342	0 %	50 %	25 %	25 %	427711242
1574	NC_019680	AG	3	6	86349	86354	50 %	0 %	50 %	0 %	427711242
1575	NC_019680	GTT	2	6	86357	86362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711242
1576	NC_019680	TTA	2	6	86389	86394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711242
1577	NC_019680	GTT	2	6	86491	86496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711242
1578	NC_019680	GCG	2	6	86498	86503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711242
1579	NC_019680	A	6	6	86534	86539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_019680	CAA	2	6	86579	86584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_019680	CCG	2	6	86680	86685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711243
1582	NC_019680	CA	3	6	86800	86805	50 %	0 %	0 %	50 %	427711243
1583	NC_019680	TAA	2	6	86821	86826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711243
1584	NC_019680	GGT	2	6	86846	86851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711243
1585	NC_019680	CCA	2	6	86935	86940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711243
1586	NC_019680	TCGG	2	8	86966	86973	0 %	25 %	50 %	25 %	427711243
1587	NC_019680	CCAGG	2	10	86986	86995	20 %	0 %	40 %	40 %	427711243
1588	NC_019680	CCG	2	6	87126	87131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711243
1589	NC_019680	ATG	2	6	87212	87217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_019680	ATA	2	6	87235	87240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_019680	CAG	2	6	87250	87255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_019680	ACTA	2	8	87258	87265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_019680	TGC	2	6	87293	87298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_019680	CT	3	6	87329	87334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1595	NC_019680	AAT	2	6	87341	87346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_019680	TCA	2	6	87402	87407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_019680	GCT	2	6	87478	87483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_019680	TAGA	2	8	87490	87497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_019680	TG	3	6	87553	87558	0 %	50 %	50 %	0 %	427711244
1600	NC_019680	CGA	2	6	87624	87629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711244
1601	NC_019680	TGGC	2	8	87667	87674	0 %	25 %	50 %	25 %	427711244
1602	NC_019680	TGGCC	2	10	87751	87760	0 %	20 %	40 %	40 %	427711244
1603	NC_019680	CAG	2	6	87887	87892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711244
1604	NC_019680	TTA	2	6	87893	87898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711244
1605	NC_019680	TGG	2	6	87945	87950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711244
1606	NC_019680	GGCCT	2	10	87960	87969	0 %	20 %	40 %	40 %	427711244
1607	NC_019680	ACC	2	6	88070	88075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711244
1608	NC_019680	ATT	2	6	88148	88153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711244
1609	NC_019680	CGG	2	6	88156	88161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711244
1610	NC_019680	CTC	2	6	88303	88308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711245
1611	NC_019680	C	6	6	88339	88344	0 %	0 %	0 %	100 %	427711245
1612	NC_019680	AAG	2	6	88406	88411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711245
1613	NC_019680	GCC	2	6	88477	88482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711245
1614	NC_019680	CCCAGG	2	12	88490	88501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711245
1615	NC_019680	CTGA	2	8	88525	88532	25 %	25 %	25 %	25 %	427711245
1616	NC_019680	CAAT	2	8	88538	88545	50 %	25 %	0 %	25 %	427711245
1617	NC_019680	CCAGGC	2	12	88605	88616	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711245
1618	NC_019680	ACC	2	6	88630	88635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711245
1619	NC_019680	GAG	2	6	88660	88665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711245
1620	NC_019680	CCG	2	6	88673	88678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711245
1621	NC_019680	GAA	2	6	88819	88824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711245
1622	NC_019680	G	6	6	88825	88830	0 %	0 %	100 %	0 %	427711245
1623	NC_019680	TCA	2	6	88838	88843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711245
1624	NC_019680	ACG	2	6	88854	88859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711245
1625	NC_019680	C	6	6	88910	88915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1626	NC_019680	GTT	2	6	89002	89007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_019680	CTCCCG	2	12	89055	89066	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	427711246
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1629	NC_019680	TCT	2	6	89120	89125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711246
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