MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 6312 chromosome

Total Repeats: 64980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019680	CGG	4	12	285725	285736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711433
5002	NC_019680	CAC	2	6	285763	285768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711433
5003	NC_019680	TTC	2	6	285871	285876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711433
5004	NC_019680	GCG	3	9	285903	285911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711433
5005	NC_019680	CTT	2	6	285913	285918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711433
5006	NC_019680	ATT	2	6	285929	285934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711433
5007	NC_019680	CTG	2	6	285968	285973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711433
5008	NC_019680	CCT	3	9	286065	286073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711433
5009	NC_019680	GATT	2	8	286078	286085	25 %	50 %	25 %	0 %	427711433
5010	NC_019680	CAG	2	6	286100	286105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711433
5011	NC_019680	CGG	2	6	286140	286145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711433
5012	NC_019680	GGA	2	6	286150	286155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711433
5013	NC_019680	ATT	2	6	286166	286171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711433
5014	NC_019680	G	6	6	286236	286241	0 %	0 %	100 %	0 %	427711433
5015	NC_019680	AGG	2	6	286296	286301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711433
5016	NC_019680	CTT	2	6	286312	286317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427711433
5017	NC_019680	ACC	2	6	286325	286330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711433
5018	NC_019680	ATT	2	6	286391	286396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711433
5019	NC_019680	CTG	2	6	286397	286402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711433
5020	NC_019680	A	6	6	286584	286589	100 %	0 %	0 %	0 %	427711433
5021	NC_019680	AAT	2	6	286832	286837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427711434
5022	NC_019680	CCGG	2	8	286848	286855	0 %	0 %	50 %	50 %	427711434
5023	NC_019680	TAAA	2	8	286875	286882	75 %	25 %	0 %	0 %	427711434
5024	NC_019680	TTG	2	6	286905	286910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711434
5025	NC_019680	TTG	2	6	286934	286939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711434
5026	NC_019680	CGC	2	6	286957	286962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711434
5027	NC_019680	TTGGG	2	10	286998	287007	0 %	40 %	60 %	0 %	427711434
5028	NC_019680	G	6	6	287116	287121	0 %	0 %	100 %	0 %	427711434
5029	NC_019680	CAC	2	6	287184	287189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711434
5030	NC_019680	GTC	2	6	287209	287214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711434
5031	NC_019680	GAG	4	12	287238	287249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711434
5032	NC_019680	AGTA	2	8	287362	287369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_019680	CCA	2	6	287485	287490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711435
5034	NC_019680	CCA	2	6	287597	287602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711435
5035	NC_019680	ATTT	2	8	287605	287612	25 %	75 %	0 %	0 %	427711435
5036	NC_019680	CCT	2	6	287616	287621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711435
5037	NC_019680	G	7	7	287650	287656	0 %	0 %	100 %	0 %	427711435
5038	NC_019680	TA	3	6	287728	287733	50 %	50 %	0 %	0 %	427711435
5039	NC_019680	CGG	2	6	287748	287753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711435
5040	NC_019680	C	7	7	287889	287895	0 %	0 %	0 %	100 %	427711435
5041	NC_019680	GTCG	2	8	287904	287911	0 %	25 %	50 %	25 %	427711435
5042	NC_019680	CTGG	2	8	287933	287940	0 %	25 %	50 %	25 %	427711435
5043	NC_019680	GAT	3	9	287958	287966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711435
5044	NC_019680	CAG	2	6	288053	288058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711435
5045	NC_019680	GGCCA	2	10	288073	288082	20 %	0 %	40 %	40 %	427711435
5046	NC_019680	GATC	2	8	288088	288095	25 %	25 %	25 %	25 %	427711435
5047	NC_019680	AACCC	2	10	288125	288134	40 %	0 %	0 %	60 %	427711435
5048	NC_019680	TGC	2	6	288228	288233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711435
5049	NC_019680	GTC	2	6	288261	288266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711435
5050	NC_019680	GGA	2	6	288272	288277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711435
5051	NC_019680	TTGG	2	8	288287	288294	0 %	50 %	50 %	0 %	427711435
5052	NC_019680	AGC	2	6	288350	288355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711435
5053	NC_019680	AAC	2	6	288359	288364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711435
5054	NC_019680	GGC	2	6	288368	288373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711435
5055	NC_019680	GAT	2	6	288405	288410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_019680	ATTT	2	8	288429	288436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_019680	TAC	2	6	288691	288696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427711436
5058	NC_019680	CCA	2	6	288785	288790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711436
5059	NC_019680	CAA	2	6	288793	288798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711436
5060	NC_019680	C	7	7	288838	288844	0 %	0 %	0 %	100 %	427711436
5061	NC_019680	TCC	2	6	288923	288928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711436
5062	NC_019680	GCG	2	6	288934	288939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711436
5063	NC_019680	TC	3	6	288952	288957	0 %	50 %	0 %	50 %	427711436
5064	NC_019680	TGA	2	6	289049	289054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711436
5065	NC_019680	CGG	2	6	289061	289066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711436
5066	NC_019680	CGG	2	6	289070	289075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711436
5067	NC_019680	GCC	2	6	289240	289245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711436
5068	NC_019680	A	6	6	289261	289266	100 %	0 %	0 %	0 %	427711436
5069	NC_019680	GGT	2	6	289309	289314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711436
5070	NC_019680	GTG	2	6	289358	289363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711436
5071	NC_019680	CAA	2	6	289381	289386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427711436
5072	NC_019680	GC	3	6	289407	289412	0 %	0 %	50 %	50 %	427711436
5073	NC_019680	GCCAGT	2	12	289468	289479	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	427711436
5074	NC_019680	TGG	2	6	289520	289525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711436
5075	NC_019680	GTC	2	6	289594	289599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711436
5076	NC_019680	ATT	2	6	289651	289656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711436
5077	NC_019680	GATC	2	8	289686	289693	25 %	25 %	25 %	25 %	427711436
5078	NC_019680	GTT	2	6	289792	289797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711436
5079	NC_019680	C	6	6	289871	289876	0 %	0 %	0 %	100 %	427711437
5080	NC_019680	C	7	7	289878	289884	0 %	0 %	0 %	100 %	427711437
5081	NC_019680	GTA	2	6	289916	289921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711437
5082	NC_019680	GCC	2	6	289927	289932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711437
5083	NC_019680	CTC	2	6	290047	290052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711437
5084	NC_019680	TGGC	2	8	290138	290145	0 %	25 %	50 %	25 %	427711437
5085	NC_019680	GTG	2	6	290194	290199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711437
5086	NC_019680	GCC	2	6	290260	290265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711437
5087	NC_019680	AGC	2	6	290337	290342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711437
5088	NC_019680	TCC	2	6	290351	290356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711437
5089	NC_019680	GAT	3	9	290359	290367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711437
5090	NC_019680	CAAG	2	8	290415	290422	50 %	0 %	25 %	25 %	427711437
5091	NC_019680	A	6	6	290478	290483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_019680	TGC	2	6	290501	290506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_019680	TTTCT	2	10	290532	290541	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5094	NC_019680	CTG	2	6	290550	290555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_019680	CTC	2	6	290589	290594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5096	NC_019680	CGG	2	6	290613	290618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_019680	CCATA	2	10	290822	290831	40 %	20 %	0 %	40 %	427711438
5098	NC_019680	TCG	2	6	290838	290843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711438
5099	NC_019680	GTCT	2	8	290875	290882	0 %	50 %	25 %	25 %	427711438
5100	NC_019680	AGT	2	6	290883	290888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711438
5101	NC_019680	ATG	2	6	290896	290901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711438
5102	NC_019680	AGC	3	9	291070	291078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711439
5103	NC_019680	G	6	6	291088	291093	0 %	0 %	100 %	0 %	427711439
5104	NC_019680	TA	3	6	291114	291119	50 %	50 %	0 %	0 %	427711439
5105	NC_019680	TTA	2	6	291137	291142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711439
5106	NC_019680	GAT	2	6	291226	291231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711439
5107	NC_019680	GTT	2	6	291304	291309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711439
5108	NC_019680	TGA	2	6	291342	291347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711439
5109	NC_019680	ATT	2	6	291356	291361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711439
5110	NC_019680	AGG	2	6	291427	291432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711439
5111	NC_019680	GGC	2	6	291436	291441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711439
5112	NC_019680	CAG	2	6	291491	291496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711439
5113	NC_019680	GGC	2	6	291508	291513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427711439
5114	NC_019680	TTG	2	6	291528	291533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711439
5115	NC_019680	T	7	7	291574	291580	0 %	100 %	0 %	0 %	427711439
5116	NC_019680	GGT	2	6	291753	291758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427711439
5117	NC_019680	TC	3	6	291817	291822	0 %	50 %	0 %	50 %	427711439
5118	NC_019680	GCC	3	9	291830	291838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711439
5119	NC_019680	T	7	7	291900	291906	0 %	100 %	0 %	0 %	427711439
5120	NC_019680	C	7	7	291925	291931	0 %	0 %	0 %	100 %	427711439
5121	NC_019680	CCA	2	6	292023	292028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427711439
5122	NC_019680	T	6	6	292057	292062	0 %	100 %	0 %	0 %	427711439
5123	NC_019680	TTG	2	6	292118	292123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711439
5124	NC_019680	CTG	2	6	292154	292159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711439
5125	NC_019680	CTGGC	2	10	292227	292236	0 %	20 %	40 %	40 %	427711439
5126	NC_019680	TTGG	2	8	292241	292248	0 %	50 %	50 %	0 %	427711439
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5128	NC_019680	TTG	2	6	292443	292448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711439
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5133	NC_019680	ATTT	2	8	292613	292620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_019680	AAT	2	6	292646	292651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_019680	CTC	2	6	292694	292699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5136	NC_019680	GTT	2	6	292746	292751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_019680	AGC	2	6	292860	292865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427711440
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5141	NC_019680	TGCTC	2	10	293047	293056	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5145	NC_019680	GGT	2	6	293157	293162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_019680	TAT	2	6	293203	293208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5147	NC_019680	TATCC	2	10	293299	293308	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5153	NC_019680	TCA	2	6	293656	293661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5154	NC_019680	CTGTCG	2	12	293663	293674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5216	NC_019680	ATT	2	6	297153	297158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5230	NC_019680	GTT	2	6	298186	298191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711448
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5245	NC_019680	AGA	2	6	299151	299156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427711448
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5371	NC_019680	GAT	2	6	305572	305577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427711454
5372	NC_019680	GCC	2	6	305609	305614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711454
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5374	NC_019680	CGC	2	6	305692	305697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427711454
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5380	NC_019680	CTG	2	6	306118	306123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427711454
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5393	NC_019680	CGG	2	6	306894	306899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_019680	ATT	2	6	306923	306928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_019680	GAAA	2	8	306942	306949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5396	NC_019680	GGA	3	9	306987	306995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427711456
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5401	NC_019680	GGCCAG	2	12	307211	307222	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	427711456
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5435	NC_019680	CAA	2	6	308846	308851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5462	NC_019680	AGT	2	6	310298	310303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5485	NC_019680	A	6	6	311757	311762	100 %	0 %	0 %	0 %	427711459
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5489	NC_019680	GTT	2	6	311946	311951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427711459
5490	NC_019680	TGCT	2	8	311974	311981	0 %	50 %	25 %	25 %	427711459
5491	NC_019680	AGCT	2	8	312006	312013	25 %	25 %	25 %	25 %	427711459
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5494	NC_019680	TCC	2	6	312264	312269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427711459
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5496	NC_019680	ATT	2	6	312327	312332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427711459
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