MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019680	CAG	2	6	56067	56072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711229
1002	NC_019680	CT	3	6	56102	56107	0 %	50 %	0 %	50 %	427711229
1003	NC_019680	TC	3	6	56182	56187	0 %	50 %	0 %	50 %	427711229
1004	NC_019680	CAC	2	6	56394	56399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711230
1005	NC_019680	GCC	2	6	56447	56452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711230
1006	NC_019680	CAA	2	6	56468	56473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711230
1007	NC_019680	TTG	2	6	56559	56564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711230
1008	NC_019680	AT	3	6	56579	56584	50 %	50 %	0 %	0 %	427711230
1009	NC_019680	ATT	2	6	56706	56711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711230
1010	NC_019680	GGTCAG	2	12	56762	56773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427711230
1011	NC_019680	GGA	2	6	56803	56808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711230
1012	NC_019680	TTA	2	6	56827	56832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711230
1013	NC_019680	TGT	2	6	56879	56884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711230
1014	NC_019680	T	6	6	56884	56889	0 %	100 %	0 %	0 %	427711230
1015	NC_019680	TCGA	2	8	56922	56929	25 %	25 %	25 %	25 %	427711230
1016	NC_019680	TGC	2	6	57008	57013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711230
1017	NC_019680	GGT	2	6	57157	57162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711231
1018	NC_019680	TCAC	2	8	57167	57174	25 %	25 %	0 %	50 %	427711231
1019	NC_019680	C	6	6	57181	57186	0 %	0 %	0 %	100 %	427711231
1020	NC_019680	GTT	2	6	57188	57193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711231
1021	NC_019680	CGC	2	6	57194	57199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711231
1022	NC_019680	GGC	2	6	57300	57305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711231
1023	NC_019680	AAAC	2	8	57374	57381	75 %	0 %	0 %	25 %	427711231
1024	NC_019680	GGA	2	6	57384	57389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711231
1025	NC_019680	GGC	2	6	57409	57414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711231
1026	NC_019680	GGAT	2	8	57480	57487	25 %	25 %	50 %	0 %	427711231
1027	NC_019680	T	6	6	57594	57599	0 %	100 %	0 %	0 %	427711231
1028	NC_019680	ACCA	2	8	57603	57610	50 %	0 %	0 %	50 %	427711231
1029	NC_019680	AAT	2	6	57613	57618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711231
1030	NC_019680	TCC	2	6	57632	57637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711231
1031	NC_019680	CAT	3	9	57666	57674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711231
1032	NC_019680	CCG	2	6	57730	57735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711231
1033	NC_019680	ATC	2	6	57778	57783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711231
1034	NC_019680	GCC	2	6	57794	57799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711231
1035	NC_019680	AAC	2	6	57845	57850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711231
1036	NC_019680	TCA	2	6	57965	57970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711231
1037	NC_019680	GCC	2	6	58133	58138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711231
1038	NC_019680	CGA	2	6	58218	58223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711231
1039	NC_019680	ACC	2	6	58240	58245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711231
1040	NC_019680	AAG	2	6	58328	58333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711231
1041	NC_019680	CCG	2	6	58349	58354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711231
1042	NC_019680	CAT	2	6	58395	58400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711231
1043	NC_019680	GGCCA	2	10	58405	58414	20 %	0 %	40 %	40 %	427711231
1044	NC_019680	CCGA	2	8	58460	58467	25 %	0 %	25 %	50 %	427711231
1045	NC_019680	A	6	6	58531	58536	100 %	0 %	0 %	0 %	427711231
1046	NC_019680	CCCGA	2	10	58543	58552	20 %	0 %	20 %	60 %	427711231
1047	NC_019680	CCA	2	6	58593	58598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711231
1048	NC_019680	AGC	2	6	58601	58606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711231
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1050	NC_019680	TGG	2	6	58689	58694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711231
1051	NC_019680	AAC	2	6	58726	58731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711231
1052	NC_019680	CCAAAC	2	12	58811	58822	50 %	0 %	0 %	50 %	427711231
1053	NC_019680	ACC	2	6	58832	58837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711231
1054	NC_019680	AAAGCC	2	12	58870	58881	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427711231
1055	NC_019680	AGC	2	6	58970	58975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711231
1056	NC_019680	CCAGG	2	10	59052	59061	20 %	0 %	40 %	40 %	427711231
1057	NC_019680	TAAAAA	2	12	59118	59129	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	427711231
1058	NC_019680	C	6	6	59153	59158	0 %	0 %	0 %	100 %	427711231
1059	NC_019680	GAA	2	6	59276	59281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019680	TCC	2	6	59295	59300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_019680	CGA	2	6	59364	59369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_019680	ATCAA	2	10	59410	59419	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_019680	GC	3	6	59454	59459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_019680	TCA	2	6	59462	59467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_019680	ACT	2	6	59510	59515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711232
1066	NC_019680	GTC	2	6	59601	59606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711232
1067	NC_019680	TGAC	2	8	59680	59687	25 %	25 %	25 %	25 %	427711232
1068	NC_019680	ATCCG	2	10	59689	59698	20 %	20 %	20 %	40 %	427711232
1069	NC_019680	ACCA	2	8	59719	59726	50 %	0 %	0 %	50 %	427711232
1070	NC_019680	TCAT	2	8	59776	59783	25 %	50 %	0 %	25 %	427711232
1071	NC_019680	ATT	2	6	59823	59828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711232
1072	NC_019680	AGG	2	6	59834	59839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711232
1073	NC_019680	GGA	2	6	59911	59916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711232
1074	NC_019680	ATC	2	6	59947	59952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711232
1075	NC_019680	GGA	2	6	60038	60043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711232
1076	NC_019680	T	6	6	60120	60125	0 %	100 %	0 %	0 %	427711232
1077	NC_019680	CAGGC	2	10	60214	60223	20 %	0 %	40 %	40 %	427711232
1078	NC_019680	CCG	2	6	60248	60253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711232
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1081	NC_019680	GGA	3	9	60344	60352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711232
1082	NC_019680	CAT	2	6	60363	60368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711232
1083	NC_019680	AAG	2	6	60373	60378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711232
1084	NC_019680	T	6	6	60402	60407	0 %	100 %	0 %	0 %	427711232
1085	NC_019680	ATC	2	6	60409	60414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711232
1086	NC_019680	GTC	2	6	60415	60420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_019680	TG	3	6	60480	60485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019680	GCC	2	6	60560	60565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_019680	AC	3	6	60604	60609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1090	NC_019680	ATCT	2	8	60615	60622	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_019680	AAG	2	6	60645	60650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711233
1092	NC_019680	ATT	2	6	60662	60667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711233
1093	NC_019680	CGG	2	6	60700	60705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711233
1094	NC_019680	CCT	2	6	60706	60711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711233
1095	NC_019680	CTG	2	6	60719	60724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711233
1096	NC_019680	AAC	2	6	60726	60731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711233
1097	NC_019680	GTC	2	6	60800	60805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711233
1098	NC_019680	T	6	6	60838	60843	0 %	100 %	0 %	0 %	427711233
1099	NC_019680	TCC	2	6	60918	60923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711233
1100	NC_019680	TCC	2	6	60927	60932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711233
1101	NC_019680	TGGG	2	8	60965	60972	0 %	25 %	75 %	0 %	427711233
1102	NC_019680	AGG	2	6	60990	60995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711233
1103	NC_019680	TC	4	8	61019	61026	0 %	50 %	0 %	50 %	427711233
1104	NC_019680	GGTCA	2	10	61085	61094	20 %	20 %	40 %	20 %	427711233
1105	NC_019680	TGG	2	6	61107	61112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711233
1106	NC_019680	C	6	6	61259	61264	0 %	0 %	0 %	100 %	427711233
1107	NC_019680	GTT	2	6	61273	61278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711233
1108	NC_019680	GC	3	6	61280	61285	0 %	0 %	50 %	50 %	427711233
1109	NC_019680	AG	3	6	61288	61293	50 %	0 %	50 %	0 %	427711233
1110	NC_019680	ATT	2	6	61300	61305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711233
1111	NC_019680	CTTG	2	8	61306	61313	0 %	50 %	25 %	25 %	427711233
1112	NC_019680	CT	3	6	61323	61328	0 %	50 %	0 %	50 %	427711233
1113	NC_019680	TGA	2	6	61398	61403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711233
1114	NC_019680	T	6	6	61475	61480	0 %	100 %	0 %	0 %	427711233
1115	NC_019680	GCC	2	6	61481	61486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711233
1116	NC_019680	TTGA	2	8	61496	61503	25 %	50 %	25 %	0 %	427711233
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1119	NC_019680	CGG	2	6	61740	61745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711233
1120	NC_019680	ATG	2	6	61827	61832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711233
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1122	NC_019680	TGAT	2	8	61956	61963	25 %	50 %	25 %	0 %	427711233
1123	NC_019680	AAGACA	2	12	62172	62183	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	427711233
1124	NC_019680	GTG	2	6	62216	62221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711233
1125	NC_019680	AGCC	2	8	62236	62243	25 %	0 %	25 %	50 %	427711233
1126	NC_019680	TGT	2	6	62262	62267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711233
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1128	NC_019680	CAG	2	6	62653	62658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711233
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