MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_019680	TCA	2	6	312664	312669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711459
5502	NC_019680	CAC	2	6	312701	312706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711459
5503	NC_019680	A	6	6	312739	312744	100 %	0 %	0 %	0 %	427711459
5504	NC_019680	GTT	2	6	312838	312843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711459
5505	NC_019680	AAG	2	6	312877	312882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711459
5506	NC_019680	GGC	2	6	312930	312935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711459
5507	NC_019680	TAA	2	6	313036	313041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711459
5508	NC_019680	TGA	2	6	313064	313069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711459
5509	NC_019680	C	6	6	313081	313086	0 %	0 %	0 %	100 %	427711459
5510	NC_019680	AG	3	6	313103	313108	50 %	0 %	50 %	0 %	427711459
5511	NC_019680	GAAA	2	8	313165	313172	75 %	0 %	25 %	0 %	427711459
5512	NC_019680	CGG	2	6	313286	313291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711459
5513	NC_019680	AAT	2	6	313305	313310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711459
5514	NC_019680	GAC	2	6	313437	313442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711459
5515	NC_019680	CTGGGG	2	12	313469	313480	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	427711459
5516	NC_019680	G	6	6	313502	313507	0 %	0 %	100 %	0 %	427711459
5517	NC_019680	CTA	2	6	313541	313546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711459
5518	NC_019680	TGG	2	6	313652	313657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711459
5519	NC_019680	TTG	2	6	313671	313676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711459
5520	NC_019680	CAGG	2	8	313775	313782	25 %	0 %	50 %	25 %	427711459
5521	NC_019680	AAT	2	6	313872	313877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711459
5522	NC_019680	GCTT	2	8	313937	313944	0 %	50 %	25 %	25 %	427711459
5523	NC_019680	CTG	2	6	313955	313960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711459
5524	NC_019680	GCAAT	2	10	313970	313979	40 %	20 %	20 %	20 %	427711459
5525	NC_019680	A	7	7	313990	313996	100 %	0 %	0 %	0 %	427711459
5526	NC_019680	CTC	2	6	314029	314034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5527	NC_019680	AGGTC	2	10	314047	314056	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5528	NC_019680	ATT	2	6	314059	314064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_019680	GCT	2	6	314070	314075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711460
5530	NC_019680	CGGC	2	8	314111	314118	0 %	0 %	50 %	50 %	427711460
5531	NC_019680	GCA	2	6	314151	314156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711460
5532	NC_019680	ATA	2	6	314219	314224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711460
5533	NC_019680	GCA	2	6	314229	314234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711460
5534	NC_019680	TGG	2	6	314378	314383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711460
5535	NC_019680	GTTG	2	8	314395	314402	0 %	50 %	50 %	0 %	427711460
5536	NC_019680	CTGA	2	8	314423	314430	25 %	25 %	25 %	25 %	427711460
5537	NC_019680	CAG	2	6	314455	314460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711460
5538	NC_019680	CAC	2	6	314485	314490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711460
5539	NC_019680	TTTG	2	8	314575	314582	0 %	75 %	25 %	0 %	427711460
5540	NC_019680	AGG	2	6	314707	314712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711460
5541	NC_019680	AG	4	8	314740	314747	50 %	0 %	50 %	0 %	427711460
5542	NC_019680	TTC	2	6	314813	314818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711460
5543	NC_019680	ATC	2	6	314948	314953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711460
5544	NC_019680	GATTG	2	10	314996	315005	20 %	40 %	40 %	0 %	427711460
5545	NC_019680	AAG	2	6	315138	315143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711460
5546	NC_019680	A	6	6	315204	315209	100 %	0 %	0 %	0 %	427711460
5547	NC_019680	AT	3	6	315246	315251	50 %	50 %	0 %	0 %	427711460
5548	NC_019680	GAT	2	6	315289	315294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711460
5549	NC_019680	TC	3	6	315415	315420	0 %	50 %	0 %	50 %	427711460
5550	NC_019680	CGC	2	6	315505	315510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711460
5551	NC_019680	CAT	2	6	315577	315582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711460
5552	NC_019680	TAA	2	6	315688	315693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711460
5553	NC_019680	C	6	6	315695	315700	0 %	0 %	0 %	100 %	427711460
5554	NC_019680	C	6	6	315868	315873	0 %	0 %	0 %	100 %	427711460
5555	NC_019680	CGG	2	6	315880	315885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711460
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5557	NC_019680	TTG	2	6	315950	315955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711460
5558	NC_019680	AAC	2	6	315959	315964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711460
5559	NC_019680	TTGAA	2	10	315965	315974	40 %	40 %	20 %	0 %	427711460
5560	NC_019680	ACA	2	6	316059	316064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711460
5561	NC_019680	CGA	2	6	316162	316167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711460
5562	NC_019680	CAATCA	2	12	316216	316227	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	427711460
5563	NC_019680	TGG	2	6	316273	316278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711460
5564	NC_019680	TTG	2	6	316292	316297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711460
5565	NC_019680	TAGG	2	8	316312	316319	25 %	25 %	50 %	0 %	427711460
5566	NC_019680	ATG	2	6	316338	316343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711460
5567	NC_019680	AAT	2	6	316493	316498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711460
5568	NC_019680	GGGC	2	8	316552	316559	0 %	0 %	75 %	25 %	427711460
5569	NC_019680	GGCTGA	2	12	316571	316582	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	427711460
5570	NC_019680	AG	3	6	316599	316604	50 %	0 %	50 %	0 %	427711460
5571	NC_019680	A	7	7	316611	316617	100 %	0 %	0 %	0 %	427711460
5572	NC_019680	A	7	7	316643	316649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_019680	CTC	2	6	316650	316655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_019680	AC	3	6	316656	316661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_019680	AAT	2	6	316817	316822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711461
5576	NC_019680	GCT	3	9	316836	316844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711461
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5578	NC_019680	GGACT	2	10	316946	316955	20 %	20 %	40 %	20 %	427711461
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5580	NC_019680	AAT	2	6	317021	317026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711461
5581	NC_019680	A	6	6	317028	317033	100 %	0 %	0 %	0 %	427711461
5582	NC_019680	ACA	2	6	317049	317054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711461
5583	NC_019680	ATC	2	6	317058	317063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711461
5584	NC_019680	CTT	2	6	317086	317091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711461
5585	NC_019680	TCC	2	6	317097	317102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711461
5586	NC_019680	GGC	2	6	317192	317197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711462
5587	NC_019680	CAA	2	6	317234	317239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711462
5588	NC_019680	CCA	3	9	317243	317251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711462
5589	NC_019680	CTCA	2	8	317277	317284	25 %	25 %	0 %	50 %	427711462
5590	NC_019680	TG	3	6	317308	317313	0 %	50 %	50 %	0 %	427711462
5591	NC_019680	TAAAGA	2	12	317328	317339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	427711462
5592	NC_019680	AAC	2	6	317383	317388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711462
5593	NC_019680	TCA	2	6	317576	317581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711462
5594	NC_019680	CCTGG	2	10	317582	317591	0 %	20 %	40 %	40 %	427711462
5595	NC_019680	CAGA	2	8	317675	317682	50 %	0 %	25 %	25 %	427711462
5596	NC_019680	AGTT	2	8	317744	317751	25 %	50 %	25 %	0 %	427711462
5597	NC_019680	ATTA	2	8	317805	317812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_019680	TGT	2	6	317833	317838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_019680	T	6	6	317852	317857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_019680	CT	3	6	317891	317896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_019680	TGT	2	6	318006	318011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_019680	ATGA	2	8	318024	318031	50 %	25 %	25 %	0 %	427711463
5603	NC_019680	CTG	2	6	318099	318104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711463
5604	NC_019680	TGG	2	6	318135	318140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711463
5605	NC_019680	GCCAGA	2	12	318188	318199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711463
5606	NC_019680	AACCC	2	10	318221	318230	40 %	0 %	0 %	60 %	427711463
5607	NC_019680	ACA	2	6	318335	318340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711463
5608	NC_019680	TCC	2	6	318344	318349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711463
5609	NC_019680	GT	3	6	318466	318471	0 %	50 %	50 %	0 %	427711463
5610	NC_019680	CTC	3	9	318490	318498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711463
5611	NC_019680	CTT	2	6	318610	318615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711463
5612	NC_019680	TCA	2	6	318682	318687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711463
5613	NC_019680	AGT	2	6	318771	318776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711463
5614	NC_019680	G	7	7	318836	318842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_019680	ATC	2	6	318968	318973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_019680	AGC	2	6	319047	319052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711464
5617	NC_019680	TGGC	2	8	319098	319105	0 %	25 %	50 %	25 %	427711464
5618	NC_019680	CAG	2	6	319160	319165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711464
5619	NC_019680	TCAG	2	8	319186	319193	25 %	25 %	25 %	25 %	427711464
5620	NC_019680	GTGA	2	8	319385	319392	25 %	25 %	50 %	0 %	427711464
5621	NC_019680	AGA	2	6	319408	319413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711464
5622	NC_019680	GCG	2	6	319448	319453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711464
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5624	NC_019680	CTA	3	9	319527	319535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711464
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5997	NC_019680	A	6	6	341118	341123	100 %	0 %	0 %	0 %	427711487
5998	NC_019680	GAAA	2	8	341126	341133	75 %	0 %	25 %	0 %	427711487
5999	NC_019680	GC	3	6	341134	341139	0 %	0 %	50 %	50 %	427711487
6000	NC_019680	CCTG	2	8	341140	341147	0 %	25 %	25 %	50 %	427711487

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