MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019680	TGA	2	6	341156	341161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
6002	NC_019680	TGG	2	6	341198	341203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711487
6003	NC_019680	ATG	2	6	341209	341214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
6004	NC_019680	CTG	2	6	341238	341243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711487
6005	NC_019680	ATGG	2	8	341250	341257	25 %	25 %	50 %	0 %	427711487
6006	NC_019680	ATT	2	6	341277	341282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711487
6007	NC_019680	GCC	2	6	341289	341294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711487
6008	NC_019680	CTC	2	6	341325	341330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711487
6009	NC_019680	GCC	2	6	341383	341388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711487
6010	NC_019680	GAA	2	6	341430	341435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711487
6011	NC_019680	AGCC	2	8	341536	341543	25 %	0 %	25 %	50 %	427711487
6012	NC_019680	A	6	6	341622	341627	100 %	0 %	0 %	0 %	427711487
6013	NC_019680	GTT	2	6	341660	341665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711487
6014	NC_019680	CTT	2	6	341673	341678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711487
6015	NC_019680	ATT	2	6	341709	341714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711487
6016	NC_019680	GGT	2	6	341724	341729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711487
6017	NC_019680	TGA	2	6	341756	341761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
6018	NC_019680	TTA	2	6	341799	341804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711487
6019	NC_019680	G	6	6	341825	341830	0 %	0 %	100 %	0 %	427711487
6020	NC_019680	AGT	2	6	341883	341888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
6021	NC_019680	GAA	2	6	342027	342032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711487
6022	NC_019680	ATG	2	6	342082	342087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711487
6023	NC_019680	ACC	2	6	342201	342206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711487
6024	NC_019680	GTG	2	6	342234	342239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711487
6025	NC_019680	TAAG	2	8	342251	342258	50 %	25 %	25 %	0 %	427711487
6026	NC_019680	TGT	2	6	342271	342276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_019680	GGT	2	6	342327	342332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_019680	TAG	2	6	342372	342377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_019680	ATTT	2	8	342381	342388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_019680	T	6	6	342386	342391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_019680	CTTT	2	8	342402	342409	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_019680	AAG	2	6	342446	342451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_019680	GCA	2	6	342523	342528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_019680	TCG	2	6	342542	342547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_019680	GT	3	6	342555	342560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_019680	CGT	2	6	342618	342623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_019680	ACC	2	6	342667	342672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_019680	AGC	2	6	342695	342700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_019680	A	8	8	342761	342768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_019680	TC	3	6	342896	342901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_019680	CAGA	2	8	342941	342948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_019680	CCGT	2	8	343093	343100	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_019680	GC	3	6	343163	343168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_019680	TGC	2	6	343227	343232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_019680	GAA	2	6	343236	343241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_019680	TGA	2	6	343275	343280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_019680	ATT	2	6	343282	343287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_019680	TATC	2	8	343334	343341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_019680	CAT	2	6	343379	343384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_019680	TTG	3	9	343541	343549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711488
6051	NC_019680	ATC	2	6	343561	343566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711488
6052	NC_019680	CTG	2	6	343639	343644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711488
6053	NC_019680	AGC	2	6	343836	343841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711488
6054	NC_019680	GGA	2	6	343857	343862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711488
6055	NC_019680	C	6	6	344010	344015	0 %	0 %	0 %	100 %	427711488
6056	NC_019680	TGG	2	6	344052	344057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711488
6057	NC_019680	CGCA	2	8	344124	344131	25 %	0 %	25 %	50 %	427711488
6058	NC_019680	CAT	2	6	344184	344189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711488
6059	NC_019680	GGC	2	6	344238	344243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711488
6060	NC_019680	GGT	2	6	344249	344254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711488
6061	NC_019680	CAGGCC	2	12	344266	344277	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711488
6062	NC_019680	AGA	2	6	344283	344288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711488
6063	NC_019680	GAT	2	6	344308	344313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711488
6064	NC_019680	CTG	2	6	344335	344340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711488
6065	NC_019680	CCGG	2	8	344358	344365	0 %	0 %	50 %	50 %	427711488
6066	NC_019680	TTAGA	2	10	344436	344445	40 %	40 %	20 %	0 %	427711488
6067	NC_019680	GGCT	2	8	344459	344466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6068	NC_019680	AGC	2	6	344521	344526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711489
6069	NC_019680	GGAT	2	8	344527	344534	25 %	25 %	50 %	0 %	427711489
6070	NC_019680	TTGG	2	8	344684	344691	0 %	50 %	50 %	0 %	427711489
6071	NC_019680	TTTA	2	8	344862	344869	25 %	75 %	0 %	0 %	427711490
6072	NC_019680	TTA	2	6	344892	344897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711490
6073	NC_019680	TCT	2	6	344902	344907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711490
6074	NC_019680	CCCGG	2	10	344909	344918	0 %	0 %	40 %	60 %	427711490
6075	NC_019680	TTGG	2	8	344969	344976	0 %	50 %	50 %	0 %	427711490
6076	NC_019680	GTT	2	6	345011	345016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711490
6077	NC_019680	GCCTG	2	10	345063	345072	0 %	20 %	40 %	40 %	427711490
6078	NC_019680	ATA	2	6	345123	345128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711490
6079	NC_019680	CCAA	2	8	345167	345174	50 %	0 %	0 %	50 %	427711490
6080	NC_019680	CAT	2	6	345266	345271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711490
6081	NC_019680	TCT	2	6	345292	345297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711490
6082	NC_019680	TGG	2	6	345372	345377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711490
6083	NC_019680	GCCTG	2	10	345399	345408	0 %	20 %	40 %	40 %	427711490
6084	NC_019680	GAC	2	6	345430	345435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711490
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6087	NC_019680	GAT	2	6	345578	345583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711490
6088	NC_019680	GAT	2	6	345589	345594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711490
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6092	NC_019680	GGGTGG	2	12	345786	345797	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	427711490
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6094	NC_019680	TGA	2	6	345985	345990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711490
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6098	NC_019680	C	6	6	346236	346241	0 %	0 %	0 %	100 %	427711490
6099	NC_019680	GTC	2	6	346290	346295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711490
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6101	NC_019680	AG	3	6	346448	346453	50 %	0 %	50 %	0 %	427711491
6102	NC_019680	GAG	2	6	346476	346481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711491
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6107	NC_019680	ACC	2	6	346623	346628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711491
6108	NC_019680	CCA	2	6	346751	346756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711491
6109	NC_019680	TTC	2	6	346779	346784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711491
6110	NC_019680	GGT	2	6	346788	346793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711491
6111	NC_019680	T	6	6	346868	346873	0 %	100 %	0 %	0 %	427711491
6112	NC_019680	CGCC	2	8	346950	346957	0 %	0 %	25 %	75 %	427711491
6113	NC_019680	CCA	2	6	347015	347020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711491
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6115	NC_019680	CAA	2	6	347057	347062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711491
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6119	NC_019680	TTG	2	6	347443	347448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711492
6120	NC_019680	GTT	2	6	347457	347462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711492
6121	NC_019680	GTTT	2	8	347483	347490	0 %	75 %	25 %	0 %	427711492
6122	NC_019680	CCAGGC	2	12	347493	347504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	427711492
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6491	NC_019680	C	6	6	367570	367575	0 %	0 %	0 %	100 %	427711512
6492	NC_019680	TCT	2	6	367727	367732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711512
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6494	NC_019680	A	8	8	367818	367825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6498	NC_019680	TTG	2	6	368011	368016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711513
6499	NC_019680	GAG	2	6	368055	368060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711513
6500	NC_019680	GTA	2	6	368080	368085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711513

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